-
1
-
-
0040786272
-
-
Wedemeyer, W. J.; Welker, E.; Narayan, M.; Scheraga, H. A. Biochemistry 2000, 39, 4207-4216.
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 4207-4216
-
-
Wedemeyer, W.J.1
Welker, E.2
Narayan, M.3
Scheraga, H.A.4
-
2
-
-
0343907216
-
-
Shimotakahara, S.; Rios, C. B.; Laity, J. H.; Zimmerman, D. E.; Scheraga, H. A.; Montelione, G. T. Biochemistry 1997, 36, 6915-6929.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 6915-6929
-
-
Shimotakahara, S.1
Rios, C.B.2
Laity, J.H.3
Zimmerman, D.E.4
Scheraga, H.A.5
Montelione, G.T.6
-
3
-
-
0030708903
-
-
Laity, J. H.; Lester, C. C.; Shimotakahara, S.; Zimmerman, D. E.; Montelione, G. T.; Scheraga, H. A. Biochemistry 1997, 36, 12683-12699.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 12683-12699
-
-
Laity, J.H.1
Lester, C.C.2
Shimotakahara, S.3
Zimmerman, D.E.4
Montelione, G.T.5
Scheraga, H.A.6
-
4
-
-
36049005474
-
-
Starovasnik, M. A.; Braisted, A. C.; Wells, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 10081-10085.
-
(1997)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.94
, pp. 10081-10085
-
-
Starovasnik, M.A.1
Braisted, A.C.2
Wells, J.A.3
-
6
-
-
0032539995
-
-
Rothwarf, D. M.; Li, Y.-J.; Scheraga, H. A. Biochemistry 1998, 37, 3760-3766.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 3760-3766
-
-
Rothwarf, D.M.1
Li, Y.-J.2
Scheraga, H.A.3
-
7
-
-
0032539956
-
-
Rothwarf, D. M.; Li, Y.-J.; Scheraga, H. A. Biochemistry 1998, 37, 3767-3776.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 3767-3776
-
-
Rothwarf, D.M.1
Li, Y.-J.2
Scheraga, H.A.3
-
8
-
-
28844456360
-
-
Mason, J. M.; Cliff, M. J.; Sessions, R. B.; Clarke, A. R. J. Biol. Chem. 2005, 280, 40494-40499.
-
(2005)
J. Biol. Chem
, vol.280
, pp. 40494-40499
-
-
Mason, J.M.1
Cliff, M.J.2
Sessions, R.B.3
Clarke, A.R.4
-
9
-
-
0035822622
-
-
Welker, E.; Wedemeyer, W. J.; Narayan, M.; Scheraga, H. A. Biochemistry 2001, 40, 9059-9064.
-
(2001)
Biochemistry
, vol.40
, pp. 9059-9064
-
-
Welker, E.1
Wedemeyer, W.J.2
Narayan, M.3
Scheraga, H.A.4
-
14
-
-
0023783477
-
-
Pace, C. N.; Grimsley, G. R.; Thomson, J. A.; Barnett, B. J. J. Biol. Chem. 1988, 263, 11820-11825.
-
(1988)
J. Biol. Chem
, vol.263
, pp. 11820-11825
-
-
Pace, C.N.1
Grimsley, G.R.2
Thomson, J.A.3
Barnett, B.J.4
-
15
-
-
0027480940
-
-
Zhou, N. E.; Kay, C. M.; Hodges, R. S. Biochemistry 1993, 32, 3178-3187.
-
(1993)
Biochemistry
, vol.32
, pp. 3178-3187
-
-
Zhou, N.E.1
Kay, C.M.2
Hodges, R.S.3
-
16
-
-
0027362677
-
-
Betz, S. F. Protein Sci. 1993, 2, 1551-1558.
-
(1993)
Protein Sci
, vol.2
, pp. 1551-1558
-
-
Betz, S.F.1
-
18
-
-
0035104132
-
-
Zavodszky, M.; Chen, C.-W.; Huang, J.-K.; Zolkiewski, M.; Wen, L.; Krishnamoorthi, R. Protein Sci. 2001, 10, 149-160.
-
(2001)
Protein Sci
, vol.10
, pp. 149-160
-
-
Zavodszky, M.1
Chen, C.-W.2
Huang, J.-K.3
Zolkiewski, M.4
Wen, L.5
Krishnamoorthi, R.6
-
19
-
-
33745328074
-
-
Siadat, O. R.; Lougarre, A.; Lamouroux, L.; Ladurantie, C.; Fournier, D. BMC Biochem. 2006, 7, 12.
-
(2006)
BMC Biochem
, vol.7
, pp. 12
-
-
Siadat, O.R.1
Lougarre, A.2
Lamouroux, L.3
Ladurantie, C.4
Fournier, D.5
-
20
-
-
0028594064
-
-
Regan, L.; Rockwell, A.; Wasserman, Z.; DeGrado, W. Protein Sci. 1994, 3, 2419-2427.
-
(1994)
Protein Sci
, vol.3
, pp. 2419-2427
-
-
Regan, L.1
Rockwell, A.2
Wasserman, Z.3
DeGrado, W.4
-
22
-
-
0032979942
-
-
Wang, Y.; Goh, S. Y.; Kuczera, K. J. Pept. Res. 1999, 53, 188-200.
-
(1999)
J. Pept. Res
, vol.53
, pp. 188-200
-
-
Wang, Y.1
Goh, S.Y.2
Kuczera, K.3
-
23
-
-
33646126931
-
-
Qin, M.; Zhang, J.; Wang, W. Biophys. J. 2006, 90, 272-286.
-
(2006)
Biophys. J
, vol.90
, pp. 272-286
-
-
Qin, M.1
Zhang, J.2
Wang, W.3
-
25
-
-
0026759298
-
-
Kobayashi, Y.; Sasabe, H.; Akutsu, T.; Saito, N. Biophys. Chem. 1992, 44, 113-127.
-
(1992)
Biophys. Chem
, vol.44
, pp. 113-127
-
-
Kobayashi, Y.1
Sasabe, H.2
Akutsu, T.3
Saito, N.4
-
26
-
-
0036937367
-
-
Martelli, P. L.; Fariselli, P.; Malaguti, L.; Casadio, R. Protein Eng. 2002, 15, 951-953.
-
(2002)
Protein Eng
, vol.15
, pp. 951-953
-
-
Martelli, P.L.1
Fariselli, P.2
Malaguti, L.3
Casadio, R.4
-
29
-
-
33747866099
-
-
Ceroni, A.; Passerini, A.; Vullo, A.; Frasconi, P. Nucleic Acids Res. 2006, 34, W177-W181.
-
(2006)
Nucleic Acids Res
, vol.34
-
-
Ceroni, A.1
Passerini, A.2
Vullo, A.3
Frasconi, P.4
-
30
-
-
31944444347
-
-
Cheng, J.; Saigo, H.; Baldi, P. Proteins: Struct., Funct., Bioinformatics 2006, 62, 617-629.
-
(2006)
Proteins: Struct., Funct., Bioinformatics
, vol.62
, pp. 617-629
-
-
Cheng, J.1
Saigo, H.2
Baldi, P.3
-
31
-
-
0842334823
-
-
Czaplewski, C.; Ołdziej, S.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. Protein Eng. Des. Sel. 2004, 17, 29-36.
-
(2004)
Protein Eng. Des. Sel
, vol.17
, pp. 29-36
-
-
Czaplewski, C.1
Ołdziej, S.2
Liwo, A.3
Scheraga, H.A.4
-
32
-
-
14044266389
-
-
Liwo, A.; Khalili, M.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 2362-2367.
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.102
, pp. 2362-2367
-
-
Liwo, A.1
Khalili, M.2
Scheraga, H.A.3
-
33
-
-
0027524668
-
-
Liwo, A.; Pincus, M. R.; Wawak, R. J.; Rackovsky, S.; Scheraga, H. A. Protein Sci. 1993, 2, 1697-1714.
-
(1993)
Protein Sci
, vol.2
, pp. 1697-1714
-
-
Liwo, A.1
Pincus, M.R.2
Wawak, R.J.3
Rackovsky, S.4
Scheraga, H.A.5
-
34
-
-
0027435091
-
-
Liwo, A.; Pincus, M. R.; Wawak, R. J.; Rackovsky, S.; Scheraga, H. A. Protein Sci. 1993, 2, 1715-1731.
-
(1993)
Protein Sci
, vol.2
, pp. 1715-1731
-
-
Liwo, A.1
Pincus, M.R.2
Wawak, R.J.3
Rackovsky, S.4
Scheraga, H.A.5
-
35
-
-
0000095892
-
-
Liwo, A.; Ołdziej, S.; Pincus, M. R.; Wawak, R. J.; Rackovsky, S.; Scheraga, H. A. J. Comput. Chem. 1997, 18, 849-873.
-
(1997)
J. Comput. Chem
, vol.18
, pp. 849-873
-
-
Liwo, A.1
Ołdziej, S.2
Pincus, M.R.3
Wawak, R.J.4
Rackovsky, S.5
Scheraga, H.A.6
-
36
-
-
0000095890
-
-
Liwo, A.; Pincus, M. R.; Wawak, R. J.; Rackovsky, S.; Ołdziej, S.; Scheraga, H. A. J. Comput. Chem. 1997, 18, 874-887.
-
(1997)
J. Comput. Chem
, vol.18
, pp. 874-887
-
-
Liwo, A.1
Pincus, M.R.2
Wawak, R.J.3
Rackovsky, S.4
Ołdziej, S.5
Scheraga, H.A.6
-
37
-
-
0001181898
-
-
Liwo, A.; Kaźmierkiewicz, R.; Czaplewski, C.; Groth, M.; Ołdziej, S.; Wawak, R. J.; Rackovsky, S.; Pincus, M. R.; Scheraga, H. A. J. Comput. Chem. 1998, 19, 259-276.
-
(1998)
J. Comput. Chem
, vol.19
, pp. 259-276
-
-
Liwo, A.1
Kaźmierkiewicz, R.2
Czaplewski, C.3
Groth, M.4
Ołdziej, S.5
Wawak, R.J.6
Rackovsky, S.7
Pincus, M.R.8
Scheraga, H.A.9
-
38
-
-
0035424584
-
-
Liwo, A.; Czaplewski, C.; Pillardy, J.; Scheraga, H. A. J. Chem. Phys. 2001, 115, 2323-2347.
-
(2001)
J. Chem. Phys
, vol.115
, pp. 2323-2347
-
-
Liwo, A.1
Czaplewski, C.2
Pillardy, J.3
Scheraga, H.A.4
-
39
-
-
0035797727
-
-
Lee, J.; Ripoll, D. R.; Czaplewski, C.; Pillardy, J.; Wedemeyer, W. J.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 7291-7298.
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, pp. 7291-7298
-
-
Lee, J.1
Ripoll, D.R.2
Czaplewski, C.3
Pillardy, J.4
Wedemeyer, W.J.5
Scheraga, H.A.6
-
40
-
-
0035797740
-
-
Pillardy, J.; Czaplewski, C.; Liwo, A.; Wedemeyer, W. J.; Lee, J.; Ripoll, D. R.; Arłukowicz, P.; Ołdziej, S.; Arnautova, Y. A.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 7299-7311.
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, pp. 7299-7311
-
-
Pillardy, J.1
Czaplewski, C.2
Liwo, A.3
Wedemeyer, W.J.4
Lee, J.5
Ripoll, D.R.6
Arłukowicz, P.7
Ołdziej, S.8
Arnautova, Y.A.9
Scheraga, H.A.10
-
41
-
-
0037133165
-
-
Liwo, A.; Arłukowicz, P.; Czaplewski, C.; Ołdziej, S.; Pillardy, J.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 1937-1942.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.99
, pp. 1937-1942
-
-
Liwo, A.1
Arłukowicz, P.2
Czaplewski, C.3
Ołdziej, S.4
Pillardy, J.5
Scheraga, H.A.6
-
42
-
-
84962446557
-
-
Ołdziej, S.; Kozłowska, U.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 8035-8046.
-
(2003)
J. Phys. Chem. A
, vol.107
, pp. 8035-8046
-
-
Ołdziej, S.1
Kozłowska, U.2
Liwo, A.3
Scheraga, H.A.4
-
43
-
-
3142681595
-
-
Liwo, A.; Ołdziej, S.; Czaplewski, C.; Kozłowska, U.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 9421-9438.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 9421-9438
-
-
Liwo, A.1
Ołdziej, S.2
Czaplewski, C.3
Kozłowska, U.4
Scheraga, H.A.5
-
44
-
-
8344277888
-
-
Ołdziej, S.; Liwo, A.; Czaplewski, C.; Pillardy, J.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 16934-16949.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 16934-16949
-
-
Ołdziej, S.1
Liwo, A.2
Czaplewski, C.3
Pillardy, J.4
Scheraga, H.A.5
-
45
-
-
8344262957
-
-
Ołdziej, S.; Lagiewka, J.; Liwo, A.; Czaplewski, C.; Chinchio, M.; Nanias, M.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 16950-16959.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 16950-16959
-
-
Ołdziej, S.1
Lagiewka, J.2
Liwo, A.3
Czaplewski, C.4
Chinchio, M.5
Nanias, M.6
Scheraga, H.A.7
-
47
-
-
23144450194
-
-
Khalili, M.; Liwo, A.; Rakowski, F.; Grochowski, P.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 13785-13797.
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 13785-13797
-
-
Khalili, M.1
Liwo, A.2
Rakowski, F.3
Grochowski, P.4
Scheraga, H.A.5
-
48
-
-
0016131619
-
-
Nishikawa, K.; Momany, F. A.; Scheraga, H. A. Macromolecules 1974, 7, 797-806.
-
(1974)
Macromolecules
, vol.7
, pp. 797-806
-
-
Nishikawa, K.1
Momany, F.A.2
Scheraga, H.A.3
-
50
-
-
33847123661
-
-
Liwo, A.; Khalili, M.; Czaplewski, C.; Kalinowski, S.; Ołdziej, S.; Wachucik, K.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 260-285.
-
(2007)
J. Phys. Chem. B
, vol.111
, pp. 260-285
-
-
Liwo, A.1
Khalili, M.2
Czaplewski, C.3
Kalinowski, S.4
Ołdziej, S.5
Wachucik, K.6
Scheraga, H.A.7
-
52
-
-
36048973123
-
-
To be submitted for publication
-
Kozlowska, U.; Liwo, A. To be submitted for publication.
-
-
-
Kozlowska, U.1
Liwo, A.2
-
54
-
-
0033514939
-
-
Lee, J.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 2025-2030.
-
(1999)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.96
, pp. 2025-2030
-
-
Lee, J.1
Liwo, A.2
Scheraga, H.A.3
-
55
-
-
0346492912
-
-
Czaplewski, C.; Liwo, A.; Pillardy, J.; Ołdziej, S.; Scheraga, H. A. Polymer 2004, 45, 677-686.
-
(2004)
Polymer
, vol.45
, pp. 677-686
-
-
Czaplewski, C.1
Liwo, A.2
Pillardy, J.3
Ołdziej, S.4
Scheraga, H.A.5
-
59
-
-
33750587438
-
-
Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690.
-
(1984)
J. Chem. Phys
, vol.81
, pp. 3684-3690
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Postma, J.P.M.2
van Gunsteren, W.F.3
DiNola, A.4
Haak, J.R.5
-
60
-
-
23144463330
-
-
Khalili, M.; Liwo, A.; Jagielska, A.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 13798-13810.
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 13798-13810
-
-
Khalili, M.1
Liwo, A.2
Jagielska, A.3
Scheraga, H.A.4
-
61
-
-
36749110571
-
-
Swope, W. C.; Andersen, H. C.; Berens, P. H.; Wilson, K. R. J. Chem. Phys. 1982, 76, 637-649.
-
(1982)
J. Chem. Phys
, vol.76
, pp. 637-649
-
-
Swope, W.C.1
Andersen, H.C.2
Berens, P.H.3
Wilson, K.R.4
-
66
-
-
0037961507
-
-
Mitsutake, A.; Sugita, Y.; Okamoto, Y. J. Chem. Phys. 2003, 118, 6664-6675.
-
(2003)
J. Chem. Phys
, vol.118
, pp. 6664-6675
-
-
Mitsutake, A.1
Sugita, Y.2
Okamoto, Y.3
-
67
-
-
0037961506
-
-
Mitsutake, A.; Sugita, Y.; Okamoto, Y. J. Chem. Phys. 2003, 118, 6676-6688.
-
(2003)
J. Chem. Phys
, vol.118
, pp. 6676-6688
-
-
Mitsutake, A.1
Sugita, Y.2
Okamoto, Y.3
-
68
-
-
33749993881
-
-
Nanias, M.; Czaplewski, C.; Scheraga, H. A. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 513-528.
-
(2006)
J. Chem. Theory Comput
, vol.2
, pp. 513-528
-
-
Nanias, M.1
Czaplewski, C.2
Scheraga, H.A.3
-
69
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Rosenberg, J. M.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021.
-
(1992)
J. Comput. Chem
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Rosenberg, J.M.2
Bouzida, D.3
Swendsen, R.H.4
Kollman, P.A.5
-
73
-
-
0034123433
-
-
Barthe, P.; Rochette, S.; Vita, C.; Roumestand, C. Protein Sci. 2000, 9, 942-955.
-
(2000)
Protein Sci
, vol.9
, pp. 942-955
-
-
Barthe, P.1
Rochette, S.2
Vita, C.3
Roumestand, C.4
-
74
-
-
17044447841
-
-
Barthe, P.; Chiche, L.; Strub, M. P.; Roumestand, C. J. Mol. Biol. 1997, 274, 801-815.
-
(1997)
J. Mol. Biol
, vol.274
, pp. 801-815
-
-
Barthe, P.1
Chiche, L.2
Strub, M.P.3
Roumestand, C.4
-
75
-
-
0031567139
-
-
Johansson, M. U.; de Chateau, M.; Wikstrom, M.; Forsen, S.; Drakenberg, T.; Bjorck, L. J. Mol. Biol. 1997, 266, 859-865.
-
(1997)
J. Mol. Biol
, vol.266
, pp. 859-865
-
-
Johansson, M.U.1
de Chateau, M.2
Wikstrom, M.3
Forsen, S.4
Drakenberg, T.5
Bjorck, L.6
-
76
-
-
0031253938
-
-
Liepinsh, E.; Andersson, M.; Ruysschaert, J. M.; Otting, G. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 793-795.
-
(1997)
Nat. Struct. Biol
, vol.4
, pp. 793-795
-
-
Liepinsh, E.1
Andersson, M.2
Ruysschaert, J.M.3
Otting, G.4
-
77
-
-
33646023674
-
-
Boulegue, C.; Milbradt, A. G.; Renner, C.; Moroder, L. J. Mol. Biol. 2006, 358, 846-856.
-
(2006)
J. Mol. Biol
, vol.358
, pp. 846-856
-
-
Boulegue, C.1
Milbradt, A.G.2
Renner, C.3
Moroder, L.4
-
78
-
-
33748286745
-
-
Pradeep, L.; Shin, H. C.; Scheraga, H. A. FEBS Lett. 2006, 580, 5029-5032.
-
(2006)
FEBS Lett
, vol.580
, pp. 5029-5032
-
-
Pradeep, L.1
Shin, H.C.2
Scheraga, H.A.3
-
79
-
-
0029881007
-
-
Koradi, R.; Billeter, M.; Wüthrich, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 51-55.
-
(1996)
J. Mol. Graphics
, vol.14
, pp. 51-55
-
-
Koradi, R.1
Billeter, M.2
Wüthrich, K.3
-
80
-
-
36049013546
-
-
http://www.gnuplot.info.
-
-
-
-
81
-
-
36048977437
-
-
http://www.xfig.org.
-
-
-
|