Bodipy-VAD-Fmk, a useful tool to study yeast peptide N-glycanase activity

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 5, Issue 22, 2007, Pages 3690-3697

  Witte, Martin D ^a   Descals, Carlos V ^a   De Lavoir, Sebastiaan V P ^a   Florea, Bogdan I ^a   Van Der Marel, Gijsbert A ^a   Overkleeft, Herman S ^a  

^a LEIDEN UNIVERSITY   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENZYME ACTIVITY; FLUORESCENCE; YEAST;

ELECTROPHILIC TRAPS; YEAST PEPTIDE N-GLYCANASE;

PEPTIDES;

GLYCOPEPTIDASE; PEPTIDE CHLOROMETHYL KETONE;

ARTICLE; CHEMISTRY; ENZYMOLOGY; FLUORESCENCE; METABOLISM; SACCHAROMYCES CEREVISIAE;

AMINO ACID CHLOROMETHYL KETONES; FLUORESCENCE; PEPTIDE-N4-(N-ACETYL-BETA-GLUCOSAMINYL) ASPARAGINE AMIDASE; SACCHAROMYCES CEREVISIAE;

EID: 35648957687     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b711531h     Document Type: Article

References (25)

1. R. E. Dempski, Jr. B. Imperiali Curr. Opin. Chem. Biol. 2002 6 844
2. R. Y. Hampton Curr. Opin. Cell Biol. 2002 14 476
3. R. G. Spiro Cell. Mol. Life Sci. 2004 61 1025
4. C. Hirsch D. Blom H. L. Ploegh EMBO J. 2003 22 1036
5. T. Suzuki H. Park N. Hollingsworth R. Sternglanz W. J. Lennarz J. Cell Biol. 2000 149 1039
6. S. Katiyar S. Joshi W. J. Lennarz Mol. Biol. Cell 2005 16 4584
7. G. Li G. Zhao X. Zhou H. Schindelin W. J. Lennarz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 15809
8. G. Li G. Zhao X. Zhou H. Schindelin W. J. Lennarz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 8348
9. S. Misaghi M. E. Pacold D. Blom H. L. Ploegh G. A. Korbel Chem. Biol. 2004 11 1677
10. T. Suzuki I. Hara M. Nakano G. Zhao W. J. Lennarz H. Schindelin N. Taniguchi K. Totani I. Matsuo Y. Ito J. Biol. Chem. 2006 281 22152
11. C. Hirsch S. Misaghi D. Blom M. E. Pacold H. L. Ploegh EMBO Rep. 2004 5 201
12. T. Suzuki Methods 2005 35 360
13. M. Verdoes B. I. Florea V. Menendez-Benito C. J. Maynard M. D. Witte W. A. van der Linden A. M. van den Nieuwendijk T. Hofmann C. R. Berkers F. W. van Leeuwen T. A. Groothuis M. A. Leeuwenburgh H. Ovaa J. J. Neefjes D. V. Filippov G. A. van der Marel N. P. Dantuma H. S. Overkleeft Chem. Biol. 2006 13 1217
14. Several fluorescent VAD-Fmk derivatives (Fam-VAD-Fmk, FITC-VAD-Fmk, SR-VAD-Fmk) have been reported as caspase activity probes. See: WO Pat., WO03058194, 2003
15. J. Grabarek B. Adbelt L. Du Z. Darzynkiewicz Exp. Cell Res. 2002 278 61
16. J. T. Palmer, US Pat., 5101068, 1992
17. W. Bröder H. Kunz Carbohydr. Res. 1993 249 221
18. T. Ogawa S. Nakabayashi K. Sasajima Carbohydr. Res. 1981 95 308
19. J. D. C. Codée R. E. J. N. Litjens R. den Heeten H. S. Overkleeft J. H. van Boom G. A. van der Marel Org. Lett. 2003 5 1519
20. B. A. Roe C. G. Boojamra J. L. Griggs C. R. Bertozzi J. Org. Chem. 1996 61 6442
21. J.-H. Lee J. M. Choi C. Lee K. J. Yi Y. Cho Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 9144
22. A. F. Kisselev A. L. Goldberg Methods Enzymol. 2005 398 364
23. D. Crich M. Smith Q. Yao J. Picione Synthesis 2001 323
24. D. Landini H. Molinari M. Penso A. Rampoldi Synthesis 1988 953
25. A. Korn S. Rudolph-Boehner L. Moroder Tetrahedron 1994 50 8381