Assimilatory and dissimilatory processes of microorganisms affecting metals in the environment

Journal of Analytical Atomic Spectrometry

Volumn 22, Issue 8, 2007, Pages 867-877

  Liermann, Laura J ^a   Hausrath, Elisabeth M ^a   Anbar, Ariel D ^b   Brantley, Susan L ^a  

^a PENNSYLVANIA STATE UNIVERSITY   (United States)

^b ARIZONA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

INDUCTIVELY COUPLED PLASMA MASS SPECTROMETRY; METABOLISM; MINERALS; MOLECULAR INTERACTIONS; TRACE ELEMENTS;

BIOSIGNATURES; CELLULAR COMPONENTS; MICROBE-MINERAL INTERACTIONS;

MICROORGANISMS;

EID: 34547406840     PISSN: 02679477     EISSN: 13645544     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b705383e     Document Type: Article

References (119)

1. J. J. R. Frausto da Silva and R. J. P. Williams, The Biological Chemistry of the Elements, Clarendon Press, 2001
2. A. L. Zerkle C. H. House S. L. Brantley Am. J. Sci. 2005 305 467
3. A. D. Anbar A. H. Knoll Science 2002 297 1137
4. J. F. Banfield and R. J. Hamers, in Processes at minerals and surfaces with relevance to microorganisms and prebiotic synthesis, eds., J. F. Banfield, and, K. H. Nealson, Washington, DC, 1997
5. L. Arrieta R. Grez Appl. Microbiol. 1971 22 487
6. J. F. Banfield S. A. Welch K. J. Edwards The Geochemical News 1998 96 11
7. W. W. Barker, S. A. Welch and J. F. Banfield, in Biogeochemical weathering of silicate minerals, Washington, DC, 1997
8. M. Robert and J. Berthelin, in Role of biological and biochemical factors in soil mineral weathering, eds., P. M. Huang, and, M. Schnitzer, Madison, WI, 1986
9. F. M. M. Morel N. M. Price Science 2003 300 944
10. C. E. Outten T. V. O'Halloran Science 2001 292 2488
11. I. M. Malinovskaya L. V. Kosenko S. K. Votselko V. S. Podgorskii Mikrobiologiya 1990 59 70
12. S. A. Welch P. Vandevivere Geomicrobiol. J. 1994 12 227
13. L. J. Liermann A. S. Barnes B. E. Kalinowski X. Zhou S. L. Brantley Chem. Geol. 2000 171 1
14. S. A. Welch W. W. Barker J. F. Banfield Geochim. Cosmochim. Acta 1999 63 1405
15. W. W. Barker J. F. Banfield Chem. Geol. 1996 132 55
16. R. B. Duff D. M. Webley R. O. Scott Soil Sci. 1963 95 105
17. A. K. Barman C. Varadachari K. Ghosh Geoderma 1992 53 45
18. P. Vandevivere S. A. Welch W. J. Ullman D. L. Kirchman Microb. Ecol. 1994 27 241
19. A. T. Stone, in 'Reactions of extracellular organic ligands with dissolved metal ions and mineral surfaces', eds., J. F. Banfield, and, K. H. Nealson, 1997
20. P. Bennett D. I. Siegel Nature 1987 326 684
21. P. C. Bennett M. E. Melcer D. I. Siegel J. P. Hassett Geochim. Cosmochim. Acta 1988 52 1521
22. P. C. Bennett Geochim. Cosmochim. Acta 1991 55 1781
23. W. W. Barker S. A. Welch S. Chu J. F. Banfield Am. Mineral. 1998 83 1551
24. J. B. Neilands Annu. Rev. Microbiol. 1982 36 285
25. G. Muller K. Raymond J. Bacteriol. 1984 160 304
26. W. J. Page M. Huyer J. Bacteriol. 1984 158 496
27. L. Hersman T. Lloyd G. Sposito Geochim. Cosmochim. Acta 1995 59 3327
28. L. Hersman P. Maurice G. Sposito Chem. Geol. 1996 132 25
29. B. A. Holmen W. H. Casey Geochim. Cosmochim. Acta 1996 60 4403
30. L. J. Liermann B. E. Kalinowski S. L. Brantley J. G. Ferry Geochim. Cosmochim. Acta 2000 64 587
31. B. E. Kalinowski L. J. Liermann S. L. Brantley A. Barnes C. G. Pantano Geochim. Cosmochim. Acta 2000 64 1331
32. S. Weyer J. Schwieters Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 2003 226 355
33. G. L. Arnold S. Weyer A. D. Anbar Anal. Chem. 2004 76 322
34. A. D. Anbar O. Rouxel Annu. Rev. Earth Planet. Sci. 2007 35 717
35. C. M. Johnson B. L. Beard Science 2005 309 1025
36. A. D. Anbar Rev. Mineral. Geochem. 2004 55 429
37. A. D. Anbar Earth Planet. Sci. Lett. 2004 217 223
38. B. Beard and C. Johnson, in Fe isotope variations in the modern and ancient Earth and other planetary bodies, 2004, ch. 10A
39. C. M. Johnson, B. L. Beard, E. E. Roden, D. K. Newman and K. H. Nealson, in Isotopic constraints on biogeochemical cycling of Fe, eds., C. M. Johnson, B. L. Beard, and, F. Albarede, Washington, DC, 2004
40. B. L. Beard C. M. Johnson J. L. Skulan K. H. Nealson L. Cox H. Sun Chem. Geol. 2003 195 87
41. L. E. Wasylenki L. J. Liermann R. Mathur G. W. Gordon S. L. Brantley A. D. Anbar J. Anal. At. Spectrom. 2007 10.1039/b705476a
42. B. Bergquist S. John E. Boyle Geochim. Cosmochim. Acta 2005 69 A547
43. S. John B. Bergquist M. Saito E. Boyle Geochim. Cosmochim. Acta 2005 69 A546
44. B. L. Beard C. M. Johnson L. Cox H. Sun K. H. Nealson C. Aguilar Science 1999 285 1889
45. G. A. Icopini S. S. Ruebush M. Tien A. D. Anbar S. L. Brantley Geology 2004 32 205
46. S. L. Brantley L. J. Liermann R. L. Guynn A. Anbar G. A. Icopini J. Barling Geochim. Cosmochim. Acta 2004 68 3189
47. A. D. Anbar J. E. Roe J. Barling K. H. Nealson Science 2000 288 126
48. T. D. Bullen A. F. White C. W. Childs D. V. Vivit M. S. Schulz Geology 2001 29 699
49. J. Barling A. D. Anbar Earth Planet. Sci. Lett. 2004 217 315
50. A. C. Lasaga, in Fundamental approaches in describing mineral dissolution and precipitation rates, eds., S. L. Brantley, and, A. F. White, 1995
51. E. S. Chardon F. R. Livens D. J. Vaughan Earth-Sci. Rev. 2006 78 1
52. T. H. Carlson, Photoelectron and Auger Spectroscopy, Plenum Press, 1975
53. R. Petrovic R. A. Berner M. B. Goldhaber Geochim. Cosmochim. Acta 1976 40 537
54. J. Schott R. A. Berner Geochim. Cosmochim. Acta 1983 47 2233
55. J. B. Neilands, in Microbial metabolism of iron, eds., A. Jacobs, and, M. Wormwood, London, 1980
56. W. J. Page, in Growth conditions for the demonstration of siderophores and iron-repressible outer membrane proteins in soil bacteria, with an emphasis on free-living diazotrophs, eds., L. L. Barton, and, B. C. Hemming, 1993
57. M. N. Hughes and R. K. Poole, in Metal transport, eds., M. N. Hughes, and, R. K. Poole, New York, 1989
58. D. J. Richardson Microbiology 2000 146 551
59. D. J. Lonergan H. L. Jenter J. D. Coates E. J. P. Phillips T. M. Schmidt D. R. Lovley J. Bacteriol. 1996 178 2402
60. D. R. Lovley Microbiol. Rev. 1991 55 259
61. D. R. Lovley, in Environmental Microbe-Metal Interactions, ed., D. R. Lovley, ASM Press, 2000
62. J. M. Zachara J. K. Fredrickson S. C. Smith P. L. Gassman Geochim. Cosmochim. Acta 2001 65 75
63. S. S. Ruebush G. A. Icopini S. L. Brantley M. Tien Geochim. Cosmochim. Acta 2006 70 56
64. M. N. Hughes and R. K. Poole, in Metal nutrition: the supply and analysis of metals in microbial cultures, eds., M. N. Hughes, and, R. K. Poole, New York, 1989
65. W. Stumm and J. J. Morgan, Aquatic Chemistry. An Introduction Emphasizing Chemical Equilibria in Natural Waters, John Wiley and Sons, 1981
66. S. Landergren and F. T. Manheim, in Molybdenum, eds., C. W. Correns, D. M. Shaw, K. K. Turekian, and, J. Zemann, New York, 1974
67. U. Förstner and G. T. W. Wittmann, Metal pollution in the aquatic environment, Springer-Verlag, 1981
68. W. B. Silvester Soil Biol. Biochem. 1989 21 283
69. H. K. Kim D. W. Graham A. A. DiSpirito M. A. Alterman N. Galeva C. K. Larive D. Asunskis P. M. A. Sherwood Science 2004 305 1612
70. K. H. Coale K. W. Bruland Deep-Sea Res. 1990 47 317
71. K. W. Bruland Limnol. Oceanogr. 1989 34 269
72. K. W. Bruland Limnol. Oceanogr. 1992 37 1008
73. M. A. Saito J. W. Moffett S. W. Chisholm J. B. Waterbury Limnol. Oceanogr. 2002 47 1629
74. J. Avias, in Nickel: Element and geochemistry, ed., R. W. Fairbridge, New York, 1972
75. P. Schonheit J. Moll R. K. Thauer Arch. Microbiol. 1979 123 105
76. G. Wachtershauser, 1989, p. 173
77. H. L. Ehrlich, Geomicrobiology, Marcel Dekker, 1990
78. L. Ahonen O. H. Tuovinen Appl. Environ. Microbiol. 1989 55 312
79. J. T. Pronk D. B. Johnson Geomicrobiol. J. 1992 10 153
80. D. B. Johnson FEMS Microbiol. Ecol. 1998 27 307
81. W. Sand K. Rhode B. Sobotke C. Zenneck Appl. Environ. Microbiol. 1992 58 85
82. L. Sam V. Rema P. Devasia K. A. Natarajan Curr. Sci. 1993 65 974
83. U. Schwertmann and R. M. Cornell, in Iron oxides in the laboratory, Weinheim, 2000
84. B. Schwyn J. B. Neilands Anal. Biochem. 1987 160 47
85. L. E. Arnow J. Biol. Chem. 1937 118 531
86. H. L. Buss S. L. Brantley L. J. Liermann Geomicrobiol. J. 2003 20 25
87. R. D. Joerger and P. E. Bishop, in Bacterial alternative nitrogen fixation systems, ed., W. M. O'Leary, 1988
88. R. N. Pau M. E. Eldridge D. J. Lowe L. A. Mitchenall R. R. Eady Biochem. J. 1993 293 101
89. W. J. Page G. A. Grant Can. J. Microbiol. 1988 34 675
90. L. J. Liermann R. L. Guynn A. Anbar S. L. Brantley Chem. Geol. 2005 220 285
91. F. Luque L. A. Mitchenall M. Chapman R. Christine R. N. Pau Mol. Microbiol. 1993 7 447
92. N. J. Mouncey L. A. Mitchenall R. N. Pau J. Bacteriol. 1995 177 5294
93. R. Locci, in Streptomycetes and Related Genera (Section 29), eds., S. T. Williams, M. E. Sharpe, and, J. G. Holt, Baltimore, 1989
94. S. L. Brantley L. Liermann M. Bau S. Wu Geomicrobiol. J. 2001 18 37
95. S. L. Brantley L. Liermann T. D. Bullen Geology 2001 29 535
96. E. M. Hausrath L. J. Liermann S. L. Brantley C. H. House J. G. Ferry Geobiology 2007 5 49
97. D. R. Boone and R. A. Mah, in Methanogenic Archaeobacteria, in Section 25 - Archaeobacteria, eds., H. Konig, K. O. Stetter, J. T. Staley, M. P. Bryant, N. Pfennig, and J. G. Holt, Baltimore, 1989
98. 2, ed., J. G. Ferry, New York, 1993
99. R. K. Watt P. W. Ludden Cell. Mol. Life Sci. 1999 56 604
100. E. M. Hausrath, L. J. Liermann and S. L. Brantley, Eleventh International Symposium on Water-Rock Interaction WRI-11, Saratoga Springs, NY, 2004, p. 1123
101. E. M. Hausrath, L. J. Liermann and S. L. Brantley, Astrobiology Science Conference, NASA, Ames, 2004
102. D. R. Lovley FEMS Microbiol. Rev. 1997 20 305
103. E. E. Roden J. M. Zachara Environ. Sci. Technol. 1996 30 1618
104. C. Liu S. Kota J. M. Zachara J. K. Fredrickson C. K. Brinkman Environ. Sci. Technol. 2001 35 2482
105. J. B. Fein A. M. Martin P. G. Wightman Geochim. Cosmochim. Acta 2001 65 4267
106. J. B. Fein S. Scott N. Rivera Chem. Geol. 2002 182 265
107. N. Yee J. B. Fein C. J. Daughney Geochim. Cosmochim. Acta 2000 64 609
108. T. J. Beveridge W. S. Fyfe Can. J. Earth Sci. 1985 22 1893
109. T. J. Beveridge R. G. E. Murray J. Bacteriol. 1980 141 876
110. K. O. Konhauser FEMS Microbiol. Rev. 1997 20 315
111. D. P. Kelly and A. P. Harrison, in Genus Thiobacillus, ed., J. T. Stalely, Baltimore, 1989
112. T. D. Brock J. Gustafson Appl. Environ. Microbiol. 1976 32 567
113. T. Sugio C. Domatsu O. Munakata T. Tano K. Imai Appl. Environ. Microbiol. 1985 49 1401
114. A. W. Breed G. S. Hansford Miner. Eng. 1999 12 383
115. G. S. Hansford J. Vargas Hydrometallurgy 2001 59 135
116. M. Gericke A. Pinches Miner. Eng. 1999 12 893
117. L. G. Leduc G. D. Ferroni J. T. Trevors World J. Microbiol. Biotechnol. 1997 13 453
118. R. Mathur J. Ruiz S. Titley L. Liermann H. Buss S. Brantley Geochim. Cosmochim. Acta 2005 69 5233
119. R. J. P. Williams J. Inorg. Biochem. 2002 88 241