Photointermediates of the rhodopsin S186A mutant as a probe of the hydrogen-bond network in the chromophore pocket and the mechanism of counterion switch

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 111, Issue 25, 2007, Pages 8843-8848

  Yan, Elsa C Y ^a   Epps, Jacqueline ^b   Lewis, James W ^b   Szundi, Istvan ^b   Bhagat, Aditi ^a   Sakmar, Thomas P ^a   Kliger, David S ^b  

^a ROCKEFELLER UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BATHORHODOPSIN (BATHO); BOVINE RHODOPSIN; PHOTOINTERMEDIATES; RHODOPSIN S186A;

ABSORPTION; CHROMOPHORES; DETERGENTS; HYDROGEN BONDS; PHOTOEXCITATION; PIGMENTS;

PROTEINS;

EID: 34547264066     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp067172o     Document Type: Article

References (39)

1. Hofmann, K. P.; Jäger, S.; Ernst, O. P. Isr. J. Chem. 1995, 35, 339-355.
2. Hug, S. J.; Lewis, J. W.; Einterz, C. M.; Thorgeirsson, T. E.; Kliger, D. S. Biochemistry 1990, 29, 1475-1485.
3. Jäger, S.; Lewis, J. W.; Zvyaga, T. A.; Szundi, I.; Sakmar, T. P.; Kliger, D. S. Biochemistry 1997, 36, 1999-2009.
4. Jäger, S.; Szundi, I.; Lewis, J. W.; Mah, T. L.; Kliger, D. S. Biochemistry 1998, 37, 6998-7005.
5. Kim, J. E.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 8508-8515.
6. Kukura, P.; McCamant, D. W.; Yoon, S.; Wandschneider, D. B.; Mathies, R. A. Science 2005, 310, 1006-1009.
7. Lewis, J. W.; Fan, G. B.; Sheves, M.; Szundi, L; Kliger, D. S. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 10024-10029.
8. Lewis, J. W.; Kliger, D. S. Methods Enzymol. 2000, 315, 164.
9. Lewis, J. W.; Szundi, I.; Kazmi, M. A.; Sakmar, T. P.; Kliger, D. S. Biochemistry 2004, 43, 12614-12621.
10. Li, J.; Edwards, P. C.; Burghammer, M.; Villa, C.; Schertier, G. F. X. J. Mol. Biol. 2004, 343, 1409-1438.
11. Ludeke, S.; Beck, R.; Yan, E. C. Y.; Sakmar, T. P.; Siebert, F.; Vogel, R. J. Mol. Biol. 2005, 353, 345-356.
12. Marin, E. P.; Krishna, A. G.; Archambault, V.; Simuni, E.; Fu, W. Y.; Sakmar, T. P. J. Biol. Chem. 2001, 276, 23873-23880.
13. Min, K. C.; Zvyaga, T. A.; Cypess, A. M.; Sakmar, T. P. J. Biol. Chem. 1993, 268, 9400-9404.
14. Neitz, M.; Neitz, J.; Jacobs, G. H. Science 1991, 252, 971-974.
15. Okada, T.; Fujiyoshi, Y.; Silow, M.; Navarro, J.; Landau, E. M.; Shichida, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 5982-5987.
16. Okada, T.; Sugihara, M.; Bondar, A. N.; Elstner, M.; Entel, P.; Buss, V. J. Mol. Biol. 2004, 342, 571-583.
17. Pan, D.; Ganim, Z.; Kim, J. E.; Mathies, R. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 4857-4864.
18. Randall, C. E.; Lewis, J. W.; Hug, S. J.; Bjorling, S. C.; Eisnershanas, I.; Friedman, N.; Ottolenghi, M.; Sheves, M.; Kliger, D. S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 3473-3485.
19. Reeves, P. J.; Callewaert, N.; Contreras, R.; Khorana, H. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 13419-13424.
20. Reeves, P. J.; Kim, J. M.; Khorana, H. G. Proc. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 13413-13418.
21. Sakmar, T. P.; Franke, R. R.; Khorana, H. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 8309-8313.
22. Schoenlein, R. W.; Peteanu, L. A.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Science 1991, 254, 412.
23. Siebert, F. Isr. J. Chem. 1995, 35, 309-323.
24. Szundi, I.; Lewis, J. W.; Kliger, D. S. Biophvs. J. 1997, 73, 688-702.
25. Szundi, L; Lewis, J. W.; Kliger, D. S. Biochemistry 2003, 42, 5091-5098.
26. Szundi, I.; Lewis, J. W.; Kliger, D. S. Photochem. Photobiol. 2005, 81, 866-873.
27. Teller, D. C.; Okada, T.; Behnke, C. A.; Palczewski, K.; Stenkamp, R. E. Biochemistry 2001, 40, 7761-7772.
28. Van Hooser, J. P.; Aleman, T. S.; He, Y. G.; Cideciyan, A. V.; Kuksa, V.; Pittler, S. J.; Stone, E. M.; Jacobson, S. G.; Palczewski, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8623-8628.
29. Yan, E. C. Y.; Kazmi, M. A.; De, S.; Chang, B. S. W.; Seibert, C.; Marin, E. P.; Mathies, R. A.; Sakmar, T. P. Biochemistry 2002, 47, 3620-3627.
30. Yan, E. C. Y.; Kazmi, M. A.; Ganim, Z.; Hou, J. M.; Pan, D. H.; Chang, B. S. W.; Sakmar, T. P.; Mathies, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 700, 9262-9267.
31. Yao, X. J.; Parnot, C.; Deupi, X.; Ratnala, V. R. P.; Swaminath, G.; Farrens, D.; Kobilka, B. Nat. Chem. Biol. 2006, 2, 417-422.
32. Zhukovsky, E. A.; Oprian, D. D. Science 1989, 246, 928-930.
33. Kochendoerfer, G. G.; Lin, S. W.; Sakmar, T. P.; Mathies, R. A. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 300-305.
34. Chan, T.; Lee, M.; Sakmar, T. P. J. Biol. Chem. 1992, 267, 9478-9480.
35. Huber, T.; Botelho, A. V.; Beyer, K.; Brown, M. F. Biophys. J. 2004, 86, 2078-2100.
36. Yan, E. C. Y.; Gamin, Z.; Kazmi, M. A.; Chang, B. S. W.; Sakmar, T. P.; Mathies, R. A. Biochemistry 2004, 43, 10867-10876.
37. Mathies, R. A.; Lugtenburg, J. The Primary Photoreaction of Rhodopsin, in Molecular Mechanisms in Visual Transduction; Stavenga, D. G., DeGrip, W. J., Pugh, E. N. J., Eds.; Elsevier Science B. V.: Amsterdam, The Netherlands, 2000; pp 55-90.
38. Tallent, J. R.; Hyde, E. W.; Findsen, L. A.; Fox, G. C.; Birge, R. R. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1581-1592.
39. Han, M.; Smith, S. O. Biochemistry 1995, 34, 1425-1432.