Truncation of amidated fragment 33-61 of bovine α-hemoglobin: Effects on the structure and anticandidal activity

Biopolymers - Peptide Science Section

Volumn 88, Issue 3, 2007, Pages 413-426

  Machado, Alessandra ^a   Sforca, Maurício L ^b   Miranda, Antonio ^c   Daffre, Sirlei ^a   Pertinhez, Thelma A ^d   Spisni, Alberto ^d   Miranda, M Terêsa M ^a  

^a UNIVERSITY OF SÃO PAULO   (Brazil)

^b Center for Molecular and Structural Biology   (Brazil)

^c FEDERAL UNIVERSITY OF SÃO PAULO   (Brazil)

^d UNIVERSITY OF PARMA   (Italy)

Author keywords

Antimicrobial peptides; Candida albicans; NMR; Peptide synthesis; Structure activity relationship

Indexed keywords

ANTICANDIDAL ACTIVITY; ANTIMICROBIAL PEPTIDES; CANDIDA ALBICANS; STRUCTURE ACTIVITY RELATIONSHIP;

BIOACTIVITY; CELL MEMBRANES; HEMOGLOBIN; LIVING SYSTEMS STUDIES; MICELLES; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE;

PEPTIDES;

ALPHA HEMOGLOBIN; DODECYL SULFATE SODIUM; HEMOGLOBIN; UNCLASSIFIED DRUG;

ANTIFUNGAL ACTIVITY; ARTICLE; CANDIDA ALBICANS; CARBOXY TERMINAL SEQUENCE; DRUG BINDING; DRUG ISOLATION; DRUG MECHANISM; DRUG STRUCTURE; MINIMUM INHIBITORY CONCENTRATION; NONHUMAN; PROTEIN DOMAIN; STRUCTURE ANALYSIS;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; ANTIFUNGAL AGENTS; CANDIDA ALBICANS; CATTLE; DRUG DESIGN; ELECTROSTATICS; HEMOGLOBINS; HEMOLYSIS; HUMANS; HYDROPHOBICITY; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PEPTIDE FRAGMENTS; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY;

BOVINAE; CANDIDA ALBICANS;

EID: 34248370596     PISSN: 00063525     EISSN: 10970282     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/bip.20688     Document Type: Article

References (55)

1. Brantl, V.; Teschemacher, H.; Henschen, A.; Lottspeich, F. Hoppe Seylers Z Physiol Chem 1979, 360, 1211-1216.
2. Bellamy, W.; Takase, M.; Yamauchi, K.; Wakabayashi, H.; Kawase K.; Tomita, M. Biochim Biophys Acta 1992, 1121, 130-136.
3. Zucht, H.-D.; Raida, M.; Adermann, K.; Mägert, H.-J.; Forssmann, W.-G. FEBS Lett 1995, 372, 185-188.
4. Farnaud, S.; Evans, R. W. Mol Immunol 2003, 40, 395-405.
5. van der Kraan, M. I. A.; Groenink, J.; Nazmi, K.; Veerman, E. C. I.; Bolscher, J. G. M.; Amerongen, A. V. N. Peptides 2004, 25, 177-183.
6. Ivanov, V. T.; Karelin, A. A.; Philippova, M. M.; Nazimov, I. V.; Pletnev, V. Z. Biopolymers 1997, 43, 171-188.
7. Fogaça, A. C.; Silva, P. I., Jr.; Miranda, M. T. M.; Bianchi, A. G.; Miranda, A.; Ribolla, P. E. M.; Daffre, S. J Biol Chem 1999, 274, 25330-25334.
8. Froidevaux, R.; Krier, F.; Nedjar-Arroume, N.; Vercaigne-Marko, D.; Kosciarz, E.; Ruckebusch, C.; Dhulster, P.; Guillochon, D. FEBS Lett 2001, 491, 159-163.
9. Parish, C. A.; Jiang, H.; Tokiwa, Y.; Berova, N.; Nakanishi, K.; McCabe, D.; Zuckerman, W.; Xia, M. M.; Gabay, J. E. Bioorg Med Chem 2001, 9, 377-382.
10. Nakajima, Y.; Ogihara, K.; Taylor, D.; Yamakawa, M. J Med Entomol 2003, 40, 78-81.
11. Liepke, C.; Baxmann, S.; Heine, C.; Breithaupt, N.; Ständker, L.; Forssmann, W.-G. J Chromatogr B 2003, 791, 345-356.
12. Nedjar-Arroume, N.; Dubois-Delval, V.; Miloudi, K.; Daoud, R.; Krier, F.; Kouach, M.; Briand, G.; Gyillochon, D. Peptides 2006, 27, 2082-2089.
13. Mak, P.; Wójcik, K.; Wicherek, L.; Suder, P.; Dubin, A. Peptides 2004, 25, 1839-1847.
14. Situ, H.; Balasubramanian, S. V.; Bobek, L. A. Biochim Biophys Acta 2000, 1475, 377-382.
15. Lequin, O.; Bruston, F.; Convert, O.; Chassaing, G.; Nicolas, P. Biochemistry 2003, 42, 10311-10323.
16. Lee, K. H.; Shin, S. Y.; Hong, J. E.; Yang, S.-T.; Kim, J. I.; Hahm, K.-S.; Kim, Y. Biochem Biophys Res Commun 2003, 309, 591-597.
17. Sforça, M. L.; Machado, A.; Figueredo, R. C. R.; Oyama, S., Jr.; Silva, F. D.; Miranda, A.; Daffre, S.; Miranda, M. T. M.; Spisni, A.; Pertinhez, T. A. Biochemistry 2005, 44, 6440-6451.
18. Gupte, M.; Kulkarni, P.; Gangulli, B. N. Appl Microbiol Biotechnol 2002, 58, 46-57.
19. Fidel, P. L., Jr. Trends Microbiol 2004, 12, 220-227.
20. Won, H.-S.; Jung, S.-J.; Kim, H. E.; Seo, M.-D.; Lee, B.-J. J Biol Chem 2004, 279, 14784-14791.
21. Shalev, D. E.; Mor, A.; Kustanovich, I. Biochemistry 2002, 41, 7312-7317.
22. Sforca, M. L.; Oyama, S., Jr.; Canduri, F.; Lorenzi, C. C. B.; Pertinhez, T. A.; Konno, K.; Souza, B. M.; Palma, M. S.; Neto, J. R.; Azevedo, W. F.; Spisni, A. Biochemistry 2004, 43, 5608-5617.
23. Chou, P. Y.; Fasman, G. D. J Mol Biol 1977, 115, 135-175.
24. Wilmot, C. M.; Thornton, J. M. J Mol Biol 1988, 203, 221-232.
25. Richardson, J. S. Adv Protein Chem 1981, 34, 167-339.
26. Holak, T. A.; Engström, A.; Kraulis, P. J.; Lindeberg, G.; Bennich, H.; Jones, T. A.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Biochemistry 1988, 27, 7620-7629.
27. Kustanovich, I.; Shalev, D. E.; Mikhlin, M.; Gaidukov, L.; Mor, A. J Biol Chem 2002, 277, 16941-16951.
28. Vila-Perelló, M.; Sánchez-Vallet, A.; García-Olmedo, F.; Molina, A.; Andreu, D. J Biol Chem 2005, 280, 1661-1668.
29. Shai, Y. Biochim Biophys Acta 1999, 1462, 55-70.
30. Bechinger, B. Crit Rev Plant Sci 2004, 23, 271-292.
31. Yang S. T.; Jeon J. H.; Kim Y.; Shin S. Y.; Hahm K. S.; Kim J. I. Biochemistry 2006, 45, 1775-1784.
32. Martins, R. M.; Sforça, M. L.; Amino, A.; Juliano, M. A.; Oyama, S., Jr.; Juliano, L.; Pertinhez, T. A.; Spisni, A.; Schenkman, S. Biochemistry 2006, 45, 1765-1774.
33. Shoemaker, K. R.; Kim, P. S.; York, E. J.; Stewart, J. M.; Baldwin, R. L. Nature 1987, 326, 563-567.
34. Maloy W. L.; Kari, U. P. Biopolymers 1995, 37, 105-122.
35. Raguse, T. L.; Porter, E. A.; Weisblum, B.; Gellman, S. H. J Am Chem Soc 2002, 124, 12774-12785.
36. Varanda, L. M.; Miranda, M. T. M. J Pept Res 1997, 50, 102-108.
37. Souza, M. P.; Tavares, M. F. M.; Miranda, M. T. M. Tetrahedron 2004, 60, 4671-4681.
38. Kiyota, S.; Franzoni, L.; Nicastro, G.; Benedetti, A.; Oyama S., Jr.; Viviani, W.; Gambarini, A. G.; Spisni, A.; Miranda, M. T. M. J Med Chem 2003, 46, 2325-2333.
39. Fehlbaum, P.; Bulet, P.; Michaut, L.; Lagueux, M.; Broekaert, W. F.; Hetru, C.; Hoffmann, J. A. J Biol Chem 1994, 269, 33159-33163.
40. Bulet, P.; Dimarcq, J.-L; Hetru, C.; Lagueax, M.; Charlet, M.; Hegy, G.; Dorsselaer, A. V.; Hoffmann, J. A. J Biol Chem 1993, 268, 14893-14897.
41. Silva, P. I., Jr.; Daffre, S.; Bulet, P. J Biol Chem 2000, 275, 33464-33470.
42. Piantini, U.; Sørensen, O. W.; Ernst, R. R. J Am Chem Soc 1982, 104, 6800-6801.
43. Braunschweiler, L.; Ernst, R. R. J Magn Reson 1983, 53, 521-528.
44. Kumar, A.; Ernst, R. R.; Wüthrich, K. Biochem Biophys Res Commun 1980, 95, 1-6.
45. Bax, A.; Davis, D. G. J Magn Reson 1985, 63, 207-213.
46. Piotto, M.; Saudek, V.; Sklenar, V. J Biomol NMR 1992, 2, 661-665.
47. Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pfeifer, J.; Bax, A. J Biomol NMR 1995, 6, 277-293.
48. Johnson, B. A.; Blevins, R. A. J Biomol NMR 1994, 4, 603-61436.
49. Güntert, P.; Mumenthaler, C.; Wüthrich, K. J Mol Biol 1997, 273, 283-298.
50. Pristovšek, P.; Rüterjans, H.; Jerala, R. J Comput Chem 2002, 23, 335-340.
51. Dauber-Osguthorpe, P.; Roberts, V. A.; Osguthorpe, D. J.; Wolff, J.; Genest, M.; Hagler, A. T. Proteins: Struct Funct Genet 1988, 4, 31-47.
52. INSIGHT II User Guide. Biosym Technologies: San Diego, 1995.
53. Laskowski, R. A.; Rullmann, J. A. C.; MacArthur, M. W.; Kaptein, R.; Thornton, J. M. J Biomol NMR 1996, 8, 477-486.
54. Brunger, A. T.; Adams, P. D.; Gore, G. M.; Delano, W. L.; Gros, P.; Grosse-Kunstleve, R. W.; Jiang, J.-S.; Kuszewski, J.; Nilges, N.; Pannu, N. S.; Read, R. J.; Rice, L. M.; Simonson, T.; Warren, G. L. Acta Crystallogr 1998, 54, 905-921.
55. Koradi, R.; Billeter, M.; Wüthrich, K. J Mol Graph 1996, 14, 51-55.