Single particle tracking of complex diffusion in membranes: Simulation and detection of barrier, raft, and interaction phenomena

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 14, 2007, Pages 3625-3632

  Jin, Songwan ^a   Verkman, A S ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALGORITHMS; COMPUTATIONAL METHODS; DIFFUSION; DISTANCE MEASUREMENT; PROBABILITY DENSITY FUNCTION;

COMPUTATIONAL ALGORITHMS; INTERPARTICLE INTERACTIONS; INTRAMEMBRANE BARRIER;

CELL MEMBRANES;

EID: 34248197573     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp067187m     Document Type: Article

References (32)

1. Wilson, K. M.; Morrision, I. E. G.; Simth, P. R.; Fernandez, N.; Cherry, R. J. J. Cell Sci. 1996, 109, 2101.
2. Qian, H.; Sheetz, M. P.; Elson, E. L. Biophys. J. 1991, 60, 910.
3. Kusumi, A.; Sako, Y.; Yamamoto, M. Biophys. J. 1993, 65, 2021.
4. Saxton, M. J.; Jacobson, K. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1997, 26, 373.
5. Daumas, F.; Destainville, N.; Millot, C.; Lopez, A.; Dean, D.; Salome, L. Biophys. J. 2003, 84, 356.
6. Ritchie, K.; Shan, X.-Y.; Kondo, J.; Iwasawa, K.; Fujiwara, T.; Kusumi, A. Biophys. J. 2005, 88, 2266.
7. Helleriegel, C.; Kristein, J.; Bräuchle, C. New J. Phys. 2005, 7, 23.
8. Saxton, M. J. Biophys. J. 1994, 72, 1744.
9. Fujiwara, T.; Ritchie, K.; Murakoshi, H.; Jacobson, K.; Kusumi, A. J. Cell Biol. 2002, 157, 1071.
10. Vriljic, M.; Nishimura, S. Y.; Brasselet, S.; Moerner, W. E.; McConnell, H. M. Biophys. J. 2002, 83, 2681.
11. Murase, K.; Fujiwara, T.; Umemura, Y.; Suzuki, K.; Lino, R.; Yamashita, H.; Saito, M.; Murakoshi, H.; Ritchie, K.; Kusumi, A. Biophys. J. 2004, 86, 4075.
12. Lemke, E. A.; Klingauf, J. J. Neurosci. 2005, 25, 11034.
13. Ölveczky, B. P.; Verkman, A. S. Biophys. J. 1998, 74, 2722.
14. Saxton, M. J. Biophys. J. 1994, 67, 2110.
15. Winckler, B.; Forscher, P.; Mellman, I. Nature 1999, 397, 698.
16. Brown, F. L. H.; Leitner, D. M.; McCammon, J. A.; Wilson, K. R. Biophys. J. 2000, 78, 2257.
17. Andersen, R. G. W.; Jacobson, K. Science 2002, 296, 1821.
18. Maxfield, F. R. Curr. Opin. Cell Biol. 2002, 14, 483.
19. Forstner, M. B.; Martin, D. S.; Navar, A. M.; Käs, J. A. Langmuir 2003, 19, 4876.
20. Saxton, M. J. Biophys. J. 1995, 69, 389.
21. Edidin, M. Trends Cell Biol. 1992, 2, 376.
22. Sako, Y.; Kusumi, A. J. Cell Biol. 1995, 129, 1559.
23. Ritchie, K.; Lino, R.; Fujiwara, T.; Murase, K.; Kusumi, A. Mol. Membr. Biol. 2003, 20, 13.
24. Suzuki, K.; Ritchie, K.; Kajikawa, E.; Fujiwara, T.; Kusumi, A. Biophys. J. 2005, 88, 3659.
25. Kusumi, A.; Nakada, C.; Ritchie, K.; Murase, K.; Suzuki, K.; Murakoshi, H.; Kasai, R. S.; Kondo, J.; Fujiwara, T. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2005, 34, 351.
26. Edidin, M. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2003, 32, 257.
27. Kenworthy, A. K.; Nichols, B. J.; Remmert, C. L.; Hendrix, G. M.; Kumar, M.; Zimmerberg, J.; Lippincott-Schwartz, J. J. Cell Biol. 2004, 165, 735.
28. Brown, D. A.; London, E. J. Biol. Chem. 2000, 275, 17221.
29. Simons, K.; Toomre, D. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2000, 7, 31.
30. Ono, A.; Freed, E. O. PNAS 2001, 98, 13925.
31. Schütz, G. J.; Kada, G.; Pastushenko, V. Ph.; Schindler, H. EMBO J. 2000, 19, 892.
32. Verbavatz, J.-M.; Ma, T.; Gobin, R.; Verkman, A. S. J. Cell Sci. 1997, 110, 2855.