NopM and NopD are rhizobial nodulation outer proteins: Identification using LC-MALDI and LC-ESI with a monolithic capillary column

Journal of Proteome Research

Volumn 6, Issue 3, 2007, Pages 1029-1037

  Rodrigues, João A ^a   López Baena, Francisco Javier ^b   Ollero, Francisco Javier ^b   Vinardell, José María ^b   Espuny, María Del Rosario ^b   Bellogín, Ramon A ^b   Ruiz Sainz, José Enrique ^b   Thomas, Jerry R ^a   Sumpton, Dave ^a   Ault, James ^a   Thomas Oates, Jane ^a  

^a UNIVERSITY OF YORK   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY OF SEVILLE   (Spain)

Author keywords

Electrospray; MALDI; Monolithic columns; nanoLC MS; Nodulation outer proteins; Sinorhizobium fredii HH103; Soybean; Type III secretion system

Indexed keywords

BACTERIAL PROTEIN; DIVINYLBENZENE; POLYSTYRENE; PROTEIN NOPD; PROTEIN NOPM; UNCLASSIFIED DRUG;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; BACTERIAL STRAIN; ELECTROSPRAY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; NODULATION; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEOMICS; RHIZOBIACEAE; SINORHIZOBIUM FREDII;

BACTERIAL OUTER MEMBRANE PROTEINS; BACTERIAL PROTEINS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; NANOTECHNOLOGY; SINORHIZOBIUM FREDII; SOYBEANS; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

GLYCINE MAX; SINORHIZOBIUM FREDII;

EID: 33947591782     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr060519f     Document Type: Article

References (41)

1. Geurts, R.; Bisseling, T. Rhizobium Plant Cell supplement 2002, S239-S249.
2. Gage, D. J. Mol. Biol. Rev. 2004, 68, 280-300.
3. Perret, X.; Staehelin, C.; Broughton, W. J. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2000, 64, 180-201.
4. Hueck, C. J. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998, 62, 373-433.
5. Pallen, M. J.; Chaudhuri, R. R.; Henderson, I. R. Curr. Opin. Microbiol. 2003, 6, 519-527.
6. Viprey, V.; del Greco, A.; Golinowski, W.; Broughton, W. J.; Perret, X. Mol. Microbiol. 1998, 28, 1381-1389.
7. Krishnan, H. B.; Lorio, J.; Kim, W. S.; Jiang, G.; Kim, K. Y.; DeBoer, M.; Pueppke, S. Mol. Plant Microbe. Interact. 2003, 16, 617-625.
8. de Lyra, M. C. C. P.; López-Baena, F. J.; Madinabeitia, N.; Vinardell, J. M.; Espuny, M. R.; Cubo, M. T.; Bellogín, R. A.; Ruiz-Sainz, J. E.; Ollero, F. J. Int. Microbiol. 2006, 9, 125-133.
9. Vinardell, J. M.; Ollero, F. J.; Hidalgo, A.; López-Baena, F. J.; Medina, C.; Ivanov-Vangelov, K.; Parada, M.; Madinabeitia, N.; Espuny, M. R.; Bellogín, R. A.; Camacho, M.; Rodríguez-Navarro, D. N.; Soria-Díaz, M. E.; Gil-Serrano, A. M.; Ruiz-Sainz, J. E. Mol. Plant Microbe. Interact. 2004, 17, 676-685.
10. Kaneko, T.; Nakamura, Y.; Sato, S.; Asamizu, E.; Kato, T.; Sasamoto, S.; Watenabe, A.; Idesawa, K.; Ishikawa, A.; Kawashima, K.; Kimura, T.; Kishida, Y.; Kiyokawa, C.; Kohara, M.; Matsumoto, M.; Matsuno, A.; Mochizuki, Y.; Nakazaki, N.; Shimpo, S.; Sugimoto, M.; Takeuchi, C.; Yamada, M.; Tabata, S. DNA Res. 2000, 7, 331-338.
11. Krause, A.; Doerfel, A.; Göttfert, M. Mol. Plant Microbe. Interact. 2002, 15, 1228-1235.
12. Marie, C.; Deakin, W. J.; Viprey, V.; Kopcinska, J.; Golinowski, W.; Krishnan, H. B.; Perret, X.; Broughton, W. J. Mol. Plant Microbe. Interact. 2003, 16, 743-751.
13. Ausmees, N.; Kobayashi, H.; Deakin, W. J.; Marie, C.; Krishnan, H. B.; Broughton, W. J.; Perret, X. J. Bacteriol. 2004, 186, 4774-4780.
14. Deakin, W. J.; Marie, C.; Saad, M. M.; Krishnan, H. B.; Broughton, W. J. Mol. Plant Microbe. Interact. 2005, 18, 499-507.
15. Saad, M. M.; Kobayashi, H.; Marie, C.; Brown, I. R.; Mansfield, J. W.; Broughton, W. J.; Deakin, W. J. J. Bacteriol. 2005, 187, 1173-1181.
16. Bartsev, A. V.; Boukli, N. M.; Deakin, W. J.; Staehelin, C.; Broughton, W. J. FEBS Lett. 2003, 554, 271-274.
17. Bartsev, A. V.; Deakin, W. J.; Boukli, N. M.; McAlvin, C. B.; Stacey, G.; Malnoe, P.; Broughton, W. J.; Staehelin, C. Plant Physiol. 2004, 134, 871-879.
18. Skorpil, P.; Saad, M. M.; Boukli, N. M.; Kobayashi, H.; Ares-Orpel, F.; Broughton, W. J.; Deakin, W. J. Mol. Microbiol. 2005, 57, 1304-1317.
19. Krishnan, H. B. J. Bacteriol. 2002, 184, 831-839.
20. Lorio, J. C.; Kim, W. S.; Krishnan, H. B. Mol. Plant Microbe. Interact. 2004, 17, 1259-1268.
21. Süss, C.; Hempel, J.; Zehner, S.; Krause, A.; Patschkowski, T.; Göttfert, M. J. Biotechnol. 126, 69-77.
22. Keyser, H. H.; Bohlool, B. B.; Hu, T. S.; Weber, D. F. Science 1982, 215, 1631-1632.
23. Balatti, P. A.; Pueppke, S. G. Plant Physiol. 1990, 94, 1276-1281.
24. Buendía-Clavería, A. M.; Chamber, M.; Ruiz-Sainz, J. E. Syst. Appl. Bacteriol. 1989, 17, 155-160.
25. Froehlich, J. E.; Wilkerson, C. G.; Ray, W. K.; McAndrew, R. S.; Osteryoung, K. W.; Gage, D. A.; Phinney, B. S. J. Proteome Res. 2003, 2, 413-425.
26. Bodnar, W. M.; Blackburn, R. K.; Krise, J. M.; Moseley, M. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2003, 14, 971-979.
27. Shevchenko, A.; Wilm, M.; Vorm, O.; Mann, M. Anal. Chem. 1996, 68, 850-858.
28. Kussmann, M.; Lassing, U.; Stumer, C. A.; Przybylski, M.; Roepstorff, P. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 483-493.
29. Wang, Q. C.; Svec, F.; Fréchet, J. M. F. Anal. Chem. 1993, 65, 2243-2248.
30. Wang, Q. C.; Svec, F.; Fréchet, J. M. F. J. Chromatogr. A. 1994, 669, 230-235.
31. Stapels, M. D.; Barofsky, D. F. Anal. Chem. 2004, 76, 5423-5430.
32. Premstaller, A.; Oberacher, H.; Walcher, W.; Timperio, A. M.; Zolla, L.; Chervet, J. P.; Cavusoglu, N.; van Dorsselaer, A.; Huber, C. G. Anal. Chem. 2001, 73, 2390-2396.
33. Ivanov, A. R.; Zang, L.; Karger, B. L. Anal. Chem. 2003, 75, 5306-5316.
34. Buttner, D.; Bonas, U. EMBO J. 2002, 21, 5313-5322.
35. Bellato, C.; Krishnan, H. B.; Cubo, T.; Temprano, F.; Pueppke, S. G. Microbiol. 1997, 143, 1381-1388.
36. Skrzypek, E.; Cowan, C.; Straley, S. C. Mol. Microbiol. 1998, 30, 1051-1065.
37. Benabdillah, R.; Mota, L. J.; Lützelschwab, S.; Demoinet, E.; Cornelis, G. R. Microb. Pathog. 2004, 36, 247-261.
38. Cornellis, G. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 2000, 97, 8778-8783.
39. Hotson, A.; Chosed, R.; Shu, H.; Orth, K.; Mudgett, M. B. Mol. Microbiol. 2003, 50, 377-389.
40. Hubber, A.; Vergunst, A. C.; Sullivan, J. C.; Hooykaas, P. J.; Ronson, G W. Mol. Microbiol. 2004, 54, 561-574.
41. Marie, C.; Deakin, W. J.; Ojanen-Reuhs, T.; Diallo, E.; Reuhs, B.; Broughton, W. J.; Perret, X. Mol. Plant Microbe. Interact. 2004, 17, 958-966.