Solvent effect on conical intersections in excited-state 9H-adenine: Radiationless decay mechanism in polar solvent

Journal of the American Chemical Society

Volumn 129, Issue 10, 2007, Pages 2901-2909

  Yamazaki, Shohei ^a   Kato, Shigeki ^a  

^a KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DISINTEGRATION; ELECTRON CORRELATIONS; ELECTRON ENERGY LEVELS; EXCITED STATES; FREE ENERGY; GEOMETRY;

FREE ENERGY SURFACE; GEOMETRY OPTIMIZATIONS; MOLLER-PLESSET METHOD; POLAR SOLVENT;

SOLVENTS;

ACETONITRILE; ADENINE; NUCLEIC ACID BASE;

AQUEOUS SOLUTION; ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; DECOMPOSITION; ENERGY; GAS; GEOMETRY; MOLECULAR DYNAMICS; SOLVENT EFFECT;

ADENINE; BINDING SITES; GASES; SOLUTIONS; SOLVENTS; THERMODYNAMICS;

EID: 33947211174     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja0669169     Document Type: Article

References (54)

1. Crespo-Hernández, C. E.; Cohen, B.; Hare, P. M.; Kohler, B. Chem. Rev. 2004, 104, 1977-2019.
2. Kang, H.; Lee, K. T.; Jung, B.; Ko, Y. J.; Kim, S. K. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 12958-12959.
3. Kang, H.; Jung, B.; Kim, S. K. J. Chem. Phys. 2003, 118, 6717-6719.
4. Canuel, C.; Mons, M.; Piuzzi, F.; Tardivel, B.; Dimicoli, I.; Elhanine, M. J. Chem. Phys. 2005, 122, 074316.
5. Ritze, H.-H.; Lippert, H.; Samoylova, E.; Smith, V. R.; Hertel, I. V.; Radloff, W.; Schultz, T. J. Chem. Phys. 2005, 122, 224320.
6. Samoylova, E.; Lippert, H.; Ullrich, S.; Hertel, I. V.; Radloff, W.; Schultz, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1782-1786.
7. Ullrich, S.; Schultz, T.; Zgierski, M. Z.; Stolow, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2262-2263.
8. Ullrich, S.; Schultz, T.; Zgierski, M. Z.; Stolow, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2796-2801.
9. Satzger, H.; Townsend, D.; Zgierski, M. Z.; Patchkovskii, S.; Ullrich, S.; Stolow, A. Prof. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 10196-10201.
10. Gustavsson, T.; Sharonov, A.; Onidas, D.; Markovitsi, D. Chem. Phys. Lett. 2002, 356, 49-54.
11. Pancur, T.; Schwalb, N. K.; Renth, F.; Temps, F. Chem. Phys. 2005, 313, 199-212.
12. Cohen, B.; Hare, P. M.; Kohler, B. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13594-13601.
13. Lührs, D. C.; Viallon, J.; Fischer, I. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 1827-1831.
14. Sobolewski, A. L.; Domcke, W.; Dedonder-Lardeux, C.; Jouvet, C. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 1093-1100.
15. Sobolewski, A. L.; Domcke, W. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 369-374.
16. Marian, C. M. J. Chem. Phys. 2005, 122, 104314.
17. Perlin, S.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 6257-6265.
18. Perun, S.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. Chem. Phys. 2005, 313, 107-112.
19. Nielsen, S. B.; Sølling, T. I. ChemPhysChem 2005, 6, 1276-1281.
20. Matsika, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 7538-7545.
21. Chen, H.; Li, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8443-8446.
22. Blancafort, L. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 210-219.
23. Serrano-Andrés, L.; Merchán, M.; Borin, A. C. Chem.-Eur. J. 2006, 12, 6559-6571.
24. Ismail, N.; Blancafort, L.; Olivucci, M.; Kohler, B.; Robb, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124. 6818-6819.
25. Merchán, M.; Serrano-Andrés, L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8108-8109.
26. Matsika, S. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7584-7590.
27. Zcierski, M. Z.; Patchkovskii, S.; Fujiwara, T.; Lim. E. C. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 9384-9387.
28. Chen, H.; Li, S. J. Chem. Phys. 2006, 124, 154315.
29. Mennucci, B.; Toniolo, A.; Tomasi, J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 4749-4757.
30. Gustavsson, T.; Bányász, Á.; Lazzarotto, E.; Markovitsi, D.; Scalmani, G.; Frisch, M. J.; Barone, V.; Improta. R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 607-619.
31. Gustavsson, T.; Sarkar, N.; Lazzarotto, E.; Markovitsi, D.; Barone, V.; Improta, R. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 12843-12847.
32. Toniolo, A.; Granucci, G.; Martinez, T. J. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 3822-3830.
33. Burghardt, I.; Cederbaum, L. S.; Hynes, J. T. Faraday Discuss. 2004, 127, 395-411.
34. Yamazaki, S.; Kato, S. J. Chem. Phys. 2005, 123, 114510.
35. Ten-no, S.; Hirata, F.; Kato, S. J. Chem. Phys. 1994, 100, 7443-7453.
36. Sato, H.; Hirata, F.; Kato, S. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1546-1551.
37. Hirao, K. Chem. Phys. Lett. 1992, 190, 374-380.
38. Nakano, H. J. Chem. Phys. 1993, 99, 7983-7992.
39. Dunning, T. H., Jr.; Hay, P. J. In Methods of Electronic Structure Theory; Schaefer, H. F., III, Ed.; Plenum: New York, 1977.
40. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. In Intermolecular Forces; Pullman, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, 1981; pp 331-342.
41. Jorgensen, W. L.; Briggs, J. M. Mol. Phys. 1988, 63, 547-558.
42. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197.
43. Singer, S. J.; Chandler, D. Mol. Phys. 1985, 55, 621-625.
44. Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell, W. D.; Kollman. P. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269-10280.
45. Witek, H. A.; Choe, Y.-K.; Finley, J. P.; Hirao, K. J. Comput. Chem. 2002, 23, 957-965.
46. Werner, H.-J. et al. MOLPRO, version 2002.6; Birmingham, U.K., 2003; see http://www.molpro.net.
47. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S.; Windus, T. L.; Dupuis, M.; Montgomery, J. A., Jr. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347-1363.
48. Clark, L. B.; Peschel, G. G.; Tinoco, I., Jr. J. Phys. Chem. 1965, 69, 3615-3618.
49. Voet, D.; Gratzer, W. B.; Cox, R. A.; Doty, P. Biopolymers 1963, 1, 193-208.
50. Yarkony, D. R. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 6277-6293.
51. Callis, P. R. Ann. Rev. Phys. Chem. 1983, 34, 329-357.
52. Daniels, M.; Hauswirth, W. Science 1971, 171, 675-677.
53. Kühl, A.; Domcke, W. J. Chem. Phys. 2002, 116, 263-274.
54. Cederbaum, L. S.; Gindensperger, E.; Burghardt, I. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 113003.