Positional Co-regulation of transcription factors in Saccharomyces cerevisiae

Journal of the Korean Physical Society

Volumn 50, Issue 1 I, 2007, Pages 332-336

  Nguyen, Cuong ^a   Yoon, Chang No ^a   Han, Seung Kee ^a   Pham, Doan Lan ^a   Kim, Hak Yong ^a  

^a Chungbuk National University   (South Korea)

Author keywords

Operon like motif; Positional co regulation; Transcriptional regulatory network

Indexed keywords

EID: 33846692802     PISSN: 03744884     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (23)

1. T. I. Lee, N. J. Rinaldi, F. Robert, D. T. Odom, Z. Bar-Joseph, G. K. Gerber, N. M. Hannett, C. T. Harbison, C. M. Thompson, I. Simon, J. Zeitlinger, E. G. Jennings, H. L. Murray, D. B. Gordon, B. Ren, J. J. Wyrick, J. B. Tagne, T. L. Volkert, E. Fraenkel, D. K. Gifford and R. A. Young, Science. P 298, 799 (2002).
2. R. Albert, J. Cell. Sci. 118, 4947 (2005).
3. A. S. Seshasayee, P. Bertone, G. M. Fraser and N. M. Luscombe, Curr. Opin. Microbiol. 9, 511 (2006).
4. D. F. Veiga, F. F. Vicente and G. Bastos, Genet. Mol. Res. 5, 254 (2006).
5. A. Wagner and J. Wright, Biosystems (in press, 2006).
6. C. N. Yoon, S. K. Han and H. Y. Kim, J. Korean Phys. Soc. 44, 638 (2004);
7. K.-I. Koh, B. Kahng and D. Kim, J. Korean Phys. Soc. 46, 551 (2005);
8. B. Kim, J. Korean Phys. Soc. 46, 722 (2005).
9. S. S. Shen-Orr, R. Milo, S. Mangan and U. Alon, Nat. Genet. 31, 64 (2002).
10. Y. H. Chang, Y. C. Wang and B. S. Chen, Bioinformatics. 22, 2276 (2006).
11. N. K. Goto, T. Zor, M. Martinez-Yamout, H. J. Dyson and P. E. Wright, J. Biol. Chem. 277, 43168 (2002).
12. S. Kruglyak and H. Tang, Trends Genet. 16, 109 (2000).
13. V. Matys, E. Fricke, R. Geffers, E. Gossling, M. Haubrock, R. Hehl, K. Hornischer, D. Karas, A. E. Kel, O. V. Kel-Margoulis, D. U. Kloos, S. Land, B. Lewicki-Potapov, H. Michael, R. Munch, I. Reuter, S. Rotert, H. Saxel, M. Scheer, S. Thiele and E. Wingender, Nucleic. Acids. Res. 31, 374 (2003).
14. C. T. Harbison, D. B. Gordon, T. I. Lee, N. J. Rinaldi, K. D. Macisaac, T. W. Danford, N. M. Hannett, J. B. Tagne, D. B. Reynolds, J. Yoo, E. G. Jennings, J. Zeitlinger, D. K. Pokholok, M. Kellis, P. A. Rolfe, K. T. Takusagawa, E. S. Lander, D. K. Gifford, E. Fraenkel and R. A. Young, Nature. 431, 99 (2004).
15. P. T. Spellman, G. Sherlock, M. Q. Zhang, V. R. Iyer, K. Anders, M. B. Eisen, P. O. Brown, D. Botstein and B. Futcher, Mol. Biol. Cell. 9, 3273 (1998).
16. S. Chu, J. DeRisi, M. Eisen, J. Mulholland, D. Botstein, P. O. Brown and I. Herskowitz, Science. 282, 699 (1998).
17. A. P. Gasch, P. T. Spellman, C. M. Kao, O. Carmel-Harel, M. B. Eisen, G. Storz, D. Botstein and P. O. Brown, Mol. Biol. Cell. 11, 4241 (2000).
18. K. J. Travers, C. K. Patil, L. Wodicka, D. J. Lockhart, J. S. Weissman and P. Walter, Cell. 101, 249 (2000).
19. S. A. Teichmann and M. M. Babu, Nat. Genet. 36, 492 (2004).
20. M. J. De Hoon, S. Imoto, K. Kobayashi, N. Ogasawara and S. Miyano, Pac. Symp. Biocomputing 9 (Hawaii, 2004).
21. B. A. Cohen, R. D. Mitra, J. D. Hughes and G. M. Church, Nat. Genet. 26, 183 (2000).
22. R. J. Cho, M. J. Campbell, E. A. Winzeler, L. Steinmetz, A. Conway, L. Wodicka, T. G. Wolfsberg, A. E. Gabrielian, D. Landsman, D. J. Lockhart and R. W. Davis, Mol. Cell. 2, 65 (1998).
23. B.-G. Yoon and M. Choi, J. Korean Phys. Soc. 47, 1053 (2005).