Affibody molecules in protein capture microarrays: Evaluation of multidomain ligands and different detection formats

Journal of Proteome Research

Volumn 6, Issue 1, 2007, Pages 171-179

  Renberg, Björn ^a   Nordin, Jon ^a   Merca, Anna ^a   Uhlén, Mathias ^a   Feldwisch, Joachim ^b   Nygren, Per Åke ^a   Karlström, Amelie Eriksson ^a  

^a ALBANOVA UNIVERSITY CENTER   (Sweden)

^b Affibody AB   (Sweden)

Author keywords

Affibody molecule; Multidomain proteins; Protein capture; Protein microarray; Sandwich assay

Indexed keywords

DIMER; FLUORESCENT DYE; IMMUNOGLOBULIN A; IMMUNOGLOBULIN E; IMMUNOGLOBULIN G; INSULIN; LIGAND; MONOMER; TAQ POLYMERASE; TUMOR NECROSIS FACTOR ALPHA;

ARTICLE; CONTROLLED STUDY; CROSS REACTION; HUMAN; INCUBATION TIME; INTERMETHOD COMPARISON; MICROARRAY ANALYSIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN IMMOBILIZATION; PROTEIN TARGETING; SENSITIVITY ANALYSIS; SIGNAL TRANSDUCTION;

BIOTINYLATION; BLOOD PROTEINS; DIMERIZATION; FLUORESCENT DYES; HUMANS; IMMUNOGLOBULIN A; IMMUNOGLOBULIN E; IMMUNOGLOBULIN G; INSULIN; LIGANDS; PROTEIN ARRAY ANALYSIS; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; SIGNAL PROCESSING, COMPUTER-ASSISTED; TUMOR NECROSIS FACTOR-ALPHA;

EID: 33846605022     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr060316r     Document Type: Article

References (37)

1. Ekins, R.; Chu, F.; Micallef, J. J. Biolumin. Chemilumin. 1989, 4 (1), 59-78.
2. Ekins, R. P. J. Pharm. Biomed. Anal. 1989, 7 (2), 155-68.
3. Miller, J. C.; Zhou, H.; Kwekel, J.; Cavallo, R.; Burke, J.; Butler, E. B.; Teh, B. S.; Haab, B. B. Proteomics 2003, 3 (1), 56-63.
4. Schweitzer, B.; Roberts, S.; Grimwade, B.; Shao, W.; Wang, M.; Fu, Q.; Shu, Q.; Laroche, I.; Zhou, Z.; Tchernev, V. T.; Christiansen, J.; Velleca, M.; Kingsmore, S. F. Nat. Biotechnol. 2002, 20 (4), 359-65.
5. Haab, B. B.; Geierstanger, B. H.; Michailidis, G.; Vitzthum, F.; Forrester, S.; Okon, R.; Saviranta, P.; Brinker, A.; Sorette, M.; Perlee, L.; Suresh, S.; Drwal, G.; Adkins, J. N.; Omenn, G. S. Proteomics 2005, 5 (13), 3278-91.
6. Kusnezow, W.; Jacob, A.; Walijew, A.; Diehl, F.; Hoheisel, J. D. Proteomics 2003, 3 (3), 254-64.
7. Fredriksson, S.; Gullberg, M.; Jarvius, J.; Olsson, C.; Pietras, K.; Gustafsdottir, S. M.; Ostman, A.; Landegren, U. Nat. Biotechnol. 2002, 20 (5), 473-7.
8. Uhlén, M.; Björling, E.; Agaton, C.; Szigyarto, C. A.; Amini, B.; Andersen, E.; Andersson, A. C.; Angelidou, P.; Asplund, A.; Asplund, C.; Berglund, L.; Bergstrom, K.; Brumer, H.; Cerjan, D.; Ekstrom, M.; Elobeid, A.; Eriksson, C.; Fagerberg, L.; Falk, R.; Fall, J.; Forsberg, M.; Bjorklund, M. G.; Gumbel, K.; Halimi, A.; Hallin, I.; Hamsten, C.; Hansson, M.; Hedhammar, M.; Hercules, G.; Kampf, C.; Larsson, K.; Lindskog, M.; Lodewyckx, W.; Lund, J.; Lundeberg, J.; Magnusson, K.; Malm, E.; Nilsson, P.; Odling, J.; Oksvold, P.; Olsson, I.; Oster, E.; Ottosson, J.; Paavilainen, L.; Persson, A.; Rimini, R.; Rockberg, J.; Runeson, M.; Sivertsson, A.; Skollermo, A.; Steen, J.; Stenvall, M.; Sterky, F.; Stromberg, S.; Sundberg, M.; Tegel, H.; Tourle, S.; Wahlund, E.; Walden, A.; Wan, J.; Wernerus, H.; Westberg, J.; Wester, K.; Wrethagen, U.; Xu, L. L.; Hober, S.; Ponten, F. Mol. Cell. Proteomics 2005, 4 (12), 1920-1932.
9. Predki, P. F.; Mattoon, D.; Bangham, R.; Schweitzer, B.; Michaud, G. Hum. Antibodies 2005, 14 (1-2), 7-15.
10. Michaud, G. A.; Salcius, M.; Zhou, F.; Bangham, R.; Bonin, J.; Guo, H.; Snyder, M.; Predki, P. F.; Schweitzer, B. I. Nat. Biotechnol. 2003, 21 (12), 1509-12.
11. Haab, B. B.; Dunham, M. J.; Brown, P. O. Genome Biol. 2001, 2 (2), RESEARCH0004.
12. MacBeath, G. Nat. Genet. 2002, 32 Suppl, 526-32.
13. Wingren, C.; Steinhauer, C.; Ingvarsson, J.; Persson, E.; Larsson, K.; Borrebaeck, C. A. Proteomics 2005, 5 (5), 1281-91.
14. Peluso, P.; Wilson, D. S.; Do, D.; Tran, H.; Venkatasubbaiah, M.; Quincy, D.; Heidecker, B.; Poindexter, K.; Tolani, N.; Phelan, M.; Witte, K.; Jung, L. S.; Wagner, P.; Nock, S. Anal. Biochem. 2003, 312 (2), 113-24.
15. Collett, J. R.; Cho, E. J.; Ellington, A. D. Methods 2005, 37 (1), 4-15.
16. Binz, H. K.; Amstutz, P.; Kohl, A.; Stumpp, M. T.; Briand, C.; Forrer, P.; Grutter, M. G.; Plückthun, A. Nat. Biotechnol. 2004, 22 (5), 575-82.
17. Smith, G. P. Science 1985, 228 (4705), 1315-7.
18. Tuerk, C.; Gold, L. Science 1990, 249 (4968), 505-10.
19. Roberts, R. W.; Szostak, J. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94 (23), 12297-302.
20. Hanes, J.; Plückthun, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94 (10), 4937-42.
21. Nord, K.; Nilsson, J.; Nilsson, B.; Uhlén, M.; Nygren, P. Å. Protein Eng. 1995, 8 (6), 601-8.
22. Nord, K.; Gunneriusson, E.; Ringdahl, J.; Ståhl, S.; Uhlén, M.; Nygren, P. Å. Nat. Biotechnol. 1997, 15 (8), 772-7.
23. Wikman, M.; Steffen, A. C.; Gunneriusson, E.; Tolmachev, V.; Adams, G. P.; Carlsson, J.; Ståhl, S. Protein Eng. Des. Sel. 2004, 17 (5), 455-62.
24. Hansson, M.; Ringdahl, J.; Robert, A.; Power, U.; Goetsch, L.; Nguyen, T. N.; Uhlén, M.; Ståhl, S.; Nygren, P. Å. Immunotechnology 1999, 4 (3-4), 237-52.
25. Sandström, K.; Xu, Z.; Forsberg, G.; Nygren, P. Å. Protein Eng. 2003, 16 (9), 691-7.
26. Gräslund, S.; Eklund, M.; Falk, R.; Uhlén, M.; Nygren, P. Å.; Ståhl, S. J. Biotechnol. 2002, 99 (1), 41-50.
27. Rönnmark, J.; Grönlund, H.; Uhlén, M.; Nygren, P. Å. Eur. J. Biochem. 2002, 269 (11), 2647-55.
28. Rönnmark, J.; Kampf, C.; Asplund, A.; Höidén-Guthenberg, I.; Wester, K.; Pontén, F.; Uhlén, M.; Nygren, P. Å. J. Immunol. Methods 2003, 281 (1-2), 149-60.
29. Andersson, M.; Rönnmark, J.; Arestrom, I.; Nygren, P. Å.; Ahlborg, N. J. Immunol. Methods 2003, 283 (1-2), 225-34.
30. Renberg, B.; Nygren, P. Å.; Eklund, M.; Eriksson Karlström, A. Anal. Biochem. 2004, 334 (1), 72-80.
31. Nord, K.; Gunneriusson, E.; Uhlén, M.; Nygren, P. Å. J. Biotechnol. 2000, 80 (1), 45-54.
32. Engfeldt, T.; Renberg, B.; Brumer, H.; Nygren, P. Å.; Eriksson Karlström, A. ChemBioChem 2005, 6 (6), 1043-50.
33. Renberg, B.; Shiroyama, I.; Engfeldt, T.; Nygren, P. Å.; Eriksson Karlström, A. Anal. Biochem. 2005, 341 (2), 334-43.
34. Nilsson, B.; Moks, T.; Jansson, B.; Abrahmsén, L.; Elmblad, A.; Holmgren, E.; Henrichson, C.; Jones, T. A.; Uhlén, M. Protein Eng. 1987, 1 (2), 107-13.
35. Gunneriusson, E.; Nord, K.; Uhlén, M.; Nygren, P. Å. Protein Eng. 1999, 12 (10), 873-8.
36. Nilsson, J.; Bosnes, M.; Larsen, F.; Nygren, P. Å.; Uhlén, M.; Lundeberg, J. Biotechniques 1997, 22 (4), 744-51.
37. Janzi, M.; Ödling, J.; Pan-Hammarström, Q.; Sundberg, M.; Lundeberg, J.; Uhlén, M.; Hammarström, L.; Nilsson, P. Mol. Cell. Proteomics 2005, 4 (12), 1942-7.