Chemical synthesis of triple-labelled three-helix bundle binding proteins for specific fluorescent detection of unlabelled protein

ChemBioChem

Volumn 6, Issue 6, 2005, Pages 1043-1050

  Engfeldt, Torun ^a   Renberg, Björn ^a   Brumer, Harry ^a   Nygren, Per Áke ^a   Karlström, Amelie Eriksson ^a  

^a ALBANOVA UNIVERSITY CENTER   (Sweden)

Author keywords

Affinity proteins; Biosensors; FRET; Peptides; Protein modifications; Solid phase synthesis

Indexed keywords

5 (2 AMINETHYLAMINO) 1 NAPHTHALENESULFONIC ACID; 6 (7 NITROBENZOFURAZAN 4 YLAMINO)HEXANOIC ACID; BINDING PROTEIN; BIOTIN; HEXANOIC ACID DERIVATIVE; IMMUNOGLOBULIN A; IMMUNOGLOBULIN G; NAPHTHALENESULFONIC ACID DERIVATIVE; RESIN; STREPTAVIDIN; SYNTHETIC PEPTIDE; SYNTHETIC PROTEIN; THREE HELIX BUNDLE BINDING PROTEIN; UNCLASSIFIED DRUG;

ANTIBODY DETECTION; ARTICLE; BINDING AFFINITY; BIOSENSOR; CHEMICAL LABELING; CHEMICAL REACTION; CIRCULAR DICHROISM; CONJUGATION; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; IMMOBILIZATION; LABORATORY AUTOMATION; PRIORITY JOURNAL; PROTECTION REACTION; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN ASSEMBLY; PROTEIN FOLDING; PROTEIN STRUCTURE; PROTEIN SYNTHESIS;

BINDING SITES; BIOSENSING TECHNIQUES; BIOTIN; CIRCULAR DICHROISM; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; FLUORESCENT DYES; IMMUNOGLOBULIN A; IMMUNOGLOBULIN G; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; PROTEINS;

EID: 20444507608     PISSN: 14394227     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.200400388     Document Type: Article

References (43)

1. D. Stoll, J. Bachmann, M. F. Templin, T. O. Joos, Drug Discovery Today 2004, 3, 1-41.
2. C. Agaton, J. Galli, I. Hölden Guthenberg, L. Janzon, M. Hansson, A. Asplund, E. Brundell, S. Lindberg, I. Ruthberg, K. Wester, D. Wurtz, C. Höög, J. Lundeberg, S. Stahl, F. Pontén, M. Uhlén, Mol. Cell. Proteomics 2003, 2, 405-414.
3. B. Liu, L. Huang, C. Sihlbom, A. Burlingame, J. D. Marks, J. Mol. Biol. 2002, 315, 1063-1073.
4. P. A. Nygren, A. Skerra, J. Immunol. Methods 2004, 290, 3-28.
5. K. Nord, J. Nilsson, B. Nilsson, M. Uhlén, P. Å. Nygren, Protein Eng. 1995, 8, 601-608.
6. K. Nord, E. Gunneriusson, J. Ringdahl, S. Ståhl, M. Uhlén, P. Å. Nygren, Nat. Biotechnol. 1997, 15, 772-777.
7. K. Nord, E. Gunneriusson, M. Uhlén, P. Å. Nygren, J. Biotechnol. 2000, 80, 45-54.
8. J. Rönnmark, C. Kampf, A. Asplund, I. Höiden-Guthenberg, K. Wester, F. Pontén, M. Uhlén, P. Å. Nygren, J. Immunol. Methods 2003, 281, 149-160.
9. J. Rönnmark, M. Hansson, T. Nguyen, M. Uhlén, A. Robert, S. Ståhl, P. Å. Nygren, J. Immunol. Methods 2002, 261, 199-211.
10. H.W. Hellinga, J. S. Marvin, Trends Biotechnol. 1998, 16, 183-189.
11. M. Takahashi, K. Nokihara, H. Mihara, Chem. Biol. 2003, 10, 53-60.
12. K. Usui, T. Ojima, M. Takahashi, K. Nokihara, H. Mihara, Biopolymers 2004, 76, 129-139.
13. K. Enander, G. T. Dolphin, B. Liedberg, I. Lundström, L. Baltzer, Chem. Eur. J. 2004, 10, 2375-2385.
14. R. M. de Lorimier, J. J. Smith, M. A. Dwyer, L. L. Looger, K. M. Sali, C. D. Paavola, S. S. Rizk, S. Sadigov, D. W. Conrad, L. Loew, H. W. Hellinga, Protein Sci. 2002, 11, 2655-2675.
15. M. Renard, L. Belkadi, N. Hugo, P. England, D. Altschuh, H. Bedouelle, J. Mol. Biol. 2002, 318, 429-442.
16. K. Enander, G. T. Dolphin, L. K. Andersson, B. Liedberg, I. Lundström, L. Baltzer, J. Org. Chem. 2002, 67, 3120-3123.
17. A. P. Wei, D. K. Blumerithal, J. N. Herron, Anal. Chem. 1994, 66, 1500-1506.
18. K. F. Geoghegan, P. J. Rosner, L. R. Hoth, Bioconjugate Chem. 2000, 11, 71-77.
19. A. P. Wei, J. N. Herron, J. Mol. Recognit. 2002, 15, 311-320.
20. T. Förster, Ann. Phys. 1948, 2, 55-75.
21. V. A. Romoser, P. M. Hinkle, A. Persechini, J. Biol. Chem. 1997, 272, 13270-13274.
22. A. Miyawaki, J. Llopis, R. Heim, J. M. McCaffery, J. A. Adams, M. Ikura, R. Y. Tsien, Nature 1997, 388, 882-887.
23. M. Brinkley, Bioconjugate Chem. 1992, 3, 2-13.
24. Fmoc Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach (Eds.: W. C. Chan, P. D. White) Oxford University Press, New York, 2000.
25. J. P. Tam, J. Xu, K. D. Eom, Biopolymers 2001, 60, 194-205.
26. R. David, M. P. Richter, A. G. Beck-Sickinger, Eur. J. Biochem. 2004, 271, 663-677.
27. A. Karlström, P. Å. Nygren, Anal. Biochem. 2001, 295, 22-30.
28. Y. Yang, Tetrahedron Lett. 1994, 35, 9689-9692.
29. J. Rönnmark, H. Grönland, M. Uhlén, P. Å. Nygren, Eur. J. Biochem. 2002, 269, 2647-2655.
30. A. Aletras, K. Barlos, D. Gatos, S. Koutsogianni, P. Mamos, Int. J. Pept. Protein Res. 1995, 45, 488-496.
31. A. Loffet, H. X. Zhang, Int. J. Pept. Protein Res. 1993, 42, 346-351.
32. L. Jendeberg, M. Tashiro, R. Tejero, B. A. Lyons, M. Uhlén, G. T. Montelione, B. Nilsson, Biochemistry 1996, 35, 22-31.
33. M. Tashiro, R. Tejero, D. E. Zimmerman, B. Celda, B. Nilsson, G. T. Montelione, J. Mol. Biol. 1997, 272, 573-590.
34. M. Högbom, M. Eklund, P. Å. Nygren, P. Nordlund, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 3191-3196.
35. E. Wahlberg, C. Lendel, M. Helgstrand, P. Allard, V. Dincbas-Renqvist, A. Hedqvist, H. Berglund, P. A. Nygren, T. Hard, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 3185-3190.
36. L. Jendeberg, B. Persson, R. Andersson, R. Karlsson, M. Uhlén, B. Nilsson, J. Mol. Recognit. 1995, 8, 270-278.
37. F. Albericio, Curr. Opin. Chem. Biol 2004, 8, 211-221.
38. B. D. Larsen, A. Holm, Int. J. Pept. Protein Res. 1994, 43, 1-9.
39. J. K. Myers, T. G. Oas, Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 552-558.
40. K. Nord, O. Nord, M. Uhlén, B. Kelley, C. Ljungqvist, P. Å. Nygren, Eur. J. Biochem. 2001, 268, 4269-4277.
41. E. Kaiser, R. L. Colescott, C. D. Bossinger, P. I. Cook, Anal. Biochem. 1970, 34, 595-598.
42. R. Maurer, B. Meyer, M. Ptashne, J. Mol Biol. 1980, 139, 147-161.
43. U. Rüther, Nucleic Acids Res. 1982, 10, 5765-5772.