One- And two-color photon echo peak shift studies of photosystem I

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 51, 2006, Pages 26303-26312

  Vaswani, Harsha M ^a   Stenger, Jens ^a   Fromme, Petra ^b   Fleming, Graham R ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b ARIZONA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHLOROPHYLL; COMPUTER SIMULATION; ENERGY TRANSFER; HAMILTONIANS; MOLECULAR DYNAMICS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

EXCITONIC COUPLING; MOLECULAR HAMILTONIAN; PHOTON ECHO PEAK SHIFT SPECTROSCOPY;

PHOTONS;

EID: 33846337814     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp061008j     Document Type: Article

References (48)

1. Jordan, P.; Fromme, P.; Witt, H. T.; Klukas, O.; Saenger, W.; Krauss, N. Nature 2001, 411, 909.
2. Fromme, P.; Witt, H. T. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1365, 175.
3. Ben-Shem, A.; Frolow, F.; Nelson, N. FEBS Lett. 2004, 564, 274.
4. Byrdin, M.; Rimke, I.; Schlodder, E.; Stehlik, D.; Roelofs, T. A. Biophys. J. 2000, 79, 992.
5. Gobets, B.; van Grondelle, R. Biochim. Biophys. Acta 2001, 1507, 80.
6. Holzwarth, A. R.; Schatz, G.; Brock, H.; Bittersmann, E. Biophys. J. 1993, 64, 1813.
7. Savikhin, S.; Xu, W.; Chitnis, P. R.; Struve, W. S. Biophys. J. 2000, 79, 1573.
8. Savikhin, S.; Xu, W.; Soukoulis, V.; Chitnis, P. R.; Struve, W. S. Biophys. J. 1999, 76, 3278.
9. Kennis, J. T. M.; Gobets, B.; van Stokkum, I. H. M.; Dekker, J.; van Grondelle, R.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 4485.
10. Melkozernov, A. N.; Lin, S.; Blankenship, R. E. Biochemistry 2000, 39, 1489.
11. Melkozernov, A. N.; Lin, S.; Blankenship, R. E.; Valkunas, L. Biophys. J. 2001, 81, 1144.
12. Gobets, B.; van Amerongen, H.; Monshouwer, R.; Kruip, J.; Roegner, M.; van Grondelle, R.; Dekker, J. Biochim. Biophys. Acta 1994, 1188, 75.
13. Gobets, B.; Dekker, J. P.; van Grondelle, R. Transfer-to-Trap Limited Model of Energy Transfer in Photosystem I. In Photosynthesis: Mechanisms and Effects; Garab, G., Ed.; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, Germany, 1998; p 503.
14. Palsson, L. O.; Dekker, J. P.; Schlodder, E.; Monshouwer, R.; van Grondelle, R. Photosynth. Res. 1996, 48, 239.
15. Palsson, L. O.; Flemming, C.; Gobets, B.; van Grondelle, R.; Dekker, J. P.; Schlodder, E. Biophys. J. 1998, 74, 2611.
16. Gobets, B.; van Stokkum, I. H. M.; van Mourik, F.; Dekker, J. P.; van Grondelle, R. Biophys. J. 2003, 85, 3883.
17. Gobets, B.; van Stokkum, I. H. M.; Rogner, M.; Kruip, J.; Schlodder, E.; Karapetyan, N. V.; Dekker, J. P.; van Grondelle, R. Biophys. J. 2001, 81, 407.
18. Byrdin, M.; Jordan, P.; Krauss, N.; Fromme, P.; Stehlik, D.; Schlodder, E. Biophys. J. 2002, 83, 433.
19. Damjanovic, A.; Vaswani, H. M.; Fromme, P.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 10251.
20. Sener, M. K.; Lu, D. Y.; Ritz, T.; Park, S.; Fromme, P.; Schulten, K. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7948.
21. Sener, M. K.; Park, S.; Lu, D. Y.; Damjanovic, A.; Ritz, T.; Fromme, P.; Schulten, K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 11183.
22. Fleming, G. R.; Yang, M.; Agarwal, R.; Prall, B. S.; Kaufman, L. J.; Neuwahl, F. V. R. Bull. Korean Chem. Soc. 2003, 24, 1081.
23. Vaswani, H. M.; Yang, M.; Damjanovic, A.; Fleming, G. R. The Mechanism of Energy Transfer and Trapping in Photosystem I. In Ultrafast Molecular Events in Chemistry and Biology; Martin, M. M., Hynes, J. T., Eds.; Elsevier: New York, 2004; Vol. 6; p 401.
24. Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2000, 113, 2823.
25. Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1999, 111, 27.
26. Agarwal, R.; Rizvi, A. H.; Prall, B. S.; Olsen, J. D.; Hunter, C. N.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. A. 2002, 106, 7573.
27. Agarwal, R.; Yang, M.; Xu, Q.-H.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B2001, 105, 1887.
28. Jimenez, R.; van Mourik, F.; Yu, J. Y.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7350.
29. Yu, J.-Y.; Nagasawa, Y.; van Grondelle, R.; Fleming, G. R. Chem. Phys. Lett. 1997, 280, 404.
30. Cho, M.; Yu, J.-Y.; Joo, T.; Nagasawa, Y.; Passino, S. A.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11944.
31. Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1999, 110, 2983.
32. Prall, B. S. Femtosecond degenerate four-wave mixing: the two-color photon echo peak shift. Ph.D. Thesis, University of California, Berkeley, 2005.
33. Prall, B. S.; Parkinson, D. Y.; Yang, M.; Ishikawa, N.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2004, 120, 2537.
34. Agarwal, R.; Prall, B. S.; Rizvi, A. H.; Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2002, 116, 6243.
35. Cho, M.; Vaswani, H. M.; Brixner, T.; Stenger, J.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10542.
36. Joo, T. H.; Jia, Y. W.; Yu, J. Y.; Lang, M. J.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1996, 104, 6089.
37. de Boeij, W. P.; Pshenichnikov, M. S.; Wiersma, D. A. Annu. Rev. Phys. Chem. 1998, 49, 99.
38. de Boeij, W. P.; Pshenichnikov, M. S.; Wiersma, D. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11806.
39. Joo, T.; Jia, Y. W.; Fleming, G. R. Opt. Lett. 1995, 20, 389.
40. Yang, M.; Damjanovic, A.; Vaswani, H. M.; Fleming, G. R. Biophys. J. 2003, 85, 140.
41. Gillie, J. K.; Small, G. J.; Golbeck, J. H. J. Phys. Chem. 1989, 93, 1620.
42. Zucchelli, G.; Jennings, R. C.; Garlaschi, F. M.; Cinque, G.; Bassi, R.; Cremonesi, O. Biophys. J. 2002, 82, 378.
43. Agarwal, R.; Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Yang, M.; Yom, J.; Mets, L.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 2908.
44. Vaswani, H. M. A theoretical and femtosecond spectroscopic investigation of energy transfer in photosynthetic complexes. Ph.D. Thesis, University of California, Berkeley, 2005.
45. Cho, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2005, 123, 114506.
46. Brixner, T.; Stenger, J.; Vaswani, H. M.; Cho, M.; Blankenship, R. E.; Fleming, G. R. Nature 2005, 343, 625.
47. Prall, B. S.; Parkinson, D. Y.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2005, 123, 054515.
48. Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2003, 119, 5614.