Three pulse photon echo peak shift study of the B800 band of the LH2 complex of rpsacidophila at room temperature: A coupled master equation and nonlinear optical response function approach

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 105, Issue 9, 2001, Pages 1887-1894

  Agarwal, Ritesh ^a   Yang, Mino ^a   Xu, Qing Hua ^a   Fleming, Graham R ^a  

^a LAWRENCE BERKELEY NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION SPECTROSCOPY; BAND STRUCTURE; CHROMOPHORES; COMPUTER SIMULATION; ENERGY TRANSFER; FUNCTIONS; LASER PULSES; MONTE CARLO METHODS; NONLINEAR OPTICS;

THREE PULSE PHOTON ECHO PEAK SHIFT;

PROTEINS;

EID: 0035280602     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0031146     Document Type: Article

References (58)

1. van Grondelle, R.; Dekker, J. P.; Gillbro, T.; Sundström, V. Biocliim. Biophys. Ada 1994, 1187, 1-65.
2. McDermott, G.; Prince, S. M.; Freer, A. A.; HawthornthwaiteLawless, A. M.; Papiz, M. Z.; Cogdell, R. J.; Isaacs, N. W. Nature 1995, 374, 517-521.
3. Koepke, J.; Hu, X.; Muenke, C.; Schulten, K.; Michel, H. Structure 1996, 4, 581-597.
4. van Grondelle, R.; Krarrier, H. J. M.; Rijgersberg, C. P. Biochim. Biophys. Acta 1982, 682, 208-215.
5. van Grondelle, R.; Bergström, H.; Sundström, V.; Gillbro, T. Biochim. Biophys. Ada 1987, 894, 313.
6. Sundström, V.; Pullerits, T.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B . 1999, 103, 2327-2346.
7. Shreve, A. P.; Trautman, J. K.; Frank, H. A.; Owens, T. G.; Albrecht, A. C. Biochim. Biophys. Acta 1991, 1058, 280-288.
8. Hess, S.; Feldchtein, F.; Rabin, A.; Nurgaleev, I.; Pullerits, T.; Sergeev, A.; Sundström, V. Chain. Phys. Lett. 1993, 216, 247-257.
9. Hess, S.; akesson, E.; Cogdell, R. J.; Pullerits, T.; Sundström, V. Biophys. J. 1995, 69, 2211 -2225.
10. Pullerits, T.; Hess, S.; Herek, J. L.; Sundström, V. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 10560-10567.
11. Jimenez, R.; Dikshit, S. N.; Bradforth, S. E.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 700, 6825-6834.
12. Ma, Y.-Z.; Cogdell, R. J.; Gillbro, T. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 1087.
13. Ma, Y.-Z.; Cogdell, R. J.; Gillbro, T. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 881.
14. Kennis, J. T. M.; Streltsov, A. M.; Fermentier, H.; Aartsma, T. J.; Amesz, J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 8369-8374.
15. Monshouwer, R.; Ortiz de Zarate, I.; van Mourik, F.; van Grondelle, R. Chem. Phys. Lett. 1995, 246, 341-346.
16. Scholes, G. D.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 18541868.
17. Sauer, K.; Cogdell, R. J.; Prince, S. M.; Freer, A.; Isaacs, N. W.; Scheer, H. Photochem. Photobiol. 1996, 64, 564-576.
18. Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 5378-5386.
19. Kuhn, O.; Sundström, V. J. Chem. Phys. 1997, 707, 4154-4164.
20. Kuhn, O.; Renger, T.; Voigt, J.; Sundstrom, V. Trends Photochem. Photobiol. 1997, 4, 213-256.
21. Jimenez, R.; van Mourik, F.; Yu, J. Y.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7350-7359.
22. Monshouwer, R.; Abrahamsson, M.; van Mourik, F.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7241-7248.
23. Chachisvilis, M.; Kuhn, O.; Pullerits, T.; Sundström, V. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7275-7283.
24. Leegwater. J. A. J. Phys. Chem. B 1996, 100, 14403.
25. Meier, T.; Chemyak, V.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7332.
26. Jean, J. M.; Friesner, R. A.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1992, 96, 5827-5842.
27. Förster, T. Delocalized Excitation and Excitation Transfer. In Modem Quantum Chemistry; Sinanoglu, O., Ed.; Academic Press: New York, 1965; Vol. Ill, pp 93-137.
28. Kramer, H. J. M.; van Grondelle, R.; Hunter, C. N.; Westerhuis, W. H. J.; Amesz, J. Biochim. Biophys. Acta 1984, 765, 156-165.
29. Wu, H.-M.; Savikhin, S.; Reddy, N. R. S.; Jankowiak, R.; Cogdell, R. J.; Struve, W. S.; Small, G. J. J. Phys. Chem. 1996, 700, 1087.
30. Wu, H.-M.; Ratsep, M.; Jankowiak, R.; Cogdell, R. J.; Small, G. J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7641.
31. Monshouwer, R.; van Grondelle, R. Biochim. Biophys. Acta 1996, 7275, 70-75.
32. De Caro, C.; Visschers, R. W.; van Grondelle, R.; Völker, S. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 10584-10590.
33. Joo, T.; Jia, Y.; Yu, J.-Y.; Lang, M. J.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1996, 104, 1.
34. Cho, M.; Yu, J.-Y.; Joo, T.; Nagasawa, Y.; Passino, S. A.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11944.
35. Fleming, G. R.; Cho, M. Anna. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 109-134.
36. Yu, J.-Y.; Nagasawa, Y.; van Grondelle, R.; Fleming, G. R. Chem. Phys. Lett. 1997, 280, 404-410.
37. Groot, M.-L.; Yu, J.-Y.; Agarwal, R.; Norris, J. R.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 5923-5931.
38. Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1999, 111, 27.
39. Agarwal, R.; Krueger, B.; Scholes, G. D.; Yang, M.; Yom, J.; Mets, . L.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 2908-2918.
40. Jean, J. M.; Chan, C.-K.; Fleming, G. R. Isr. J. Chem. 1988, 28, 169-175.
41. van Oijen, A. M.; Ketelaars, M.; Kohler, J.; Aartsma, T. J.; Schmidt, J. Biophys. J. 2000, 78, 1570-1577.
42. Passino, S. A.; Yutaka, N.; Joo, T.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. A 1997, 707, 725-731.
43. Joo, T.; Jia, Y.; Yu, J.-Y.; Jonas, D. M.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 700, 2399-2409.
44. Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2000, 113, 2823.
45. Nagasawa, Y.; Passino, S. A.; Joo, T.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1997, 706, 4840-4852.
46. Nagasawa, Y.; Yu, J.-Y.; Cho, M.; Fleming, G. R. Faraday Discuss. 1997, 108, 23-34.
47. Reddy, N. R. S.; Small, G. J.; Seibert, M.; Picorel, R. Chem. Phys. Lett. 1991, 757, 391.
48. Pullerits, T.; van Mourik, F.; Monshouwer, R.; Visschers, R. W.; van Grondelle, R. J. Lumin. 1994, 58, 168.
49. Ohta, K.; Larsen, D. S.; Yang, M.; Fleming, G. R. Submitted for publication in J. Chem. Phys.
50. Kumble, R.; Palese, S.; Visschers, R. W.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1996, 207, 396.
51. Visschers, R. W.; Chang, M. C.; van Mourik, F.; Parkesloach, P. S.; Heller, B. A.; Loach, P. A.; Vangrondelle, R. Biochemistry 1991, 30, 5734-5742.
52. van Oijen, A. M.; Ketelaars, M.; Kohler, J.; Aartsma, T. J.; Schmidt, J. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 9363-9366.
53. van Oijen, A. M.; Ketelaars, M.; Kohler, J.; Aartsma, T. J.; Schmidt, J. Chem. Phys. 1999, 247, 53-60.
54. Tietz, C.; Chekhlov, O.; Drabenstedt, A.; Wrachtmp, J. J. Phys. Chem. B 1999, 705, 6328-6333.
55. Mukamel, S. Principles of Nonlinear Optical Spectroscopy; Oxford University Press: New York, 1995.
56. Frieberg, A.; Timpmann, K.; Ruus, R.; Woodbury, N. W. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 10032-10041.
57. van Oijen, A. M.; Ketelaars, M.; Kohler, J.; Aartsma, T. J.; Schmidt, J. Science 1999, 285, 400.
58. Yang, M.; Agarwal, R.; Fleming, G. R. Submitted for publication in J. Photochem. Photobiol. A Lord Porter Issue.