Collective dynamics of lysozyme in water: Terahertz absorption spectroscopy and comparison with theory

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 47, 2006, Pages 24255-24259

  Xu, Jing ^a   Plaxco, Kevin W ^a   Allen, S James ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION SPECTROSCOPY; COMPUTER SIMULATION; HARMONIC ANALYSIS; HYDRATION; MATHEMATICAL MODELS; MOLECULAR DYNAMICS; OSCILLATORS (ELECTRONIC);

HARMONIC MULTIPLIERS; LYSOZYME; TERAHERTZ DYNAMICS;

PROTEINS;

EID: 33846245528     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp064830w     Document Type: Article

References (32)

1. Brooks, B.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 6571.
2. Brooks, B.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1985, 82, 4995.
3. Chen, Y. A.; Prohofsky, E. W. Biopolymers 1995, 35, 573.
4. Dauber-Osguthorpe, P.; Osguthorpe, D. J.; Stern, P. S.; Moult, J. J. Comput. Phys. 1999, 151, 169.
5. Go, N.; Noguti, T.; Nishikawa, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 3696.
6. Hinsen, K. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1998, 33, 417.
7. Levitt, M.; Sander, C.; Stern, P. S. J. Mol. Biol. 1985, 181, 423.
8. Tama, F.; Gadea, F. X.; Marques, O.; Sanejouand, Y.-H. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2000, 41, 1.
9. van Vlijmen, H. W. T.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 3009.
10. Fisher, B. M.; Walther, M.; Jepsen, P. U. Phys. Med. Biol. 2002, 47, 3807.
11. Fitzgerald, A. J.; Berry, E.; Zinov'ev, N. N.; Homer-Vanniasinkam, S.; Miles, R. E.; Chamberlain, J. M.; Smith, M. A. J. Biol. Phys. 2003, 29, 123.
12. Globus, T. R.; Bykhovskaia, M.; Woolard, D. L.; Gelmont, B. L. J. Phys. D: Appl. Phys. 2003, 36, 1314.
13. Globus, T. R.; Woolard, D. L.; Khromova, T.; Crowe, T. W.; Bykhovskaia, M.; Gelmont, B. L.; Hesler, J.; Samuels, A. C. J. Biol. Phys. 2003, 29, 89.
14. Han, P. Y.; Cho, G. C.; Zhang, X.-C. Opt. Lett. 2000, 25, 242.
15. Markelz, A. G.; Roitberg, A.; Heilweil, E. J. Chem. Phys. Lett. 2000, 320, 42.
16. Markelz, A. G.; Whitmire, S.; Hillebrecht, J.; Birge, R. Phys. Med. Biol. 2002, 47, 3797.
17. Walker, G. C.; Berry, E.; Smye, S. W.; Brettle, D. S. Phys. Med. Biol. 2004, 49, N363.
18. Whitmire, S. E.; Wolpert, D.; Markelz, A. G.; Hillebrecht, J. R.; Galan, J.; Birge, R. Biophys. J. 2003, 85, 1269.
19. Woodward, R. M.; Wallace, V. P.; Arnone, D. D.; Linfeild, E. H.; Pepper, M. J. Biol. Phys. 2003, 29, 257.
20. Zhang, C.; Tarhan, E.; Ramdas, A. K.; Weiner, A. M.; Durbin, S. M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10077.
21. Xu, J.; Plaxco, K. W.; Allen, S. J. Protein Sci. 2006, 15, 1175.
22. Xu, J.; Plaxco, K. W.; Allen, S. J. J. Chem. Phys. 2006, 124, 036101.
23. Smith, D. R.; Loewenstein, E. V. Appl. Opt. 1975, 14, 1335.
24. García de la Torre, J. Biophys. Chem. 2001, 93, 159.
25. Peon, J.; Pal, S. K.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 10964.
26. Perkins, S. J. Biophys. Chem. 2001, 93, 129.
27. Knab, J.; Chen, J.-Y.; Markelz, A. G. Biophys. J. 2006, 90, 2576.
28. Chen, S.-H.; Liu, L.; Fratini, E.; Baglioni, P.; Faraone, A.; Mamontov, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 9012.
29. Kuok, M. H.; Lim, H. S.; Ng, S. C.; Liu, N. N.; Wang, Z. K. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 255502; 91, 149901.
30. Lim, H. S.; Kuok, M. H.; Ng, S. C.; Wang, Z. K. Appl. Phys. Lett. 2004, 84, 4182.
31. Pfeiffer, H.; Heremans, K. Chem. Phys. Lett. 2002, 361, 226.
32. Chang, C.-C.; Yeh, X.-C.; Lee, H.-T.; Lin, P.-Y.; Kan, L.-S. Phys. Rev. E 2004, 70, 011904.