Recent trends in eukaryotic proteomics, glycomics, and lipidomics;Současné trendy v analýze eukaryotických proteomů, glykomů a lipidomů

Chemicke Listy

Volumn 100, Issue 12, 2006, Pages 1084-1095

  Man, Petr ^a   Bezouška, Karel ^a,b  

^a INSTITUTE OF MICROBIOLOGY   (Czech Republic)

^b CHARLES UNIVERSITY   (Czech Republic)

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EID: 33845732639     PISSN: 00092770     EISSN: 12137103     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (71)

1. Patterson S. D., Aebersold R. H.: Nat. Genet. Suppl. 53, 311 (2003).
2. O'Farell P. H.: J. Biol. Chem. 250, 4007 (1975).
3. http://www.hupo.org, 15.3.2005.
4. http://www.EFPS.org, 15.3.2005.
5. Dell A., Morris H. R.: Science 291, 2355 (2001).
6. Lai R.: Cancer 95, 1071 (2002).
7. Ritchie R. F., Palomaki G. E., Neveux L. M., Navolotskaia O.: J. Clin. Lab. Anal. 13, 280 (1999).
8. Uetz P., Giot L., Cagney G., Mansfield T. A.: Nature 403, 623 (2000).
9. Link A.J.: Nat. Biotechnol. 17, 676 (1999).
10. Rabilloud T.: Proteomics 2, 3 (2002).
11. Gorg A.: Electrophoresis 21, 1037 (2000).
12. Karas M., Hillenkamp F.: Anal. Chem. 60, 2299 (1988).
13. Patterson S. D., Aebersold R.: Electrophoresis 16, 1791 (1995).
14. Fenn J. B., Mann M., Meng C. K., Wong S. F., White-house C. M.: Science 246, 64 (1989).
15. Hunt D. F.: Science 256, 1817 (1992).
16. Tureček F.: J. Mass Spectrom. 37, 1 (2002).
17. McConnell S. J., Hoess R. H.: J. Mol. Biol. 250, 460 (1995).
18. Holt L. J., Enever C., de Wildt R. M., Tomlinson I. M.: Curr. Opin. Biotechnol. 11, 445 (2000).
19. Mitchell P. A.: Nat. Biotechnol. 20, 225 (2002).
20. Andersen J. S., Lyon C. E., Fox A. H., Mann M.: Curr. Biol. 12, 1 (2002).
21. Skop A. R., Liu H., Yates J., Meyer B. J., Heald R.: Science 305, 61 (2004).
22. Drickamer K., Taylor M. E.: Genome Biol. 3, 1034.1 (2002).
23. Moniaux N., Andrianifahanana M., Brand R. E., Batra S. K.: Br. J. Cancer 91, 1633 (2004).
24. Gong C. X., Liu F., Zamfir A., Peter-Katalinic J.: Electrophoresis 25, 2649 (2004).
25. Mutoni F., Brockington M., Torelli S., Brown S. C.: Curr. Opin. Neurol. 17, 205 (2004).
26. Bařinka C., Šácha P., Sklenář J., Man P., Bezouška K., Slusher B. S., Konvalinka J.: Protein Sci. 13, 1627 (2004).
27. Pavlíček J., Sopko B., Ettrich R., Kopecky V. Jr, Baumruk V., Man P., Havlíček V., Vrbacký M., Martí nková L., Křen V., Pospíšil M., Bezouška K.: Biochemistry 42, 9295 (2003).
28. Voet D., Voet J. G.: Biochemistry. Wiley, New York (1990).
29. Kornfeld R., Kornfeld S.: Annu. Rev. Biochem. 54, 631 (1985).
30. Moremen K. W.: Biochem. Biophys. Acta 1573, 225 (2002).
31. Hounsell E. F., Davies M. J., Renouf D. V.: Glycoconjugate J. 13, 19 (1996).
32. Cummings R. D.: Methods Enzymol. 230, 66 (1994).
33. Bezouška K., Sklenář J., Novák P., Halada P., Havlíček V., Kraus M., Tichá M., Jonáková V.: Protein Sci. 8, 1551 (1999).
34. Denzinger T., Diekmann H., Bruns K., Laessing U., Stuermer C., Przybylski M.: J. Mass Spectrom. 34, 435 (1999).
35. Harvey D. J.: Mass Spectrom. Rev. 18, 349 (1999).
36. Gates R., Rathbone E., Masterson L., Wright L., Electricwala A.: Glycoprotein Analysis Manual. Sigma-Aldrich (2004).
37. Takasaki S., Misuochi T., Kobata A.: Methods Enzymol. 83, 263 (1982).
38. Edge A. S.: Biochem. J. 376, 239 (2003).
39. Takasaki S., Yamashita K., Kobata A.: J. Biol. Chem. 253, 6068 (1978).
40. http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc, 15.3.2005.
41. http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc, 15.3.2005.
42. http://www.cbs.dtu.dk/services/DictyOGlyc, 15.3.2005.
43. http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang, 15.3.2005.
44. Gonzales J., Takao T., Hon H., Besada V., Rodriguez R., Padron G., Shimonishi Y.: Anal. Biochem. 205, 151 (1992).
45. http://us.expasy.org/tools/glycomod, 15.3.2005.
46. http://www.dkfz.de/spec/glypeps, 15.3.2005.
47. Sullivan B., Addona T. A., Carr S. A.: Anal. Chem. 76, 3112 (2004).
48. Demelbauer U. M., Zehl M., Plematl A., Allmaier G., Rizzi A.: Rapid Commun. Mass Spectrom. 18, 1575 (2004).
49. Gooley A. A., Pisano A., Packer N. H., Ball M., Jones A., Alewood P. F., Redmond J. W., Williams K. L.: Glycoconjate J. 77, 180 (1994).
50. Migorodskaya E., Roepstorff P., Zubarev R. A.: Anal. Chem. 77, 4431 (1999).
51. Hakansson K., Cooper H. J., Emmett M. R., Costello C. E., Marshall A. G., Nilsson C. L.: Anal. Chem. 73, 4530 (2001).
52. Kjeldsen F., Haselmann K. F., Budnik B. A., Sorensen E. S., Zubarev R. A.: Anal. Chem. 75, 2355 (2003).
53. Sutton C. W., Cottrell J. S., v knize: Newer Methods In Glycoprotein and Glycolipids Characterization (Cumming, D., Reinhold, V.N., ed.). Academics Press, London 1994.
54. Sutton C. W., O'Neil J. A., Cottrell J. S.: Anal. Biochem. 218, 34 (1994).
55. Domon B., Costello C. E.: Glycoconjugate J. 5, 397 (1988).
56. Dell A., Reason A. J., Khoo K. H., Panico M., Mc Dowell R. A., Morris H. R.: Methods Enzymol. 230, 108 (1994).
57. Talbo G., Mann M.: Rapid Commun. Mass Spectrom. 10, 100 (1996).
58. Bacher G., Korner R., Atrih A., Foster S. J., Roepstorff P., Allmaier G.: J. Mass Spectrom. 36, 124 (2001).
59. Čmelík R., Štikařovská M., Chmelík J.: J. Mass Spectrom. 39, 1467 (2004).
60. Robbe C., Capon C., Coddeville B., Michalski J. C.: Rapid Commun. Mass Spectrom. 18, 412 (2004).
61. Harvey D. J.: Rapid Commun. Mass Spectrom. 19, 484 (2005).
62. Harvey D. J.: J. Am. Soc. Mass Spectrom. 12, 926 (2001).
63. Jiang Y., Cole R. B.: J. Am. Soc. Mass Spectrom. 16, 60 (2005).
64. Hricovini M.: Curr. Med. Chem. 11, 2526 (2004).
65. Karlsson N. G., Packer N. H.: Anal. Biochem. 305, 173 (2002).
66. Karlsson N. G., Wilson N. L., Wirth H. J., Dawes P., Joshi H., Packer N. H.: Rapid Commun. Mass Spectrom. 18, 2282 (2004).
67. Havlíček V., Higgins L., Chan W., Haiada P., Šebo P., Sakamoto H., Hackett M.: J. Mass Spectrom. 36, 384 (2001).
68. Man P., Novák P., Cebecauer M., Horváth O., Fišerová A., Havlíček V., Bezouška K.: Proteomics 5, 113 (2005).
69. Hunt A. N., Clark G. T., Attard G. S., Postle A. D.: J. Biol. Chem. 276, 8492 (2001).
70. Hunt A. N., Alb J. G., Koster G., Postle A. D., Bankaitis V. A.: Biochem. Soc. Trans. 32, 1063 (2004).
71. Han X., Yang J., Cheng H., Ye H., Gross R. W.: Anal. Biochem. 330, 317 (2004).