메뉴 건너뛰기




Volumn 125, Issue 16, 2006, Pages

The effect of sequence correlation on bubble statistics in double-stranded DNA

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACOUSTIC NOISE; CORRELATION METHODS; FINITE ELEMENT METHOD; RANDOM PROCESSES; STATISTICAL METHODS; THERMAL EFFECTS;

EID: 33750474435     PISSN: 00219606     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1063/1.2359724     Document Type: Article
Times cited : (10)

References (52)
  • 4
    • 19544379865 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.93.108108
    • J. Yan and J. F. Marko, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett. 93.108108 93, 108108 (2004); R. Ranjith, P. B. Sunil Kumar, and G. I. Menon, Phys. Rev. Lett. 94, 138102 (2005).
    • (2004) Phys. Rev. Lett. , vol.93 , pp. 108108
    • Yan, J.1    Marko, J.F.2
  • 5
    • 18244404581 scopus 로고    scopus 로고
    • J. Yan and J. F. Marko, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett. 93.108108 93, 108108 (2004); R. Ranjith, P. B. Sunil Kumar, and G. I. Menon, Phys. Rev. Lett. 94, 138102 (2005).
    • (2005) Phys. Rev. Lett. , vol.94 , pp. 138102
    • Ranjith, R.1    Sunil Kumar, P.B.2    Menon, G.I.3
  • 6
    • 0013952703 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.1727786
    • D. Poland and H. A. Scheraga, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.1727786 45, 1464 (1966); M. E. Fisher, J. Chem. Phys. 45, 1469 (1966).
    • (1966) J. Chem. Phys. , vol.45 , pp. 1464
    • Poland, D.1    Scheraga, H.A.2
  • 7
    • 36849097642 scopus 로고
    • D. Poland and H. A. Scheraga, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.1727786 45, 1464 (1966); M. E. Fisher, J. Chem. Phys. 45, 1469 (1966).
    • (1966) J. Chem. Phys. , vol.45 , pp. 1469
    • Fisher, M.E.1
  • 8
    • 4243187319 scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.62.2755
    • M. Peyrard and A. R. Bishop, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.62.2755 62, 2755 (1989); T. Dauxois, M. Peyrard, and A. R. Bishop, Phys. Rev. E 47, 684 (1993).
    • (1989) Phys. Rev. Lett. , vol.62 , pp. 2755
    • Peyrard, M.1    Bishop, A.R.2
  • 9
    • 12144279970 scopus 로고
    • M. Peyrard and A. R. Bishop, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.62.2755 62, 2755 (1989); T. Dauxois, M. Peyrard, and A. R. Bishop, Phys. Rev. E 47, 684 (1993).
    • (1993) Phys. Rev. E , vol.47 , pp. 684
    • Dauxois, T.1    Peyrard, M.2    Bishop, A.R.3
  • 13
    • 0001277586 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.83.5178
    • S. Cocco and R. Monasson, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett. 83.5178 83, 5178 (1999); J. Rudnick and R. Bruinsma, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.65.030902 65, 030902 (R) (2002); M. Barbi, S. Lepri, M. Peyrard, and N. Theodorakopoulos, Phys. Rev. E 68, 061909 (2003).
    • (1999) Phys. Rev. Lett. , vol.83 , pp. 5178
    • Cocco, S.1    Monasson, R.2
  • 14
    • 37649028048 scopus 로고    scopus 로고
    • 1063-651X 10.1103/PhysRevE.65.030902
    • S. Cocco and R. Monasson, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett. 83.5178 83, 5178 (1999); J. Rudnick and R. Bruinsma, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.65.030902 65, 030902 (R) (2002); M. Barbi, S. Lepri, M. Peyrard, and N. Theodorakopoulos, Phys. Rev. E 68, 061909 (2003).
    • (2002) Phys. Rev. E , vol.65 , pp. 030902
    • Rudnick, J.1    Bruinsma, R.2
  • 15
    • 84983708261 scopus 로고    scopus 로고
    • S. Cocco and R. Monasson, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett. 83.5178 83, 5178 (1999); J. Rudnick and R. Bruinsma, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.65.030902 65, 030902 (R) (2002); M. Barbi, S. Lepri, M. Peyrard, and N. Theodorakopoulos, Phys. Rev. E 68, 061909 (2003).
    • (2003) Phys. Rev. E , vol.68 , pp. 061909
    • Barbi, M.1    Lepri, S.2    Peyrard, M.3    Theodorakopoulos, N.4
  • 16
    • 0034257985 scopus 로고    scopus 로고
    • 1063-651X 10.1103/PhysRevE.62.3958
    • M. S. Causo, B. Coluzzi, and P. Grassberger, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.62.3958 62, 3958 (2000); Y. Kafri, D. Mukamel, and L. Peliti, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.85.4988 85, 4988 (2000); T. Garel, C. Monthus, and H. Orland, Europhys. Lett. 55, 132 (2001).
    • (2000) Phys. Rev. E , vol.62 , pp. 3958
    • Causo, M.S.1    Coluzzi, B.2    Grassberger, P.3
  • 17
    • 0034351060 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.85.4988
    • M. S. Causo, B. Coluzzi, and P. Grassberger, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.62.3958 62, 3958 (2000); Y. Kafri, D. Mukamel, and L. Peliti, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.85.4988 85, 4988 (2000); T. Garel, C. Monthus, and H. Orland, Europhys. Lett. 55, 132 (2001).
    • (2000) Phys. Rev. Lett. , vol.85 , pp. 4988
    • Kafri, Y.1    Mukamel, D.2    Peliti, L.3
  • 18
    • 0035385019 scopus 로고    scopus 로고
    • M. S. Causo, B. Coluzzi, and P. Grassberger, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.62.3958 62, 3958 (2000); Y. Kafri, D. Mukamel, and L. Peliti, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.85.4988 85, 4988 (2000); T. Garel, C. Monthus, and H. Orland, Europhys. Lett. 55, 132 (2001).
    • (2001) Europhys. Lett. , vol.55 , pp. 132
    • Garel, T.1    Monthus, C.2    Orland, H.3
  • 25
    • 0642346608 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.91.148101
    • Y. Zeng, A. Montrichok, and G. Zocchi, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.91.148101 91, 148101 (2003); Y. Zeng, A. Montrichok, and G. Zocchi, J. Mol. Biol. 339, 67 (2004).
    • (2003) Phys. Rev. Lett. , vol.91 , pp. 148101
    • Zeng, Y.1    Montrichok, A.2    Zocchi, G.3
  • 26
    • 2342485985 scopus 로고    scopus 로고
    • Y. Zeng, A. Montrichok, and G. Zocchi, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.91.148101 91, 148101 (2003); Y. Zeng, A. Montrichok, and G. Zocchi, J. Mol. Biol. 339, 67 (2004).
    • (2004) J. Mol. Biol. , vol.339 , pp. 67
    • Zeng, Y.1    Montrichok, A.2    Zocchi, G.3
  • 35
    • 24344507289 scopus 로고    scopus 로고
    • 0295-5075 10.1209/epl/i2005-10144-9
    • S. K. Banik, T. Ambjörnsson, and R. Metzler, Europhys. Lett. 0295-5075 10.1209/epl/i2005-10144-9 71, 852 (2005); T. Ambjörnsson and R. Metzler, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.72.030901 72, 030901 (R) (2005); T. Ambjörnsson and R. Metzler, J. Phys.: Condens. Matter 17, S1841 (2005).
    • (2005) Europhys. Lett. , vol.71 , pp. 852
    • Banik, S.K.1    Ambjörnsson, T.2    Metzler, R.3
  • 36
    • 28844460043 scopus 로고    scopus 로고
    • 1063-651X 10.1103/PhysRevE.72.030901
    • S. K. Banik, T. Ambjörnsson, and R. Metzler, Europhys. Lett. 0295-5075 10.1209/epl/i2005-10144-9 71, 852 (2005); T. Ambjörnsson and R. Metzler, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.72.030901 72, 030901 (R) (2005); T. Ambjörnsson and R. Metzler, J. Phys.: Condens. Matter 17, S1841 (2005).
    • (2005) Phys. Rev. E , vol.72 , pp. 030901
    • Ambjörnsson, T.1    Metzler, R.2
  • 37
    • 18744416836 scopus 로고    scopus 로고
    • S. K. Banik, T. Ambjörnsson, and R. Metzler, Europhys. Lett. 0295-5075 10.1209/epl/i2005-10144-9 71, 852 (2005); T. Ambjörnsson and R. Metzler, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.72.030901 72, 030901 (R) (2005); T. Ambjörnsson and R. Metzler, J. Phys.: Condens. Matter 17, S1841 (2005).
    • (2005) J. Phys.: Condens. Matter , vol.17 , pp. 1841
    • Ambjörnsson, T.1    Metzler, R.2
  • 40
    • 0004256049 scopus 로고    scopus 로고
    • 2nd ed. (McGraw-Hill, New York
    • R. F. Weaver, Molecular Biology, 2nd ed. (McGraw-Hill, New York, 2002).
    • (2002) Molecular Biology
    • Weaver, R.F.1
  • 41
    • 0034687143 scopus 로고    scopus 로고
    • E. Yeramian, Gene 255, 139 (2000).
    • (2000) Gene , vol.255 , pp. 139
    • Yeramian, E.1
  • 43
  • 44
    • 28844464259 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.95.218104
    • T. S. van Erp, S. Cuesta-Lopez, J.-G. Hagmann, and M. Peyrard, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.95.218104 95, 218104 (2005); C. H. Choi, A. Usher, G. Kalosakas, K.. Rasmussen, and A. R. Bishop, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.96.239801 96, 239801 (2006); T. S. van Erp, S. Cuesta-Lopez, J.-G. Hagmann, and M. Peyrard, Phys. Rev. Lett. 96, 239802 (2006).
    • (2005) Phys. Rev. Lett. , vol.95 , pp. 218104
    • Van Erp, T.S.1    Cuesta-Lopez, S.2    Hagmann, J.-G.3    Peyrard, M.4
  • 45
    • 33745205353 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.96.239801
    • T. S. van Erp, S. Cuesta-Lopez, J.-G. Hagmann, and M. Peyrard, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.95.218104 95, 218104 (2005); C. H. Choi, A. Usher, G. Kalosakas, K.. Rasmussen, and A. R. Bishop, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.96.239801 96, 239801 (2006); T. S. van Erp, S. Cuesta-Lopez, J.-G. Hagmann, and M. Peyrard, Phys. Rev. Lett. 96, 239802 (2006).
    • (2006) Phys. Rev. Lett. , vol.96 , pp. 239801
    • Choi, C.H.1    Usher, A.2    Kalosakas, G.3    Rasmussen, K.4    Bishop, A.R.5
  • 46
    • 33745242559 scopus 로고    scopus 로고
    • T. S. van Erp, S. Cuesta-Lopez, J.-G. Hagmann, and M. Peyrard, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.95.218104 95, 218104 (2005); C. H. Choi, A. Usher, G. Kalosakas, K.. Rasmussen, and A. R. Bishop, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.96.239801 96, 239801 (2006); T. S. van Erp, S. Cuesta-Lopez, J.-G. Hagmann, and M. Peyrard, Phys. Rev. Lett. 96, 239802 (2006).
    • (2006) Phys. Rev. Lett. , vol.96 , pp. 239802
    • Van Erp, T.S.1    Cuesta-Lopez, S.2    Hagmann, J.-G.3    Peyrard, M.4
  • 48
    • 0034238118 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007
    • D. K. Lubensky and D. R. Nelson, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 85, 1572 (2001); D. K. Lubensky and D. R. Nelson, Phys. Rev. E 65, 631917 (2002).
    • (2001) Phys. Rev. Lett. , vol.85 , pp. 1572
    • Lubensky, D.K.1    Nelson, D.R.2
  • 49
    • 37649027722 scopus 로고    scopus 로고
    • D. K. Lubensky and D. R. Nelson, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 85, 1572 (2001); D. K. Lubensky and D. R. Nelson, Phys. Rev. E 65, 631917 (2002).
    • (2002) Phys. Rev. E , vol.65 , pp. 631917
    • Lubensky, D.K.1    Nelson, D.R.2


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.