Coarse-grained transmembrane proteins: Hydrophobic matching, aggregation, and their effect on fusion

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 27, 2006, Pages 13614-13623

  Smeijers, A F ^a   Pieterse, K ^a   Markvoort, A J ^a   Hilbers, P A J ^a  

^a EINDHOVEN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL MEMBRANES; CELLS; HYDROPHOBICITY; LIPIDS; MONOLAYERS; TRANSPORT PROPERTIES;

BILAYERS; SPHERICAL VESICLES; TRANSMEMBRANE PROTEINS; VESICLE ENLARGEMENT;

PROTEINS;

EID: 33746453289     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp062012y     Document Type: Article

References (35)

1. Smeijers, A. F.; Markvoort, A. J.; Pieterse, K.; Hilbers, P. A. J. J. Phys. Chem. B, 2006, 110, 13212-13219.
2. Marrink, S. J.; Mark, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11144-11145.
3. Stevens, M. J.; Hoh, J. H.; Woolf, T. B. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 188102.
4. Kol, M. A.; de Kroon, A. I. P. M.; Rijkers, D. T. S.; Killian, J. A.; de Kruijff, B. Biochemistry 2001, 40, 10500-10506.
5. Matsuzaki, K.; Murase, O.; Fujii, N.; Miyajima, K. Biochemistry 1996, 35, 5, 11361-11368.
6. Jahn, R.; Grubmüller, H. Curr. Opin. Cell Biol. 2002, 14, 488-495.
7. Markvoort, A. J.; Pieterse, K.; Steijaart, M. N.; Spijker, P.; Hilbers, P. A. J. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 22649-22654.
8. Sui, H.; Han, B. G.; Lee, J. K.; Walian, P.; Jap, B. K. Nature 2001, 414, 872-878.
9. Nielsen, S. O.; Lopez, C. F.; Srinivas, G.; Klein, M. L. J. Phys.: Condens. Matter 2004, 16, R481-R512.
10. Fujiyoshi, Y.; Mitsuoka, K.; de Groot, B. L.; Philippsen, A.; Grubmüller, H.; Agre, P.; Engel, A. Curr. Opin. Struct. Biol. 2002, 12, 509-515.
11. Tajkhörshid, E.; Nollert, P.; Jensen, M. Ø.; Miercke, L. J. W.; O'Connell, J.; Stroud, R. M.; Schulten, K. Science 2002, 296, 525-530.
12. Lopez, C. F.; Nielsen, S. O.; Ensing, B.; Moore, P. B.; Klein, M. L. Biophys. J. 2005, 88, 3083-3094.
13. Hummer, G.; Rasalah, J. C.; Noworyta, J. P. Nature 2001, 414, 188-190.
14. Sasaki, Y.; Shukla, R.; Smith, B. D. Org. Biomol. Chem. 2004, 2, 214-219.
15. Tannert, A.; Pohl, A.; Pomorski, T.; Herrmann, A. Int. J. Antimicrob. Agents 2003, 22, 177-187.
16. Alberts, B.; Bray, D.; Lewis, J.; Raff, M.; Roberts, K.; Watson, J. D. Molecular Biology of the Cell; Garland: New York, 1994.
17. Daleke, D. L. J. Lipid Res. 2003, 44, 233-242.
18. Kol, M. A.; de Kroon, A. I. P. M.; Killian, J. A.; de Kruijff, B. Biochemistry 2004, 43, 2673-2681.
19. Marx, U.; Lassmann, G.; Holzhütter, H. G.; Wüstner, D.; Müller, P.; Höhlig, A.; Kübelt, J.; Herrmann, A. Biophys. J. 2000, 78, 2628-2640.
20. Kol, M. A.; van Dalen, A.; de Kroon, A. I. P. M.; de Kruijff, B. J. Biol. Chem. 2003, 278, 24586-24593.
21. Menon, A. K.; Watkins, W. E., III; Hrafnsdóttir, S. Curr. Biol. 2000, 10, 241-252.
22. Nomura, K.; Corzo, G.; Nakajima, T.; Iwashita, T. Biophys. J. 2004, 87, 2497-2507.
23. Shai, Y. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1462, 55-70.
24. Harroun, T. A.; Heller, W. T.; Weiss, T. M.; Yang, L.; Huang, H. W. Biophys. J. 1999, 76, 937-945.
25. Zeidel, M. L.; Ambudkar, S. V.; Smith, B. L.; Agre, P. Biochemistry 1992, 31, 7436-7440.
26. Garrett, R. H.; Grisham, C. M. Biochemistry; Saunders College Publishing: Fort Worth, TX, 1995.
27. Kozlovsky, Y.; Chernomordik, L. V.; Kozlov, M. M. Biophys. J. 2002, 83, 2634-2651.
28. Noguchi, H.; Takasu, M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 9547-9551.
29. Heuvingh, J.; Pincet, F.; Cribier, S. Eur. Phys. J. E 2004, 14, 269-276.
30. Yang, L.; Huang, H. W. Science 2002, 297, 1877-1879.
31. Petrache, H. I.; Zuckerman, D. M.; Sachs, J. N.; Killian, J. A.; Koeppe, R. E., II; Woolf, T. B. Langmuir 2002, 18, 1340-1351.
32. Nielsen, S. O.; Ensing, B.; Ortiz, V.; Moore, P. B.; Klein, M. L. Biophys. J. 2005, 88, 3822-3828.
33. Weiss, T. M.; Wel, P. C. A.; Killian, J. A.; Koeppe, R. E., II; Huang, H. W. Biophys. J. 2003, 84, 379-385.
34. Marrink, S. J.; Mark, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 15233-15242.
35. Müller, M.; Katsov, K.; Schick, M. Biophys. J. 2003, 85, 1611-1623.