Dynamics of the Staudinger reaction

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 1, Issue 3, 2005, Pages 353-362

  Tian, Wei Quan ^a,b   Wang, Yan Alexander ^a  

^a UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA   (Canada)

^b KYUSHU UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 33745791733     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct049918x     Document Type: Article

References (52)

1. Staudinger, H.; Meyer, J. Helv. Chim. Acta 1919, 2, 635.
2. (a) Cordridge, D. E. C. Phosphorus 2000: Chemistry, Biochemistry & Technology; Elsevier: Amsterdam, 2000.
3. (b) Irving, J. T. Calcium and phosphorus metabolism; Academic Press: New York, 1973.
4. (a) Gololobov, Yu. G.; Zhmurova, I. N.; Kasukhin, L. F. Tetrahedron 1981, 37, 437.
5. (b) Gololobov, Yu. G.; Zhmurova, I. N.; Kasukhin, L. F. Tetrahedron 1992, 48, 1353.
6. Kato, H.; Ohmori K.; Suzuki, K. Synlett 2001, SI, 1003.
7. (a) Saxon, E.; Luchansky, S. J.; Hang, H. C.; Yu, C.; Lee, S. C.; Bertozzi, C. R. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14893.
8. (b) Saxon, E.; Bertozzi, C. R. Science 2000, 287, 2007.
9. (c) Kato, H.; Ohmori K.; Suzuki, K. Synlett 2001, SI, 1003.
10. Tian, W. Q.; Wang, Y. A. J. Org. Chem. 2004, 69, 4299.
11. Widauer, C.; Grützmacher, H.; Shevchenko I.; Gramlich, V. Eur. J. Inorg. Chem. 1999, 1659.
12. Alajarin, M.; Conesa, C.; Rzepa, H. S. J. Chem. Soc, Perkin Trans. 1999, 2, 1811.
13. Goerlich, R.; Farkens, M.; Fischer, A.; Jones, P. G.; Schmutzler, R. Z. Anorg. Allg. Chem. 1994, 620, 707.
14. Molina, P.; López-Leonardo, C.; Llamas-Botía, J.; Foces-Foces, C.; Fernández-Castaño, C. Tetrahedron 1996, 52, 9629.
15. Alajarín, M.; Molina, P.; López-Leonardo, C. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1997, 36, 67.
16. Allen, L. C. Int. J. Quantum Chem. 1994, 49, 253.
17. (a) Fukui, K. Acc. Chem. Res. 1981, 14, 363.
18. (b) Gonzalez, C.; Schlegel, H. B. J. Chem. Phys. 1989, 90, 2154.
19. (c) Gonzalez, C.; Schlegel, H. B. J. Phys. Chem. 1990, 94, 5523.
20. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179.
21. Mackerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, T. F. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Nago, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiórkievicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586.
22. Rappé, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A. III.; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10046.
23. Modern methods for multidimensional dynamics computation in chemistry; Thompson, D. L., Ed.; World Scientific: Singapore, 1998.
24. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471.
25. Marx, D.; Hutter, J. In Modern methods and algorithms of quantum chemistry; Grotendorst, J., Ed.; John von Neumann Institute for Computing: Jülich, 2000; Vol. 1, p 301.
26. Hartke, B.; Carter, E. A. J. Chem. Phys. 1992, 97, 6569.
27. Lippert, G.; Hutter, J.; Parrinello, M. Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 124.
28. Lippert, G.; Hutter, J.; Parrinello, M. Mol. Phys. 1997, 92, 477.
29. Schlegel, H. B.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Voth, G. A.; Daniels, A. D.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J. J. Chem. Phys. 2001, 114, 9758.
30. Iyengar, S. S.; Schlegel, H. B.; Millam, J. M.; Voth, G. A.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 10291.
31. Schlegel, H. B.; Iyengar, S. S.; Li, X.; Millam, J. M.; Voth, G. A.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J. J. Chem. Phys. 2002, 117, 8694.
32. Iyengar, S. S.; Schlegel, H. B.; Voth, G. A.; Millam, J. M.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J. Isr. J. Chem. 2002, 42, 191.
33. Gibson, D. A.; Ionova, I. V.; Carter, E. A. Chem. Phys. Lett 1995, 240, 261.
34. (a) Tuckerman, M. E. J. Phys.: Condens. Matter 2002, 12, R1297.
35. (b) Nose, S. J. Chem. Phys. 1984, 81, 511.
36. (c) Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695.
37. (d) Martyna, G. J.; Klein, M. L.; Tuckerman, M. E. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2635.
38. (e) Tuckerman, M. E.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1994, 101, 1302.
39. Rega, N.; Iyengar, S. S.; Voth, G. A.; Schlegel, H. B.; Vreven, T.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 4210.
40. Gaussian 03, Revision B.05, Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003.
41. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
42. (a) Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
43. (b) Miehlich, B.; Savin, A.; Stoll, H.; Preuss, H. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 200.
44. (a) Sheng, Y.; Musaev, D. G.; Reddy, K. S.; McDonald, F. E.; Morokuma, K. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 4149.
45. (b) Vereecken, L.; Peeters, J.; Bettinger, H. F.; Kaiser, R. I.; Schleyer, P. v. R.; Schaefer, H. F., III J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 2781.
46. (c) Jiao, H.; Frapper, G.; Halet, J.-F.; Saillard, J.-Y. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 5945.
47. (d) Beno, B. R.; Wilsey, S.; Houk, K. N. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 4816.
48. (e) Batra, R.; Giese, B.; Spichty, M.; Gescheidt, G.; Houk, K. N. J. Phys. Chem. 1996, 100, 18371.
49. (f) Jursic, B.; Zdravkovski, Z. J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2 1995, 1223.
50. Reed, A. E.; Curtiss, L. A.; Weinhold, F. Chem. Rev. 1988, 88, 899.
51. Leffler, J. E.; Temple, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1967, 89, 5235.
52. The single-point calculations based on the ADMP trajectory are certainly different from the BOMD simulations, since the BOMD calculates the force from the converged charge density and potential.