Mapping allostery through equilibrium perturbation NMR spectroscopy

Journal of the American Chemical Society

Volumn 128, Issue 26, 2006, Pages 8406-8407

  Das, Rahul ^a   Abu Abed, Mona ^a   Melacini, Giuseppe ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALLOSTERISM; ARTICLE; BINDING SITE; EQUILIBRIUM CONSTANT; HYDROPHOBICITY; LIGAND BINDING; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR STABILITY; NITROGEN NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PROTON TRANSPORT;

ALLOSTERIC REGULATION; BINDING SITES; DEUTERIUM; HYDROGEN; LIGANDS; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

EID: 33745685964     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja060046d     Document Type: Article

References (25)

1. (a) Kern, D.; Zuiderweg, E. R. P. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 748.
2. (b) Volkman, B. F.; Lipson, D.; Wemmer, D.; Kern, D. Science 2001, 291, 2429.
3. (a) Won, H. S.; Lee, T. W.; Park, S. H.; Lee, B. J. J. Biol. Chem. 2002, 277, 11450.
4. (b) Kraemer, A.; Rehmann, H. R.; Cool, R. H.; Theiss, C.; de Rooij, J.; Bos, J. L.; Wittinghofer, A. J. Mol. Biol. 2001, 306, 1167.
5. (a) Kim, C; Xuong, N. H.; Taylor, S. S. Science 2005, 307, 690.
6. (b) Su, Y.; Dostmann, W. R. G.; Herberg, F. W.; Durick, K.; Xuong, N. H.; Teneyck, L.; Taylor, S. S.; Varughese, K. I. Science 1995, 269, 807.
7. (c) Anand, G. S.; Hughes, C. A.; Jones, J. M.; Taylor, S. S.; Komives, E. A. J. Mol. Biol. 2002, 323, 377.
8. (d) Wu, J.; Brown, S.; Xuaong, N. H.; Taylor, S. S. Structure 2004, 12, 1057.
9. (a) Weber, I. T.; Steitz, T. A. J. Mol. Biol. 1987, 198, 311.
10. (b) Parkinson, G.; Wilson, C.; Gunasekera, A.; Ebright, Y. W.; Ebright, R. E.; Berman, H. M. J. Mol. Biol. 1996, 260, 395.
11. Rehmann, H.; Prakash, B.; Wolf, E.; Rueppel, A.; De Rooij, J.; Bos, J. L.; Wittinghofer, A. Nat. Struct. Biol. 2003, 10, 26.
12. (a) Clayton, G. M.; Silverman, W. R.; Heginbotham, L.; Morais-Cabral, J. H. Cell 2004, 119, 615.
13. (b) Zagotta, W. N.; Olivier, N. B.; Black, K. D.; Young, E. C.; Olson, R.; Gouaux, E. Nature 2003, 425, 200.
14. Fayos, R.; Melacini, G.; Newlon, M. G.; Burns, L.; Scott, J. D.; Jennings, P. A. J. Biol. Chem. 2003, 278, 18581.
15. (a) Tollinger, M.; Skrynnikov, N. R.; Mulder, F. A. A.; Forman-Kay, J. D.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11341.
16. (b) Mulder, F. A. A.; Skrynnikov, N. R.; Hon, B.; Dahlquist, F. W.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 967.
17. (a) Palmer, A. G.; Kroenke, C. D.; Loria, J. P. Methods Enzymol. 2001, 339, 204.
18. (b) Eisenmesser, E. Z.; Bosco, D. A.; Akke, M.; Kern, D. Science 2002, 295, 1520.
19. (c) Malmendal, A.; Evenas, J.; Forsen, S.; Akke, M. J. Mol. Biol. 1999, 293, 883.
20. Bai, Y. W.; Englander, J. J.; Mayne, L.; Milne, J. S.; Englander, S. W. Methods Enzymol. 1995, 259, 344.
21. (a) Hwang, T. L.; van Zijl, P. C. M.; Mori, S. J. Biomol. NMR 1998, 11, 221.
22. (b) Melacini, G.; Boelens, R.; Kaptein, R. J. Biomol. NMR 1999, 15, 189.
23. Huang, L. J. S.; Taylor, S. S. J. Biol. Chem. 1998, 273, 26739.
24. Berman, H. M.; Ten Eyck, L. F.; Goodsell, D. S.; Haste, N. M.; Kornev, A.; Taylor, S. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 45.
25. Gibson, R. M.; Buechler, Y.; Taylor, S. S. J. Biol. Chem. 1997, 272, 16343.