Spin labeling of Natronomonas pharaonis halorhodopsin: Probing the cysteine residues environment

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 17, 2006, Pages 8825-8831

  Mevorat Kaplan, Keren ^a   Weiner, Lev ^a   Sheves, Mordechai ^a  

^a WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE   (Israel)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; CHROMOPHORES; CONFORMATIONS; ELECTRON MOBILITY; LIGHT ABSORPTION; PARAMAGNETIC RESONANCE; PIGMENTS; PROTEINS;

AMINO ACID SEQUENCE; HALORHODOPSIN; NATRONOMONAS PHARAONIS; RETINAL CHROMOPHORE;

NEGATIVE IONS;

EID: 33744491574     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp054750c     Document Type: Article

References (57)

1. Matsuno-Yagi, A.; Mukahata, Y. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1977, 78, 237.
2. Otomo, J.; Tomioka, H.; Sasabe, H. Biochim. Biophys. Acta 1992, 1112, 7.
3. Soppa, J.; Duschl, J.; Oesterhelt, D. J. Bacteriol. 1993, 175, 2720.
4. Mukohata, Y.; Ihara, K.; Tamura, T.; Sugiyama, Y. J. Biochem. (Tokyo) 1999, 125, 649.
5. Bivin, D. B.; Stoeckenius, W. J. Gen. Microbiol. 1986, 132, 2167.
6. Duschl, A.; Lanyi, J. K.; Zimanyi, L. J. Biol. Chem. 1990, 265, 1261.
7. Varo, G.; Needleman, R.; Lanyi, J. K. Biochemistry 1995, 34, 14500.
8. Losi, A.; Wegener, A. A.; Engelhard, M.; Braslavsky, S. E. Photochem. Photobiol. 2001, 74, 495.
9. Varo, G.; Brown, L.; Sasaki, J.; Kandori, H.; Maeda, A.; Needelman, R.; Lanyi, J. K. Biochemistry 1995, 34, 14490.
10. Chizhov, I.; Engelhard, M. Biophys, J. 2001, 81, 1600.
11. Rothschild, K.; Bousche, O.; Braiman, M.; Hasselbacher, C.; Spudich, J. Biochemistry 1988, 27, 2420.
12. Braiman, M.; Walter, T.; Briercheck, D. Biochemistry 1994, 33, 1629.
13. Hackmann, C.; Guijarro, J.; Chizhov, I.; Engelhard, M.; Rodig, C.; Siebert, F. Biophys. J. 2001, 81, 394.
14. Alshuth, T.; M. Stockburger; P. Hegemann; Oesterhelt, D. FEBS Lett. 1985, 179, 55.
15. Ames, J. B.; J. Raap; J. Lugtenburg; Mathies, R. A. Biochemistry 1992, 31, 12546.
16. Gerscher, S.; Mylrajan, M.; Hildebrandt, P.; Baron, M. H.; Muller, R.; Engelhard, M. Biochemistry 1997, 36, 11012.
17. Varo, G.; Needleman, R.; Lanyi, J. K. Biophys. J. 1995, 68, 2062.
18. Bamberg, E.; Tittor, J.; Oesterhelt, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 639.
19. Ludman, K.; Ibron, J.; Lanyi, J.; Varo, G. Biophys. J. 2000, 78, 959.
20. Blanck, A.; Oesterhelt, D. EMBO J. 1987, 6, 265.
21. Maeda, A.; Ogurusu, T.; Yoshizawa, T.; Kitagawa, T. Biochemistry 1985, 24, 2517.
22. Pande, C.; Lanyi, J. K.; Callender, R. Biophys. J. 1989, 55, 425.
23. Kolbe, M.; Besir, H.; Essen, L. O.; Oesterhelt, D. Science 2000, 288, 1390.
24. Schegk, W.; Tittor, G.; Lottspiech, F.; Oesterhelt, D. In Chemistry of Peptides and Proteins; Voelter, W., Ovchinikov, Y., Ivanov, V., Eds.; Walter de Gruyter: Berlin, 1986; p 259.
25. Ariki, M.; Lanyi, J. J. Biol. Chem. 1984, 259, 3504.
26. Hubbell, W.; Gross, A.; Langen, R.; Lietzow, M. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 649.
27. Steinhoff, H.-J. Front. Biosci. 2002, 7, c97-110.
28. Berliner, L. J.; Grunwald, J.; Hankovszky, H. O.; Hideg, K. Anal. Biochem. 1982, 119, 450.
29. Columbus, L.; Hubbell, W. L. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 288.
30. Hubbell, W.; Altenbach, C. Curr. Opin. Struct. Biol. 1994, 4, 566.
31. (a) Kokorin, A. I.; Zamarayev, K. I.; Grigorian, G. L.; Ivanov, V. P.; Rozantsev E. G. Biofizika 1972, 17, 34.
32. (b) Kokorin, A. I. Application of Nitroxyl Biradicals in Medical-Biological Studies. In Method of Spin Labels and Probes: Problems and Perspectives; Emanuel, N. M., Zhdanov, R. I., Eds.; Nauka: Moscow, 1986; p 61.
33. Steinhoff, H.-J. Biol. Chem. 2004, 385, 913.
34. Eaton, S. S.; Eaton, G. R. Electron Paramagn. Reson. 2004, 19, 318.
35. Hohenfeld, I. P.; Wegener, A. A.; Engelhard, M. FEBS Lett. 1999, 442, 198.
36. Riener, C. K.; Kada, G.; Gruber, H. G. Anal. Bioanal. Chem. 2002, 373, 266
37. Steinhoff, H. J.; Radzwill, N.; Thevis, W.; Lenz, V.; Brandenburg, D.; Antson, A.; Dodson, G.; Wollmer, A. Biophys J. 1997, 73, 3287.
38. Rabenstein, M. D.; Shin, Y. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 8239.
39. Steinhoff, H.-J.; Dombrowsky, O.; Karim, C.; Schneiderhahn, C. Eur. Biophys. J. 1991, 20, 293
40. Hustedt, E. J.; Beth, A. H. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1999, 28, 129.
41. Fanucci, G. E.; Coggshall, K. A.; Cadieux, N.; Kim, M.; Kadner, R. J.; Cafiso, D. S. Biochemistry 2003, 42, 1391.
42. Gross, A.; Columbus, L.; Hideg, K.; Altenbach, C.; Hubbell, W. L. Biochemistry 1999, 38, 10324.
43. Hess, J.; Voss, J.; FitzGerald, G. J. Biol. Chem. 2002, 277, 35516.
44. Voss, J.; Salwinski, L.; Kaback, R.; Hubbell, W. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 12295.
45. Lanyi, J. K.; Duschl, A.; Hatfield, G. W.; May, K.; Oesterhelt, D. J. Biol. Chem. 1990, 265, 1253.
46. Molin, Y. N.; Salikhov, K. M.; Zamaraev, K. I. In Spin Exchange; Springer-Verlag: Chapter 4, 1980; p 147.
47. Gross, A.; Hubbell, W. L. Biochemistry 2002, 41, 1123.
48. Dzikovski, B. G.; Livshits, V. A.; Marsh, D. Biophys J. 2003, 85, 1005.
49. Paleos, C. M.; Dais, P. J. Chem. Commun. 1977, 10, 345.
50. Krainev, A. G.; Vainer, L. M. Biochemistry (Moscow) 1988, 53, 1703.
51. Aharoni, A.; Weiner, L.; Ottolenghi, M.; Sheves, M. J. Biol. Chem 2000, 275, 21010.
52. Steinhoff, H. J.; Mollaaghababa, R.; Altenbach, C.; Hideg, K.; Krebs, M.; Khorana, H. G.; Hubbell, W. L. Science 1994, 266, 105.
53. Steinhoff, H. J.; Mollaaghababa, R.; Altenbach, C.; Khorana, H. G.; Hubbell, W. L. Biophys. Chem. 1995, 56, 89.
54. Luecke, H.; Schobert, B.; Richter, H.-T.; Cartailler, J.-P.; Lanyi, J. K. Science 1999, 286, 255.
55. Subramaniam, S.; Lindahl, M.; Bullough, P.; Faruqi, A.; Tittor, J.; Oesterhelt, D.; Brown, L.; Lanyi, J.; Henderson, R. J. Mol, Biol. 1999, 287, 145.
56. Subramaniam, S.; Henderson, R. Nature 2000, 406, 653.
57. Radzwill, N.; Gerwert, K.; Steinhoff, H.-J. Biophys J. 2001, 80, 2856.