One-step, non-denaturing isolation of an RNA polymerase enzyme complex using an improved multi-use affinity probe resin

Molecular BioSystems

Volumn 1, Issue 1, 2005, Pages 53-56

  Uljana Mayer, M ^a   Shi, Liang ^a   Squier, Thomas C ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CYSTEINE; DITHIOL DERIVATIVE; DNA DIRECTED RNA POLYMERASE; DRUG DERIVATIVE; RESIN; TOLUENE;

ARTICLE; CHEMISTRY; ISOLATION AND PURIFICATION; MASS SPECTROMETRY; SHEWANELLA;

CYSTEINE; MASS SPECTROMETRY; RESINS, SYNTHETIC; RNA POLYMERASE I; SHEWANELLA; TOLUENE;

SHEWANELLA ONEIDENSIS;

EID: 33644811688     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b500950b     Document Type: Article

References (22)

1. A. Bauer B. Kuster Eur. J. Biochem. 2003 270 570 578
2. A. Dziembowski B. Seraphin FEBS Lett. 2004 556 1 6
3. D. Figeys Curr. Opin. Biotechnol. 2003 14 119 125
4. A. C. Gavin M. Bosche R. Krause P. Grandi M. Marzioch A. Bauer J. Schultz J. M. Rick A. M. Michon C. M. Cruciat M. Remor C. Hofert M. Schelder M. Brajenovic H. Ruffner A. Merino K. Klein M. Hudak D. Dickson T. Rudi V. Gnau A. Bauch S. Bastuck B. Huhse C. Leutwein M. A. Heurtier R. R. Copley A. Edelmann E. Querfurth V. Rybin G. Drewes M. Raida T. Bouwmeester P. Bork B. Seraphin B. Kuster G. Neubauer G. Superti-Furga Nature 2002 415 141 147
5. Y. Ho A. Gruhler A. Heilbut G. D. Bader L. Moore S. L. Adams A. Millar P. Taylor K. Bennett K. Boutilier L. Y. Yang C. Wolting I. Donaldson S. Schandorff J. Shewnarane M. Vo J. Taggart M. Goudreault B. Muskat C. Alfarano D. Dewar Z. Lin K. Michalickova A. R. Willems H. Sassi P. A. Nielsen K. J. Rasmussen J. R. Andersen L. E. Johansen L. H. Hansen H. Jespersen A. Podtelejnikov E. Nielsen J. Crawford V. Poulsen B. D. Sorensen J. Matthiesen R. C. Hendrickson F. Gleeson T. Pawson M. F. Moran D. Durocher M. Mann C. W. V. Hogue D. Figeys M. Tyers Nature 2002 415 180 183
6. B. Seraphin Adv. Protein Chem. 2002 61 99 117
7. B. A. Griffin S. R. Adams R. Y. Tsien Science 1998 281 269 272
8. B. A. Griffin S. R. Adams J. Jones R. Y. Tsien Methods Enzymol. 2000 327 565 578
9. S. R. Adams R. E. Campbell L. A. Gross B. R. Martin G. K. Walkup Y. Yao J. Llopis R. Y. Tsien J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6063 6076
10. K. S. Thorn N. Naber M. Matuska R. D. Vale R. Cooke Protein Sci. 2000 9 213 217
11. The gene of RNA Polymerase A (rpoA) from S. oneidensis was amplified by PCR and cloned into the pBAD-DTOPO 202 vector (Invitrogen) according the manufacturer's protocol. To add the tetracysteine tag on the C-terminus of RpoA, the reverse primer (5′- CTTGCAACAACCAGGGCAACATGCAGCTAGGTCGTCTGCTAAACTAGCTG) contained the coding sequence for AACCPGCCK (marked in bold). The forward primer (5′- CACCCAGAGTACGGTTTACAGTTACGC) was used to amplify both coding and promoter region of rpoA. pBAD-DTOPO 202 also adds the 6His and V5 tags to the recombinant RpoA for purification and identification
12. L. Snyder and W. Champness, Molecular Genetics of Bacteria, ASM Press, Washingon, DC, 2003
13. L. Shi J. T. Lin L. M. Markillie T. C. Squier B. S. Hooker BioTechniques 2005 38 297 299
14. 50 mM HEPES, 140 mM sodium chloride, 5 mM 2-mercaptoethanol, pH 7.5 was the buffer used
15. Y. Shen N. Tolic R. Zhao L. Pasa-Tolic L. Li S. J. Berger R. Harkewicz G. A. Anderson M. E. Belov R. D. Smith Anal. Chem. 2001 73 3011 3021
16. E. F. Strittmatter L. J. Kangas K. Petritis H. M. Mottaz G. A. Anderson Y. Shen J. M. Jacobs D. G. Camp R. D. Smith J. Proteome Res. 2004 3 760 769
17. M. P. Washburn D. Wolters J. R. Yates Nat. Biotechnol. 2001 19 242 247
18. D. A. Wolters M. P. Washburn J. R. Yates Anal. Chem. 2001 73 5683 5690
19. K. Kvint L. Nachin A. Diez T. Nystrom Curr. Opin. Microbiol. 2003 6 140 145
20. M. C. Sousa D. B. McKay Structure 2001 9 1135 1141
21. G. Gaietta T. J. Deerinck S. R. Adams J. Bouwer O. Tour D. W. Laird G. E. Sosinsky R. Y. Tsien M. H. Ellisman Science 2002 296 503 507
22. B. Chen M. U. Mayer L.-M. Markillie D. L. Stenoien T. C. Squier Biochemistry 2005 44 905 914