Fiber-optic microsphere-based arrays for multiplexed biological warfare agent detection

Analytical Chemistry

Volumn 78, Issue 4, 2006, Pages 1023-1033

  Song, Linan ^a   Ahn, Soohyoun ^a   Walt, David R ^a  

^a TUFTS UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA ARRAYS; MICROSPHERE-BASED ARRAYS; MULTIPLEXED BIOLOGICAL; WARFARE AGENT DETECTION;

BACTERIA; DNA SEQUENCES; FIBER OPTICS; MILITARY OPERATIONS; PROTEINS; VIRUSES;

ARRAYS;

MICROSPHERE; SINGLE STRANDED DNA;

ARTICLE; BACILLUS ANTHRACIS; BACILLUS THURINGIENSIS; BACILLUS THURINGIENSIS KURSTAKI; BIOLOGICAL WARFARE; BRUCELLA MELITENSIS; CLOSTRIDIUM BOTULINUM; COVALENT BOND; DNA HYBRIDIZATION; DNA MICROARRAY; DNA SEQUENCE; FIBER OPTICS; FRANCISELLA TULARENSIS; GENE AMPLIFICATION; NONHUMAN; POLYMERASE CHAIN REACTION; RELIABILITY; REPRODUCIBILITY; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; VACCINIA VIRUS; YERSINIA PESTIS;

BIOLOGICAL WARFARE; FIBER OPTIC TECHNOLOGY; FIBER OPTICS; MICROSPHERES; OLIGONUCLEOTIDE ARRAY SEQUENCE ANALYSIS; OPTICAL FIBERS; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

EID: 33144481854     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac051417w     Document Type: Article

References (40)

1. Walt, D. R.; Franz, D. R. Anal. Chem. 2000, 72, 738A-746A.
2. Harris, C. Anal. Chem. 2002, 74, 126A-133A.
3. Klapper, P. E.; Jungkind, D. L.; Fenner, T.; Antinozzi, R.; Schirm, J.; Blanckmeister, C. Clin. Chem. 1998, 44, 1737-1739.
4. Jungkind, D. J. Clin. Virol. 2001, 20, 1-6.
5. Peruski, L. F., Jr.; Peruski, A. H. BioTechniques 2003, 35, 840-846.
6. Ivnitski, D.; O'Neil, D. J.; Gattuso, A.; Schlicht, R.; Calidonna, M.; Fisher, R. BioTechniques 2003, 35, 862-869.
7. Iqbal, S. S.; Mayo, M. W.; Bruno, J. G.; Bronk, B. V.; Batt, C. A.; Chambers, J. P. Biosens. Bioelectron. 2000, 15, 549-578.
8. McBride, M. T.; Gammon, S.; Pitesky, M.; O'Brien, T. W.; Smith, T.; Aldrich, J.; Langlois, R. G.; Colston, B.; Venkateswaran, K. S. Anal. Chem. 2003, 75, 1924-1930.
9. McBride, M. T.; Masquelier, D.; Hindson, B. J.; Makarewicz, A. J.; Brown, S.; Burris, K.; Metz, T.; Langlois, R. G.; Tsang, K. W.; Bryan, R.; Anderson, D. A.; Venkateswaran, K. S.; Milanovich, F. P.; Colston, B. W., Jr. Anal. Chem. 2003, 75, 5293-5299.
10. Rowe, C. A.; Tender, L. M.; Feldstein, M. J.; Golden, J. P.; Scruggs, S. B.; MacCraith, B. D.; Cras, J. J.; Ligler, F. S. Anal. Chem. 1999, 71, 3846-3852.
11. Taitt, C. R.; Anderson, G. P.; Lingerfelt, B. M.; Feldstein, M. J.; Ligler, F. S. Anal. Chem. 2002, 74, 6114-6120.
12. Zuk, R. F.; Ginsberg, V. K.; Houts, T.; Rabbie, J.; Merrick, H.; Ullman, E. F.; Fischer, M. M.; Sizto, C. C.; Stiso, S. N.; Litman, D. J. Clin. chemistry 1985 31, 1144-1150.
13. Ng, S. P.; Tsui, C. O.; Roberts, D.; Chau, P. Y.; Ng, M. H. Appl. Environ. Microbiol. 1996 62, 2294-2302.
14. Crooks, S. R.; Ross, P.; Thompson, C. S.; Haggan, S. A.; Elliott, C. T. Lumin.: J. Biol. Chem. Lumin. 2000 15, 371-376.
15. Henchal, E. A.; Teska, J. D.; Ludwig, G. V.; Shoemaker, D. R.; Ezzell, J. W. Clin. Lab. Med. 2001 27, 661-678.
16. Baeumner, A. J.; Pretz, J.; Fang, S. Anal. Chem. 2004, 76, 888-894.
17. Bhagwat, A. A. Int. J. Food Microbiol. 2003, 84, 217-224.
18. Cady, N. C.; Stelick, S.; Kunnavakkam, M. V.; Batt, C. A. Sens. and Actuators, B: Chemical 2005, 107, 332-341.
19. Hsu, C. F.; Tsai, T. Y.; Pan, T. M. J. Clin. Microbiol. 2005, 43, 2668-2673.
20. Ellerbrok, H.; Natterman, H.; Ozel, M.; Beutin, L.; Appel. B.; Pauli, G. FEMS Microbiol. Lett. 2002, 214, 51-59.
21. Belgrader, P.; Benett, W.; Hadley, D.; Richards, J.; Stratton, P.; Mariella, R., Jr.; Milanovich, F. Science 1999 16, 284, 449-450.
22. Bej, A. K.; Mahbubani, M. H.; Miller, R.; DiCesare, J. L.; Haff, L.; Atlas, R. M. Mol. Cell. Probes 1990, 4, 353-365.
23. Hughes, T. R.; Mao, M.; Jones, A. R.; Burchard, J.; Marton, M. J.; Shannon, K. W.; Lefkowitz, S. M.; Ziman, M.; Schelter, J. M.; Meyer, M. R.; Kobayashi, S.; Davis, C.; Dai, H.; He, Y. D.; Stephaniants, S. B.; Cavet, G.; Walker, W. L.; West, A.; Coffey, F.; Shoemaker, D. D.; Stoughton, R.; Blanchard, A. P.; Friend, S. H.; Linsley, P. S. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 342-347.
24. Lockhart, D. J.; Winzeler, E. A. Nature 2000, 405, 827-836.
25. Mills, J. C.; Roth, K. A.; Cagan, R. L.; Gordon, J. I. Nat. Cell Biol. 2001, 3, E175-178.
26. Fan, J. B.; Chen, X.; Halushka, M. K.; Berno, A.; Huang, X.; Ryder, T.; Lipshutz, R. J.; Lockhart, D. J.; Chakravarti, A. Genome Res. 2000, 10, 853-860.
27. Churchill, G. A. Nat. Genet. 2002, 32, 490-495.
28. Southern, E.; Mir, K.; Shchepinov, M. Nat. Genet. 1999, 21, 5-9.
29. Ji, J.; Schanzle, J. A.; Tabacco, M. B. Anal. Chem. 2004, 76, 1411-1418.
30. Wilson, W. J.; Strout, C. L.; DeSantis, T. Z.; Stilwell, J. L.; Carrano, A. V.; Andersen, G. L. Mol. Cell. Probes 2002, 16, 119-127.
31. Belgrader, P.; Benett, W.; Hadley, D.; Long, G.; Mariella, R., Jr.; Milanovich, F.; Nasarabadi, S.; Nelson, W.; Richards, J.; Stratton, P. Clin. Chem. 1998, 44, 2191-2194.
32. Ferguson, J. A.; Steemers, F. J.; Walt, D. R. Anal. Chem. 2000, 72, 5618-5624.
33. Epstein, J. R.; Lee, M.; Walt, D. R. Anal. Chem. 2002, 74, 1836-1840.
34. Walt, D. R. Science 2000, 287, 451-452.
35. Song, L.; Ahn, S.; Walt, D. R. Emerging Infect. Dis. 2005, 11, 1629-1632.
36. Call, D. R.; Brockman, F. J.; Chandler, D. P. Int. J. Food Microbiol. 2001, 67, 71-80.
37. Reif, T. C.; Johns, M.; Pillai, S. D.; Carl, M. Appl. Environ. Microbiol. 1994, 60, 1622-1625.
38. Relogio, A.; Schwager, C.; Richter, A.; Ansorge, W.; Valcarcel, J. Nucleic Acids Res. 2002, 30, e51.
39. Henegariu, O.; Heerema, N. A.; Dlouhy, S. R.; Vance, G. H.; Vogt, P. H. BioTechniques 1997, 23, 504-511.
40. Markoulatos, P.; Siafakas, N.; Moncany, M J. Clin. Lab. Anal. 2002, 16, 47-51.