Excitation decay pathways of Lhca proteins: A time-resolved fluorescence study

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 109, Issue 44, 2005, Pages 21150-21158

  Ihalainen, Janne A ^a,e   Croce, Roberta ^b   Morosinotto, Tomas ^c,d   Van Stokkum, Ivo H M ^a   Bassi, Oberto ^c,d   Dekker, Jan P ^a   Van Grondelle, Rienk ^a  

^a VU UNIVERSITY AMSTERDAM   (Netherlands)

^b CNR   (Italy)

^c UNIVERSITY OF VERONA   (Italy)

^d AIX MARSEILLE UNIVERSITY   (France)

^e UNIVERSITY OF ZURICH   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACETONE; ANTENNAS; APPROXIMATION THEORY; COMPLEXATION; CORRELATION METHODS; FLUORESCENCE; MONOMERS; PIGMENTS; POLYPEPTIDES; QUANTUM THEORY; SAMPLING;

EMISSION YIELDS; LHCA PROTEINS; PIGMENT COMPOSITION; QUANTUM YIELDS;

PROTEINS;

ARABIDOPSIS PROTEIN; LHCA1 ANTENNA COMPLEX PROTEIN, ARABIDOPSIS; LHCA2 ANTENNA COMPLEX PROTEIN, ARABIDOPSIS; LHCA4 CHLOROPHYLL A B BINDING PROTEIN, PLANT; LHCA4 CHLOROPHYLL A-B-BINDING PROTEIN, PLANT; VEGETABLE PROTEIN;

ARTICLE; CHEMISTRY; ENERGY TRANSFER; HALF LIFE TIME; LIGHT HARVESTING SYSTEM; PHOTOSYSTEM I;

ARABIDOPSIS PROTEINS; ENERGY TRANSFER; HALF-LIFE; LIGHT-HARVESTING PROTEIN COMPLEXES; PHOTOSYSTEM I PROTEIN COMPLEX; PLANT PROTEINS;

EID: 28144457206     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0519316     Document Type: Article

References (52)

1. Haworth, P.; Watson, J. L.; Arntzen, C. J. Biochim. Biophys. Acta 1983, 724, 151-158.
2. Jansson, S. Trends Plant Sci. 1999, 4, 236-240.
3. Ganeteg, U.; Klimmek, F.; Jansson, S. Plant Mol. Biol. 2004, 54, 641-651.
4. Boekema, E. J.; Jensen, P. E.; Schlodder, E.; van Breemen, J. F. L.; van Roon, H.; Scheller, H. V.; Dekker: J. P. Biochemistry 2001, 40, 1029-1036.
5. Ben-Shem, A.; Frolow, F.; Nelson, N. Nature 2003, 420, 630-635.
6. Croce, R.; Morosinotto, T.; Castelletti, S.; Breton, J.; Bassi, R. Biochim. Biophys. Acta 2002, 1556, 29-40.
7. Liu, Z.; Hanchi, Y.; Wang, K.; Kuang, T.; Zhang, J.; Gui, L.; An, X.; Chang, W. Nature 2004, 428, 287-292.
8. van Amerongen, H.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 604-617.
9. Novoderezhkin, V. I.; Palacios, M. A.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R.; J. Phys. Chem. B. 2004, 108, 10363-10375.
10. Novoderezhkin, V.; Palacios, M. A.; van Amerongen H.; van Grondelle R. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10493-10504.
11. Morosinotto, T.; Breton, J.; Bassi, R.; Croce, R. J. Biol. Chem. 2003, 278, 49223-49229.
12. Ihalainen, J. A.; van Stokkum, I. H. M.; Gibasiewicz, K., Germano, M.; van Grondelle, R.; Dekker: J. P. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1706, 267-275.
13. Croce, R.; Dorra, D.; Holzwarth, A. R.; Jennings, R. C. Biochemistry 2000, 39, 6341-6348.
14. Gobets, B.; van Stokkum, I. H. M.; Rögner, M.; Kruip, M.; Schlodder, E.; Karapetyan N. V.; Dekker J. P.; van Grondelle R. Biophys. J. 2001, 81, 407-424.
15. Gobets, B.; van Grondelle, R. Biochim. Biophys. Acta 2001, 1507, 80-99.
16. Mukerji, I.; Sauer, K. Biochim. Biophys. Acta 1993, 1142, 311-320.
17. Crocs, R.; Zucchelli, G.; Garlaschi, F. M.; Jennings, R. C. Biochemistry 1998, 37, 17355-17360.
18. Ihalainen, J. A.; Gobets, B.; Sznee, K.; Brazzoli, M.; Croce, R. Bassi, R.; van Grondelle, R.; Korppi-Tommola, J. E. I.; Dekker, J. P. Biochemistry 2000, 39, 8625-8631.
19. Ihalainen, J. A.; Rätsep, M.; Jensen, P. E.; Scheller, H. V.; Croce, R.; Bassi, R.; Korppi-Tommola, J. E. I.; Freiberg, A. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9086-9093.
20. Gobets, B.; Kennis, J. T. M.; Ihalainen, J. A.; Brazzoli, M.; Croce, R.; van Stokkum, I. H. M.; Bassi, R.; Dekker, J. P.; van Amerongen, H.; Fleming, G. R.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 10132-10139.
21. Jennings, R. C.; Zucchelli, G.; Engelmann, E.; Garlaschi, F. M. Biophys. J. 2004, 87, 488-497.
22. Schmid, V. H. R.; Cammarata, K. V.; Bruns, B. U.; Schmidt, G. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 7667-7672.
23. Schmid, V. H. R.; Paulsen, H.; Rupprecht, J. Biochemistry 2002, 41, 9126-9131.
24. Castelletti, S.; Morosinotto, T.; Robert, B.; Caffarri, S. Bassi, R.; Croce, R. Biochemistry 2003, 42, 4226-4234.
25. Morosinotto, T.; Castelletti, S.; Breton, J.; Bassi, R.; Croce, R. J. Biol. Chem. 2002, 277, 36253-36261.
26. Schmid, V. H. R.; Thome, P.; Ruhle, W.; Paulsen, H.; Kuhlbrandt, W.; Rogl, H. FEBS Lett. 2001, 49, 27-31.
27. Croce, R.; Morosinotto, T.; Ihalainen, J. A.; Chojnicka, A.; Breton, J.; Dekker, J. P.; van Grondelle, R.; Bassi, R. J. Biol. Chem. 2004, 279, 48543-48549.
28. Melkozernov, A. N.; Schmid, V. H. R.; Schmidt, G. W.; Blankenship, R. E. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 8183-8189.
29. Melkozernov, A. N.; Schmid, V. H. R.; Lin, S.; Paulsen, H.; Blankenship, R. E. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 4313-4317.
30. Melkozernov, A. N.; Lin, S.; Schmid, V. H. R.; Paulsen, H.; Schmidt, G. W.; Blankenship, R. E. FEBS Lett. 2002, 471, 89-92.
31. Gibasiewicz, K.; Croce, R.; Morosinotto, T.; Ihalainen, J. A.; van Stokkum, I. H. M.; Dekker, J. P.; Bassi, R.; van Grondelle, R. Biophys. J. 2005, 88, 1959-1969.
32. Ben-Shem, A.; Frolow, F.; Nelson, N. Photosynth. Res. 2004, 81, 239-250.
33. Weber, G.; Teale, F. W. J. Trans. Faraday Soc. 1957, 53, 646-655.
34. Holzwarth, A. R. In Biophysical Techniques in Photosynthesis; Amesz, J., Hoff, A. J., Eds.; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 1996; pp 75-92.
35. van Stokkum I. H. M.; Larsen, D. S.; van Grondelle, R. Biochim. Biophys. Acta 2004, 1657, 82-104.
36. Palacios, M. A.; de Weerd, F. L.; Ihalainen, J. A.; van Grondelle, R. van Amerongen, H. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 5782-5787.
37. van Amerongen, H.; Valkunas, L.; van Grondelle, R. Photosynthetic Excitons; World Scientific: Singapore, 2000; Chapters 2 and 3.
38. Berera, R.; Palacios, R.; Vengris, M.; Kodis, G.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H.; Gust, D.; Moore, T. A.; Moore, A. L.; Kennis, J. T. M. In Photosynthesis: Fundamental Aspects to Global Perspectives; van der Est, A., Bruce, D., Eds.; Alliance Communications Group: Lawrence, KS, 2005; pp 1075-1077.
39. Holt, N. E.; Zigmantas, D.; Valkunas, L.; Li, X.-P.; Niyogi, K. K.; Fleming, G. R. Science 2005, 307, 433-435.
40. Peterman, E. J. G.; Wenk, S. O.; Pullertis, T.; Pålsson, L. O.; van Grondelle, R.; Dekker, J. P.; Rögner, M.; van Amerongen, H. Biophys. J. 1998, 75, 389-398.
41. Dashdorj, N.; Zhang, H.; Kim, H.; Yan, J.; Cramer, W. A.; Savikhin, S. Biophys. J. 2005, 88, 4178-4187.
42. Renger, T. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 188101.
43. Carbonera, D.; Agostini, G.; Morosinotto, T.; Bassi, R. Biochemistry 2005, 44, 8337-8346.
44. Rätsep, M.; Johnson, T. W.; Chitnis, P. R.; Small, G. J. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 836-847.
45. Zazubovich, V.; Matsuzaki, S.; Johnson, T. W.; Hayes, J. M.; Chitnis, P. R.; Small, G. J. Chem. Phys. 2002, 275, 47-59.
46. Frese, R. N.; Palacios, M. A.; Azzizi, A.; van Stokkum, I. H. M.; Kruip, J.; Rögner, M.; Karapetayan, M. V.; Schlodder, E.; van Grondelle, R.; Dekker, J. P. Biochim. Biophys. Acta 2002, 1554, 180-191.
47. Croce, R.; Müller, M. G.; Bassi, R.; Holzwarth, A. R. Biophys. J. 2001, 80, 901-915.
48. Croce, R.; Müller, M. G.; Caffarri, S.; Bassi, R.; Holzwarth, A. R. Biophys. J. 2003, 84, 2517-2532.
49. Gradinaru, C. C.; Ozdemir, S.; Gulen, D.; van Stokkum, I. H. M.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. Biophys. J. 1998, 75, 3064-3077.
50. Barzda, V.; Gulbinas, V.; Kananavicius, R.; Cervinskas, V.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R.; Valkunas, L. Biophys. J. 2001, 80, 2409-2421.
51. Palacios, M. Ph.D. Thesis, Vrije Universiteit Amsterdam, 2005.
52. Ihalainen, J. A.; Jensen, P. E.; Haldrup, A.; van Stokkum, I. H. M.; van Grondelle, R.; Scheller, H. V.; Dekker, J. P. Biophys. J. 2002, 83, 2190-2201.