Absorption spectra of first-row transition metal complexes of bacteriochlorins: A theoretical analysis

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 109, Issue 24, 2005, Pages 12214-12221

  Petit, Laurence ^a,b   Adamo, Carlo ^a   Russo, Nino ^a  

^a UNIVERSITY OF CALABRIA   (Italy)

^b PSL RESEARCH UNIVERSITY   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION; BACTERIA; COMPLEXATION; ELECTRONIC PROPERTIES; MOLECULAR DYNAMICS; PHOTODYNAMIC THERAPY; SOLVENTS; ULTRAVIOLET RADIATION;

EXCITED STATES; METAL SUBSTITUTION; SOLVENT BULKS; WATER MOLECULES;

TRANSITION METALS;

BACTERIOCHLORIN; HEAVY METAL; NITROGEN; PORPHYRIN; SOLVENT;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; SPECTROPHOTOMETRY;

METALS, HEAVY; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; NITROGEN; PORPHYRINS; SOLVENTS; SPECTROPHOTOMETRY;

EID: 22444436041     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp050667d     Document Type: Article

References (73)

1. Raab, O. Z. Biol. 1900, 39, 524-546.
2. Sessler, J. L.; Hemmi, G.; Mody, T. D.; Murai, T.; Burrell, A.; Young, S. W. Acc. Chem. Res. 1994, 27, 43.
3. Hajri, A.; Wack, S.; Meyer, C.; Smith, M. K.; Leberquier, M.; Aprahamian, M. Photochem. Photobiol. 2002, 75, 140-148.
4. Van Tenten, Y.; Schuitmaker, H. J.; De Wolf, A.; Willekens, B.; Vrensen, G. F. J. M.; Tassignon, M. J. Exp. Eye Res. 2001, 72, 41-48.
5. MacDonald, I. J.; Dougherty, T. J. J. Porphyrins Phthalocyanines 2001, 5, 105-129.
6. Rosenthal, D. I.; Nurenberg, P.; Becerra, C. R.; Frenkel, E. P.; Carbone, D. P.; Lum, B. L.; Miller, R.; Engel, J.; Young, S.; Miles, D.; Renschier, M. F.; Clin. Cancer Res. 1945, 5, 739.
7. Rockson, S. G.; Kramer, P.; Razavi, M.; Szuba, A.; Filardo, S.; Adelman, D. C. Circulation 2000, 102, 2322.
8. Fukuzumi, S.; Ohkubo, K.; Chen, Y.; Pandey, R. K.; Zhan, R.; Shao, J.; Radish, K. M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 5105-5113.
9. Pfaltz, A.; Jaun, B.; Fassler, A.; Eschenmoser, A.; Jaenchen, R.; Gilles, H. H.; Deikert, G.; Thauer, R. K. Helv. Chim. Acta 1982, 65, 828.
10. Ellefson, W. L.; Whitman, W. B.; Wolf, R. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 3707.
11. Murphy, M. J.; Siegel, L. M.; Tover, S. R.; Kamin, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1974, 71, 612.
12. Vega, J. M.; Kamin, H. J. Biol. Chem. 1977, 252, 892.
13. Stolzenberg, A. M.; Schussel, L. J. Inorg. Chem. 1991, 30, 3205-3213.
14. Renner, M. W.; Furenlid, L. R.; Stolzenberg, A. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 293-300.
15. Huang, W.-Y.; Wild, U. P.; Johnson, L. W. J. Phys. Chem. 1992, 96, 6189-6195.
16. Parusel, A. B. J.; Grimme, S. J. Porphyrins Phthalocyanines 2001, 5, 225-232.
17. Yamaguchi, Y.; Yokoyama, S.; Mashiko, S. J. Chem. Phys. 2002, 116, 6541-6548.
18. Hasegawa, J.; Ozeki, Y.; Ohkawa, K.; Hada, M.; Nakatsuji, H. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 1320-1326.
19. Parusel, A. B. J.; Ghosh, A. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 2504-2507.
20. Kuzmitsky, V. A.; et al. Chem. Phys. 2004, 298, 1-16.
21. Linnanto, J.; Korppi-Tommola, J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 3855-3866.
22. Tomasi, J.; Persico, M. Chem. Rev. 1994, 94, 2027.
23. Casida, M. E. In Recent Advances in Density Functional Methods, Part I; Chong, D. P., Ed.; World Scientific: Singapore, 1995.
24. Ciofini, I.; Laine, P. P.; Bedioui, F.; Adamo, C. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10763.
25. Ciofini, I.; Daul, C.; Adamo, C. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 11182.
26. Adamo, C.; Barone, V. J. Chem. Phys. 1999, 110, 6158.
27. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865;
28. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 1396.
29. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
30. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
31. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822.
32. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslpwski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B. 05; Gaussian, Inc.: Wallingford CT, 2004.
33. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 270.
34. Francl, M. M.; Petro, W. J.; Hehre, W. J.; Binkley, J. S.; Gordon, M.-H.; DeFree, D. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1982, 77, 3654.
35. Ghosh, A. J. Chem. Phys. 1997, 101, 3290-3297.
36. Wondimagegn, T.; Ghosh, A. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 10858-10862.
37. Hay, P. J. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1634.
38. Summers, J. S.; Stolzenberg, A. M. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 10559-10567.
39. Stratmann, R. E.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J. J. Chem. Phys. 1998, 109, 8128.
40. Chiodo, S.; Russo, N.; Sicilia, E. J. Comput. Chem. 2005, 26, 175.
41. Wachters, A. J. H. J. Chem. Phys. 1970, 52, 1033.
42. Hay, P. J. J. Chem. Phys. 1977, 66, 4377.
43. Barone, V.; Cossi, M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1995.
44. Cossi, M.; Barone, V. J. Chem. Phys. 2001, 115, 4708.
45. Reed, A. E.; Curtiss, L. A.; Weinhold, F. Chem. Rev. 1988, 88, 899.
46. Renner, M. W.; Fajer, J. J. Biol. Inorg. Chem. 2001, 6, 823-830.
47. Stavrev, K.; Zerner, M. C. Chem. Phys. Lett. 1995, 233, 179-184.
48. Spiro, T. G.; Kozlowski, P. M.; Zgierski, M. Z. J. Roman Spectrosc. 1998, 29, 869-879.
49. Matsuzawa, N.; Ata, M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 7698-7706.
50. Zwaans, R.; van Lenthe, J. H.; den Boer, D. H. W. J. Mol. Struct. 1995, 339, 153-160.
51. Zwaans, R.; van Lenthe, J. H.; den Boer, D. H. W. J. Mol. Struct. 1996, 367, 15-24.
52. Goff, H.; La Mar, G. N.; Reed, C. A. J Am. Chem. Soc. 1977, 99, 2026.
53. Liao, M.-S.; Scheiner, S. J. Chem. Phys. 2002, 117, 205-219.
54. Jensen, K. P.; Ryde, U. ChemBioChem 2003, 4, 413-424.
55. Kozlowski, P. M.; Spiro, T. G.; Bérces, A.; Zgierski, M. Z. J Phys. Chem. B 1998, 102, 2603-2608.
56. Oliveira, K. M. T.; Trsic, M. J. Mol. Struct. 2001, 539, 107-117.
57. Subramanian, J. In Porphyrins and Metalloporphyrins; Smith, K. M., Ed.; Elsevier Scientific: Amsterdam, The Netherlands, 1975; p 555.
58. Lin, W. C. Inorg. Chem. 1976, 15, 1114.
59. Scheldt, W. R. In The Porphyrin Handbook; Kadish, K. M., Smith, K. M., Guilard, R., Eds.; Academic Press: New York, 2000; Vol. 3, pp 49-112.
60. Munro, O. Q.; Bradley, J. C.; Hancock, R. D.; Marques, H. M.; Marsicano, F.; Wade, P. W. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 7218-7230.
61. Barkigia, K. M.; Renner, M. W.; Furenlid, L. R.; Medforth, C. J.; Smith, K. M.; Fajer, J. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 3627-3635.
62. Collman, J. P.; Hoard, J. L.; Kim, N.; Lang, G.; Reed, C. A. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 2676.
63. Kutzler, F. W.; Swepston, P. N.; Berkovitch-Yellin, Z.; Ellis, D. E.; Ibers, J. A. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 2996.
64. Vasudevan, J.; Bumby, R. T.; Knapp, S.; Potenza, J. A.; Emge, T. J.; Schugar, H. J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11676.
65. Gouterman, M.; Wagniere, G. H.; Snyder, L. C. J. Mol. Spectrosc. 1963, 11, 108.
66. Hashimoto, T.; Choe, Y. K.; Nakano, H.; Hirao, K. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 1894.
67. Adamo, C.; Scuseria, G. E.; Barone, V. J. Chem. Phys. 1999, 111, 2889-2899.
68. Procyk, A. D.; Stolzenberg, A. M.; Bocian, D. F. Inorg. Chem. 1993, 32, 627-633.
69. Hannah, S.; Lynch, V.; Guldi, D. M.; Gerasimchuk, N.; MacDonald, C. L. B.; Magda, D.; Sessler, J. L. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 8416-8427.
70. Improta, R.; Barone, V. Chem Rev. 2004, 104, 1231.
71. Adamo, C.; Barone, V. Chem. Phys. Lett. 2000, 330, 152-160.
72. Boys, S. F.; Bemardi, F. Mol. Phys. 1970, 19, 553.
73. Barone, V.; Orlandini, L.; Adamo, C. Chem. Phys. Lett. 1994, 231, 295.