Spectroscopic properties of Mg-chlorin, Mg-bacteriochlorin, and bacteriochlorophylls a, b, c, d, e, f, g, and h studied by semiempirical and ab initio MO/CI methods

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 105, Issue 15, 2001, Pages 3855-3866

  Linnanto, Juha ^a   Korppi Tommola, Jouko ^a  

^a UNIVERSITY OF JYVÄSKYLÄ   (Finland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

SPECTROSCOPIC PROPERTIES;

ABSORPTION; BACTERIOLOGY; COORDINATION REACTIONS; MAGNESIUM COMPOUNDS; MOLECULAR STRUCTURE; ORGANIC SOLVENTS; PHOTOSYNTHESIS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

CHLOROPHYLL;

EID: 0035912428     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0021547     Document Type: Article

References (89)

1. Imhoff, J. F. In Anoxygenic Photosynthetic Bacteria; Blankenship, R. E., Madigan, M. T., Bauer, C. R, Eds.; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 1995; pp 1-15.
2. Senge, O. M.; Schmith, K. M. In Anoxygenic Photosynthetic Bacteria; Blankenship, R. E., Madigan, M. T., Bauer, C. E., Eds.; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 1995; pp 137-149.
3. Scheer, H. In Chlorophylls; Scheer, H., Ed.; CRC Press: Boca Raton, FL, 1991; pp 3-17.
4. Madigan, M. T.; Ormerod, J. G. In Anoxygenic Photosynlhelic Bacteria; Blankenship, R. E., Madigan, M. T., Bauer, C. E. Eds.; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 1995; pp 17-30.
5. Thompson, M. A.; Fajer, J. J. Phys. Chem. 1992, 96, 2933.
6. Chow, H.-C; Serlin, R.; Strouse, C. E. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 7230.
7. Serlin, R.; Chow, H.-C.; Strouse, C. E. /. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 7237.
8. Kratsky, C.; Dunitz, J. D. Ada Crystallogr. B 1975, 31, 1586.
9. Kratsky, C.; Dunitz, J. D. Ada Crystallogr. B 1977, 33, 545.
10. Kratsky, C.; Isenring, H. P.; Dunitz, J. D. Ada Crystallogr. B 1977, 33, 547.
11. Barkiga, K. M.; Gottfried, D. S. Ada Crystallogr. C1994,50,2069.
12. Barkiga, K. M.; Chantranupong, L.; Smith, K. M.; Fajer, J. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 7566.
13. Barkiga, K. M.; Fajer, J.; Chang, C. K.; Young, R. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 6457.
14. Barkiga, K/ M.; Miura, M.; Thompson, M. A.; K. M.; Fajer, J. Inorg. Chem. 1991, 30, 2233.
15. Miller, K. R. Nature 1982, 300, 53.
16. Deisenhofer, J.; Epp, O.; Miki, R.; Huber, R.; Michel, H. Nature 1985,3/5,618.
17. Chang, C. H.; Tiede, D.; Tang, J.; Smith, H.; Norris, J. R.; Schiffer, M. FEBS Lett. 1986, 205, 82.
18. McDermott, G.; Prince, S. M.; Feer, A. A.; HawthornthwaiteLawless, A. M.; Papiz, M.'Z.; Cogdell, R. J.; Isaacs, N. W. Nature 1995, 374, 517.
19. Koepke, J.; Hu, X.; Muenke, C.; Schulten, K.; Michel, H. Structure 1996,4,581.
20. Hoff, A. J.; Amesz, J. In Chlorophylls; Scheer, H., Ed.; CRC Press: Boca Raton, FL, 1991; pp 723-738.
21. Dorough, G. D.; Miller, J. R. J. Am. Chem. Soc. 1952, 74, 6106.
22. Bellacchio, E.; Sauer, K. J. Phys. Chem. 1999, 103B, 2279.
23. Umetsu, M.; Wang, Z.-Y.; Kab'ayashi, M.; Nozawa, T. Biochim. Biophys'.Acta 1999, 1410, 19.
24. Planner, A.; Dudkowiak, A J. Photochem. Photobiol. 1998, 115, 151.
25. Lapogue, K.; Naveke, A.; Gall, A.; Ivancich, A.; Seguin, J.; Scheer, H.; Strugis, J. N.; Mattioli, T. A.; Robert, B. Biochemistry 1999,38, 11115.
26. Nishizawa, E.; Hashimoto, H.; Koyama, Y. Chem. Phys. Lett. 1991, 181, 387.
27. Thijssen, H. P. H.; Volker, S. Chem. Phys. Lett. 1981, 82, 478.
28. Jeffrey, S. W. Biochim. Biophys. Ada 1969, 777, 456.
29. Miller, M.; Gillbro, T.; Oison, J. M. Photochem. Photobiol. 1993, 57, 98.
30. Steensgard, D. B.; Matsuura, K.; Cox, R. P.; Miller, M. Photochem. Photobiol. 1993, 57, 98.
31. Frackowiak, D.; Dudkowiak, A.; Ptak, A.; Malak, H.; Gryczynski, I.; Zelent, B. J. Photochem. Photobiol. 1999, 44B, 231.
32. x, and Soret regions.
33. x, and Soret regions.
34. Borrego, C. M.; Arellano, J. B.; Abella, C. A.; Gillbro, T.; GarciaGil, J. Photosynth. Res. 1999, 60, 257.
35. Linnanto, J.; Korppi-Tommola, J. E. L; Helenius, V. M. J. Phys. Chem. 1999, 103B, 8739.
36. Linnanto, J.; Korppi-Tommola, J. E. I. J. Chin. Chem. Soc. 2000, 47,657.
37. Hasegawa, J.; Ozeki, Y.; Ohkawa, K.; Hada, M.; Nakatsuji, H. J. Phys. Chem. 1998, 102B, 1320.
38. Ghosh, A. J. Phys. Chem. 1997, 101B, 3290.
39. Facelli, J. C. J. Phys. Chem. 1997, 102B, 2111.
40. Marchi, M.; Hutter, J.; Parrinello, M. J. Am. Cljem. Soc. 1996,118, 7847.
41. Zhang, L. Y.; Friesner, R. A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 16479.
42. Hanson, L. K.; Fajer, J.; Thompson, M. A.; Zerner, M. C. J. Am. Chem. Soc. 1987, 709, 4728.
43. Linnanto, J.; Korppi-Tommola, J. E. I. Phys. Cltem. Cliem. Phys. 2000, 2, 4962.
44. Stewart, J. J. P. J. Compta. Chem. 1989, 10, 209.
45. SPARTAN, version 5.0, revision A; Wavefunction Inc.: Irvine, CA, 1993, 1994.
46. Stewart, J. J. P. QCPE Bull. 1985, 5, 133.
47. Ridley, J. E.; Zerner, M. C. Theor. Chim. Acta (Bed.) 1973, 32, 111.
48. Ridley, J. E.; Zerner, M. C. Theor. Chim. Acta (Berl.) 1976, 42, 223.
49. Zemer, M. C.; Loew, G. H.; Kirchner, R. F.; Mueller-Westerhoff, U. T. J. Am. Chem. Soc. 1980, 702, 589.
50. HyperChem Computational Chemistry, Pan -2: Theory and Methods; Hypercube, Inc.; Publication HC40-00-03-00.
51. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Keith, T.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; Al-Laham, M. A.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S.; Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; HeadGordon, M.; Gonzalez, C.; Pople J. A. Gaussian 94, revision B.l; Gaussian Inc.: Pittsburgh, PA, 1995
52. Pilar, F. L. Elementary Quantum Chemistry; McGraw-Hill: New York, 1990; p 300.
53. Petke, J. D.; Maagiora, G. M.; Shipman, L. L.; Christoffersen, R. E. J. Mol. Spectrosc. 1978, 71, 64.
54. Petke, J. D.; Maggiora, G. M.; Shipman, L. L.; Christoffersen, R. E. J. Mol. Spectrosc. 1978, 73, 311.
55. Seely, G. R.; Jensen, R. G. Speclrochim. Acta 1965, 21, 1835.
56. Umetsu, M.; Wang, Z.-Y.; Kobayashi, M.; Nozawa, T. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1410, 19.
57. Seely, G. R.; Jensen, R. G. Spectrochim. Acta 1965, 21, 1835.
58. Serlin, R.; Chow, H.-C.; Strouse, C. E. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 7230.
59. Stewart, J. J. P. J. Comput. Chem. 1991, 12, 320.
60. Katz, J. J.; Closs, G. L.; Pennington, F. C.; Thomas, M. R.; Strain, H. H. J. Am. Client. Soc. 1963, 85, 3801.
61. Boxer, S. G.; Closs, G. L.; Katz, J. J. J. Am. Chem. Soc. 1974, 96, 7058.
62. Renge, I.; Avarmaa, R. Photochem. Photobiol. 1985, 42, 253.
63. Fujiwara, M.; Tasumi, M. J. Phys. Chem. 1986, 90, 250.
64. Koyama, Y.; Umemoto, Y.; Akamatsu, A.; Uehara, K.; Tanaka, M. J. Mol. Struct. 1986, 146, 273.
65. Sato, H.; Okada, K.; Uehara, K.; Ozaki, Y. Photochem. Pholobiot. 1995, 61, 175.
66. CIoss, G. L.; Katz, J. J.; Pennington, F. C; Thomas, M. R.; Strain, H. H. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 3809.
67. Sauer, K.; Smith, J. R. L.; Schultz, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1966, 88, 2681.
68. Ballschmiter, K.; Katz, J. J. J. Am. Chem. Soc. 1969, 91, 2661.
69. Ballschmiter, K.; Truesdell, K.; Katz, J. J. Biochim. Biophys. Acta 1969, 184, 604.
70. Katz, J. J.; Janson, T. R.; Kostka, A. G.; Uphaus, R. A. J. Am. Chem. Soc. 1972, 94, 2883.
71. Trifunac, A. D.; Katz, J. J. J. Am. Chem. Soc. 1974, 96, 5233.
72. Hynninen, P. H. Z Naturforsch. 1984, 39B, 675.
73. Kooyman, R. P. H.; Schaafsma, T. J. J. Am. Chem. Soc. 1984,106, 551.
74. Abraham, R. J.; Goff, D. A.; Smith, K. M. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1988, J, 2443.
75. Thibodeau, D. L.; Koningstein, J. A. J. Phys. Chem. 1989,93,7713.
76. Hynninen, P. H.; Lötjönen, S. Biochim. Biophys. Acta 1993, 1183, 381.
77. Oba, T.; Furukawa, H.; Wang, Z.-Y.; Nozawa, T.; Mimuro, M.; Tamiaki, H.; Watanabe, T. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 7882.
78. Fong, F. K.; Koester, V. J. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 6888.
79. Abraham, R. J.; Smith, K. M. J. Am. Chem. Soc. 1983, 705, 5734.
80. Katz, J. J.; Ballschmiter, K.; Garcia-Morin, M.; Strain, H. H.; Uphaus, R. A. Proc. Natl. Acad. Sei. U.S.A. 1968, 60, 100.
81. Le Brech, J.; Leblanc, R. M.; Antippa, A. F. Chem. Phys. Leu. 1974, 26, 37.
82. Fong, F. K. Proc. Natl. Acad. Sei. U.S.A. 1974, 71, 3692.
83. Fong, F. K. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 6890.
84. Shipman, L. L.; Cotton, T. M.; Norris, J. R.; Katz, J. J. Proc. Natl. Acad. Sei. U.S.A. 1976, 73, 1791.
85. Fong, F. K.; Koester, V. J.; Polies, J. S. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 6407.
86. Gurinovich, G. P.; Zenkevich, E. L; Chirvony, V. S.; Gadonas, R.; Pelakauskas, A. Exp. Technol. Phys. 1989, 37, 335.
87. Uehara, K.; Mimuro, M.; Tanaka, M. Photochem. Photobiol. 1991, 53, 371.
88. Oksanen, J. A. I.; Helenius, V. M.; Hynninen, P. H.; van Amerongen, H.; Korppi-Tommola, J. E. I.; van Grondelle, R. Photochem. Photobiol. 1996, 64, 356.
89. Oba, T.; Mimuro, M.; Wang, Z.-Y.; Nozawa, T.; Yoshida, S.; Watanabe, T. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 3261.