Construction of an electrochemical DNA chip for simultaneous genotyping of single nucleotide polymorphisms

Analyst

Volumn 130, Issue 5, 2005, Pages 687-693

  Takahashi, Masayoshi ^a   Okada, Jun ^a   Ito, Keiko ^a   Hashimoto, Michie ^a   Hashimoto, Koji ^a   Yoshida, Yuri ^b   Furuichi, Yasuhiro ^b   Ohta, Yasuhiko ^c   Mishiro, Sunji ^c   Gemma, Nobuhiro ^a  

^a TOSHIBA CORPORATION   (Japan)

^b GeneCare Research Institute Co   (Japan)

^c Shinagawa ku   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

4 [5 (4 METHYL 1 PIPERAZINYL)[2,5' BI 1H BENZIMIDAZOL] 2' YL]PHENOL; GENOMIC DNA;

ALLELE; ARTICLE; BLOOD SAMPLING; DNA MICROARRAY; ELECTROCHEMICAL ANALYSIS; ELECTRODE; GENOTYPE; HEPATITIS C; OLIGONUCLEOTIDE PROBE; POLYMERASE CHAIN REACTION; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM;

EID: 21044459955     PISSN: 00032654     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b414030n     Document Type: Article

References (44)

1. T. Sakaeda, T. Nakamura and K. Okumura, Biol. Pharm. Bull., 2002, 25, 11, 1391-1400.
2. P. Dalen, M. L. Dahl, M. Eichelbaum, L. Bertilsson and G. R. Wilkinson, Pharmacogenetics, 1999, 9, 697-706.
3. X. P. Qin, H. G. Xie, W. Wang, N. He, S. L. Huang, Z. H. Xu, D. S. Ou-Yang, Y. J. Wang and H. H. Zhou, Clin. Pharmacol. Ther., 1999, 66, 642-646.
4. R. Santacroce, A. Ratti, F. Caroli, B. Foglieni, A. Ferraris, L. Cremonesi, M. Margaglione, M. Seri, R. Ravazzolo, G. Restagno, B. Dallapiccola, E. Rappaport, E. S. Pollak, S. Surrey, M. Ferrari and P. Fortina, Clin. Chem., 2002, 48, 12, 2124-2130.
5. W. H. Chou, F. X. Yan, D. K. Robbins-Weilert, T. B. Ryder, W. W. Liu, C. Perbost, M. Fairchild, J. de Leon, W. H. Koch and P. J. Wedlund, Clin. Chem., 2003, 49, 4, 542-551.
6. R. G. Sosnowski, E. Tu, W. F. Butler, J. P. O'Connell and M. J. Heller, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1997, 94, 4, 1119-1123.
7. C. Labarca and K. Paigen, Anal. Biochem., 1980, 102, 2, 344-352.
8. M. Ozsoz, A. Erdem, K. Kerman, D. Ozkan, B. Tugrul, N. Topcuoglu, H. Ekren and M. Taylan, Anal. Chem., 2003, 75, 9, 2181-2187.
9. L. Authier, C. Grossiord and P. Brossier, Anal. Chem., 2001, 73, 18, 4450-4456.
10. J. Wang, D. Xu, A. N. Kawde and R. Polsky, Anal. Chem., 2001, 73, 22, 5576-5581.
11. K. Kerman, M. Saito, Y. Morita, Y. Takamura, M. Ozsoz and E. Tamiya, Anal. Chem., 2004, 76, 7, 1877-1884.
12. F. Patolsky, A. Lichtenstein and I. Willner, Nat. Biotechnol., 2001, 19, 3, 253-257.
13. E. Kim, K. Kim, H. Yang, Y. T. Kim and J. Kwak, Anal. Chem., 2003, 75, 21, 5665-5672.
14. Z. P. Aguilar and I. Fritsch, Anal. Chem., 2003, 75, 15, 3890-3897.
15. E. M. Boon, D. M. Ceres, T. G. Drummond, M. G. Hill and J. K. Barton, Nat. Biotechnol., 2000, 18, 10, 1096-1100.
16. M. A. Lapierre, M. O'Keefe, B. J. Taft and S. O. Kelley, Anal. Chem., 2003, 75, 22, 6327-6333.
17. J. Cha, J. I. Han, Y. Choi, D. S. Yoon, K. W. Oh and G. Lim, Biosens. Bioelectron., 2003, 18, 10, 1241-1247.
18. A. Liu and J. Anzai, Anal. Chem., 2004, 76, 10, 2975-2980.
19. M. Y. Vagin, E. E. Karyakina, T. Hianik and A. A. Karyakin, Biosens. Bioelectron., 2003, 18, 8, 1031-1037.
20. C. Fan, K. W. Plaxco and A. J. Heeger, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2003, 100, 16, 9134-9137.
21. R. M. Umek, S. W. Lin, J. Vielmetter, R. H. Terbrueggen, B. Irvine, C. J. Yu, J. F. Kayyem, H. Yowanto, G. F. Blackburn, D. H. Farkas and Y. P. Chen, J. Mol. Diagn., 2001, 3, 2, 74-84.
22. E. Palecek, M. Masarik, R. Kizek, D. Kuhlmeier, J. Hassmann and J. Schulein, Anal. Chem., 2004, 76, 19, 5930-5936.
23. M. T. Carter and A. J. Bard, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 24, 7528-7530.
24. M. Rodriguez and A. J. Bard, Anal. Chem., 1990, 62, 24, 2658-2662.
25. K. M. Millan and S. R. Mikkelsen, Anal. Chem., 1993, 65, 17, 2317-2323.
26. K. Hashimoto, K. Miwa, M. Goto and Y. Ishimori, Supramol. Chem., 1993, 2, 265-270.
27. G. Marrazza, G. Chiti, M. Mascini and M. Anichini, Clin. Chem., 2000, 46, 1, 31-37.
28. Sungbo Cho, James Jungho Pak, Jinseop Hong and Youngmi Kimpak, J Korean Phys. Soc., 2002, 41, 6, 1054-1057.
29. K, Hashimoto, K. Ito and Y. Ishimori, Anal. Chim. Acta, 1994, 286, 219-224.
30. K. Hashimoto, K. Ito and Y. Ishimori, Anal. Chem., 1994, 66, 3830-3833.
31. K. Hashimoto, K. Ito and Y. Ishimori, Sens. Actuators, B, 1998, 46, 220-225.
32. P. E. Pjura, K. Grzeskowiak and R. E. Dickerson, J. Mol. Biol., 1987, 197, 2, 257-271.
33. J. Portugal and M. J. Waring, Biochim. Biophys. Acta, 1988, 949, 2, 158-168.
34. K. Hashimoto and Y. Ishimori, Lab Chip, 2001, 1, 61-63.
35. M. Hijikata, Y. Ohta and S. Mishiro, Intervirology, 2000, 43, 124-127.
36. M. Hijikata, Y. Ohta and S. Mishiro, Intervirology, 2001, 44, 379-382.
37. M. Matsushita, M. Hijikata, M. Matsushita, Y. Ohta and S. Mishiro, J. Hepatol., 1998, 29, 695-700.
38. M. Matsushita, M. Hijikata, Y. Ohta, K. Iwata, M. Matsumoto, K. Nakao, K. Kanai, N. Yoshida, K. Baba and S. Mishiro, Arch. Virol., 1998, 143, 645-651.
39. H. Watanabe, N. Enomoto, K. Nagayama, N. Izumi, F. Marumo, C. Sato and M. Watanabe, J. Infect. Dis., 2001, 183, 1195-1203.
40. R. G. Sosnowski, E. Tu, W. F. Butler, J. P. O'Connell and M. J. Heller, Proc. Natl. Acad. Sci., U. S. A., 1997, 94, 4, 1119-1123.
41. V. Lyamichev, A. L. Mast, J. G. Hall, J. R. Prudent, M. W. Kaiser, T. Takova, R. W. Kwiatkowski, T. J. Sander, M. de Arruda, D. A. Arco, B. P. Neri and M. A. Brow, Nat. Biotechnol., 1999, 17, 292-296.
42. W. N. Vreeland, R. J. Meagher and A. E. Barron, Anal. Chem., 2002, 74, 17, 4328-4333.
43. M. A. Iannone, J. D. Taylor, J. Chen, M. S. Li, P. Rivers, K. A. Slentz-Kesler and M. P. Weiner, Cytometry, 2000, 39, 2, 131-140.
44. M. V. Myakishev, Y. Khripin, S. Hu and D. H. Hamer, Genome Res., 2001, 11, 1, 163-169.