Differential influence of dynamic processes on forward and reverse electron transfer across a protein-protein interface

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 102, Issue 10, 2005, Pages 3564-3569

  Hoffman, Brian M ^a   Celis, Laura M ^a   Cull, Deborah A ^a   Patel, Ami D ^a   Seifert, Jennifer L ^a   Wheeler, Korin E ^a   Wang, Jingyun ^a   Yao, Jiang ^a   Kurnikov, Igor V ^a   Nocek, Judith M ^a  

^a NORTHWESTERN UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Cytochrome c; Cytochrome c peroxidase; Dynamics; Hemoglobin; Myoglobin

Indexed keywords

CYTOCHROME B5; CYTOCHROME C; CYTOCHROME C PEROXIDASE; FERRYLMYOGLOBIN; HEMOGLOBIN A;

ARTICLE; ELECTRON TRANSPORT; HUMAN; HUMAN CELL; MEASUREMENT; MOLECULAR DYNAMICS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; VISCOSITY;

CYTOCHROME-C PEROXIDASE; CYTOCHROMES C; ELECTRON TRANSPORT; HEMOGLOBINS; HUMANS; MYOGLOBIN; PROTEIN CONFORMATION; PROTEINS; VISCOSITY;

EID: 20144370426     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0408767102     Document Type: Article

References (51)

1. Balzani, V. (2001) Electron Transfer in Chemistry (Wiley, New York).
2. Marcus, R. A. & Sutin, N. (1985) Biochim. Biophys. Acta 811, 265-322.
3. Nocek, J. M., Zhou, J. S., De Forest, S., Priyadarshy, S., Beratan, D. N., Onuchic, J. N. & Hoffman, B. M. (1996) Chem. Rev. 96, 2459-2489.
4. Liang, Z.-X., Kurnikov, I. V., Nocek, J. M., Mauk, A. G., Beratan, D. N. & Hoffman, B. M. (2004) J. Am. Chem. Soc. 126, 2785-2798.
5. Salemme, F. R. (1976) J. Mol. Biol. 102, 563-568.
6. McLendon, G. & Hake, R. (1992) Chem. Rev. 92, 481-490.
7. Northrup, S. H., Thomasson, K. A., Miller, C. M., Barker, P. D., Eltis, L. D., Guillemette, J. G., Inglis, S. C. & Mauk, A. G. (1993) Biochemistry 32, 6613-6623.
8. Bendall, D. S. (1996) Protein Electron Transfer (BIOS Scientific, Oxford).
9. Nocek, J. M., Sishta, B. P., Cameron, J. C., Mauk, A. G. & Hoffman, B. M. (1997) J. Am. Chem. Soc. 119, 2146-2155.
10. Zhu, Z., Cunane, L. M., Chen, Z.-W., Durley, R. C. E., Mathews, F. S. & Davidson, V. L. (1998) Biochemistry 37, 17128-17136.
11. Hoffman, B. M., Ratner, M. A. & Wallin, S. A. (1990) in Advances in Chemistry, eds. Johnson, M. K., King, R. B., Kurtz, D. M., Jr., Kutal, C., Norton, M. L. & Scott, R. A. (Am. Chem. Soc., Washington, DC), Vol. 226, pp. 125-146.
12. Pletneva, E. V., Fulton, D. B., Kohzuma, T. & Kostic, N. M. (2000) J. Am. Chem. Soc. 122, 1034-1046.
13. Davidson, V. L. (1996) Biochemistry 35, 14035-14039.
14. Liang, Z.-X., Nocek, J., Huang, K., Hayes, R. T., Kurnikov, I. V., Beratan, D. N. & Hoffman, B. M. (2002) J. Am. Chem. Soc. 124, 6849-6859.
15. Naito, N., Huang, H., Sturgess, W., Nocek, J. M. & Hoffman, B. M. (1998) J. Am. Chem. Soc. 120, 11256-11262.
16. Natan, M. J., Kuila, D., Baxter, W. W., King, B. C., Hawkridge, F. M. & Hoffman, B. M. (1990) J. Am. Chem. Soc. 112, 4081-4082.
17. Qin, L. & Kostic, N. M. (1994) Biochemistry 55, 12392-12399.
18. Ivkovic-Jensen, M. M., Ullmann, G. M., Crnogorac, M. M., Ejdebaeck, M., Young, S., Hansson, O. & Kostic, N. M. (1999) Biochemistry 38, 1589-1597.
19. Beratan, D. N., Onuchic, J. N., Winkler, J. R. & Gray, H. B. (1992) Science 258, 1740-1741.
20. Winkler, J. R. (2000) Curr. Opin. Chem. Biol. 4, 192-198.
21. Ho, P. S., Hoffman, B. M., Kang, C. H. & Margoliash, E. (1983) J. Biol. Chem. 258, 4356-4363.
22. Mauro, J. M., Fishel, L. A., Hazzard, J. T., Meyer, T. E., Tollin, G., Cusanovich, M. A. & Kraut, J. (1988) Biochemistry 27, 6243-6256.
23. Seifert, J. L. (2005) Ph.D. thesis (Northwestern University, Evanston, IL).
24. Pelletier, H. & Kraut, J. (1992) Science 258, 1748-1755.
25. Williams, R. C. & Tsay, K. (1973) Anal. Biochem. 54, 137-145.
26. Yip, Y. K, Waks, M. & Beychok, S. (1977) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74, 64-68.
27. Naito, A., Hui, H. L., Noble, R. W. & Hoffman, B. M. (2001) Biochemistry 40, 2060-2065.
28. Funk, W. D., Lo, T. P., Mauk, M. R., Brayer, G. D., MacGillivray, R. T. A. & Mauk, A. G. (1990) Biochemistry 29, 5500-5508.
29. Lloyd, E., Ferrer, J. C., Funk, W. D., Mauk, M. R. & Mauk, A. G. (1994) Biochemistry 33, 11432-11437.
30. Guillemette, J. G., Matsushima-Hibiya, Y., Atkinson, T. & Smith, M. (1991) Protein Eng. 4, 585-592.
31. Fitzgerald, M. M., Churchill, M. J., McRee, D. E. & Goodin, D. B. (1994) Biochemistry 33, 3807-3818.
32. Goodin, D. B., Davidson, M. G., Roe, J. A., Mauk, A. G. & Smith, M. (1991) Biochemistry 30, 4953-4962.
33. Asakura, T. & Yonetani, T. (1969) J. Biol. Chem. 244, 537-544.
34. Pollack, W. B. R., Rosell, F. I., Twitchett, M. B., Dumont, M. E. & Mauk, A. G. (1998) Biochemistry 37, 6124-6131.
35. Miner, C. S. & Dalton, N. N. (1953) Glycerol (Reinhold, New York).
36. McGourty, J. L., Peterson-Kennedy, S. E., Ruo, W. Y. & Hoffman, B. M. (1987) Biochemistry 26, 8302-8312.
37. Liang, Z.-X., Nocek, J. M., Kurnikov, I. V., Beratan, D. N. & Hoffman, B. M. (2000) J. Am. Chem. Soc. 122, 3552-3553.
38. Naito, N. R. (1999) Ph.D. thesis (Northwestern University, Evanston, IL).
39. Steinfeld, J. I., Francisco, J. S. & Hase, W. L. (1989) Chemical Kinetics and Dynamics (Prentice-Hall, Englewood Cliffs, NJ).
40. Peterson-Kennedy, S. E., McGourty, J. L., Kalweit, J. A. & Hoffman, B. M. (1986) J. Am. Chem. Soc. 108, 1739-1746.
41. Nocek, J. M., Stemp, E. D. A., Finnegan, M. G., Koshy, T. I., Johnson, M. K., Margoliash, E., Mauk, A. G., Smith, M. & Hoffman, B. M. (1991) J. Am. Chem. Soc. 113, 6822-6831.
42. Nocek, J. M., Liang, N., Wallin, S. A., Mauk, A. G. & Hoffman, B. M. (1990) J. Am. Chem. Soc. 112, 1623-1625.
43. Nocek, J., Hatch, S. L., Seifert, J. L., Hunter, G., Thomas, D. D. & Hoffman, B. M. (2002) J. Am. Chem. Soc. 124, 9404-9411.
44. Ivkovic-Jensen, M. M. & Kostic, N. M. (1997) Biochemistry 36, 8135-8144.
45. Grove, T. Z. & Kostic, N. M. (2003) J. Am. Chem. Soc. 125, 10598-10607.
46. Tetreault, M., Rongey, S. H., Feher, G. & Okamura, M. Y. (2001) Biochemistry 40, 8452-8462.
47. Feng, C., Kedia, R. V., Hazzard, J. T., Hurley, J. K., Tollin, G. & Enemark, J. H. (2002) Biochemistry 41, 5816-5821.
48. Balabin, I. A. & Onuchic, J. N. (2000) Science 290, 114-117.
49. Autenrieth, F., Tajkhorshid, E., Schulten, K. & Luthey-Schulten, Z. (2004) J. Phys. Chem. B 108, 20376-20387.
50. Guo, M., Bhaskar, B., Li, H., Barrows, T. P. & Poulos, T. L. (2004) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 5940-5945.
51. Goldbeck, R. A., Paquette, S. J. & Kliger, D. S. (2001) Biophys. J. 81, 2919-2934.