Electronic structure of the nucleobases

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 109, Issue 16, 2005, Pages 7749-7757

  MacNaughton, J ^a   Moewes, A ^a   Kurmaev, E Z ^b  

^a UNIVERSITY OF SASKATCHEWAN   (Canada)

^b INSTITUTE OF METAL PHYSICS   (Russian Federation)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION SPECTROSCOPY; BIOLOGICAL MATERIALS; ELECTRONIC STRUCTURE; ENERGY GAP; EXTRAPOLATION; NANOSTRUCTURED MATERIALS; PHOSPHATES; PROBABILITY DENSITY FUNCTION;

MOLECULAR RECOGNITION; NANOWIRES; NUCLEOBASES; X-RAY ABSORPTION SPECTROSCOPY (XAS); X-RAY EMISSION SPECTROSCOPY (XES);

DNA;

ADENINE; CYTOSINE; GUANINE; THYMINE;

ARTICLE; CHEMISTRY; COMPARATIVE STUDY; SPECTROSCOPY; X RAY;

ADENINE; CYTOSINE; GUANINE; SPECTRUM ANALYSIS; THYMINE; X-RAYS;

EID: 18544366125     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0463058     Document Type: Article

References (41)

1. Robertson, N.; McGowan, C. A. Chem. Soc. Rev. 2003, 32, 96.
2. Braun, E.; Eichen, Y.; Sivan, U.; Ben-Yoseph, G. Nature 1998, 391, 775.
3. de Pablo, P. J.; Moreno-Herrero, F.; Colchero, J.; Gómez Herrero, J.; Herrero, P.; Baró, A. M.; Ordejón, P.; Soler, J. M.; Artacho, E. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 4992.
4. Storm, A. J.; van Noort, J.; de Vries, S.; Dekker, C. Appl. Phys. Lett. 2001, 79, 3881.
5. Tran, P.; Alavi, B.; Gruner, G. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 1564.
6. Porath, D.; Bezryadin, A.; de Vries, S.; Dekker, C. Nature 2000, 403, 635.
7. Yoo, K.-H.; Ha, D. H.; Lee, J.-O.; Park, J. W.; Kim, J.; Kim, J. J.; Lee, H.-Y.; Kawai, T.; Choi, H. Y. Phys. Rev. Lett. 2001, 87, 198102.
8. Rakilin, A.; Aich, P.; Papadopoulos, C.; Kobzar, Y.; Vedeneev, A. S.; Lee, J. S.; Xu, J. M. Phys. Rev. Lett. 2001, 86, 3670.
9. Fink, H.-W.; Schönenberger, C. Nature 1999, 398, 407.
10. Kasumov, A. Yu.; Kociak, M.; Guéron, S.; Reulet, B.; Volkov, V. T.; Klinov, D. V.; Bouchiat, H. Science 2001, 291, 280.
11. Zhang, M.-L.; Miao, M. S.; Van Dogen, V. E.; Ladik, J. J.; Mintmire, J. W. J. Chem. Phys. 1999, 111, 8696.
12. Felice, R. D.; Calzorali, A.; Molinari. E.; Garbezi, A. Phys. Rev. B 2001, 65, 45104.
13. Reha, D.; Kabelac, M.; Ryjacek, F.; Sponer, J.; Sponer, J. E.; Elstner, M.; Suhai, S.; Hobza, P. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3366.
14. Calzorali, A.; Felice, R. D.; Molinari, E.; Garbesi, A. Physica E 2002, 13, 1236.
15. Calzolari, A.; Felice, R. D.; Molinari, E.; Garbezi, A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 2509.
16. Honorio, K. M.; Da Silva, A. B. F. Int. J. Quantum Chem. 2003, 95, 126.
17. Bogar, F.; Ladik, J. Chem. Phys. 1998, 237, 273.
18. Isaacson, Michael J. Chem. Phys. 1972, 56, 1813.
19. Moewes, A.; MacNaughton, J.; Wilks, R.; Lee, J. S.; Wettig, S. D.; Kraatz, H.-B.; Kunnaev, E. Z. J. Electron Spectrosc. Relat. Phenom. 2004, 137-140, 817.
20. Kirtley, S. M.; Mullins, O. C.; Chen, J.; van Elp, J.; George, S. J.; Chen, C. T.; O'Halloran, T.; Cramer, S. P. Biochim. Biophys. Acta 1992, 1132, 249.
21. Fujii, K.; Akamatsu, K.; Muramatsu, Y.; Yokoya, A. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res., Sect. B 2003, 199, 249.
22. Jia, J. J.; Calicott, T. A.; Yurkas, J.; Ellis, A. W.; Himpsel, F. J.; Samant, M. G.; Stöhr, J.; Ederer, D. L.; Carlisle, J. A.; Hudson, E. A.; Terminello, L. J.; Shun, D. K.; Perera, R. C. C. Rev. Sci. Instrum. 1995, 66, 1394.
23. Carlisle, J. A.; Blankenship, S. R.; Terminello, L. J.; Jia, J. J.; Callcott, T. A.; Ederer, D. L.; Perera, R. C. C.; Himpsel, F. J. J. Electron Spectrosc. Relat. Phenom. 2000, 110, 323.
24. Fomichev, V. A.; Rumsh, M. A. J. Phys. Chem. Solids 1968, 29, 1015.
25. Lusvardi, V. S.; Barteau, M. A.; Chen, J. G.; Eng, J., Jr.; Frühberger, B.; Teplyakov, A. Surf. Sci. 1998, 597, 237.
26. Kosugi, N. Theor. Chim. Acta 1987, 72, 149.
27. Kosugi, N.; Kuroda, H. Chem. Phys. Lett. 1980, 74, 490.
28. Hunt, W. J.; Goddard, W. A., III Chem. Phys. Lett. 1969, 3, 414.
29. Huzdnaga, S.; Andzelm, J.; Klobukowski, M.; Radzio-Andzelm, E.; Sakai, Y.; Tatewaki, H. Gaussian Basis Sets for Molecular Calculations; Elsevier: Amsterdam, 1984.
30. Hermann, K.; Pettersson, L. G. M.; Casida, M. E.; Daul, C.; Goursot, A.; Koester, A.; Proynov, E.; St-Amant, A.; Salahub, D. R.; Carravetta, V.; Duarte, H.; Godbout, N.; Guan, J.; Jamorski, C.; Leboeuf, M.; Malkin, V.; Malkina, O.; Nyberg, M.; Pedocchi, L.; Sim, F.; Triguero, L.; Vela, A. StoBe-deMon, version 1.0; StoBe Software: Berlin, 2002.
31. Becke, A. D. Phys. Rev A 1988, 38, 3098.
32. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822.
33. Triguero, L.; Pettersson, L. G. M.; Ågren, H. Phys. Rev. B 1998, 58, 8097.
34. Kolczewski, C; Püttner, R.; Plashkevych, O.; Ågren, H.; Staemmler, V.; Martins, M.; Snell, G.; Schlachter, A. S.; Sant'Anna, M.; Kaindl, G.; Pettersson, L. G. M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 6426.
35. Kutzelnigg, W.; Fleischer, U.; Schindler, M. NMR-Basic Principles and Progreis; Springer-Verlag: Heidelberg, 1990.
36. Triguero, L.; Pettersson, L. G. M.; Ågren, H. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 10599.
37. Thewalt, U.; Bugg, C. E.; Marsh, R. E. Acta Crystalhgr., Sect. B 1971, 27, 2358.
38. Barker, D. L.; Marsh, R. E. Acta Crystallogr. 1964, 17, 1581.
39. van Buuren, T.; Dinh, L. N.; Chase, L. L.; Siekhaus, W. J.; Terminello, L. J. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 3803.
40. Luning, J.; Rockenberger, J.; Eisebitt, S.; Rubensson, J.-E.; Karl, A.; Kornowski, A.; Weller, H.; Eberhardt, W. Solid State Commun. 1999, 112, 5.
41. McGuinness, C.; Fu, D.; Downes, J. E.; Smith, K. E. J. Appl. Phys. 2003, 94, 3919.