Characterization of the Cargo Attachment Complex of Cytoplasmic Dynein Using NMR and Mass Spectrometry

Methods in Enzymology

Volumn 380, Issue , 2004, Pages 219-241

  Barbar, Elisar ^a   Hare, Michael ^a  

^a OHIO UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DYNEIN ADENOSINE TRIPHOSPHATASE; PROTEIN SUBUNIT;

AMINO TERMINAL SEQUENCE; ARTICLE; BINDING SITE; CYTOPLASM; ENZYME STRUCTURE; MASS SPECTROMETRY; NONHUMAN; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ASSEMBLY; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN FOLDING; PROTEIN FUNCTION; PROTEIN LOCALIZATION; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; SPECTROFLUOROMETRY; STRUCTURE ANALYSIS; TEMPERATURE DEPENDENCE;

EID: 1542379807     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(04)80011-9     Document Type: Article

References (37)

1. T. Hays and M. G. Li, Curr. Biol. 11, R136 (2001).
2. M. McGrail and T. S. Hays, Development 124, 2409 (1997).
3. C. M. Pfarr, M. Coue, P. M. Grissom, T. S. Hays, M. E. Porter, and J. R. McIntosh, Nature 345, 263 (1990).
4. R. B. Vallee, C. Y. Tai, N. E. Faulkner, and D. L. Dujardin, J. Gen. Physiol. 118, 12 (2001).
5. I. Corthesytheulaz, A. Pauloin, and S. R. Pfeffer, J. Cell Biol. 118, 1333 (1992).
6. B. M. Paschal and R. B. Vallee, Nature 330, 181 (1987).
7. U. Goodenough and J. Heuser, J. Mol. Biol. 180, 1083 (1984).
8. D. I. Nurminsky, M. V. Nurminskaya, E. V. Benevolenskaya, Y. Y. Shevelyov, D. L. Hartl, and V. A. Gvozdev, Mol. Cell. Biol. 18, 6816 (1998).
9. S. M. King, E. Barbarese, J. F. Dillman, S. E. Benashski, K. T. Do, R. S. Patel-King, and K. K. Pfister, Biochemistry 37, 15033 (1998).
10. S. M. King, Biochim. Biophys. Acta 1496, 60 (2000).
11. W. Steffen, S. Karki, K. T. Vaughan, R. B. Vallee, E. L. F. Holzbaur, D. G. Weiss, and S. A. Kuznetsov, Mol. Biol. Cell. 8, 2077 (1997).
12. S. Karki and E. L. F. Holzbaur, Curr. Opin. Cell Biol. 11, 45 (1999).
13. A. R. Kini and C. A. Collins, Cell Motil. Cytoskeleton 48, 52 (2001).
14. P. Romero, Z. Obradovic, X. H. Li, E. C. Garner, C. J. Brown, and A. K. Dunker, Proteins Struct. Func. Genet. 42, 38 (2001).
15. A. Bateman, E. Birney, L. Cerruti, R. Durbin, L. Etwiller, S. R. Eddy, S. Griffiths-Jones, K. L. Howe, M. Marshall, and E. L. L. Sonnhammer, Nucleic Acids Res. 30, 276 (2002).
16. S. Ma, L. Trivinos-Lagos, R. Graf, and R. L. Chisholm, J. Cell Biol. 147, 1261 (1999).
17. J. Carey, Methods Enzymol. 328, 499 (2000).
18. M. Makokha, M. Hare, M. Li, T. Hays, and E. Barbar, Biochemistry 41, 4302 (2002).
19. E. Barbar, B. Kleinman, D. Imhoff, M. Li, T. Hays, and M. Hare, Biochemistry 40, 1596 (2001).
20. M. Makokha and E. Barbar, Biophys. J. 80, 2530 (2001).
21. K. Langsetmo, W. F. Stafford, K. Mabuchi, and T. Tao, J. Biol. Chem. 276, 34318 (2001).
22. J. Liang, S. R. Jaffrey, W. Guo, S. H. Snyder, and J. Clardy, Nat. Struct. Biol. 6, 735 (1999).
23. F. Delaglio, S. Grzesiek, G. W. Vuister, G. Zhu, J. Pfeifer, and A. Bax, J. Biomol. NMR 6, 277 (1995).
24. D. E. Zimmerman, C. A. Kulikowski, Y. P. Huang, W. Q. Feng, M. Tashiro, S. Shimotakahara, C. Y. Chien, R. Powers, and G. T. Montelione, J. Mol. Biol. 269, 592 (1997).
25. N. J. Greenfield, Y. J. Huang, T. Palm, G. V. T. Swapna, D. Monleon, G. T. Montelione, and S. E. Hitchcock-DeGregori, J. Mol. Biol. 312, 833 (2001).
26. H. Kuboniwa, S. Grzesiek, F. Delaglio, and A. Bax, J. Biomol. NMR 4, 871 (1994).
27. P. Guntert, C. Mumenthaler, and K. Wuthrich, J. Mol. Biol. 273, 283 (1997).
28. R. A. Laskowski, J. A. C. Rullmann, M. W. MacArthur, R. Kaptein, and J. M. Thornton, J. Biomol. NMR 8, 477 (1996).
29. M. Makokha, Y. Huang, G. Montelione, A. S. Edison, and E. Barbar, Protein Science, in press.
30. M. Salzmann, K. Pervushin, G. Wider, H. Senn, and K. Wuthrich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 13585 (1998).
31. J. Fiaux, E. B. Bertelsen, A. L. Horwich, and K. Wuthrich, Nature 418, 207 (2002).
32. J. W. Peng and G. Wagner, Methods Enzymol. 239, 563 (1994).
33. A. Scaloni, N. Miraglia, S. Orru, P. Amodeo, A. Motta, G. Marino, and P. Pucci, J. Mol. Biol. 277, 945 (1998).
34. C. Zwahlen, P. Legault, S. J. F. Vincent, J. Greenblatt, R. Konrat, and L. E. Kay, J. Am. Chem. Soc. 119, 6711 (1997).
35. Y. K. Chae, F. Abildgaard, E. R. Chapmann, and J. L. Markley, J. Biol. Chem. 273, 25659 (1998).
36. D. S. Garrett, Y. J. Seok, A. Peterkofsky, A. M. Gronenborn, and G. M. Clore, Nat. Struct. Biol. 6, 166 (1999).
37. C. J. Penkett, C. M. Dobson, L. J. Smith, J. R. Bright, A. R. Pickford, I. D. Campbell, and J. R. Potts, Biochemistry 39, 2887 (2000).