Hydrogen atom loss in pyrimidine DNA bases induced by low-energy electrons: Energetics predicted by theory

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 108, Issue 49, 2004, Pages 19013-19019

  Li, Xifeng ^a   Sevilla, Michael D ^b   Sanchet, Léon ^a  

^a UNIVERSITY OF SHERBROOKE   (Canada)

^b OAKLAND UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTRON AFFINITIES; HYDROGEN ATOMS; LOW-ENERGY ELECTRONS (LEE); PYRIMIDINE;

ATOMS; CHEMICAL MODIFICATION; DISSOCIATION; ELECTRON ENERGY LEVELS; ELECTRONS; HYDROGEN; NEGATIVE IONS; SURFACES;

DNA;

EID: 10844268728     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp046343r     Document Type: Article

References (34)

1. Scheer, A. M.; Aflatooni, K.; Gallup, G. A.; Burrow, P. D. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 068102.
2. Abdoul-Carime, H.; Gohlke, S.; Illenberger, E. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 166103.
3. Hanel, G.; Gstir, B.; Denifl, S.; Scheicr, P.; Probst, M.; Farizon, B.; Farizon, M.; Illenberger, E.; Märk, T. D. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 188104.
4. Denifl, S.; Ptasińska, S.; Probst, M.; Hrusak, J.; Scheier, P.; Märk, T. D. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6562-6569.
5. Denifl, S.; Ptasińska, S.; Cingel, M.; Matejcik, S.; Scheier, P.; Märk, T. D. Chem. Phys. Lett. 2003, 377, 74-80.
6. Abouaf, R.; Pommier, J.; Dunet, H. Int. J. Mass Spectrom, 2003, 226, 397-403.
7. Dugal, P. C.; Abdoul-Carime, H.; Sanche, L. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 5610.
8. Huels, M. A.; Hahndorf, I.; Illenberger, E.; Sanche, L. J. Chem. Phys. 1998, 108, 1309.
9. Sanche, L. Mass Spectrom. Rev. 2002, 21, 349-369.
10. Pan, X.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Sanche, L. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 208102.
11. Ptasińska, S.; Denifl, S.; Scheier, P.; Märk, T. D. J. Chem. Phys. 2004, 120, 8505.
12. Antic, D.; Parenteau, L.; Sanche, L. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 4711-4716.
13. Boudniffa, B.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Huels, M. A.; Sanche, L. Science 2000, 287, 1658.
14. Huels, M. A.; Boudaiffa, B.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Sanche, L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4467-4477.
15. Martin, F.; Burrow, P. D.; Cai, Z.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Sanche, L. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 068101-1.
16. Collins, G. Sci. Am. 2003, 289, 26-28
17. Li, X.; Sevilla, M. D.; Sanche, L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13668-13669
18. Berdys, J.; Anusiewicz, I.; Skurski, P.; Simons, J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6441-6447.
19. von Sonntag, C. The Chemical Basis for Radiation Biology, Taylor and Francis: London, 1987.
20. Li, X.; Sanche, L.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 5472-5476
21. Gaussian 98, revision A.7; Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scusería, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Mälick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. I.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 1998.
22. Rienstra-Kiracofe, J. C.; Tschumper, G. S.; Schaefer, H. P., III. Chem. Rev. 2002, 102, 231-282.
23. Li, X.; Cai, Z.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1596-1603.
24. Vera, D. M. A.; Pierini, A. B. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2899-2903.
25. Gaussian 03, revision B.05: Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; and Pople, J. A. Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003.
26. Spartan '04, Wavefunction, Inc., Irvine, CA.
27. Li, X.; Cai, Z.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 10115-23.
28. Dolguunitcheva, O.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 8782-6.
29. Ochterski, J. W.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A., Jr. J. Chem. Phys. 1996, 104, 2598.
30. Foresman, J. B.; Frisch, Æ. Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, 2nd ed.; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1995-96: p 157.
31. Zheng, Y.; Cloutier, P.; Hunting, D. J.; Wagner, J. R.; Sanche, L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1002-1003.
32. Abdoul-Carime, H.; Gohlke, S.; Fischbach, E.; Scheike, J.; Illenberger, E. Chem. Phys. Lett. 2004, 387, 267-270.
33. a. Hendricks, J. H.; Lyapustina, S. A.; de Clercq, H. L.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 1998, 108, 8-11.
34. b. Desfrancois, C.; Periquet, V.; Bouteiller, Y.; Schermann, J. P. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1274-1278.