Using a lac Repressor Roadblock to Analyze the E. Coli Transcription Elongation Complex

Methods in Enzymology

Volumn 371, Issue , 2003, Pages 207-218

  King, Rodney A ^a   Sen, Ranjan ^a   Weisberg, Robert A ^a  

^a EUNICE KENNEDY SHRIVER NATIONAL INSTITUTE OF CHILD HEALTH AND HUMAN DEVELOPMENT   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN; NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE; OLIGONUCLEOTIDE; REPRESSOR PROTEIN; RNA POLYMERASE; TRANSCRIPTION ELONGATON COMPLEX; UNCLASSIFIED DRUG;

AFFINITY LABELING; ENZYME SUBUNIT; ESCHERICHIA COLI; GENETIC TRANSCRIPTION; LACTOSE OPERON; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN CROSS LINKING; REVIEW;

BACTERIA (MICROORGANISMS); ESCHERICHIA COLI;

EID: 0346275199     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(03)71015-5     Document Type: Article

References (42)

1. C. L. Poglitsch, G. D. Meredith, A. L. Gnatt, G. J. Jensen, W. H. Chang, J. Fu, and R. D. Kornberg, Cell 98, 791 (1999).
2. J. Fu, A. L. Gnatt, D. A. Bushnell, G. J. Jensen, N. E. Thompson, R. R. Burgess, P. R, David, and R. D. Kornberg, Cell 98, 799 (1999).
3. K. S. Murakami, S. Masuda, and S. A. Darst, Science 296, 1280 (2002).
4. G. Zhang, E. A. Campbell, L. Minakhin, C. Richter, K. Severinov, and S. A. Darst, Cell 98, 811 (1999).
5. D. G. Vassylyev, S. Sekine, O. Laptenko, J. Lee, M. N. Vassylyeva, S. Borukhov, and S. Yokoyama, Nature 417, 712 (2002).
6. H. Yin, I. Artsimovitch, R. Landick, and J. Gelles, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 13124 (1999).
7. M. Kashlev, E. Martin, A. Polyakov, K. Severinov, V. Nikiforov, and A. Goldfarb, Gene 130, 9 (1993).
8. C. K. Surratt, S. C. Milan, and M. J. Chamberlin, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 7983 (1991).
9. W. S. Reznikoff, J. H. Miller, J. G. Scaife, and J. R. Beckwith, J. Mol. Biol. 43, 201 (1969).
10. D. H. Mitchell, W. S. Reznikoff, and J. R. Beckwith, J. Mol. Biol. 93, 331 (1975).
11. G. L. Herrin, Jr. and G. N. Bennett, Gene 32, 349 (1984).
12. M. Besse, B. Wilcken-Bergmarin, and B. Muller-Hill, EMBO J. 5, 1377 (1986).
13. H. Horowitz and T. Platt, Nucleic Acids Res. 10, 5447 (1982).
14. P. A. Pavco and D. A. Steege, Nucleic Acids Res. 19, 4639 (1991).
15. P. A. Pavco and D. A. Steege, J. Biol. Chem. 265, 9960 (1990).
16. J. Bertin, N. A. Sunstrom, P. Jain, and N. H. Acheson, Virology 189, 715 (1992).
17. S. Connelly and J. L. Manley, Mol. Cell Biol. 9, 5254 (1989).
18. A. Kuhn, I. Bartsch, and I. Grummt, Nature 344, 559 (1990).
19. B. K. Mohanty, T. Sahoo, and D. Bastia, EMBO J. 15, 2530 (1996).
20. K. L. Brown, G. J. Sarkis, C. Wadsworth, and G. F. Hatfull, EMBO J. 16, 5914 (1997).
21. U. Deuschle, R. Gentz, and H. Bujard, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 4134 (1986).
22. M. A. Sellitti, P. A. Pavco, and D. A. Steege, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 3199 (1987).
23. K. M. Arndt and M. J. Chamberlin, J. Mol. Biol. 213, 79 (1990).
24. K. C. Cone, M. A., Sellitti, and D. A. Steege, J. Biol. Chem. 258, 11296 (1983).
25. F. Toulme, M. Guerin, N. Robichon, M. Leng, and A. R. Rahmouni, EMBO J. 18, 5052 (1999).
26. M. Guerin, M. Leng, and A. R. Rahmouni, EMBO J. 15, 5397 (1996).
27. T. J. Giordano, U. Deuschle, H. Bujard, and W. T. McAllister, Gene 84, 209 (1989).
28. U. Deuschle, R. A. Hipskind, and H. Bujard, Science 248, 480 (1990).
29. D. Reines and J. Mote, Jr., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1917 (1993).
30. N. J. Keen, M. J. Gait, and J. Karn, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 2505 (1996).
31. N. J. Keen, M. J. Churcher, and J. Karn, EMBO J. 16, 5260 (1997).
32. R. Sen, R. A. King, and R. A. Weisberg, Mol. Cell 7, 993 (2001).
33. R. A. Weisberg, M. E. Gottesman, R. W. Hendrix, and J. W. Little, Annu. Rev. Genet. 33, 565 (1999).
34. M. Clerget, D. J. Jin, and R. A. Weisberg, J. Mol. Biol. 248, 768 (1995).
35. R. A. King, S. Banik-Maiti, D. J. Jin, and R. A. Weisberg, Cell 87, 893 (1996).
36. J. H. Miller, "Experiments in Molecular Genetics." Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1972.
37. R. W. Simons, F. Houman, and N. Kleckner, Gene 53, 85 (1987).
38. A. Simons, D. Tils, B. von Whicken-Bergmann, and B. Muller-Hill, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 1624 (1984).
39. M. Kashlev, E. Nudler, K. Severinov, S. Borukhov, N. Komissarova, and A. Goldfarb, Methods Enzymol. 274, 326 (1996).
40. A. Das, M. Pal, J. G. Mena, W. Whalen, K. Wolska, R. Crossley, W. Rees, P. H. von Hippel, N. Costantino, D. Court, M. Mazzulla, A. S. Altieri, R. A. Byrd, S. Chattopadhyay, J. DeVito, and B. Ghosh, Methods Enzymol. 274, 374 (1996).
41. N. Komissarova and M. Kashlev, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 1755 (1997).
42. E. Nudler, A. Mustaev, E. Lukhtanov, and A. Goldfarb, Cell 89, 33 (1997).