Proteomics Analysis of Phosphotyrosyl-Proteins in Human Lumbar Cerebrospinal Fluid

Journal of Proteome Research

Volumn 2, Issue 5, 2003, Pages 476-487

  Yuan, Xianglin ^a   Desiderio, Dominic M ^a  

^a UNIVERSITY OF TENNESSEE HEALTH SCIENCE CENTER   (United States)

Author keywords

Gel electrophoresis; Human cerebrospinal fluid; Mass spectrometry; Phosphorylated proteins; Proteomics; Western blotting

Indexed keywords

CERULOPLASMIN; COMPLEMENT COMPONENT C4; GELSOLIN; KALLIKREIN; PROTEIN; PROTEIN PRECURSOR;

ARTICLE; CENTRAL NERVOUS SYSTEM; CEREBROSPINAL FLUID ANALYSIS; CHOROID PLEXUS; GEL ELECTROPHORESIS; HUMAN; IMMUNOPRECIPITATION; LIQUID CHROMATOGRAPHY; LUMBAR PUNCTURE; MASS SPECTROMETRY; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN CEREBROSPINAL FLUID LEVEL; PROTEIN PHOSPHORYLATION; PROTEOMICS; TWO DIMENSIONAL GEL ELECTROPHORESIS; WESTERN BLOTTING;

BLOTTING, WESTERN; CEREBROSPINAL FLUID PROTEINS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; DATABASES, PROTEIN; ELECTROPHORESIS, GEL, TWO-DIMENSIONAL; HUMANS; MASS SPECTROMETRY; PHOSPHORYLATION; PRECIPITIN TESTS; PROTEINS; PROTEOMICS; SILVER STAINING; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 0242569370     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr025589a     Document Type: Article

References (60)

1. Godovac-Zimmermann, J.; Brown, L. R. Mass Spectrom. Rev. 2001, 20, 1-57.
2. Strohman, R. Biotechnology 1994, 12, 156-164.
3. Wikins, M. R.; Sanchez, J. C.; Willians, K. L.; Hochstrasser, D. F. Electrophoresis 1996, 17, 830-838.
4. Wilkins, M. R.; Gasteiger, E.; Godey, A. A.; Herbert, B. R.; Molloy, M. P.; Binz, P. A.; Ou, K.; Sanchez, J. C.; Bairoch, A.; Williams, K. L.; Hochstrasser, D. F. J. Mol. Biol. 1999, 289, 645-657.
5. Hunter, T. Cell 1995, 80, 225-236.
6. Posada, J.; Cooper, J. A. Mol. Biol. Cell 1992, 3, 583-592.
7. Krebs, E. G. Trends Biol. Sci. 1994, 19, 439-439.
8. Faux, M. C.; Scott, J. D. Trends Biol. Sci. 1996, 21, 312-315.
9. Hunter, T. Trans. R. Soc. London B. Biol. Sci. 1998, 353, 583-605.
10. Hubbard, M. J.; Cohen, P. Trends Biochem. Sci. 1993, 18, 172-177.
11. Kaufmann, B. J. E.; Fussenegger, M. Proteomics 2001, 1, 194-199.
12. Adamczyk, M.; Gebler, J. C.; Wu, J. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001, 15, 1481-1488.
13. Lentner, C. Geigy Scientific Table 1; CIBA-Geigy: New Jersey, 1981; pp 165-177.
14. Knight, J. A. Ann. Clin. Lab. Sci. 1997, 27, 93-104.
15. Nilsson, C. L. Scand J. Clin. Lab. Invest. 1999, 59, 383-392.
16. Harajiri, S.; Wood, G.; Desiderio, D. M. J. Chromatogr. 1992, 575, 213-222.
17. Liu, D.; Dass, C.; Wood, G.; Desiderio, D. M. J. Chromatogr. 1990, 500, 395-412.
18. Kusmierz, J. J.; Desiderio, D. M. J. Chromatogr. 1992, 574, 189-196.
19. Kaneko, T.; Wood, G.; Crouch, W. L.; Desiderio, D. M. Anal. Biochem. 1993, 275, 45-53.
20. Kaneko, T.; Wood, G.; Crouch, W. L.; Desiderio, D. M. Peptides 1994, 75, 41-47.
21. Walsh, M. J.; Limos, L.; Tourtellotte, W. W. J. Neurochem. 1984, 43, 1277-1285.
22. Wiederkehu, F.; Ogilvie, A.; Vonderschmitt, D. J. J. Neurochem. 1987, 49, 363-372.
23. Yun, M.; Wu, W.; Hood, L.; Harrington, M. Electrophoresis 1992, 13, 1002-1013.
24. Davidsson, P.; Puchades, M.; Blennow, K. Electrophoresis 1999, 20, 431-437.
25. Raymackers, J.; Daniels, A.; Brabandere, V.; Missiaen, C.; Dauwe, M.; Verhaert, P.; Vanmechelen, E.; Meheus, L. Electrophoresis 2000, 21, 2266-2283.
26. Sickmann, A.; Dormeyer, W.; Wortelkamp, S.; Woitalla, D.; Kuhn, W.; Meyer, H. E. Electrophoresis 2000, 21, 2721-2728.
27. D maps available at http://us.expasy.org/ch2dothergifs/publi/csf.gif.
28. Yuan, X.; Russell, T.; Wood, G.; Desiderio, D. M. Electrophoresis 2002, 23, 1185-1196.
29. Sickmann, A.; Dormeyer, W.; Wortelkamp, S.; Woitalla, D.; Kuhn, W.; Meyer, H. E. J. Chromatogr. B 2002, 771, 167-196.
30. Yuan, X.; Desiderio D. M. J. Mass Spectrom. 2002, 37, 512-524.
31. Rohlff, C. Electrophoresis 2000, 21, 1227-1234.
32. Hu, Y. Y.; He, S. S.; Wang, X.; Duan, Q. H.; Grundke-Iqbal, I.; Iqbal, K.; Wang, J. Am. J. Pathol. 2002, 160, 1269-1278.
33. Blennow, K.; Vanmechelen, E.; Hampel, H. Mol. Neurobiol. 2001, 24, 87-97.
34. Itoh, N.; Arai, H.; Vrakami, K.; Ishiguro, K.; Ohno, H.; Hampel, H.; Buerger, K.; Wiltfang, J.; Otto, M.; Kretzschmar, H.; Moeller, H. J.; Imagawa, M.; Kohno, H.; Nakashima, K.; Kuzuhara, S.; Sasaki, H.; Imahori, K. Ann. Neurol. 2001, 50, 150-156.
35. Parnetti, L.; Lanari, A.; Amici, S.; Gallai, V.; Vanmechelen, E.; Hulstaert, F. Neuroscience 2001, 22, 77-78.
36. Hampel, H.; Buerger, K.; Kohnken, R.; Teipel, S. J.; Zinkowski, R.; Moeller, H. J.; Rapoport, S. I.; Davies, P. Ann. Neurol. 2001, 49, 545-546.
37. Sjogren, M.; Davidsson, P.; Tullberg, M.; Minthon, L.; Wallin, A.; Wikkelso, C.; Granerus, A. K.; Vanderstichele, H.; Vanmechelen, E.; Blennow, K. J. Neurol. Neurosurg. Psych. 2001, 70, 624-530.
38. Kohnken, R.; Buerger, K.; Zinkowshi, R.; Miller, C.; Kerkman, D.; DeBernardis, J.; Shen, J.; Moller, H. J.; Davies, P.; Hampel, H. Neurosci. Lett. 2000, 287, 187-190.
39. Vanmechelen, E.; Vanderstichele, H.; Davidsson, P.; Van Kerschaver, E.; Van DerPerre, B.; Sjogren, M.; Andreasen, N.; Blennow, K. Neurosci. Lett. 2000, 285, 49-52.
40. Ishiguro, K.; Ohno, H.; Arai, H.; Yamaguchi, H.; Urakami, K.; Park, J. M.; Sato, K.; Kohno, H.; Imahori, K. Neurosci. Lett. 1999, 270, 91-94.
41. Hoffmann, R.; Lee, V. M.; Leight, S.; Varga, I.; Otvos, L., Jr. Biochemistry 1997, 36, 8114-8124.
42. Buerger, K.; Zinkowshi, R.; Teipel, S. J.; Tapiola, T.; Arai, H.; Blennow, K.; Andreasen, N.; Hofmann-Kiefer, K.; DeBernardis, J.; Kerkman, D.; McCuUoch, C.; Kohnken, R.; Padberg, F.; Pirttila, T.; Schapiro, M. B.; Rapoport, S. I.; Moller, H. J.; Davies, P.; Hamel, H. Arch. Neurol. 2002, 59, 1267-1272.
43. Arai, H.; Ishiguro, K.; Ohno, H.; Moriyama, M.; Itoh, N.; Okamura, N.; Matsui, T.; Morikawa, Y.; Horikawa, E.; Kohno, H.; Sasaki, H.; Imahori, K. Exp. Neurol. 2000, 166, 201-203.
44. Hu, Y. Y.; Hem, S. S.; Wang, X. C.; Duan, Q. H.; Khatoon, S.; Iqbal, K.; Grundke-Iqbal, I.; Wang, J. Z. Neurosci. Lett. 2002, 320, 156-160.
45. Gandy, S. E.; Grebb, J. A.; Rosen, N.; Albert, K. A.; Devinsky, O.; Blumberg, H.; Anderson, N.; Cedarbaum, J. M.; Porter, R. J.; Sedvall, G. Ann. Neurol. 1990, 28, 829-833.
46. Stensballe, A.l Andersen, S.; Jensen, O. N. Proteomics 2001, 1, 207-222.
47. Sickmann, A.; Meyer, H. E. Proteomics 2001, 1, 200-206.
48. Coligan, J. E.; Dunn, B. M.; Ploegh, H. L.; Speicher, D. W.; Wingfield, P. T. Current Protocols in Protein Science; John Wiley & Sons: New York, 2000; pp 13.0.1-13.9.27.
49. Marcus, K.; Immler, D.; Sternberger, J.; Meyer, H. E. Electrophoresis 2000, 21, 2622-2636.
50. Maguire, P. B.; Wynne, K. J.; Harney, D. F.; O'Donoghue, N. M.; Stephens, G.; Fitzgerald, D. J. Proteomics 2002, 2, 642-646.
51. Gronborg, M.; Kristiansen, T. Z.; Stensballe, A.; Andersen, J. S.; Ohara, O.; Mann, M.; Jensen, O. N.; Pandey, A. Molecular & Cellular Proteomics 2002, 1, 517-527.
52. Zhu, X.; Desiderio, D. M. Anal. Lett. 1994, 27, 2267-2280.
53. Gorg, A.; Obermaier, C.; Boguth, G.; Harder, A.; Scheibe, B.; Wildgruber, R.; Weiss, W. Electrophoresis 2000, 21, 1037-1053.
54. Shevchenko, A.; Jensen, O.; Podtelejnikov, A. V.; Sagliocco, F.; Willm, M.; Vorm, O.; Mortensen, P.; Shevchenko, A.; Boucherie, H.; Mann, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 14 440-14 445.
55. Gharahdaghi, F.; Weinberg, C. R.; Meagher, D. A.; Imai, B. S.; Mische, S. M. Electrophoresis 1999, 20, 601-605.
56. Huddleston, M. J.; Annan, R. S.; Bean, M. F.; Carr, S. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1993, 4, 710-717.
57. Carr, S. A.; Huddleston, M. J.; Annan, R. S. Anal. Biochem. 1996, 239, 180-192.
58. Janek, K.; Wenschuh, H.; Blenert, M.; Krause, E. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001, 15, 1593-1599.
59. Zhou, H.; Watts, J. D.; Aebersold, R. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 375-378.
60. Steen, H.; Kuster, B.; Fernandez, M.; Pandey, A.; Mann, M. Anal. Chem. 2001, 73, 1440-1448.