Theoretical study of the energetics of proton pumping and oxygen reduction in cytochrome oxidase

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 39, 2003, Pages 10946-10955

  Siegbahn, Per E M ^a   Blomberg, Margareta R A ^a   Blomberg, Mattias L ^a  

^a STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTRON TRANSPORT PROPERTIES; HYDROXYLATION; MATHEMATICAL MODELS; OXYGEN; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; PROTONS; REDOX REACTIONS; X RAY ANALYSIS;

BINUCLEAR CENTER; CYTOCHROME OXIDASE; OXYGEN REDUCTION; PROTON PUMPING;

ENZYMES;

EID: 0142091718     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp035486v     Document Type: Article

References (36)

1. Ostermeier, C.; Harrenga, A.; Ermler, U.; Michel, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 10547-10553.
2. Yoshikawa, S.; Shinzawa-Itoh, K.; Nakashima, R.; Yaono, R.; Yamashita, E.; Inoue, N.; Yao, M.; Fei, M. J.; Libeu, C. P.; C. P.; Mizushima, T.; Yamaguchi, H.; Tomizaki, T.; Tsukihara, T. Science 1998, 280, 1723-1729.
3. Svensson-Ek, M.; Abrahamson, J.; Larsson, G.; Toø''rnroth, S.; Brzezinski, P.; Iwata, S. J. Mol. Biol. 2002, 321-329-339.
4. Wikström, M. Nature 1977, 266, 271-273.
5. Wikström, M.; Jasaitis, A.; Backgren, C.; Puustinen, A.; Verkhovsky, M. I. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1459, 514-520.
6. Gennis, R. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 12747-12749.
7. Ferguson-Miller, S.; Babcock, G. Chem. Rev. 1996, 96, 2889-2907.
8. Michel, H.; Behr, J.; Harrenga, A.; Kannt, A. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1998, 27, 329-356.
9. Morgan, J. E.; Verkhovsky, M. I.; Palmer, G.; Wikström, M. Biochemistry 2001, 40, 6882-6892.
10. Wikström, M. Nature 1989, 338, 776-778.
11. Michel, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 12819-12824.
12. Ruitenberg, M.; Kannt, A.; Bamberg, E.; Fendler, K.; Michel, H. Nature 2002, 417, 99-102.
13. Verkhovsky, M. I.; Jasaitis, A.; Verkhovskaya, M. L.; Morgan, J. E.; Wikström, M. Nature 1999, 400, 480-483.
14. Iwata, S.; Ostermeier, C.; Ludwig, B.; Michel, H. Nature 1995, 376, 660-669.
15. Morgan, J. E.; Verkhovsky, M. I.; Wikström, M. J. Bioenerg. Biomembr. 1994, 26, 599-608.
16. Wikström, M.; Morgan, J. E.; Verkhovsky, M. I. J. Bioenerg. Biomembr. 1998, 30, 139-145.
17. Wikström, M. Biochim. Biophys. Acta 2000, 44827, 1-11.
18. Michel, H. Biochemistry 1999, 38, 15129-15140.
19. Becke, A. D. Phys. Rev. 1988, A38, 3098.
20. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372.
21. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
22. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 299.
23. Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M.; Babcock, G. T. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8812-8824.
24. Jaguar 4.0; Schrödinger, Inc.: Portland, OR, 1991-2000.
25. Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Redfern, R. C.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 2000, 112, 7374-7383.
26. Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A. Annu. Rev. Phys. Chem. 1999, 50, 221-249.
27. Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A. Chem. Rev. 2000, 100, 421-437.
28. Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 9375-9386.
29. Siegbahn, P. E. M. Q. Rev. Biophys. 2003, 36, 91-145.
30. Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M.; Babcock, G. T.; Wikström, M. J. Inorg. Biochem. 2000, 80, 261-269.
31. Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M.; Babcock, G. T.; Wikström, M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12848-12858.
32. Zaslavsky, D.; Kaulen, A. D.; Smirnova, I. A.; Vygodina, T.; Konstatinov, A. A. FEBS Lett. 1993, 336, 389-393.
33. Proshlyakov, D. A.; Pressler, M. A.; Babcock, G. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 8020-8025.
34. Karpefors, M.; Ädelroth, P.; Namslauer, A.; Zhen, Y.; Brzezinski, P. Biochemistry 2000, 39, 14664.
35. Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M.; Wikström, M. Inorg. Chem. 2003, 42, 5231-5243.
36. Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A. Biochim. Biophys. Acta, in press.