The blasticidin S biosynthesis gene cluster from Streptomyces griseochromogenes: Sequence analysis, organization, and initial characterization

ChemBioChem

Volumn 4, Issue 9, 2003, Pages 821-828

  Cone, Martha C ^a   Yin, Xihou ^a   Grochowski, Laura L ^a   Parker, Morgan R ^a   Zabriskie, T Mark ^a  

^a OREGON STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Antifungal agents; Biosynthesis; Heterologous expression; Peptidyl nucleoside

Indexed keywords

ANTIFUNGAL AGENT; ARGININE; ARGININE 2,3 AMINOMUTASE; BACTERIAL DNA; BLASTICIDIN S; CYTIDINE PHOSPHATE; CYTOSINE; CYTOSYLGLUCURONIC ACID; GENE PRODUCT; GLUCURONIC ACID; GLUCURONOSYLTRANSFERASE; GUANIDINO N METHYLTRANSFERASE; HYDROLASE; METHYLTRANSFERASE; TRANSFERASE; UNCLASSIFIED DRUG;

AMINO ACID SEQUENCE; ANTIBIOTIC BIOSYNTHESIS; ARTICLE; BLSM GENE; COSMID; ESCHERICHIA COLI; GENE; GENE CLUSTER; METHYLATION; MOLECULAR CLONING; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; OPEN READING FRAME; PRIORITY JOURNAL; SEQUENCE HOMOLOGY; STREPTOMYCES; STREPTOMYCES GRISEOCHROMOGENES; STREPTOMYCES LIVIDANS;

ANTI-BACTERIAL AGENTS; BASE SEQUENCE; CLONING, MOLECULAR; COSMIDS; DNA, BACTERIAL; ESCHERICHIA COLI; GENE EXPRESSION REGULATION, BACTERIAL; MOLECULAR SEQUENCE DATA; MULTIGENE FAMILY; NUCLEOSIDES; OPEN READING FRAMES; RESTRICTION MAPPING; STREPTOMYCES;

BACTERIA (MICROORGANISMS); ESCHERICHIA COLI; PROKARYOTA; STREPTOMYCES; STREPTOMYCES GRISEOCHROMOGENES; STREPTOMYCES LIVIDANS;

EID: 0141683556     PISSN: 14394227     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.200300583     Document Type: Article

References (69)

1. C. Bormann, V. Mohrle, C. Bruntner, J. Bacteriol. 1996, 178, 1216-1218.
2. R. A. Lacalle, J. A. Tercero, A. Jimenez, EMBO J. 1992, 11, 785-792.
3. M. A. Fernández-Moreno, C. Vallín, F. Malpartida, J. Bacteriol. 1997, 179, 6929-6936.
4. J. Propin, M. Fernandez-Moreno, F. Malpartida, 2000, direct submission to GenBank, Accession no. AJ271405.
5. C. Bruntner, B. Lauer, W. Schwarz, V. Mohrle, C. Bormann, Mol. Gen. Genet. 1999, 262, 102-114.
6. H. Chen, B. K. Hubbard, S. E. O'Connor, C. T. Walsh, Chem. Biol. 2002, 9, 103-112.
7. C. Bruntner, C. Bormann, Eur. J. Biochem. 1998, 254, 347-355.
8. B. Lauer, R. Russwurm, W. Schwarz, A. Kalmanczhelyi, C. Bruntner, A. Rosemeier, C. Bormann, Mol. Gen. Genet. 2001, 264, 662-673.
9. B. Lauer, R. Süssmuth, D. Kaiser, G. Jung, C. Bormann, J. Antibiot. 2000, 53, 385-392.
10. J. A. Tercero, J. C. Espinosa, R. A. Lacalle, A. Jiménez, J. Biol. Chem. 1996, 271, 1579-1590.
11. M. A. Rubio, J. C. Espinosa, J. A. Tercero, A. Jimenez, FEBS Lett. 1998, 437, 197-200.
12. J. C. Espinosa, J. A. Tercero, M. A. Rubio, A. Jimenez, J. Bacteriol. 1999, 181, 4914-4918.
13. J. A. Tercero, R. A. Lacalle, A. Jimenez, Eur. J. Biochem. 1993, 218, 963-971.
14. N. Grammel, K. Pankevych, J. Demydchuk, K. Lambrecht, H. P. Saluz, H. Krugel, Eur. J. Biochem. 2002, 269, 347-357.
15. S. J. Gould, J. Guo, J. Bacteriol. 1994, 176, 1282-1286.
16. S. J. Gould, Q. Zhang, J. Antibiot. 1995, 48, 652-656.
17. Q. Zhang, M. C. Cone, S. J. Gould, T. M. Zabriskie, Tetrahedron 2000, 56, 693-701.
18. M. C. Cone, A. K. Petrich, S. J. Gould, T. M. Zabriskie, J. Antibiot. 1998, 51, 409-417.
19. S. Takeuchi, K. Hirayama, K. Ueda, H. Sakai, H. Yonehara, J. Antibiot. 1958, 11, 1-5.
20. T. Misato, I. Ishii, M. Asakawa, Y. Okimoto, K. Fukunaga, Ann. Phytopathol. Soc. Jpn. 1959, 24, 302-306.
21. H. Yamaguchi, C. Yamamoto, N. Tanaka, J. Biochem. 1965, 57, 667-677.
22. H. Yamaguchi, N. Tanaka, J. Biochem. 1965, 60, 632-642.
23. M. Izumi, H. Miyazawa,T. Kamakura, I. Yamaguchi, T. Endo, F. Hanaoka, Exp. Cell Res. 1991, 197, 229-233.
24. C. Karreman, Nucleic Acids Res. 1998, 26, 2508-2510.
25. C. B. Mamoun, I. Y. Gluzman, S. Goyard, S. M. Beverley, D. E. Goldberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 8716-8720.
26. H. Seto, I. Yamaguchi, N. Otake, H. Yonehara, Agric. Biol. Chem. 1968, 32, 1292-1298.
27. P. C. Prabhakaran, N. T. Woo, P. S. Yorgey, S. J. Gould, J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 5785-5791.
28. J. Guo, S. J. Gould, J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 5898-5899.
29. J. Ishikawa, K. Hotta, FEMS Microbiol. Lett. 1999, 174, 251-253.
30. S. F. Altschul, W. Gish, W. Miller, E. W. Myers, D. J. Lipman, J. Mol. Biol. 1990, 215, 403-410.
31. S. D. Bentley, K. F. Chater, A.M. Cerdeno-Tarraga, G. L. Challis, N. R. Thomson, K. D. James, D. E. Harris, M. A. Quail, H. Kieser, D. Harper, A. Bateman, S. Brown, G. Chandra, C. W. Chen, M. Collins, A. Cronin, A. Fraser, A. Goble, J. Hidalgo, T. Hornsby, S. Howarth, C. H. Huang, T. Kieser, L. Larke, L. Murphy, K. Oliver, S. O'Neil, E. Rabbinowitsch, M. A. Rajandream, K. Rutherford, S. Rutter, K. Seeger, D. Saunders, S. Sharp, R. Squares, S. Squares, K. Taylor, T. Warren, A. Wietzorrek, J. Woodward, B. G. Barrell, J. Parkhill, D. A. Hopwood, Nature 2002, 417, 141-147.
32. M. Redenbach, H. M. Kieser, D. Denapaite, A. Eichner, J. Cullum, H. Kinashi, D.A. Hopwood, Mol. Microbiol. 1996, 21, 77-96.
33. R. W. Eaton, K. N. Timmis, J. Bacteriol. 1986, 168, 123-131.
34. Y. Mao, M. Varoglu, D. H. Sherman, Chem. Biol. 1999, 6, 251-263.
35. U. Deppenmeier, A. Johann, T. Hartsch, R. Merkl, R. A. Schmitz, R. Martinez-Arias, A. Henne, A. Wiezer, S. Baumer, C. Jacobi, H. Bruggemann, T. Lienard, A. Christmann, M. Bomeke, S. Steckel, A. Bhattacharyya, A. Lykidis, R. Overbeek, H. P. Klenk, R. P. Gunsalus, H. J. Fritz, G. Gottschalk, J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 2002, 4, 453-461.
36. S. T. Cole, R. Brosch, J. Parkhill, T. Garnier, C. Churcher, D. Harris, S. V. Gordon, K. Eiglmeier, S. Gas, C. E. Barry, 3rd, F. Tekaia, K. Badcock, D. Basham, D. Brown, T. Chillingworth, R. Connor, R. Davies, K. Devlin, T. Feltwell, S. Gentles, N. Hamlin, S. Holroyd, T. Hornsby, K. Jagels, A. Krogh, L. McLean, S. Moule, L. Murphy, K. Oliver, J. Osborne, M. A. Quail, M.-A. Rajandream, J. Rogers, S. Rutter, K. Seeger, J. Skelton, R. Squares, S. Squares, J. E. Sulston, K. Taylor, S. Whitehead, B. G. Barrell, Nature 1998, 393, 537-544.
37. Direct submission to GenBank, NCBI Microbial Genomes Annotation Project, 2002.
38. S. Omura, H. Ikeda, J. Ishikawa, A. Hanamoto, C. Takahashi, M. Shinose, Y. Takahashi, H. Horikawa, H. Nakazawa, T. Osonoe, H. Kikuchi, T. Shiba, Y. Sakaki, M. Hattori, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 12215-12220.
39. F. J. Ruzicka, K. W. Lieder, P. A. Frey, J. Bacteriol. 2000, 182, 469-476.
40. C. G. Kim, T. W. Yu, C. B. Fryhle, S. Handa, H. G. Floss, J. Biol. Chem. 1998, 273, 6030-6040.
41. B. Lauer, R. Russwurm, C. Bormann, Eur. J. Biochem. 2000, 267, 1698-1706.
42. H. Ogawa, T. Date, T. Gomi, K. Konishi, H. C. Pitot, G. L. Cantoni, M. Fujioka, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988, 85, 694-698.
43. Direct submission to GenBank, NCBI Microbial Genomes Annotation Project, 2002.
44. S. J. Gould, J. Guo, K. Dejesus, A. Geitmann, Can. J. Chem. 1994, 72, 6-11.
45. G. A. O'Donovan, J. Neuhard, Bacteriol. Rev. 1970, 34, 279-343.
46. H. Sawada, T. Suzuki, S.-I. Akiyama, Y. Nakao, J. Ferment. Technol. 1985, 63, 23-27.
47. A. Imada, S. Igarasi, J. Bacteriol. 1967, 94, 1551-1559.
48. E. Takano, J. White, C. J. Thompson, M.J. Bibb, Gene 1995, 166, 133-137.
49. a) S. Tabor, C. C. Richardson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1985, 82, 1074-1078;
50. b) Yin et al., unpublished work.
51. S. A. Short, S. R. Armstrong, S. E. Ealick, D. J. Porter, J. Biol. Chem. 1996, 271, 4978-4987.
52. P. A. Kaminski, J. Biol. Chem. 2002, 277, 14400-14407.
53. K. Okuyama, T. Noguchi, direct submission to GenBank, Accession No. AB039914.
54. K. Okuyama, T. Noguchi, Biosci. Biotechnol. Biochem. 2000, 64, 2243-2245.
55. E. J. Lawlor, H. A. Baylis, K. F. Chater, Genes Dev. 1987, 1, 1305-1310.
56. J. A. Tercero, J. C. Espinosa, A. Jimenez, FEBS Lett. 1998, 421, 221-223.
57. S. Rigali, A. Derouaux, F. Giannotta, J. Dusart, J. Biol. Chem. 2002, 277, 12507-12515.
58. W. C. Nierman, T. V. Feldblyum, M. T. Laub, I. T. Paulsen, K. E. Nelson, J. A. Eisen, J. F. Heidelberg, M. R. Alley, N. Ohta, J. R. Maddock, I. Potocka, W. C. Nelson, A. Newton, C. Stephens, N. D. Phadke, B. Ely, R. T. DeBoy, R. J. Dodson, A. S. Durkin, M. L. Gwinn, D. H. Haft, J. F. Kolonay, J. Smit, M. B. Craven, H. Khouri, J. Shetty, K. Berry, T. Utterback, K. Tran, A. Wolf, J. Vamathevan, M. Ermolaeva, O. White, S. L. Salzberg, J. C. Venter, L. Shapiro, C. M. Fraser, J. Eisen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 4136-4141.
59. K. Arakawa, R. Müller, T. Mahmud, H. G. Floss, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10644-10645.
60. J. Guo, J. W. Frost, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10642-10643.
61. D. J. Aberhart, S. J. Gould, H.-J. Lin, T. K. Thiruvengadam, B. H. Weiller, J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 5461-5470.
62. P. A. Frey in Comprehensive Natural Products Chemistry, Volume 5, (Eds.: K. Nakanishi, D. Barton), Elsevier, New York, 205-233;
63. b) Grochowski and Zabriskie, unpublished results.
64. T. D. Bugg, C. T. Walsh, Nat. Prod. Rep. 1992, 9, 199-215.
65. S. C. Lu, FASEB J. 1999, 13, 1169-1183.
66. C. Méndez, J. A. Salas, FEMS Microbiol. Lett. 1998, 158, 1-8.
67. M. H. Blondelet-Rouault, J. Weiser, A. Lebrihi, P. Branny, J. L. Pernodet, Gene 1997, 190, 315-317.
68. J. Sambrook, E. F. Fritsch, T. Maniatis, Molecular Cloning. A Laboratory Manual 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 1989.
69. T. Kieser, M. J. Bibb, M. J. Buttner, K. F. Chater, D. A. Hopwood, Practical Streptomyces Genetics, The John Innes Foundation, Norwich, 2000.