Do main chain hydrogen bonds create dominant electron transfer pathways? An investigation in designed proteins

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 30, 2003, Pages 7288-7292

  Zheng, Yongjian ^a   Case, Martin A ^a   Wishart, James F ^b   McLendon, George L ^a  

^a PRINCETON UNIVERSITY   (United States)

^b BROOKHAVEN NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTRON TUNNELING; HYDROGEN BONDS; MATHEMATICAL MODELS; PROTEINS; REACTION KINETICS;

ELECTRON TRANSFER (ET);

CHARGE TRANSFER;

EID: 0041696876     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp027092u     Document Type: Article

References (44)

1. Gray, H. B.; Winkler, J. R. Annu. Rev. Biochem. 1996, 65, 537-561.
2. Cukier, R. I.; Nocera, D. G. Annu. Rev. Phys. Chem. 1998, 49, 337-369.
3. Bendall, D. S., Ed. Protein Electron Transfer; BIOS Scientific Publishers: Oxford, U.K., 1996.
4. Marcus, R. A.; Sutin, N. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 265-322.
5. Moser, C. C.; Page, C. C.; Farid, R.; Dutton, P. L. J. Bioenerg. Biomembr. 1995, 27, 263-274.
6. Moser, C. C.; Page, C. C.; Chen, X.; Dutton, P. L. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 393-398.
7. Williams, R. J. P. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 373-377.
8. Hopfield, J. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1974, 71, 3640-3644.
9. Wuttke, D. S.; Bjerrum, M. J.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Science 1992, 256, 1007-1009.
10. Onuchic, J. N.; Beratan, D. N.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1992, 21, 349-377.
11. Curry, W. B.; Grabe, M. D.; Kurnikov, I. V.; Skourtis, S. S.; Beratan, D. N.; Regan, J. J.; Aquino, A. J. A.; Beroza, P.; Onuchic, J. N. J. Bioenerg. Biomembr. 1995, 27, 285-293.
12. Beratan, D. N.; Betts, J. N.; Onuchic, J. N. Science 1991, 252, 1285-1288.
13. Skourtis, S. S.; Beratan, D. N. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 378-386.
14. Skourtis, S. S.; Beratan, D. N. Adv. Chem. Phys. 1997, 106, 377-452.
15. Regan, J. J.; DiBiblio, A. J.; Langen, R.; Skov, L. K.; Winkler, J. R.; Gray, H. B.; Onuchic, J. N. Chem. Biol. 1995, 2, 489-496.
16. Isied, S. S.; Ogawa, M. Y.; Wishart, J. F. Chem. Rev. 1992, 92, 381-394.
17. Cabana, L. A.; Schanze, K. S. Adv. Chem. Ser. 1990, 226, 101-124.
18. DeRege, P. J. F.; Williams, S. A.; Therien, M. J. Science 1995, 269, 1409-1413.
19. Turro, C.; Chang, C. K.; Leroi, G. E.; Cukier, R. I.; Nocera, D. G. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4013-4015.
20. Harriman, A.; Kubo, Y.; Sessler, J. L. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 388-390.
21. Williamson, D. A.; Bowler, B. E. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10902-10911.
22. Kirby, J. P.; Roberts, J. A.; Nocera, D. G. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 9230-9236.
23. deRege, P. J. F.; Williams, S. A.; Therien, M. J. Science 1995, 269, 1409-1413.
24. Ghadiri, M. R.; Soares, C.; Choi, C. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 825-831.
25. Ghadiri, M. R.; Case, M. A. Angew. Chem., Int. Ed. 1993, 97, 1669-1680.
26. Case, M. A.; Ghadiri, M. R.; Mutz, M. W.; McLendon, G. L. Chirality 1998, 10, 35-40.
27. Mutz, M. W.; Case, M. A.; Wishart, J. F.; Ghadiri, M. R.; McLendon, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 858-859.
28. Zhou, J.; Case, M. A.; Wishart, J. F.; McLendon, G. L. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9975-9980.
29. Case, M. A.; McLendon, G. L. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 8089-8090.
30. Wishart, J. F.; Sun, J.; Cho, M.; Su, C.; Isied, S. S. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 687-698.
31. Pace, C. N. Methods Enzymol. 1986, 131, 267-280.
32. Shin, I.; Ting, A. Y.; Schultz, P. G. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 12667-12668.
33. Koh, J. T.; Cornish, V. W.; Schultz, P. G. Biochemistry 1997, 36, 11314-11322.
34. Chapman, E.; Thorson, J. S.; Schultz, P. G. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7151-7152.
35. Isied, S. S. Adv. Chem. Ser. 1990, 226, 91-100.
36. LaChance-Galang, K. J.; Doan, P. E.; Clarke, M. J.; Rao, U.; Yamano, A.; Hoffman, B. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 3529-3538.
37. Gochin, M.; Khorosheva, V.; Case, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11018-11028.
38. http://www.uphs.upenn.edu/biocbiop/local_pages/dutton_lab.html.
39. Regan, J. J. "greenpath software 0.95", Jeffrey J. Regan, San Diego, 1993.
40. Page, C. C.; Moser, C. C.; Chen, X.; Dutton, P. L. Nature, 1999, 402, 47-52.
41. Beratan, D. N.; Onuchic, J. N.; Betts, J. N.; Bowler, B. E.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 7915-7921.
42. Jones, M. L.; Kurnikov, I. V.; Beratan, D. N. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 2002-2006.
43. Kraulis, P. J. J. Appl. Crystallogr. 1991, 24, 946-950.
44. Merritt, E. A.; Bacon, D. J. Methods Enzymol. 1997, 277, 505-524.