Structure and function in the isolated reaction-center complex of photosystem II. 2. Models for energy relaxation and charge separation in a protein matrix

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 9, 2003, Pages 2162-2169

  Shiang, Joseph J ^a   Yoder, Laurie M ^a   Sension, Roseanne J ^a  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHARGE SEPARATION; ENERGY RELAXATION; ISOLATED REACTION-CENTER COMPLEX; RHODOBACTER SPHAERIDES;

CHARGE TRANSFER; CHLOROPHYLL; COMPUTER SIMULATION; ELECTRONIC DENSITY OF STATES; MOLECULAR DYNAMICS; NUMERICAL METHODS; PHOTOSYNTHESIS; RELAXATION PROCESSES; STRUCTURE (COMPOSITION);

PROTEINS;

EID: 0037422345     PISSN: 10895647     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp021983k     Document Type: Article

References (48)

1. Gatzen, G.; Muller, M. G.; Greibenow, K.; Holzwarth, A. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 7269.
2. Greenfield, S. R.; Seiberg, M.; Govindjee; Wasielewski, M. R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 2251.
3. Peterman, E. J. G.; Van Amerongen, H.; Van Grondelle, R.; Dekker, J. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 6128.
4. Groot, M.-L.; Van Mourik, F.; Eijckelhoff, C.; Van Stokkum, I. H. M.; Dekker, J. P.; Van Grondelle, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 4389.
5. Jankowiak, R.; Ratsep, M.; Picorel, R.; Seibert, M.; Small, G. J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 9759.
6. Greenfield, S. R.; Seibert, M.; Govindjee; Wasielewski, M. R. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 8364.
7. Konermann, L.; Gatzen, G.; Holzwarth, A. R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 2933.
8. Johnston, H. G.; Wang, J.; Ruffle, S.; Sayre, R. T.; Gustafson, T. L. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 4777.
9. Prokhorenko, V. I.; Holzwarth, A. R. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11563.
10. Barter, L. M. C.; Bianchietti, M.; Jeans, C.; Schilstra, M. J.; Hankamer, B.; Diner, B. A.; Barber, J.; Durrant, J. R.; Klug, D. R. Biochemistry 2001, 40, 4026.
11. Zouni, A.; Witt, H.-T.; Kern, J.; Fromme, P.; Krauss, N.; Saenger, W.; Orth, P. Nature 2001, 409, 739.
12. Konermann, L.; Yruela, I.; Holzwarth, A. R. Biochemistry 1977, 36, 7498.
13. Van Bredorede, M. E.; Van Grondelle, R. FEBS Lett. 1999, 455, 1.
14. Jordanides, X. J.; Scholes, G. D.; Flemming, G. R. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 1652.
15. Kiramier, C.; Weems, D.; Holten, D. Biochemistry 1999, 38, 11516.
16. Ivashin, N.; Källabering, B.; Larson, S.; Hansson, Ö. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5017.
17. Pudlak, M.; Pincak, R. Chem. Phys. Lett. 2001, 342, 587.
18. Durrant, J. R.; Klug, D. R.; Kwa, S. L. S.; Van Grondelle, R,; Porter, G.; Dekker, J. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 4798.
19. Leegwater, J. A.; Durrant, J. R.; Klug, D. R. J. Phys. Chem. B 1977, 101, 7205.
20. Yokojima, S.; Meier, T.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 1997, 106, 3837.
21. Shiang, J. J.; Liu, H.; Sension, R. J. J. Chem. Phys. 1998, 109, 9494.
22. Zhang, L. Y.; Friesner, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 13608.
23. Makri, N.; Sim, E.; Makarov, D. E.; Topaler, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 19996 93, 3926.
24. Booth, P. J.; Crystall, B.; Giorgi. L. B.; Barker, J.; Klug, D. R.; Porter, G. Biochim. Biophys. Acta 1990, 1016, 141.
25. Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M.; Babcock, G. T. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8812.
26. Groot, M.-L.; Peterman, E. J. G.; Van Kan, P. J. M.; Van Stokkum, I. H. M.; Dekker, J. P.; Van Grondelle, R. Biophys. J. 1994, 67, 318.
27. Won, Y.; Friesner, R. A. J. Phys. Chem. 1988, 92, 2208.
28. Ogrodnik, A.; Keupp, W.; Volk, M.; Aumeier, G.; Michel-Beyerle, M. E. J. Phys. Chem. 1994, 98, 3432.
29. Peloquin, J. M.; Williams, J. C.; Lind, X.; Alden, R. G.; Taguchi, A. K. W.; Allen, J. P.; Woodbury, N. W. Biochemistry 1994, 33, 8089.
30. Holzwarth, A. R.; Muller, M. G. Biochemistry 1996, 35, 11820.
31. Hill, N.; Whaley, K. B. Chem. Phys. 1996, 210 117.
32. Warshel, A.; Parson, W. W. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 6143.
33. Leggett, A. J.; Chakravarty, S.; Dorsey, A. T.; Fisher, M. P. A.; Garg, A.; Swerger, W. Rev. Mod. Phys. 1987, 59, 1.
34. Xu, D.; Schulten, K. Chem. Phys. 1994, 182, 91.
35. Schulten, K.; Tesch, M. Chem. Phys. 1991, 158, 421.
36. Kühn, O.; Sundströ, V. J. Chem. Phys. 1997, 107, 4154.
37. Liu, H. J.; Pullen, S. H.; Walker, L. A.; Sension, R. J. J. Chem. Phys. 1998, 108, 4992.
38. Makri, N.; Makarov, D. E. J. Chem. Phys. 19995 102, 4600.
39. Egger, R.; Mak,C. H. J. Phys. Chem. 1994, 98, 9903.
40. Volk, M.; Gilbert, M.; Rousseau, G.; Richter, M.; Ogrodnik, A.; Michel-Beyerle, M.-E. FEBS Lett. 1993, 336, 357.
41. Roelofs, T. G.; Gilbert, M.; Shuvalov, V. A.; Holzwarth, A. R. Biochim. Biophys. Acta 1991, 1060, 237.
42. Svensson, B.; Etchebest, C.; Tuffery, P.; VanKan, P.; Smith, J.; Styring, S. Biochemistry 1996, 35, 14486.
43. Cattaneo, R.; Zucchelli, G.; Garlaschi, F. M.; Finzi, L.; Jennings, R. C. Biochemistry 1995, 34, 15267.
44. Moser, C.; Sension, R. J.; Szarka, A. Z.; Repinec, S. T.; Hochstrasser, R. M.; Dutton, P. L. Chem. Phys. 1995, 197, 343.
45. Donovan, B.; Walker, L. A., II; Kaplan, D.; Bouvier, M.; Yocum, C. F.; Sension, R. J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 5232.
46. Konermann, L.; Holzwarth, A. R. Biochemistry 1996, 35, 829.
47. Dekker, J. P.; Van Grondelle, R. Photosynth. Res. 2000, 63, 195.
48. Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2000, 113, 2823.