Marriage of XAFS and crystallography for structure-function studies of metalloproteins

Journal of Synchrotron Radiation

Volumn 10, Issue 1, 2003, Pages 9-15

  Hasnain, S Samar ^a   Strange, Richard W ^a  

^a DARESBURY LABORATORY   (United Kingdom)

Author keywords

Genomes; High resolution crystallography; Metalloproteins; XAFS

Indexed keywords

COPPER; METALLOPROTEIN;

ARTICLE; BINDING SITE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; METHODOLOGY; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; RADIODENSITOMETRY; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

BINDING SITES; COPPER; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; DENSITOMETRY, X-RAY; METALLOPROTEINS; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY;

EID: 0037208353     PISSN: 09090495     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1107/S0909049502022446     Document Type: Article

References (38)

1. Adman, E. T., Godden, J. E. & Turley, S. (1995). J. Biol. Chem. 270, 27458-27474.
2. Ascone, I., Castamer, R., Bolognesi, M., Tarricone, C., Strappolo, M. E. & Desideri, A. (1997). Biochem. Biophys. Res. Commun. 241, 119-121.
3. Bertini, I., Luchinat, C. Ming, L. J., Piccoli, M., Sola, M. & Valentine, J. S. (1992). Inorg. Chem. 31, 4433-4435.
4. Binsted, N., Gurman, S. J., Campbell, J. W. & Stephenson, P. (1991). SERC Daresbury Laboratory Program EXCURVE, Daresbury Laboratory, Warrington, UK.
5. Binsted, N. & Hasnain, S. S. (1996). J. Synchrotron Rad. 3, 185-196.
6. Binsted, N., Strange, R. W. & Hasnain, S. S. (1992). Biochemistry, 31, 12117-12125.
7. Blackburn, N. J., Hasnain, S. S., Binsted, N., Diakun, G. P., Garner, C. D. & Knowles, P. F. (1984). Biochem. J. 219, 985-990.
8. Bordo, D., Djinovic, K. & Bolognesi, M. (1994). J. Mol. Biol. 238, 366-386.
9. Cheung, K. C., Strange, R. W. & Hasnain, S. S. (2000). Acta Cryst. D56, 697-704.
10. Djinovic, K., Gatti, G., Coda, A., Antolini, L., Pelosi, G., Desideri, A., Falconi, M., Marmocchi, F., Rotilio, G. & Bolognesi, M. (1992). J. Mol. Biol. 225, 791-809.
11. Dodd, F. E., Hasnain, S. S., Abraham, Z. H. L., Eady, R. R. & Smith, B. E. (1997). Acta Cryst. D53, 406-418.
12. Dodd, F. E., Van Beeumen, J., Eady, R. R. & Hasnain, S. S. (1998). J. Mol. Biol. 282, 369-382.
13. Ellis, M. J., Dodd, F. E., Strange, R. W., Prudencio, M., Sawers, G., Eady, R. R. & Hasnain, S. S. (2001). Acta Cryst. D57, 1110-1118.
14. Ellis, M. J., Eady, R. R. & Hasnain, S. S. (2003). Acta Cryst. D. In preparation.
15. Godden, J. W., Turley, S., Teller, D. C., Adman, E. T., Liu, M. Y., Payne, W. J. & LeGall, J. (1991). Science, 253, 438-442.
16. Hart, P. J., Liu, H., Pellegrini, M., Nersissian, A. M., Gralla, E. B., Valentine, J. S. & Eisenberg, D. (1998). Protein Sci. 7, 545-555.
17. Hasnain, S. S. & Hodgson, K. O. (1999). J. Synchrotron Rad. 6, 864-875.
18. Hough, M. & Hasnain, S. S. (1999). J. Mol. Biol. 287, 579-592.
19. Hough, M. & Hasnain, S. S. (2003). J. Mol. Biol. In preparation.
20. Hough, M. A., Strange, R. W. & Hasnain, S. S. (2000). J. Mol. Biol. 304, 231-241.
21. Howes, B. D., Abraham, Z. H. L., Lowe, D. J., Brüser, T., Eady, R. R. & Smith, B. E. (1994). Biochemistry, 33, 3171-3177.
22. Kau, L., Spira-Solomon, D., Penner-Hahn, J. E., Hodgson, K. O. & Solomon, E. I. (1987). J. Am. Chem. Soc. 109, 6433-6442.
23. Kokimota, M., Nishiyama, M., Murphy, M. E. P., Turley, S., Adman, E. T., Horinuochi, S. & Beppu, T. (1994). Biochemistry, 33, 5246-5252.
24. McAdam, M. E., Fox, R. A., Lavelle, F. & Fielden, M. F. (1977). Biochem. J. 165, 71-79.
25. Murphy, L. M., Strange, R. W. & Hasnain, S. S. (1997). Structure, 5, 371-379.
26. Murphy, M. E. P., Turley, S. & Adman, E. T. (1997). J. Biol. Chem. 272, 28455-28460.
27. Murphy, M. E. P., Turley, S., Kukimoto, M., Nishiyama, M., Horinouchi, S., Sasaki, H., Tanoruki, M. & Adman, E. T. (1995). Biochemistry, 34, 12107-12117.
28. Ogihara, N., Parge, H. E., Hart, P. J., Weiss, M. S., Goto, J. J., Crane, B. R., Tsang, J., Slater, K., Roe, J. A., Valentine, J. S., Eisenberg, D. & Tanier, J. A. (1996). Biochemistry, 35, 2316-2321.
29. Onori, G., Santucci, A., Scafati, A., Belli, M., Della Longa, S., Bianconi, A. & Palladino, L. (1988). Chem. Phys. Lett. 149, 289-293.
30. Pesce, A., Capasso, C. Battistoni, A., Folcarelli, S., Rotilio, G., Desideri, A. & Bolognesi, M. (1997). J. Mol. Biol. 274, 408-420.
31. Rypniewski, W. R., Mangani, S., Bruni, B., Orioli, P. L., Casati, M. & Wilson, K. S. (1995) J. Mol. Biol. 251, 282-296.
32. Strange, R. W., Alagna, L., Durham, P. J. & Hasnain, S. S. (1990). J. Am. Chem. Soc. 112, 4265-4268.
33. Strange, R. W., Dodd, F. E., Abraham, Z. H. L., Grössmann, J. G., Brüser, T., Eady, R. R., Smith, B. E. & Hasnain, S. S. (1995). Nature Struct. Biol. 2, 287-292.
34. Strange, R. W., Murphy, L. M., Dodd, F. E., Abraham, Z. H. L., Eady, R. R., Smith, B. E. & Hasnain, S. S. (1999). J. Mol. Biol. 287, 1001-1009.
35. Stroppolo, M. E., Nuzzo, S., Pesce, A., Rosano, C., Battistoni, A., Bolognesi, M., Mobilio, S. & Desideri, A. (1998). Biochem. Biophys. Res. Commun. 249, 579-582.
36. Tainer, J. A., Getzoff, E. D., Beem, K. M., Richardson, J. S. & Richardson, D. C. (1982). J. Mol. Biol. 160, 181-217.
37. Tainer, J. A., Getzoff, E. D., Richardson, J. S. & Richardson, D. C. (1983). Nature, 306, 284-287.
38. Zumpft, W. G. (1997). Microbiol. Mol. Biol. Rev. 61, 533-616.