Improvement of resolution, mass accuracy, and reproducibility in reflected mode DE-MALDI-TOF analysis of DNA using fast evaporation - Overlayer sample preparations

Analytical Chemistry

Volumn 72, Issue 16, 2000, Pages 3860-3866

  Koomen, John M ^a   Russell, William K ^a   Hettick, Justin M ^a   Russell, David H ^a  

^a Texas AandM University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA;

ACCURACY; ARTICLE; DNA DETERMINATION; EVAPORATION; MASS SPECTROMETRY; REPRODUCIBILITY;

DNA; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 0034663438     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac0001941     Document Type: Article

References (49)

1. Karas, M.; Bachmann, D.; Bahr, U.; Hillenkamp, F. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1987, 78, 53.
2. Burlingame, A. L.; Boyd, R. K.; Gaskell, S. J. Anal. Chem. 1998, 70, 647R-716R.
3. Wang, B. H.; Biemann, K. Anal. Chem. 1994, 66, 1918-1924.
4. Kirpekar, F.; Nordhoff, E.; Kristiansen, K.; Roepstorff, P.; Hahner, S.; Hillenkamp, F. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1995, 9, 525-531.
5. Gut, I. G.; Jeffery, W. A.; Pappin, D. J. C.; Beck, S. Rapid. Commun. Mass Spectrom. 1997, 11, 43-50.
6. Jacutin, S.; Zhang, A. J.; Russell, D. H.; Gibbs, R. A.; Burgess, K. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 5072-5076.
7. Ono, T.; Scalf, M.; Smith, L. M. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 4581-4588.
8. Tang, W.; Zhu, L.; Smith, L. M. Anal. Chem. 1997, 69, 302-312.
9. Berlin, K.; Gut, I. G. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1999, 13, 1739-1743.
10. Berkenkamp, S.; Kirpekar, F.; Hillenkamp, F. Science 1998, 281, 260-262.
11. Kirpekar, F.; Berkenkamp, S.; Hillenkamp, F. Anal. Chem. 1999, 71, 2334-2339.
12. Wu, K. J.; Steding, A.; Becker, C. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1993, 7, 142-146.
13. Tang, K.; Taranenko, N. I.; Allman, S. L.; Chen, C. H.; Chang, L. Y.; Jacobson, K. B. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1994, 8, 673-677.
14. Strupat, K.; Karas, M.; Hillenkamp, F. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1991, 111, 89-102.
15. Zhu, L.; Parr, G. R.; Fitzgerald, M. C.; Smith, L. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6048.
16. Hathaway, G. M. Biotechniques 1994, 17, 150-155.
17. Pieles, U.; Zuercher, W.; Schaer, M.; Moser, H. E. Nucleic Acids Res. 1991, 21, 3191-3196.
18. Zhu, Y. F.; Chung, C. N.; Taranenko, N. I.; Allman, S. L.; Martin, S. A.; Haff, L.; Chen, C. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10, 383-388.
19. Lecchi, P.; Le, H. M. T.; Pannell, L. K. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 1276-1277.
20. Juhasz, P.; Roskey, M. T.; Smirnov, I. P.; Haff, L. A.; Vestal, M. L.; Martin, S. A. Anal. Chem. 1996, 68, 941-946.
21. Roskey, M. T.; Juhasz, P.; Smirnov, I. P.; Takach, E. J.; Martin, S. A.; Haff, L. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 4724-4729.
22. Smirnov, I. P.; Roskey, M. T.; Juhasz, P.; Takach, E. J.; Martin, S. A.; Haff, L. A. Anal. Biochem. 1996, 238, 19-25.
23. Wang, B. H.; Hopkins, C. E.; Belenky, A. B.; Cohen, A. S. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1997, 169/170, 331-350.
24. Russell, D. H.; Edmondson, R. D. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 263-276.
25. Zhu, Y. F.; Taranenko, N. I.; Allman, S. A.; Martin, S. A.; Haff, L.; Chen, C. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10, 1591-1596.
26. Li, Y. C. L.; Cheng, S.-w.; Chan, T.-W. D. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1998, 12, 993-998.
27. Simmons, T. A.; Limbach, P. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1998, 9, 668-675.
28. Cheng, S.-w.; Chan, T.-W. D. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10, 907-910.
29. Asara, J. M.; Allison, J. Anal. Chem. 1999, 71, 2866-2870.
30. Shaler, T. A.; Wickham, J. N.; Sannes, K. A.; Wu, K. J.; Becker, C. H. Anal. Chem. 1996, 68, 576-579.
31. Hung, K. C.; Rashidzadeh, H.; Wang, Y.; Guo, B. Anal. Chem. 1998, 70, 3088-3093.
32. Hung, K. C.; Ding, H.; Guo, B. Anal. Chem. 1999, 71, 518-521.
33. Liu, Y.-H.; Bai, J.; Liang, X.; Lubman, D. M. Anal. Chem. 1995, 67, 3482-3490.
34. Bai, J.; Liu, Y.-H.; Cain, T. C.; Lubman, D. M. Anal. Chem. 1994, 66, 3423-3430.
35. Bai, J.; Lin, Y. H.; Liang, X. L.; Zhy, Y. D.; Lubman, D. M. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1995, 9, 1172-1176.
36. Little, D. P.; Cornish, T. J.; O'Donnell, M. J.; Braun, A.; Cotter, R. J.; Koester, H. Anal. Chem. 1997, 69, 4540-4546.
37. O'Donnell, M. J.; Tang, K.; Koester, H.; Smith, C. L.; Cantor, C. R. Anal. Chem. 1997, 69, 2438-2443.
38. Vorm, O.; Roepstorff, P.; Mann, M. Anal. Chem. 1994, 66, 3281-3287.
39. Edmondson, R. D.; Russell, D. H. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1996, 7, 995-1001.
40. Dai Y. Q.; Whittal, R. M.; Li, L. Anal. Chem. 1999, 71, 1087-1091.
41. Russell, D. H.; Edmondson, R. D. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 263-276.
42. Jensen, O. N.; Podtelejnikov, A. V.; Mann, M. Anal. Chem. 1997, 69, 4741-4750.
43. Clauser, K. R.; Baker, P.; Burlingame, A. L. Anal. Chem. 1999, 71, 2871-2882.
44. Dai, Y.; Whittal, R. M.; Li, L.; Weinberger, S. R. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10, 1792-1796.
45. Xiang, F.; Beavis, R. C. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1994, 8, 199.
46. Beavis, R. C.; Lindner, J.; Grotemeyer, J.; Schlag, E. W. Chem. Phys. Lett. 1988, 146, 310-314.
47. Koester, C.; Castoro, J. A.; Wilkins, C. L. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 7572-7574.
48. Castoro, J. A.; Wilkins, C. L. Anal. Chem. 1993, 65, 2621-2627.
49. Solouki, T.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1994, 8, 26-31.