Folding studies on the human chorionic gonadotropin β-subunit using optical spectroscopy of peptide fragments

Journal of the American Chemical Society

Volumn 122, Issue 36, 2000, Pages 8623-8630

  Gangani, R A ^a,b,c   Silva, D ^a   Sherman, Simon A ^a   Perini, Fulvio ^a   Bedows, Elliott ^a   Keiderling, Timothy A ^a  

^a UNIVERSITY OF ILLINOIS AT CHICAGO   (United States)

^b UNIVERSITY OF NEBRASKA MEDICAL CENTER   (United States)

^c UNIVERSITY OF NEBRASKA MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACID; CHORIONIC GONADOTROPIN BETA SUBUNIT; DODECYL SULFATE SODIUM; PEPTIDE FRAGMENT; TRIFLUOROETHANOL; WATER;

ALPHA CHAIN; ALPHA HELIX; ARTICLE; BETA CHAIN; CIRCULAR DICHROISM; CONTROLLED STUDY; HUMAN; HUMAN CELL; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN FOLDING; PROTEIN INTERACTION; PROTEIN STRUCTURE; SPECTROSCOPY; SPECTRUM;

EID: 0034644437     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja0013172     Document Type: Article

References (83)

1. Pierce, J. G.; Parsons, T. F. Annu. Rev. Biochem. 1981, 50, 465-495.
2. Ruddon, R. W.; Norton, S. E. Semin. Oncol. 1993, 20, 251-260.
3. Bedows, E.; Norton, S. E.; Huth, J. R.; Ruddon, R. W., J. Biol. Chem. 1994, 209, 10574-10580.
4. Lapthom, A. J.; Harris, D. C.; Littlejohn, A.; Lustbader, J. W.; Canfield, R. E.; Machin, K. J.; Morgen, F. J.; Isaacs, N. W. Nature 1994, 369, 455-461.
5. Wu, H.; Lustbader, J. W.; Liu, Y.; Canfield, R. E.; Hendrickon, W. A. Structure 1994, 2, 545-558.
6. Huth, J. R.; Mountjoy, K.; Perini, F.; Ruddon, R. W. J. Biol. Chem. 1992, 207, 8870-8879.
7. Bedows, E.; Huth, J. R.; Ruddon, R. W. J. Biol. Chem. 1992, 267, 8880-8886.
8. Bedows, E.; Huth, J. R.; Suganuma, N.; Bartels, C; Boime, I.; Ruddon, R. W. J. Biol. Chem. 1993, 268, 11655-11662.
9. Beebe, J. S.; Mountjoy, K.; Krzesicki, R. F.; Perini, F.; Ruddon, R. W. J. Biol. Chem. 1990, 265, 312-317.
10. Viguera, A. R.; Jimenez, M. A.; Rico, M.; Serrano, L. J. Mol. Biol. 1996, 255, 507-521.
11. Ramirez-Alvarado, M.; Serrano, L.; Blanco, F. J. Protein Sci. 1997, 6, 162-174.
12. Prieto, J.; Wilmans, M.; Jimenez, M. A.; Rico, M.; Serrano, L. J. Mol. Biol. 1997, 268, 760-778.
13. Yang, J. J.; Buck, M.; Pitkeathly, M.; Kotik, M.; Haynie, D. T.; Dobson, C. M.; Radford, S. E. J. Mol. Biol. 1995, 253, 483-491.
14. Yang, J. J.; Van den Berg, B.; Pitkeathly, M.; Smith, L. J.; Bolin, K. A.; Keiderling, T. A.; Redfield, C; Dobson, C. M.; Radford, S. E. Folding Des. 1996, 1, 473-484.
15. Neira, J. L.; Rico, M. Folding Des. 1997, 2, R1-R11.
16. Reymond, M. T.; Merutka, G.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Protein Sci. 1997, 6, 706-716.
17. Baldwin, R. L. J. Biomol. NMR 1995, 5, 103-109.
18. Johnson, W. C. Proteins 1990, 7, 205-214.
19. Johnson, W. C. Methodo!. Enzymol. 1992, 270, 426-447.
20. Venyaminov, S. Y.; Yang, J. T. In Circular Dichroism and the Confonnational Analysis of Biomoleciiles', Fasman, G. D., Ed.; Plenum Press: New York, 1996; pp 69-107.
21. Krittanai, C.; Johnson, W. C. Anal. Biochem. 1997, 253, 57-64.
22. Woody, R. W.; Dunker, A. K. In Circular Dichroism and the Conformalional Analysis of Biomolecules; Fasman, G. D., Ed.; Plenum Press: New York, 1996; pp 109-157.
23. Manisch, H. H.; Chapman, D. Infrared Spectroscopy of Biomolecules; Wiley-Liss: Chichester, U.K., 1996.
24. Goormaghtigh, E.; Cabiaux, V.; Ruysschaert, J. M. In Subcellular Biochemistry; Hilderson, H. J., Ralston, G. B., Eds.; Plenum: New York, 1994; Vol. 23, pp 329-362.
25. Arrondo, J. L. R.; Muga, A.; Castresana, J.; Goni, F. M. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1992, 59, 23-56.
26. Freedman, T. B.; Nafie, L. A.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1995, 37, 265-279.
27. Nafie, L. A. Anna. Rev. Phys. Chem. 1997, 48, 357-386.
28. Diem, M. In Biomolecular Spectroscopy II; Birge, R. R., Nafie, L. A., Eds.; SPIE, 1991; pp 28-36.
29. Keiderling, T. A.; Suva, R. A. G. D.; Yoder, G.; Dukor, R., K. Bioorg. Med. Chem. 1999, 7, 133-141.
30. Keiderling, T. A. In Circular Dichroism and the Confonnational Analysis of Biomolecules; Fasman, G. D., Ed.; Plenum: New York, 1996; pp 555-598.
31. Keiderling, T. A. In Circular dichroism: principles and applications for chemists and biologists, 2nd ed.; Nakanishi, K., Berova, N., Woody, R. A., Eds.; John Wiley & Sons: New York, 2000; pp 621-666.
32. Suva, R. A. G. D.; Sherman, S. A.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1999, 50, 413.
33. Sherman, S. A.; Gmeirter, W. H.; Kirnarskiy, L.; Perini, F.; Ruddon, R. W. J. Biomol. Struct. Dyn. 1995, 13, 441-445.
34. Keiderling, T. A. In Practical Fourier Transform Infrared Spectroscopy; Krishnan, K., Ferraro, J. R., Eds.; Academic Press: San Diego, 1990; pp 203-284.
35. Griffiths, P. R.; Pariente, G. L. Trends Anal Chem. 1986, 5, 209-215.
36. Greenfield, N.; Fasman, G. D. Biochemistry 1969, 8,4108-4116.
37. Greenfield, N. J. Anal. Biochem. 1996, 235, 1-10.
38. Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991,57, 1747-1761.
39. Baumruk, V.; Huo, D. F.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121.
40. Wang, L.; Voloshin, O. N.; Stasiak, A.; Camerini-Otero, R. D. J. Mol. Biol. 1998, 277, 1-11.
41. Waterhous, D. V.; Johnson, W. C, Jr. Biochemistry 1994,33,2121-2128.
42. Hamada, D.; Kuroda, Y.; Tanaka, T.; Goto, Y. J. Mol. Biol. 1995, 254, 737-746.
43. Ramirez-Alvarado, M.; Blanco, F. J.; Niemann, H.; Serrano, L. J. Mol. Biol. 1997, 273, 898-912.
44. Brown, J. E.; Klee, W. A. Biochemistry 1971, 10, 470-476.
45. Munoz, V.; Serrano, L.; Jimenez, M. A.; Rico, M. J. Mol. Biol. 1995, 247, 648-669.
46. Waltho, J. P.; Feher, V. A.; Merutka, G.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 1993, 32, 6337-6347.
47. Bruch, M. D.; Dhingra, M. M.; Gierasch, L. M. Proteins: Struct., Fund., Genet. 1991, 10, 130-139.
48. Blanco, F. J.; Rivas, G.; Serrano, L. Nature Struct. Biol. 1994, 1, 584-590.
49. Blanco, F. J.; Jimenez, M. A.; Herranz, J.; Rico, M.; Santoro, J.; Nieto, J. L. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 5887-5888.
50. Rico, M.; Nieto, J. L.; Santoro, J.; Bermejo, F. J.; Herranz, J. FEES Lett. 1983, 762, 314-319.
51. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 519-538.
52. Arrondo, J. L. R.; Blanco, F. J.; Serrano, L.; Goni, F. M. FEBS Lett. 1996, 384, 35-37.
53. Surewicz, W.; Manisch, H. H.; Chapman, D. Biochemistry 1993, 32, 389-394.
54. Jackson, M.; Manisch, H. H. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biot. 1995, 30, 95-120.
55. Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J. Am. Chem. Soc. 1986,108,5576-5581.
56. Palerlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765.
57. Lacroix, E.; Kortemme, T.; de la Paz, M. L.; Serrano, L. Cuir. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 487-493.
58. Woody, R. W. Biopolymers 1969, 8, 669-683.
59. Cantor, C. R.; Timasheff, S. N. The Proteins; Academic Press: New York, 1982; Vol. 5, pp 145-306.
60. Tinoco, I.; Maestre, M. F.; Bluslamante, C. Trends Biochem. Sci. 1983, 8, 41-44.
61. Briggs, M. S.; Gierasch, L. M. Biochemistry 1984,23,3111-3114.
62. Briggs, M. S.; CornellD. G.; Dluhy, R. A.; Gierasch, L. M. Science 1986, 233, 206-208.
63. Buchko, G. W.; Rozek, A.; Hoyt, D. W.; Cushley, R. J.; Kennedy, M. A. Biochim. Biophys. Ada 1998, 7592, 101-108.
64. Lundahl, P.; Greijer, E.; Sandberg, M.; Cardell, S.; Eriksson, K. Biochim. Biophys. Acta 1986, 873, 20-26.
65. Reynolds, J. A.; Tanford, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1970, 66, 1002-1007.
66. Nelson, C. A. J. Biol. Chem. 1971, 246, 3895-3901.
67. Takagi, T.; Tsujii, K.; Shirahama, K. J. Biochem. 1975, 77, 939-947.
68. Everett, D. H. Basic Principles of Colloid Science; Royal Society of Chemistry: London, 1988.
69. Jasanoff, A.; Fersht, A. R. Biochemistry 1994, 33, 2129-2135.
70. Bruce, I. C.; Scott, R. P.; Fred, E. C. Protein Sci. 1993, 2, 2134-2145.
71. Doty, P.; Holtzer, A. M.; Bradbury, J. H.; Blout, E. R. J. Am. Chem. Soc. 1954, 76, 4493.
72. Liebes, L. F.; Zand, R.; Phillips, W. D. Biochim. Biophys. Acta 1975, 405, 27-39.
73. Dyson, H. J.; Rance, M.; Houghten, R. A.; Wright, P. E.; Lerner, R. A. J. Mol. Biol. 1988, 207, 201-217.
74. Shin, H. C.; Merutka, G.; Waltho, J. P.; Tennant, L. L.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 1993, 32, 6356-6364.
75. Shiraki, K.; Nishikawa, K.; Goto, Y. J. Mol. Biol. 1995,245, 180-194.
76. Cox, J. P. L.; Evans, P. A.; Packman, L. C.; Williams, D. H. J. Mol. Biol. 1993, 234, 483-492.
77. Blanco, F. J.; Serrano, L. Eur. J. Biochem. 1995, 230, 634-649.
78. Blanco, F. J.; Jimenez, M. A.; Pineda, A.; Rico, M.; Santoro, J.; Nieto, J. L. Biochemistry 1994, 33, 6004-6014.
79. Hollosi, M.; Majer, Z. S.; Ronai, A. Z.; Magyar, A.; Medzihradszy, K.; Holly, S.; Perczel, A.; Fasman, G. D. Biopolymers 1994,34, 177-185.
80. Vonstosch, A. G.; Jimenez, M. A.; Kinzel, V.; Reed, J. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1995, 23, 196-203.
81. Huth, J. R.; Perini, F.; Lockridge, O.; Bedows, E.; Ruddon, R. W. ]. Biol. Chem. 1993, 268, 16472-16482.
82. Ruddon, R. W.; Sherman, S. A.; Bedows, E. Protein Sci. 1996, 5, 1443-1452.
83. Shin, H.; Merutka, G.; Waltho, J. P.; Wright, P. E.; Dyson, H. J. Biochemistry 1993, 32, 6348-6355.