How tetrahedral are methyl groups in proteins? A liquid crystal NMR study

Journal of the American Chemical Society

Volumn 121, Issue 19, 1999, Pages 4690-4695

  Ottiger, Marcel ^a   Bax, Ad ^a  

^a NATIONAL INSTITUTE OF DIABETES AND DIGESTIVE AND KIDNEY DISEASES   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DIMYRISTOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; METHYL GROUP; PROTEIN DERIVATIVE;

ARTICLE; CARBON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; CHEMICAL ANALYSIS; CHEMICAL BOND; CHEMICAL INTERACTION; CONFORMATION; LIQUID CRYSTAL; MAGNETIC FIELD; MATHEMATICAL MODEL; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE;

EID: 0033583758     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja984484z     Document Type: Article

References (56)

1. Emsley, J. W.; Lindon, J. C.; Tabony, J. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 2 1975, 71, 586-595.
2. Khetrapal, C. L.; Saupe, A. Mol. Cryst. Liq. Cryst. 1973, 19, 367-381
3. Wooton, J. B.; Savitsky, G. B.; Jacobus, J.; Beyerlein, A. L. J. Chem. Phys. 1977, 66, 4226-4230. Wooton, J. B.; Savitsky, G. B.; Jacobus, J.; Beyerlein, A. L.; Emsley, J. W. J. Chem. Phys. 1979, 70, 438-442.
4. Wooton, J. B.; Savitsky, G. B.; Jacobus, J.; Beyerlein, A. L. J. Chem. Phys. 1977, 66, 4226-4230. Wooton, J. B.; Savitsky, G. B.; Jacobus, J.; Beyerlein, A. L.; Emsley, J. W. J. Chem. Phys. 1979, 70, 438-442.
5. Emsley, J. W.; Longen, M.; Veracini, C. A.; Catalone, D.; Pedulli, G. F. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1982, 1289-1296.
6. Lehnmann, M. S.; Koetzle, T. F.; Hamilton, W. C. J. Am. Chem. Soc. 1972, 94, 2657-2660.
7. Koetzle, T. F.; Golic, L.; Lehnmann, M. S.; Verbist, J. J.; Hamilton, W. C. J. Chem. Phys. 1974, 60, 4690-4696.
8. Duncan, J. L. J. Mol. Struct. 1970, 6, 447-459.
9. Iijima, T.; Kimura, M. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1969, 42, 2159-2164. Iijima, T.; Tsuchiva, S. J. Mol. Spectrosc. 1972, 44, 88-107.
10. Iijima, T.; Kimura, M. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1969, 42, 2159-2164. Iijima, T.; Tsuchiva, S. J. Mol. Spectrosc. 1972, 44, 88-107.
11. Nicholson, L. K.; Kay, L. E.; Torchia, D. A. In NMR Spectroscopy and its Application to Biomedical Research; Sarkar, S. K., Ed.; Elsevier: New York, 1996; pp 241-279.
12. Wand, A. J.; Urbauer, J. L.; McEvoy, R. P.; Bieber, R. J. Biochemistry 1996, 35, 6116-6125.
13. Chatfield, D. C.; Szabo, A.; Brooks, B. R. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5301-5311.
14. Jones, W. C.; Rothgeb, T. M.; Gurd, F. R. N. J. Biol. Chem. 1976, 251, 7452-7460. Richarz, R.; Nagayama, K.; Wüthrich, K. Biochemistry 1980, 19, 5189-5196.
15. Jones, W. C.; Rothgeb, T. M.; Gurd, F. R. N. J. Biol. Chem. 1976, 251, 7452-7460. Richarz, R.; Nagayama, K.; Wüthrich, K. Biochemistry 1980, 19, 5189-5196.
16. Nicholson, L. K.; Kay, L. E.; Baldisseri, D. M.; Arango, J.; Young, P. E.; Bax, A. ; Torchia, D. A. 1992, 31, 5253-5263.
17. Muhandiram, D. R.; Yamazaki, T.; Sykes, B. D.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11536-11544. Yang, D. W.; Mok, Y. K.; Forman-Kay, J. D.; Farrow, N. A.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1997, 272, 790-804. Yang, D. W.; Mittermaier, A.; Mok, Y. K.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1998, 276, 939-954.
18. Muhandiram, D. R.; Yamazaki, T.; Sykes, B. D.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11536-11544. Yang, D. W.; Mok, Y. K.; Forman-Kay, J. D.; Farrow, N. A.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1997, 272, 790-804. Yang, D. W.; Mittermaier, A.; Mok, Y. K.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1998, 276, 939-954.
19. Muhandiram, D. R.; Yamazaki, T.; Sykes, B. D.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11536-11544. Yang, D. W.; Mok, Y. K.; Forman-Kay, J. D.; Farrow, N. A.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1997, 272, 790-804. Yang, D. W.; Mittermaier, A.; Mok, Y. K.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1998, 276, 939-954.
20. LeMaster, D. M.; Kushlan, D. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 9255-9264.
21. Straus, S. K.; Bremi, T.; Ernst, R. R. J. Biomol. NMR 1997, 10, 119-128.
22. Lee, A. L.; Urbauer, J. L.; Wand, A. J. J. Biomol. NMR 1997, 9, 437-440.
23. Bax, A.; Tjandra, N. J. Biomol. NMR 1997, 10, 289-292. Tjandra, N.; Bax, A. Science 1997, 278, 1111-1114. Wang, Y.-X.; Marquardt, J. L.; Wingfield, P.; Stahl, S. J.; Lee-Huang, S.; Torchia, D. A.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7385-7386. Bewley, C. A.; Gustafson, K. R.; Boyd, M. R.; Covell, D. G.; Bax, A.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 571-578. Cornilescu, G.; Marquardt, J. L.; Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6836-6837.
24. Bax, A.; Tjandra, N. J. Biomol. NMR 1997, 10, 289-292. Tjandra, N.; Bax, A. Science 1997, 278, 1111-1114. Wang, Y.-X.; Marquardt, J. L.; Wingfield, P.; Stahl, S. J.; Lee-Huang, S.; Torchia, D. A.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7385-7386. Bewley, C. A.; Gustafson, K. R.; Boyd, M. R.; Covell, D. G.; Bax, A.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 571-578. Cornilescu, G.; Marquardt, J. L.; Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6836-6837.
25. Bax, A.; Tjandra, N. J. Biomol. NMR 1997, 10, 289-292. Tjandra, N.; Bax, A. Science 1997, 278, 1111-1114. Wang, Y.-X.; Marquardt, J. L.; Wingfield, P.; Stahl, S. J.; Lee-Huang, S.; Torchia, D. A.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7385-7386. Bewley, C. A.; Gustafson, K. R.; Boyd, M. R.; Covell, D. G.; Bax, A.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 571-578. Cornilescu, G.; Marquardt, J. L.; Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6836-6837.
26. Bax, A.; Tjandra, N. J. Biomol. NMR 1997, 10, 289-292. Tjandra, N.; Bax, A. Science 1997, 278, 1111-1114. Wang, Y.-X.; Marquardt, J. L.; Wingfield, P.; Stahl, S. J.; Lee-Huang, S.; Torchia, D. A.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7385-7386. Bewley, C. A.; Gustafson, K. R.; Boyd, M. R.; Covell, D. G.; Bax, A.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 571-578. Cornilescu, G.; Marquardt, J. L.; Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6836-6837.
27. Bax, A.; Tjandra, N. J. Biomol. NMR 1997, 10, 289-292. Tjandra, N.; Bax, A. Science 1997, 278, 1111-1114. Wang, Y.-X.; Marquardt, J. L.; Wingfield, P.; Stahl, S. J.; Lee-Huang, S.; Torchia, D. A.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7385-7386. Bewley, C. A.; Gustafson, K. R.; Boyd, M. R.; Covell, D. G.; Bax, A.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 571-578. Cornilescu, G.; Marquardt, J. L.; Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6836-6837.
28. Sanders, C. R.; Schwonek, J. P. Biochemistry 1992, 31, 8898-8905. Sanders, C. R.; Landis, G. C. Biochemistry 1995, 34, 4030-4040. Ram, P.; Prestegard, J. H. Biochim. Biophys. Acta 1988, 940, 289-294. Sanders, C. R.; Prestegard, J. H. Biophys. J. 1990, 58, 447-460.
29. Sanders, C. R.; Schwonek, J. P. Biochemistry 1992, 31, 8898-8905. Sanders, C. R.; Landis, G. C. Biochemistry 1995, 34, 4030-4040. Ram, P.; Prestegard, J. H. Biochim. Biophys. Acta 1988, 940, 289-294. Sanders, C. R.; Prestegard, J. H. Biophys. J. 1990, 58, 447-460.
30. Sanders, C. R.; Schwonek, J. P. Biochemistry 1992, 31, 8898-8905. Sanders, C. R.; Landis, G. C. Biochemistry 1995, 34, 4030-4040. Ram, P.; Prestegard, J. H. Biochim. Biophys. Acta 1988, 940, 289-294. Sanders, C. R.; Prestegard, J. H. Biophys. J. 1990, 58, 447-460.
31. Sanders, C. R.; Schwonek, J. P. Biochemistry 1992, 31, 8898-8905. Sanders, C. R.; Landis, G. C. Biochemistry 1995, 34, 4030-4040. Ram, P.; Prestegard, J. H. Biochim. Biophys. Acta 1988, 940, 289-294. Sanders, C. R.; Prestegard, J. H. Biophys. J. 1990, 58, 447-460.
32. Clore, G. M.; Starich, M. R.; Gronenborn, A. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10571-10572. Hansen, M. R.; Rance, M.; Pardi, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11210-11211.
33. Clore, G. M.; Starich, M. R.; Gronenborn, A. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10571-10572. Hansen, M. R.; Rance, M.; Pardi, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11210-11211.
34. Koenig, B. W.; Hu, J.-S.; Ottiger, M.; Bose, S.; Hendler, R. W.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1385-1386.
35. Prosser, R. S.; Losonczi, J. A.; Shiyanovskaya, I. V. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11010-11011.
36. Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 12334-12341.
37. Engh, R. A.; Huber, R. Acta Crystallogr. 1991, A47, 392-400.
38. Henry, E. R.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 1985, 82, 4753-4761.
39. Schwartz, L. J.; Meirovitch, E.; Ripmeester, J. A.; Freed, J. H. J. Phys. Chem. 1983, 87, 4453-4461. Hiyama, Y.; Roy, S.; Guo, K.; Butler, L. G.; Torchia, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 2525-2526.
40. Schwartz, L. J.; Meirovitch, E.; Ripmeester, J. A.; Freed, J. H. J. Phys. Chem. 1983, 87, 4453-4461. Hiyama, Y.; Roy, S.; Guo, K.; Butler, L. G.; Torchia, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 2525-2526.
41. Ottiger, M.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1998, 12, 361-372.
42. Losonczi, J. A.; Prestegard, J. H. J. Biomol. NMR 1998, 12, 447-451.
43. Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pfeifer, J.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1995, 6, 277-293.
44. Ottiger, M.; Delaglio, F.; Marquardt, J. L.; Tjandra, N.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1998, 134, 365-369.
45. Garrett, D. S.; Powers, R.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. J. Magn. Reson. 1991, 95, 214-220.
46. Wang, A. C.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2483-2494.
47. Wang, A. C.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1993, 3, 715-720.
48. Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1998, 133, 216-221.
49. Saupe, A.; Englert, G. Phys. Rev. Lett. 1963, 11, 462-465. Emsley, J. W.; Lindon, J. C. NMR Spectroscopy using liquid crystal solvents; Pergamon Press: New York, 1975.
50. Saupe, A.; Englert, G. Phys. Rev. Lett. 1963, 11, 462-465. Emsley, J. W.; Lindon, J. C. NMR Spectroscopy using liquid crystal solvents; Pergamon Press: New York, 1975.
51. Lipari, G.; Szabo, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4546-4559.
52. Tjandra, N.; Grzesiek, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6264-6272. Tolman, J. R.; Flanagan, J. M.; Kennedy, M. A.; Prestegard, J. H. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 292-297.
53. Tjandra, N.; Grzesiek, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6264-6272. Tolman, J. R.; Flanagan, J. M.; Kennedy, M. A.; Prestegard, J. H. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 292-297.
54. Eisenreich, W.; Strauss, G.; Werz, U.; Fuchs, G.; Bacher, A. Eur. J. Biochem. 1993, 215, 619-632.
55. Vijay-Kumar, S.; Bugg, C. E.; Cook, W. J. J. Mol. Biol. 1987, 194, 531-544.
56. Morris, G. A.; Freeman, R. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 760-762.