Gene identification by exon amplification

Methods in Enzymology

Volumn 303, Issue , 1999, Pages 83-99

  Church, Deanna M ^a   Buckler, Alan J ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPLEMENTARY DNA; RNA;

ANIMAL CELL; CLONING VECTOR; DNA SYNTHESIS; EXON; GENE AMPLIFICATION; GENE INSERTION; GENE ISOLATION; GENE MAPPING; GENE SEQUENCE; GENETIC ANALYSIS; MOLECULAR CLONING; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; REVERSE TRANSCRIPTION POLYMERASE CHAIN REACTION; REVIEW;

ANIMALIA;

EID: 0032989282     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(99)03008-6     Document Type: Article

References (49)

1. M. L. Yaspo, L. Gellen, R. Mott, B. Korn, D. Nizetic, A. M. Poustka, and H. Lehrach, Hum. Mol. Genet. 4, 1291 (1995).
2. D. A. Ruddy, G. S. Kronmal, V. K. Lee, G. A. Mintier, L. Quintant, R. Domingo, Jr., N. C. Meyer, A. Irrinki, E. E. McClelland, A. Fullan, F. A. Mapa, T. Moore, W. Thomas, D. B. Loeb, C. Harmon, Z. Tsuchihashi, R. K. Wolff, R. C. Schatzman, and J. N. Feder, Genome Res. 7, 441 (1997).
3. I. Pribill, G. T. Barnes, J. Chen, D. Church, A. Buckler, G. P. Bates, H. Lehrach, M. J. Gusella, M. P. Duyao, C. M. Ambrose, M. E. MacDonald, and J. F. Gusella, Somat. Cell Mol. Genet. 23, 413 (1997).
4. A. P. Monaco, R. L. Neve, C. Colletti-Feener, C. J. Bertelson, D. M. Kurnit, and L. M. Kunkel, Nature (London) 323, 646 (1986).
5. J. M. Rommens, M. C. Iannuzzi, B. Kerem, M. L. Drumm, G. Melmer, M. Dean, R. Rozmahel, J. L. Cole, D. Kennedy, N. Hidaka, M. Buchwald, J. R. Riordan, L.-C. Tsui, and F. S. Collins, Science 245, 1059 (1989).
6. K. M. Call, T. Glaser, C. Y. Ito, A. J. Buckler, J. Pelletier, D. A. Haber, E. A. Rose, A. Kral, H. Yeger, W. H. Lewis, C. Jones, and D. E. Housman, Cell 60, 509 (1990).
7. R. G. Snell, L. A. Doucette-Stamm, K. M. Gillespie, S. A. Taylor, L. Riba, G. P. Bates, M. R. Altherr, M. E. MacDonald, J. F. Gusella, J. J. Wasmuth, H. Lehrach, D. E. Housman, P. S. Harper, and D. J. Shaw, Hum. Mol. Genet. 2, 305 (1993).
8. W. D. Benton and R. W. Davis, Science 196, 180 (1977).
9. S. Parimoo, S. R. Patanjali, H. Shukla, D. D. Chaplin, and S. M. Weissman, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 9623 (1991).
10. M. Lovett, J. Kere, and L. M. Hinton, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 9628 (1991).
11. R. G. Del Mastro, L. Wang, A. D. Simmons, T. D. Gallardo, G. A. Clines, J. A. Ashley, C. J. Hilliard, J. J. Wasmuth, J. D. McPherson, and M. Lovett, Genome Res. 5, 185 (1995).
12. J. W. Touchman, G. G. Bouffard, L. A. Weintraub, J. R. Idol, L. Wang, C. M. Robbins, J. C. Nussbaum, M. Lovett, and E. D. Green, Genome Res. 7, 281 (1997).
13. M. D. Adams, J. M. Kelley, J. D. Gocayne, M. Dubnick, M. H. Polymeropoulos, H. Xiao, C. R. Merril, A. Wu, B. Olde, R. F. Moreno, A. R. Kerlavage, W. R. McCombie, and J. C. Venter, Science 252, 1651 (1991).
14. A. S. Khan, A. S. Wilcox, M. H. Polymeropoulos, J. A. Hopkins, T. J. Stevens, M. Robinson, A. K. Orpana, and J. Sikela, Nature Genet. 2, 180 (1992).
15. K. Okubo, N. Hori, R. Matoba, T. Niiyama, A. Fukushima, Y. Kojima, and K. Matsubara, Nature Genet. 2, 173 (1992).
16. G. D. Schuler, M. S. Boguski, E. A. Stewart, L. D. Stein, G. Gyapay, K. Rice, R. E. White, P. Rodriguez-Tomé, A. Aggarwal, E. Bajorek, S. Bentolila, B. B. Birren, A. Butler, A. B. Castle, N. Chiannilkulchai, A. Chu, C. Clee, S. Cowles, P. J. R. Day, T. Dibling, N. Drouot, I. Dunham, S. Duprat, C. East, C. Edwards, J.-B. Fan, N. Fang, C. Fizames, C. Garrett, L. Green, D. Hadley, M. Harris, P. Harrison, S. Brady, A. Hicks, E. Holloway, L. Hui, S. Hussain, C. Louis-Dit-Sully, J. Ma, A. MacGilvery, C. Mader, A. Maratukulam, T. C. Matise, K. B. McKusick, J. Morissette, A. Mungall, D. Muselet, H. C. Nusbaum, D. C. Page, A. Peck, S. Perkins, M. Piercy, F. Qin, J. Quackenbush, S. Ranby, T. Reif, S. Rozen, C. Sanders, X. She, J. Silva, D. K. Slonim, C. Soderlund, W.-L. Sun, P. Tabar, T. Thangarajah, N. Vega-Czarny, D. Vollrath, S. Voyticky, T. Wilmer, X. Wu, M. D. Adams, C. Auffray, N. A. R. Walter, R. Brandon, A. Dehejia, P. N. Goodfellow, R. Houlgatte, J. R. Hudson, Jr., S. E. Ilde, K. R. Iorio, W. Y. Lee, N. Seki, T. Nagase, K. Ishikawa, N. Nomura, C. Phillips, M. H. Polymeropoulos, M. Sandusky, K. Schmitt, R. Berry, K. Swanson, R. Torres, J. C. Venter, J. M. Sikela, J. S. Beckmann, J. Weissenbach, R. M. Meyers, D. R. Cox, M. R. James, D. Bentley, P. Deloukas, E. S. Lander, and T. J. Hudson, Science 274, 540 (1996).
17. A. Bird, M. Taggart, M. Frommer, O. J. Miller, and D. Macleod, Cell 40, 91 (1986).
18. F. Antequera and A. Bird, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90, 11995 (1993).
19. S. H. Cross, J. A. Charlton, X. Nan, and A. P. Bird, Nature Genet. 6, 236 (1994).
20. E. C. Uberbacher, Y. Xu, and R. J. Mural, Methods Enzymol. 266, 259 (1996).
21. K. A. Frazer, Y. Ueda, Y. Zhu, V. R. Gifford, M. R. Garofalo, N. Mohandas, C. H. Martin, M. J. Palazzolo, J. F. Cheng, and E. M. Rubin, Genome Res. 7, 495 (1997).
22. M. Burset and R. Guigo, Genomics 34, 353 (1996).
23. G. M. Duyk, S. W. Kim, R. M. Myers, and D. R. Cox, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87, 8995 (1990).
24. D. Auch and M. Reth, Nucleic Acids Res. 18, 6743 (1990).
25. A. J. Buckler, D. D. Chang, S. L. Graw, J. D. Brook, D. A. Haber, P. A. Sharp, and D. E. Housman, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 4005 (1991).
26. D. B. Krizman and S. M. Berget, Nucleic Acids Res. 21, 5198 (1993).
27. A. R. Buchman and P. Berg, Mol. Cell. Biol. 8, 4395 (1988).
28. D. M. Church, A. C. Rogers, S. L. Graw, D. E. Housman, J. F. Gusella, and A. J. Buckler, Hum. Mol. Genet. 2, 1915 (1993).
29. M. A. North, P. Sanseau, A. J. Buckler, D. Church, A. Jackson, K. Patel, J. Trowsdale, and H. Lehrach, Mammalian Genome 4, 466 (1993).
30. D. M. Church, C. J. Stotler, J. L. Rutter, J. R. Murrell, J. A. Trofatter, and A. J. Buckler, Nature Genet. 6, 98 (1994).
31. H. J. Mardon, G. Sebastio, and F. Barelle, Nucleic Acids Res. 15, 7725 (1987).
32. T. A. Cooper and C. P. Ordahl, Nucleic Acids Res. 17, 7905 (1989).
33. P. E. Hodges and L. E. Rosenberg, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 4142 (1989).
34. J. A. Trofatter, K. R. Long, J. L. Rutter, C. J. Stotler, A. N. Turner, J. R. Murrell, and A. J. Buckler, Genome Res. 5, 214 (1995).
35. T. C. Burn, T. D. Connors, K. W. Klinger, and G. M. Landes, Gene 161, 183 (1995).
36. F. Gibson, H. Lehrach, A. J. Buckler, S. D. Brown, and M. A. North, Biotechniques 16, 453 (1994).
37. T. Maniatis, E. F. Fritsch, and J. Sambrook, "Molecular Cloning: A Laboratory Manual." Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989.
38. Y. Gluzman, Cell 23, 175 (1981).
39. P. L. Felgner, T. R. Gadek, M. Holm, R. Roman, H. W. Chan, M. Wenz, J. P. Northrop, G. M. Ringold, and M. Danielsen, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84, 7413 (1987).
40. D. Marchuk, M. Drumm, A. Saulino, and F. S. Collins, Nucleic Acids Res. 19, 1154 (1991).
41. D. A. Mead, N. K. Pey, C. Herrnstadt, R. A. Marcil, and L. M. Smith, Biotechnology 9, 657 (1991).
42. A. Rashtchian, G. W. Buchman, D. M. Schuster, and M. S. Berhinger, Anal. Biochem. 206, 91 (1991).
43. D. M. Church, J. Yang, M. Bocian, R. Shiang, and J. J. Wasmuth, Genome Res. 7, 787 (1997).
44. D. M. Church, A. Carey, and A. J. Buckler, unpublished results (1997).
45. S. Chu, K. R. Long, A. J. Buckler, and M. P. Duyao, unpublished results (1997).
46. M. A. Frohman, M. K. Dush, and G. R. Martin, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85, 8998 (1988).
47. M. A. Frohman, Methods Enzymol. 218, 340 (1993).
48. D. J. Munroe, R. Loebbert, E. Brie, T. Whitton, D. Prawitt, D. Vu, A. Buckler, A. Winterpracht, B. Zabel, and D. E. Housman, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92, 2209 (1995).
49. T. D. Connors, T. C. Burn, J. M. Millholland, T. J. Van Raay, G. M. Landes, Q. Wang, J. Shen, J. Splawski, M. E. Curran, and M. T. Keating, BRL Focus 18, 31 (1996).