Environmental dependence of the dynamics of protein hydration water [10]

Journal of the American Chemical Society

Volumn 121, Issue 41, 1999, Pages 9740-9741

  Tarek, Mounir ^a   Tobias, Douglas J ^b  

^a NATIONAL INSTITUTE OF STANDARDS AND TECHNOLOGY   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PHYCOCYANIN; RIBONUCLEASE; WATER;

CHEMICAL ENVIRONMENT; COMPUTER SIMULATION; CRYSTAL; HYDRATION; LETTER; MOLECULAR DYNAMICS; NEUTRON SCATTERING; POWDER; PROTEIN FOLDING; PROTEIN STRUCTURE;

EID: 0032757044     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja990643i     Document Type: Letter

References (29)

1. Austin, R. H.; Beeson, K. W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Gunsalas, I. C. Biochemistry 1975, 14, 5355-5373; Rasmussen, B. F.; Stock, A. M.; Ringe, D.; Petsko, G. A. Nature 1992, 357, 423-424; Doster, W.; Cusack, S.; Petry, W. Nature 1989, 337, 754-756.
2. Austin, R. H.; Beeson, K. W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Gunsalas, I. C. Biochemistry 1975, 14, 5355-5373; Rasmussen, B. F.; Stock, A. M.; Ringe, D.; Petsko, G. A. Nature 1992, 357, 423-424; Doster, W.; Cusack, S.; Petry, W. Nature 1989, 337, 754-756.
3. Austin, R. H.; Beeson, K. W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Gunsalas, I. C. Biochemistry 1975, 14, 5355-5373; Rasmussen, B. F.; Stock, A. M.; Ringe, D.; Petsko, G. A. Nature 1992, 357, 423-424; Doster, W.; Cusack, S.; Petry, W. Nature 1989, 337, 754-756.
4. Ferrand, M.; Dianoux, A. J.; Petry, W.; Zaccai, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 9668-9672; Fitter, J.; Lechner, R. E.; Dencher, N. A. Biophys. J. 1997, 73, 2126-2137.
5. Ferrand, M.; Dianoux, A. J.; Petry, W.; Zaccai, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 9668-9672; Fitter, J.; Lechner, R. E.; Dencher, N. A. Biophys. J. 1997, 73, 2126-2137.
6. Steinbach, P. J.; Brooks, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 9135-9139.
7. Barron, L. D.; Hecht, L.; Wilson, G. Biochemistry 1997, 36, 13143-13147.
8. Bryant, R. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1996, 25, 29-53; Denisov, V. P.; Halle, B. Faraday Discuss. 1996, 103, 227-244; Lounnas, V.; Pettitt, B. M. Proteins 1994, 18, 148-160; Makarov, V. A.; Feig, M.; Andrews, B. K.; Pettitt, B. M. Biophys. J. 1998, 75, 150-158; Cheng, Y.-K.; Rossky, P. J. Nature 1998, 392, 696-698.
9. Bryant, R. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1996, 25, 29-53; Denisov, V. P.; Halle, B. Faraday Discuss. 1996, 103, 227-244; Lounnas, V.; Pettitt, B. M. Proteins 1994, 18, 148-160; Makarov, V. A.; Feig, M.; Andrews, B. K.; Pettitt, B. M. Biophys. J. 1998, 75, 150-158; Cheng, Y.-K.; Rossky, P. J. Nature 1998, 392, 696-698.
10. Bryant, R. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1996, 25, 29-53; Denisov, V. P.; Halle, B. Faraday Discuss. 1996, 103, 227-244; Lounnas, V.; Pettitt, B. M. Proteins 1994, 18, 148-160; Makarov, V. A.; Feig, M.; Andrews, B. K.; Pettitt, B. M. Biophys. J. 1998, 75, 150-158; Cheng, Y.-K.; Rossky, P. J. Nature 1998, 392, 696-698.
11. Bryant, R. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1996, 25, 29-53; Denisov, V. P.; Halle, B. Faraday Discuss. 1996, 103, 227-244; Lounnas, V.; Pettitt, B. M. Proteins 1994, 18, 148-160; Makarov, V. A.; Feig, M.; Andrews, B. K.; Pettitt, B. M. Biophys. J. 1998, 75, 150-158; Cheng, Y.-K.; Rossky, P. J. Nature 1998, 392, 696-698.
12. Bryant, R. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1996, 25, 29-53; Denisov, V. P.; Halle, B. Faraday Discuss. 1996, 103, 227-244; Lounnas, V.; Pettitt, B. M. Proteins 1994, 18, 148-160; Makarov, V. A.; Feig, M.; Andrews, B. K.; Pettitt, B. M. Biophys. J. 1998, 75, 150-158; Cheng, Y.-K.; Rossky, P. J. Nature 1998, 392, 696-698.
13. Bellissent-Funel, M. C.; Zanotti, J. M.; Chen, S. H. Faraday Discuss. 1996, 103, 281-294;
14. Bellissent-Funel, M. C.; Chen, S. H.; Zanotti, J. M. Phys. Rev. E 1995, 51, 4558-4569; Middendorf, H. D. Physica B 1996, 226, 113-127; Settles, M.; Doster, W. Faraday Discuss. 1996, 103, 269-279.
15. Bellissent-Funel, M. C.; Chen, S. H.; Zanotti, J. M. Phys. Rev. E 1995, 51, 4558-4569; Middendorf, H. D. Physica B 1996, 226, 113-127; Settles, M.; Doster, W. Faraday Discuss. 1996, 103, 269-279.
16. Bellissent-Funel, M. C.; Chen, S. H.; Zanotti, J. M. Phys. Rev. E 1995, 51, 4558-4569; Middendorf, H. D. Physica B 1996, 226, 113-127; Settles, M.; Doster, W. Faraday Discuss. 1996, 103, 269-279.
17. Steinbach, P. J.; Brooks, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 55-59; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Europhys. Lett. 1997, 37, 201-206; Rocchi, C.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 3315- 3325; Paciaroni, A.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 6277-6280.
18. Steinbach, P. J.; Brooks, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 55-59; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Europhys. Lett. 1997, 37, 201-206; Rocchi, C.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 3315- 3325; Paciaroni, A.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 6277-6280.
19. Steinbach, P. J.; Brooks, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 55-59; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Europhys. Lett. 1997, 37, 201-206; Rocchi, C.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 3315-3325; Paciaroni, A.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 6277-6280.
20. Steinbach, P. J.; Brooks, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 55-59; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Europhys. Lett. 1997, 37, 201-206; Rocchi, C.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 3315- 3325; Paciaroni, A.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 6277-6280.
21. Griebenow, K.; Klibanov, A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 10969-10976.
22. Wlodawer, A.; Svensson, L. A.; Sjolin, L.; Gilliland, G. Biochemistry 1988, 27, 2705-2717.
23. Martyna, G. J.; Samuelson; S., Hughs, A.; Tobias, D. J.; Yarne, D.; Klein, M. L.; Tuckerman, M. E., manuscript in preparation.
24. Martyna, G. J.; Tuckerman, M. E.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. Mol. Phys. 1996, 87, 1117-1157.
25. MacKerell, A. D., Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K., III; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiórkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
26. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
27. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593.
28. Doniach, S.; Eastman, P. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 157-163.
29. Beé, M. Quasielastic Neutron Scattering; Adam Hilger: Bristol, 1988.