Molecular tools for study of biofilm physiology

Methods in Enzymology

Volumn 310, Issue , 1999, Pages 20-42

  Christensen, Bjarke Bak ^a   Sternberg, Claus ^a   Andersen, Jens Bo ^a   Palmer Jr , Robert J ^a   Nielsen, Alex Toftgaard ^a   Givskov, Michael ^a   Molin, Søren ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BETA GALACTOSIDASE; GREEN FLUORESCENT PROTEIN; RIBOSOME RNA;

ARTICLE; BACTERIAL GENETICS; BACTERIAL GROWTH; BIOFILM; FLOW CYTOMETRY; GENE TRANSFER; HYDRATION; MARKER GENE; METHODOLOGY; MOLECULAR BIOLOGY; NONHUMAN; PHYSIOLOGY; PRIORITY JOURNAL; REPORTER GENE; RESEARCH; RNA HYBRIDIZATION;

BACTERIA (MICROORGANISMS);

EID: 0032743280     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(99)10004-1     Document Type: Article

References (52)

1. D. E. Caldwell, "Microbial Biofilms" (H. M. Lappin-Scott and J. W. Costerton, eds.), p. 64. Cambridge Univ. Press, Cambridge, UK, 1995.
2. R. J. Palmer, Jr., Methods Enzymol. [12] 310 (1998) (this volume).
3. G. J. Brakenhoff, H. T. v.d. Voort, M. W. Baarslag, B. Mans, J. L. Oud, R. Zwart, and R. v. Driel, Scan. Microsc. 2, 1831 (1988).
4. D. E. Caldwell, D. R. Korber, and J. R. Lawrence, "Advances in Microbial Ecology" (K. C. Marshall, ed.), Vol. 12, p. 1. Plenum Press, New York, 1992.
5. D. E. Caldwell, D. R. Korber, and J. R. Lawrence, J. Appl. Bact. Suppl. 74, 52S (1993).
6. D. E. Caldwell, D. R. Korber, and J. R. Lawrence, J. Microbiol. Methods 15, 249 (1992).
7. S. Møller, D. R. Korber, G. M. Wolfaardt, S. Molin, and D. E. Caldwell, Appl. Environ. Microbiol. 63, 2432 (1997).
8. G. M. Wolfaardt, J. R. Lawrence, R. D. Robarts, S. J. Caldwell, and D. E. Caldwell, Appl. Environ. Microbiol. 60, 434 (1994).
9. N. R. Pace, D. A. Stahl, D. L. Lane, and G. J. Olsen, Adv. Microb. Ecol. 9, 1 (1986).
10. G. J. Olsen, D. J. Lane, S. J. Giovannoni, N. R. Pace, and D. A. Stahl, Annu. Rev. Microbiol. 40, 337 (1986).
11. C. R. Woese, Microbiol. Rev. 51, 221 (1987).
12. R. I. Amann, W. Ludwig, and K. H. Schleifer, Microbiol. Rev. 59, 143 (1995).
13. A. A. Massol-Deyá, J. Whallon, R. F. Hickey, and J. M. Tiedje, Appl. Environ. Microbiol. 61, 769 (1995).
14. E. B. Mackie, K. N. Brown, and J. W. Costerton, J. Bacteriol. 138, 609 (1979).
15. M. E. Bayer and H. Thurow, J. Bacteriol. 130, 911 (1998).
16. D. A. Stahl and R. I. Amann, "Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics" (E. Stackebrandt and M. Goodfellow, eds.), p. 205. Wiley, New York, 1991.
17. A. Longin, C. Souchier, M. French, and P. Bryon, J. Histochem. Cytochem. 41, 1833 (1993).
18. M. Chalfie, Y. Tu, G. Euskirchen, W. W. Ward, and D. C. Prasher, Science 263, 802 (1994).
19. R. Heim, D. C. Prasher, and R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91, 12501 (1994).
20. C. D. Webb, A. Decatur, A. Teleman, and R. Losick, J. Bacteriol. 177, 5906 (1995).
21. S. Dhandayuthapani, L. E. Via, C. A. Thomas, P. M. Horowitz, D. Deretic, and V. Deretic, Mol. Microbiol. 17, 901 (1995).
22. B. B. Christensen, C. Sternberg, and S. Molin, Gene 173, 59 (1996).
23. B. Normander, B. B. Christensen, S. Molin, and N. Kroer, Appl. Environ. Microbiol. 64, 1902 (1998).
24. R. K. Neidenthal, L. Riles, M. Johnston, and J. H. Hegemann, Yeast 12, 773 (1996).
25. S. J. Casper and C. A. Holt, Gene 173, 69 (1996).
26. B. Ludin, R. Doll, S. Meili, S. Kaech, and A. Matus, Gene 173, 107 (1996).
27. B. P. Cormack, R. H. Valdivia, and S. Falkow, Gene 173, 33 (1996).
28. A. T. Nielsen, unpublished results (1998).
29. R. Tombolini, A. Unge, M. E. Davey, F. J. de Bruijn, and J. K. Jansson, FEMS Microbiol. Ecol. 22, 17 (1997).
30. K. C. Keiler, P. R. H. Waller, and R. T. Sauer, Science 271, 990 (1996).
31. S. Gottesmam, E. Roche, Y. Zhou, and R. T. Sauer, Genes Dev. 12, 1338 (1998).
32. C. Herman, D. Thevenet, P. Bouloc, G. C. Walker, and R. D'Ari, Genes Dev. 12, 1348 (1998).
33. K. C. Keiler and R. T. Sauer, J. Biol. Chem. 271, 2589 (1996).
34. J. B. Andersen, C. Sternberg, L. K. Poulsen, S. P. Bjørn, M. Givskov, and S. Molin, Appl. Environ. Microbiol. 64, 2240 (1998).
35. D. G. Davies and G. G. Geesey, Appl. Microbiol. Biotechnol. 61, 860 (1995).
36. R. Nir, Y. Yisraeli, R. Lamed, and E. Sahar, Appl. Environ. Microbiol. 56, 3861 (1990).
37. F. Russo-Marie, M. Roederer, B. Sager, L. A. Herzenberg, and D. Kaiser, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90, 8194 (1993).
38. M. Herrero, V. de Lorenzo, and K. N. Timmis, J. Bacteriol. 172, 6557 (1990).
39. L. H. Hansen, S. J. Sørensen, and L. B. Jensen, Gene 186, 167 (1998).
40. V. de Lorenzo, M. Herrero, U. Jacubzik, and K. N. Timmis, J. Bacteriol. 172, 6568 (1990).
41. B. Kessler, V. de Lorenzo, and K. N. Timmis, Mol. Gen. Genet. 233, 293 (1992).
42. D. H. Figurski and D. R. Helinski, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 76, 1648 (1979).
43. L. Eberl et al., Mol. Microbiol. 12, 131 (1994).
44. C. S. Kristensen, L. Eberl, J. M. Sanchez-Romero, M. Givskov, S. Molin, and V. d. Lorenzo, J. Bacteriol. 177, 52 (1995).
45. J. v. d. B. Arjan, L. A. De Weger, W. T. Tucker, and B. J. J. Lutgenberg, Appl. Environ. Microbiol. 62, 1076 (1998).
46. J. Laville, C. Blumer, C. v. Schrötter, G. Defago, and D. Haas, J. Bacteriol. 180, 3187 (1998).
47. B. B. Christensen, C. Sternberg, J. B. Andersen, L. Eberl, S. Møller, M. Givskov, and S. Molin, Appl. Environ. Microbiol. 64, 2247 (1998).
48. S. Tabor and C. C. Richardson, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82, 1074 (1985).
49. S. Møller, C. Sternberg, J. B. Andersen, B. B. Christensen, J. L. Ramos, M. Givskov, and S. Molin, Appl. Environ. Microbiol. 64, 721 (1998).
50. M. Schaechter, O. Maaløe, and N. O. Kjeldgaard, J. Gen. Microbiol. 19, 592 (1958).
51. L. K. Poulsen, G. Ballard, and D. A. Stahl, Appl. Environ. Microbiol. 59, 1354 (1993).
52. C. Sternberg, B. B. Christensen, T. Johansen, A. T. Nielsen, J. B. Andersen, M. Givskov, and S. Molin, submitted.