Monitoring gene expression in biofilms

Methods in Enzymology

Volumn 310, Issue , 1999, Pages 56-79

  Prigent Combaret, Claire ^a   Lejeune, Philippe ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; BACTERIUM CULTURE; BIOFILM; CULTURE MEDIUM; ESCHERICHIA COLI; FUSION GENE; GENE EXPRESSION; JELLYFISH; METHODOLOGY; NONHUMAN; POLYMERASE CHAIN REACTION; PRIORITY JOURNAL; PSEUDOMONAS AERUGINOSA; REPORTER GENE; RESEARCH; VIBRIO FISCHERI;

BACTERIA (MICROORGANISMS); ESCHERICHIA COLI; PHOTOBACTERIUM; PSEUDOMONAS; PSEUDOMONAS AERUGINOSA; VIBRIO FISCHERI;

EID: 0032741922     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(99)10006-5     Document Type: Article

References (66)

1. J. W. Costerton, Z. Lewandowski, D. E. Caldwell, D. R. Korber, and H. M. Lappin-Scott, Annu. Rev. Microbiol 49, 711 (1995).
2. R. J. Palmer, Jr., and D. C. White, Trends Microbiol. 5, 435 (1997).
3. C. E. ZoBell, J. Bacteriol. 46, 39 (1943).
4. M. C. M. van Loosdrecht, J. Lyklema, W. Norde, and A. J. B. Zehnder, Microbiol. Rev. 54, 75 (1990).
5. J. Henrichsen, Bacteriol. Rev. 36, 478 (1972).
6. A. E. Goodman and K. C. Marshall, in "Microbial Biofilms" (H. M. Lappin-Scott and J. W. Costerton, eds.), p. 80. Cambridge Univ. Press, Cambridge, 1995.
7. C. Prigent-Combaret, O. Vidal, C. Dorel, and P. Lejeune, submitted for publication.
8. T. J. Silhavy, M. L. Berman, and L. W. Enquist, eds., in "Experiments with Gene Fusions." Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, 1984.
9. J. H. Miller, Methods Enzymol. 204 (1991).
10. N. Symonds, A. Toussaint, P. Van de Putte, and M. M Howe, eds., in "Phage Mu." Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, 1987.
11. J. H. Miller, in "A Short Course in Bacterial Genetics." Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1992.
12. D. E. Caldwell, D. R. Korber, and J. R. Lawrence, Adv. Microbial Ecol. 12, l (1992).
13. R. Nir, Y. Yisraeli, R. Lamed, and E. Sahar, Appl. Environ. Microbiol. 56, 3861 (1990).
14. A. M. Alvarez, M. Ibáñez, and R. Rotger, Biotechniques 15, 974 (1993).
15. P. J. Lewis, C. E. Nwoguh, M. R. Barer, C. R. Harwood, and J. Errington, Mol. Microbiol. 13, 655 (1994).
16. C. E. Nwoguh, C. R. Harwood, and M. R. Barer, Mol. Microbiol. 17, 545 (1995).
17. A. Plovins, A.M. Alvarez, M. Ibañez, M. Molina, and C. Nombela, Appl. Environ. Microbiol. 60, 4638 (1994).
18. D. G. Davies, A. M. Chakrabarty, and G. G. Geesey, Appl. Environ. Microbiol. 59, 1181 (1993).
19. D. G. Davies and G. G. Geesey, Appl. Environ. Microbiol. 61, 860 (1995).
20. M. Chalfie, Y. Tu, G. Euskirchen, W. W. Ward, and D. C. Prasher, Science 263, 802 (1994).
21. D. C. Prasher, V. K. Eckenrode, W. W. Ward, F. G. Prendergast, and M. J. Cormier, Gene 111, 229 (1992).
22. S. Delagrave, R. E. Hawtin, C. M. Silva, M. M. Yang, and D. C. Youvan, Bio Technology 13, 151 (1995).
23. T. Ehrig, D. J. O'Kane, and F. G. Prendergast, FEBS Lett. 367, 163 (1995).
24. B. P. Cormack, R. H. Valdivia, and S. Falkow, Gene 173, 33 (1996).
25. R. Heim, A. B. Cubitt, and R. Y. Tsien, Nature 373, 663 (1995).
26. J. B. Andersen, C. Sternberg, L. K. Poulsen, S. P. Bjørn, M. Givskov, and S. Molin, Appl. Environ. Microbiol. 64, 2240 (1998).
27. A. G. Matthysse, S. Stretton, C. Dandie, N. C. McClure, and A. E. Goodman, FEMS Microbiol. Lett. 145, 87 (1996).
28. G. V. Bloemberg, G. A. O'Toole, B. J. J. Lugtenberg, and R. Kolter, Appl. Environ. Microbiol. 63, 4543 (1997).
29. W. G. Miller and S. E. Lindow, Gene 191, 149 (1997).
30. V. S. Kalogeraki and S. C. Winans, Gene 188, 69 (1997).
31. R. S. Burlage, Z. K. Yang, and T. Mehlhorn, Gene 173, 53 (1996).
32. S. Stretton, S. Techkarnjanaruk, A. M. McLennan, and A. E. Goodman, Appl. Environ. Microbiol. 64, 2554 (1998).
33. J. W. Hastings, Gene 173, 5 (1996).
34. J. Engebrecht, K. Nealson, and M. Silverman, Cell 32, 773 (1983).
35. J. Engebrecht and M. Silverman, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81, 4154 (1984).
36. J. Engebrecht, M. Simon, and M. Silverman, Science 227, 1345 (1985).
37. R. J. Palmer, Jr., C. Phiefer, R. Burlage, G. Sayler, and D. C. White, in "Bioluminescence and Chemiluminescence: Molecular Reporting with Photons" (J. W. Hastings, L. J. Kricha, and P. E. Stanley, eds.), p. 445. Wiley, New York, 1996.
38. T. Kaneko and R. R. Colwell, J. Bacteriol. 113, 24 (1973).
39. P. A. Blake, R. E. Weaver, and D. G. Hollis, Annu. Rev. Microbiol 34, 341 (1980).
40. S. Shinoda and K. Okamoto, J. Bacteriol. 129, 1266 (1977).
41. M. R. Belas and R. R. Colwell, J. Bacteriol. 151, 1568 (1982).
42. J. R. Lawrence, D. R. Korber, and D. E. Caldwell, J. Bacteriol. 174, 5732 (1992).
43. R. Belas, A. Mileham, M. Simon, and M. Silverman, J. Bacteriol. 158, 890 (1984).
44. R. Belas, M. Simon, and M. Silverman, J. Bacteriol. 167, 210 (1986).
45. B. A. Castilho, P. Olfson, and M. J. Casadaban, J. Bacteriol. 158, 488 (1984).
46. L. McCarter, M. Hilmen, and M. Silverman, Cell 54, 345 (1988).
47. L. McCarter and M. Silverman, J. Bacteriol. 171, 731 (1989).
48. T. Schmoll, M. Ott, B. Oudega, and J. Hacker, J. Bacteriol. 172, 5103 (1990).
49. R. Belas, D. Erskine, and D. Flaherty, J. Bacteriol. 173, 6279 (1991).
50. C. Allison, H.-C. Lai, D. Gygi, and C. Hughes, Mol. Microbiol. 8, 53 (1993).
51. R. Belas, in "Urinary Tract Infections: Molecular Pathogenesis and Clinical Management" (H. L. T. Mobley and J. W. Warren, eds.), p 271. Am. Soc. for Microbiology, Washington, DC, 1996.
52. R. Belas, J. Bacteriol. 176, 7169 (1994).
53. R. Belas, D. Erskine, and D. Flaherty, J. Bacteriol. 173, 6289 (1991).
54. L. Dagostino, A. E. Goodman, and K. C. Marshall, Biofouling 4, 113 (1991).
55. J. Östling, A. E. Goodman, and S. Kjelleberg, FEMS Microbiol Ecol. 86, 83 (1991).
56. O. Vidal, R. Longin, C. Prigent-Combaret, C. Dorel, M. Hooreman, and P. Lejeune, J Bacteriol. 180, 2442 (1998).
57. T. A. Baker, M. M. Howe, and C. A. Gross, J. Bacteriol. 156, 970 (1983).
58. J. M. Schupp, S. E. Travis, L. B. Price, R. F. Shand, and P. Keim, Biotechniques 19, 18 (1995).
59. G. D. Christensen, L. Baldassarri, and W. A. Simpson, Methods Enzymol. 253, 477 (1995).
60. A. Olsén, A. Arnqvist, M. Hammar, S. Sukupolvi, and S. Normark, Mol. Microbiol. 7, 523 (1993).
61. B. D. Hoyle, L. J. Williams, and J. W. Costerton, Infect. Immun. 61, 777 (1993).
62. N. A. Zielinski, A. M. Chakrabarty, and A. Berry, J. Biol. Chem. 266, 9754 (1991).
63. M. A. Cohenford, J. Abraham, and A. A. Medeiros, Anal. Biochem. 168, 252 (1988).
64. N. H. Albertson, S. Stretton, S. Pongpattanakitshote, S. Kjelleberg, and A. E. Goodman, FEMS Microbiol. Lett. 140, 287 (1996).
65. S. Møller, C. Sternberg, J. B. Andersen, B. B. Christensen, J. L. Ramos, M. Givskov, and S. Molin, Appl. Environ. Microbiol. 64, 721 (1998).
66. R. E. Hodson, W. A. Dustman, R. P. Garg, and M. A. Moran, Appl. Environ. Microbiol. 61, 4074 (1995).