Optimizing the stability of single-chain proteins by linker length and composition mutagenesis

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 95, Issue 11, 1998, Pages 5929-5934

  Robinson, Clifford R ^a,b   Sauer, Robert T ^a  

^a MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^b 3 Dimensional Pharmaceuticals   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; GENE ACTIVITY; GENE SEQUENCE; MUTAGENESIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN FOLDING; PROTEIN STABILITY; REPRESSOR GENE;

EID: 0032568591     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.95.11.5929     Document Type: Article

References (34)

1. Bird, R. E., Hardman, K. D., Jacobson, J. W., Johnson, S., Kaufman, B. M., Lee, S.-M., Lee, T., Pope, S. H., Riordan, G. S. & Whitlow, M. (1988) Science 242, 423-426.
2. Pomerantz, J. L., Sharp, P. A. & Pabo, C. O. (1995) Science 267, 93-96.
3. Predki, P. F. & Regan, L. (1995) Biochem. 34, 9834-9839.
4. Hallewell, R. A., Laria, I., Tabrizi, A., Carlin, C., Getzoff, E. D., Tainer, J. A., Cousens, L. S. & Mullenbach, G. T. (1989) J. Biol. Chem. 264, 5260-5268.
5. Bizub, D., Weber, I. T., Caraeron, C. E., Leis, J. P. & Skalka, A. M. (1991) J. Biol. Chem. 266, 4951-4958.
6. Kim, S.-H., Rang, C-H., Kim, R., Cho, J. M., Lee, Y.-B. & Lee, T.-K. (1989) Protein Eng. 2, 571-575.
7. Liang, H., Sandberg, W. S. & Terwillinger, T. C. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 7010-7014.
8. Toth, M. J. & Schimmel, P. (1986) J. Biol. Chem. 261, 6643-6646.
9. Robinson, C. R. & Sauer, R. T. (1996) Biochem. 35, 109-116.
10. O'Shea, E. K., Rutkowski, R. & Kim, P. S. (1992) Cell 68, 699-708.
11. Pantoliano, M. W., Bird, R. E., Johnson, S., Asel, E. D., Dodd, S. W., Wood, J. F. & Hardman, K. D. (1991) Biochem. 30, 10117-10125.
12. Mallender, W. D. & Voss, E. W., Jr. (1994) J. Biol. Chem. 269, 199-206.
13. Rumbley, C. A., Denzin, L. K., Yantz, L., Tetin, S. Y. & Voss, E. W., Jr. (1993) J. Biol. Chem. 268, 13667-13674.
14. Stemmer, W. P., Morris, S. K. & Wilson, B. S. (1993) BioTechniques 14, 256-265.
15. Lieschke, G. J., Rao, P. K., Gately, M. K. & Mulligan, R. C. (1997) Nat. Biotech. 15, 35-40.
16. Eustance, R. J. & Schleif, R. F. (1996) J. Bacteriol. 178, 7025-7030.
17. Govindaraj, S. & Poulos, T. L. (1996) Protein Sci. 5, 1389-1393.
18. Kortt, A. A., Lan, M., Oddie, G. W., Gruen, C. L., Burns, J. E., Pearce, L. A., Atwell, J. L., McCoy, A. J., Howlett, G. J., Metzger, D. W., et at. (1997) Protein Eng. 10, 423-433.
19. Whitlow, M., Bell, B. A., Feng, S.-L., Filpula, D., Hardman, K. D., Hubert, S. L., Rollence, M. L., Wood, J. F., Schott, M. E., Milenic, D. E., et al. (1993) Protein Eng. 6, 989-995.
20. Deonarain, M. P., Rowlinson-Busza, G., George, A. J. T. & Epenetos, A. A. (1997) Protein Eng. 10, 89-98.
21. Tang, Y., Jiang, N., Parakh, C. & Hilvert, D. (1996) J. Biol. Chem. 271, 15682-15686.
22. Newton, D. L., Xue, Y., Oison, K. A., Fett, J. W. & Rybak, S. M. (1996) Biochem. 35, 545-553.
23. Huston, J. S., McCartney, J., Tai, M.-S., Mottola-Hartshorn, C., Jin, D., Warren, F., Keck, P. & Oppermann, H. (1993) Int. Rev. Immunol. 10, 195-217.
24. Bowie, J. U. & Sauer, R. T. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 2152-2156.
25. Milla, M. E., Brown, B. M. & Sauer, R. T. (1993) Protein Sci. 2, 2198-2205.
26. Robinson, C. R. & Sauer, R. T. (1996) Biochem. 35, 13878-13884.
27. Poljak, R. J. (1994) Structure 2, 1121-1123.
28. Perisic, O., Webb, P. A., Holliger, P., Winter, G. & Williams, R. L. (1994) Structure 2, 1217-1226.
29. Nagi, A. D. & Regan, L. (1997) Fold. Des. 2, 67-75.
30. Chan, H. S. & Dill, K. A. (1988) J. Chem. Phys. 90, 492-509.
31. Ramachandran, G. N. & Sasisekharan, V. (1968) Adv. Protein Chem. 23, 283-437.
32. Breg, J. N., van Opheusden, J. H. J., Burgering, M. J. M., Roelens, R. & Kaptein, R. (1990) Nature (London) 346, 586-589.
33. Raumann, B. E., Rould, M. A., Pabo, C. O. & Sauer, R. T. (1994) Nature (London) 367, 754-757.
34. Kraulis, P. J. (1991) J. Appl. Cryst. 24, 946-950.