EPR studies on the mono- and dicobalt(II)-substituted forms of the aminopeptidase from Aeromonas proteolytica. Insight into the catalytic mechanism of dinuclear hydrolases

Journal of the American Chemical Society

Volumn 119, Issue 8, 1997, Pages 1923-1933

  Bennett, Brian ^a   Holz, Richard C ^a  

^a UTAH STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HYDROLASE;

AEROMONAS; ARTICLE; ELECTRON SPIN RESONANCE; ENZYME ACTIVITY; ENZYME MECHANISM; ENZYME STRUCTURE;

EID: 0030934626     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja963021v     Document Type: Article

References (77)

1. Sorrell, T. N. Tetrahedron 1989, 45, 3-68.
2. Karlin, K. D.; Tyeklar, Z. Bioinorganic Chemistry of Copper; Chapman & Hill: New York, NY, 1993.
3. Vallee, B. L.; Auld, D. S. Biochemistry 1993, 32, 6493-6500.
4. Hough, E.; Hansen, L. K.; Birknes, B.; Jynge, K.; Hansen, S.; Horvik, A.; Little, C.; Dodson, E.; Derewenda, Z. Nature 1989, 338, 357-360.
5. Kim, E. E.; Wyckoff, H. W. J. Mol. Biol. 1991, 218, 449-464.
6. Bone, R.; Frank, L.; Springer, J. P.; Pollack, S. J.; Osborne, S.-A.; Atack, J. R.; Knowles, M. R.; McAllister, G.; Ragan, C. I.; Broughton, H. B.; Baker, R.; Fletcher, S. R. Biochemistry 1994, 33, 9460-9467.
7. Beese, L. S.; Steitz, T. A. EMBO J. 1991, 10, 25-33.
8. Davies, J. F.; Hostomska, Z.; Hostomsky, Z.; Jordan, S. R.; Mathews, D. A. Science 1991, 252, 88-95.
9. Lahm, A.; Volbeda, A.; Suck, D. J. Mol. Biol. 1990, 215, 207-210.
10. Jabri, E.; Carr, M. B.; Hausinger, R. P.; Karplus, P. A. Science 1995, 268, 998-1004.
11. Holz, R. C.; Que, L., Jr.; Ming, L.-J. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4434-4436.
12. True, A. E.; Scarrow, R. C.; Randall, C. R.; Holz, R. C.; Que, L. J. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4246-4255.
13. Sträter, N.; Klabunde, T.; Tucker, P.; Witzel, H.; Krebs, B. Science 1995, 268, 1489-1492.
14. Roderick, S. L.; Matthews, B. W. Biochemistry 1993, 32, 3907-3912.
15. Burley, S. K.; David, P. R.; Taylor, A.; Lipscomb, W. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 6878-6882.
16. Burley, S. K.; David, P. R.; Sweet, R. M.; Taylor, A.; Lipscomb, W. N. J. Mol. Biol. 1992, 224, 113-140.
17. Chevrier, B.; Schalk, C.; D'Orchymont, H.; Rondeau, J.-M.; Moras, D.; Tarnus, C. Structure 1994, 2, 283-291.
18. Fenton, D. E.; Okawa, H. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1993, 1349-1357.
19. Feig, A. L.; Lippard, S. J. Chem. Rev. 1994, 94, 759-805.
20. Karlin, K. D. Science 1993, 261, 701-708.
21. Que, L., Jr.; True, A. E. Dinuclear Iron-and Manganese-Oxo Sites in Biology; John Wiley: New York, 1990; Vol. 38, pp 97-200.
22. Chin, J. Acc. Chem. Res. 1991, 24, 145-152.
23. Lai, K.; Dave, K. I.; Wild, J. R. J. Biol. Chem. 1994, 269, 16579-16584.
24. Menger, F. M.; Gan, L. H.; Johnson, E.; Durst, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 2800-2803.
25. Norland, P.; Sjöberg, B.-M.; Eklund, H. Nature 1990, 345, 593-598.
26. Rosenzweig, A. C.; Federick, C. A.; Lippard, S. J.; Nordlund, P. Nature 1993, 366, 537-543.
27. deMare, F.; Kurtz, D. M.; Nordland, P. Nature Struct. Bio. 1996, 3, 539-546.
28. Ben-Bassat, A.; Bauer, K.; Chang, S.-Y.; Myambo, K.; Boosman, A.; Chang, S. J. Bacteriol. 1987, 169, 751-757.
29. Prescott, J. M.; Wagner, F. W.; Holmquist, B.; Vallee, B. L. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1983, 114, 646-652.
30. Prescott, J. M.; Wagner, F. W.; Holmquist, B.; Vallee, B. L. Biochemistry 1985, 24, 5350-5356.
31. Lebioda, L.; Stec, B. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8511-8513.
32. Rose, S. L.; Dickinson, L. C.; Westhead, E. W. J. Biol. Chem. 1984, 259, 4405-4413.
33. Lai, K.; Dave, K. I.; Wild, J. R. J. Biol. Chem. 1994, 269, 16579-16584.
34. Omburo, G.; Mullins, L. S.; Raushel, F. M. Biochemistry 1993, 32, 9148-9155.
35. Chae, M. Y.; Omburo, G. A.; Lindahl, P. A.; Raushel, F. M. Arch. Biochem. Biophys. 1995, 316, 765-772.
36. Bicknell, R.; Hanson, G. R.; Holmquist, B.; Little, C. Biochemistry 1986, 25, 4219-4223.
37. Elgren, T. E.; Ming, L.-J.; Que, L. Inorg. Chem. 1994, 33, 891-894.
38. Kuo, J. M.; Raushel, F. M. Biochemistry 1994, 33, 4265-4272.
39. Martinelli, R. A.; Hanson, G. R.; Thompson, J. S.; Holmquist, B.; Pilbrow, J. R.; Auld, D. S.; Vallee, B. L. Biochemistry 1989, 28, 2251-2258.
40. Sellin, S.; Eriksson, L. E. G.; Aronsson, A.-C.; Mannervik, B. J. Biol. Chem. 1983, 258, 2091-2093.
41. Werth, M. T.; Tang, S.-F.; Formicka, G.; Zeppezauer, M.; Johnson, M. K. Inorg. Chem. 1995, 34, 218-228.
42. Bubacco, L.; Magliozzo, R. S.; Beltramini, M.; Salvato, S.; Peisach, J. Biochemistry 1992, 31, 9294-9303.
43. Grell, E.; Bray, R. C. Biochim. Biophys. Acta 1971, 236, 503-506.
44. Bencini, A.; Bertini, I.; Canti, G.; Gatteschi, D.; Luchinat, C. J. Inorg. Biochem. 1981, 14, 81-91.
45. Makinen, M. W.; Kuo, L. C.; Yim, M. B.; Wells, G. B.; Fukuyama, J. M.; Kim, J. E. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 5245-5255.
46. Prescott, J. M.; Wilkes, S. H. Methods Enzymol. 1976, 45B, 530-543.
47. Chen, G.; Edwards, T.; D'souza, V. M.; Holz, R. C. Biochemistry 1996, in press.
48. Schalk, C.; Remy, J.-M.; Chevrier, B.; Moras, D.; Tamus, C. Arch. Biochem. Biophys. 1992, 294, 91-97.
49. Baker, J. O.; Wilkes, S. H.; Bayliss, M. E.; Prescott, J. M. Biochemistry 1983, 22, 2098-2103.
50. Prescott, J. M.; Wilkes, S. H.; Wagner, F. W.; Wilson, K. J. J. Biol. Chem. 1971, 246, 1756-1764.
51. Gill, S. C.; von Hippel, P. H. Anal. Biochem. 1989, 182, 319-326.
52. Gill, S. C., von Hippel, P. H. Anal. Biochem. 1990, 189, 283.
53. Edelhoch, H. Biochemistry 1967, 6, 1948-1954.
54. Bennett, B.; Berks, B. C.; Ferguson, S. J.; Thomson, A. J.; Richardson, D. J. Eur. J. Biochem. 1994, 226, 789-798.
55. Bennett, B.; Gruer, M.; Guest, J. R.; Thomson, A. J. Eur. J. Biochem. 1995, 233, 317-326.
56. Sears, H. J.; Bennett, B.; Spiro, S.; Thomson, A. J.; Richardson, D. J. Biochem. J. 1995, 310, 311-314.
57. Bennett, B.; Benson, N.; McEwan, A. G.; Bray, R. C. Eur. J. Biochem. 1994, 225, 321-331.
58. Bray, R. C. Quart. Rev. Biophys. 1988, 21, 299-329.
59. Belford, R. L. EPK Symposium, 21st Rocky Mountain Conference, Denver, Colorado 1979,
60. Maurice, A. M. Ph.D. Thesis, University of Illinois, 1980.
61. Nilges, M. J. Ph.D. Thesis, University of Illinois, 1979.
62. Pilbrow, J. R. J. Magn. Res. 1978, 31, 479-489.
63. Chevrier, B.; D'Orchymont, H.; Schalk, C.; Tarnus, C.; Moras, D. Eur. J. Biochem. 1996, 237, 393-398.
64. Hagen, W. R. Adv. Inorg. Chem. 1982, 38, 165-222.
65. Hendrich, M. P.; Debrunner, P. G. Biophys. J. 1989, 56, 489-506.
66. Munck, E.; Surerus, K. K.; Hendrich, M. P. Metallobiochemistry, Pt D 1993, 227, 463-479.
67. Hagen, W. R.; Dunham, W. R.; Sands, R. H.; Shaw, R. W.; Beinert, H. Biochim. Biophys. Acta 1984, 765, 399-402.
68. Calhoun, M. W.; Gennis, R. B.; Salerno, J. C. FEBS Lett. 1992, 309, 127-129.
69. Tsubaki, M.; Mogi, T.; Anraku, Y.; Hori, H. Biochemistry 1993, 32, 6065-6072.
70. Hagen, W. R.; Dunham, W. R.; Johnson, M. K.; Fee, J. A. Biochim. Biophys. Acta 1985, 828, 369-374.
71. Lynch, J. B.; Juarez-Garcia, C.; Munck, E.; Que, L., Jr. J. Biol. Chem. 1989, 264, 8091-8096.
72. Vertagen, F. J. M.; Voorhorst, W. G. B.; Kolkman, J. A.; Wolbert, R. B. G.; Hagen, W. R. FEBS Lett. 1993, 336, 13-18.
73. Pierik, A. J.; Wassink, H.; Haaker, H.; Hagen, W. R. Eur. J. Biochem. 1993, 212, 51-61.
74. Sureras, K. K.; Hendrich, M. P.; Christie, P. D.; Rottgardt, D.; Orme-Johnson, W. H.; Munck, E. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 8579-8590.
75. Pierik, A. J.; Hagen, W. R.; Dunham, W. R.; Sands, R. H. Eur. J. Biochem. 1992, 206, 705-719.
76. Holz, R. C.; Brink, J. M.; Gobena, F. T.; O'Connor, C. J. Inorg. Chem. 1994, 33, 6086-6092.
77. Christianson, D. W.; Lipscomb, W. N. Acc. Chem. Res. 1989, 22, 62-69.