DNA looping by Ku and the DNA-dependent protein kinase

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 94, Issue 9, 1997, Pages 4267-4272

  Cary, Robert B ^a   Peterson, Scott R ^a   Wang, Jinting ^a   Bear, David G ^b   Bradbury, E Morton ^a,c   Chen, David J ^a  

^a LOS ALAMOS NATIONAL LABORATORY   (United States)

^b UNIVERSITY OF NEW MEXICO HEALTH SCIENCES CENTER   (United States)

^c UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

atomic force microscopy; DNA repair; double strand break; electron microscopy

Indexed keywords

PROTEIN KINASE;

ARTICLE; CONFORMATIONAL TRANSITION; DNA CONFORMATION; DNA REPAIR; DNA SEQUENCE; DNA STRAND BREAKAGE; ENZYME BINDING; GENE REARRANGEMENT; HUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ASSEMBLY; PROTEIN DNA INTERACTION;

EID: 0030903145     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.94.9.4267     Document Type: Article

References (63)

1. Alt, F. W., Oltz, E. M., Young, F., Gorman, J., Taccioli, G. & Chen, J. (1992) Immunol. Today 13, 306-314.
2. Jackson, S. P. & Jeggo, P. A. (1995) Trends Biochem. Sci. 20, 412-415.
3. Jeggo, P. A., Taccioli, G. E. & Jackson, S. P. (1995) Bioessays 17, 949-957.
4. Hinnen, A., Hicks, J. B. & Fink, G. R. (1978) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75, 1929-1933.
5. Orr-Weaver, T. L., Szostak, J. W. & Rothstein, R. J. (1981) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78, 6354-6358.
6. Orr-Weaver, T. L. & Szostak, J. W. (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 4417-4421.
7. Rothstein, R. (1983) Methods Enzymol. 101, 202-211.
8. Roth, D. B. & Wilson, J. H. (1985) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 3355-3359.
9. Robins, D. M., Ripley, S., Henderson, A. S. & Axel, R. (1981) Cell 23, 29-39.
10. Lin, F. L., Sperle, K. & Sternberg, N. (1985) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 1391-1395.
11. Smith, A. J. & Berg, P. (1984) Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 49, 171-181.
12. Smithies, O., Gregg, R. G., Boggs, S. S., Koralewski, M. A. & Kucherlapati, R. S. (1985) Nature (London) 317, 230-234.
13. Thomas, K. R., Folger, K. R. & Capecchi, M. R. (1986) Cell 44, 419-428.
14. Pfeiffer, P. & Vielmetter, W. (1988) Nucleic Acids Res. 16, 907-924.
15. Roth, D. B. & Wilson, J. H. (1986) Mol. Cell. Biol. 6, 4295-4304.
16. Roth, D. B., Porter, T. N. & Wilson, J. H. (1985) Mol. Cell. Biol. 5, 2599-2607.
17. Thode, S., Schafer, A., Pfeiffer, P. & Vielmetter, W. (1990) Cell 60, 921-928.
18. Boubnov, N. V., Hall, K. T., Wills, Z., Lee, S. E., He, D. M., Benjamin, D. M., Pulaski, C. R., Band, H., Reeves, W., Hendrickson, E. A. & Weaver, D. T. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 890-894.
19. Smider, V., Rathmell, W. K., Lieber, M. R. & Chu, G. (1994) Science 266, 288-291.
20. Blunt, T., Finnie, N. J., Taccioli, G. E., Smith, G. C., Demengeot, J., Gottlieb, T. M., Mizuta, R., Varghese, A. J., Alt, F. W., Jeggo, P. A. & Jackson, S. P. (1995) Cell 80, 813-823.
21. Finnie, N. J., Gottlieb, T. M., Blunt, T., Jeggo, P. A. & Jackson, S. P. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 320-324.
22. Kirchgessner, C. U., Patil, C. K., Evans, J. W., Cuomo, C. A., Fried, L. M., Carter, T., Oettinger, M. A. & Brown, J. M. (1995) Science 267, 1178-1183.
23. Peterson, S. R., Kurimasa, A., Oshimura, M., Dynan, W. S., Bradbury, E. M. & Chen, D. J. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 3171-3174.
24. Taccioli, G. E., Gottlieb, T. M., Blunt, T., Priestley, A., Demengeot, J., Mizuta, R., Lehmann, A. R., Alt, F. W., Jackson, S. P. & Jeggo, P. A. (1994) Science 265, 1442-1445.
25. Lees-Miller, S. P., Godbout, R., Chan, D. W., Weinfeld, M., Day, R. S., III, Barron, G. M. & Allalunis-Turner, J. (1995) Science 267, 1183-1185.
26. Rathmell, W. K. & Chu, G. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 7623-7627.
27. Chen, F., Peterson, S. R., Story, M. D. & Chen, D. J. (1996) Mutat. Res. 362, 9-19.
28. Finnie, N. J., Gottlieb, T. M., Blunt, T., Jeggo, P. A. & Jackson, S. P. (1996) Philos. Trans. R. Soc. London B 351, 173-179.
29. Roth, D. B., Lindahl, T. & Gellert, M. (1995) Curr. Biol. 5, 496-499.
30. Lees-Miller, S. P., Chen, Y. R. & Anderson, C. W. (1990) Mol. Cell. Biol. 10, 6472-6481.
31. Carter, T., Vancurova, I., Sun, I., Lou, W. & DeLeon, S. (1990) Mol. Cell. Biol. 10, 6460-6471.
32. Dvir, A., Peterson, S. R., Knuth, M. W., Lu, H. & Dynan, W. S. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 11920-11924.
33. Gottlieb, T. M. & Jackson, S. P. (1993) Cell 72, 131-142.
34. Hartley, K. O., Gell, D., Smith, G. C., Zhang, H., Divecha, N., Connelly, M. A., Admon, A., Lees-Miller, S. P., Anderson, C. W. & Jackson, S. P. (1995) Cell 82, 849-856.
35. Knuth, M. W., Gunderson, S. I., Thompson, N. E., Strasheim, L. A. & Burgess, R. R. (1990) J. Biol. Chem. 265, 17911-17920.
36. Giffin, W., Torrance, H., Rodda, D. J., Prefontaine, G. G., Pope, L. & Hache, R. J. (1996) Nature (London) 380, 265-268.
37. Roberts, M. R., Han, Y., Fienberg, A., Hunihan, L. & Ruddle, F. H. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 6354-6358.
38. Kim, D., Ouyang, H., Yang, S. H., Nussenzweig, A., Burgman, P. & Li, G. C. (1995) J. Biol. Chem. 270, 15277-15284.
39. DiCroce, P. A. & Krontiris, T. G. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 10137-10141.
40. May, G., Sutton, C. & Gould, H. (1991) J. Biol. Chem. 266, 3052-3059.
41. Hoff, C. M., Ghosh, A. K., Prabhakar, B. S. & Jacob, S. T. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 762-766.
42. Niu, H., Zhang, J. & Jacob, S. T. (1995) Gene Expression 4, 111-124.
43. Niu, H. & Jacob, S. T. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 9101-9105.
44. Blier, P. R., Griffith, A. J., Craft, J. & Hardin, J. A. (1993) J. Biol. Chem. 268, 7594-7601.
45. Griffith, A. J., Blier, P. R., Mimori, T. & Hardin, J. A. (1992) J. Biol. Chem. 267, 331-338.
46. Mimori, T. & Hardin, J. A. (1986) J. Biol. Chem., 261, 10375-10379.
47. Li, L. L. & Yeh, N. H. (1992) Exp. Cell. Res. 199, 262-268.
48. Dvir, A., Stein, L. Y., Calore, B. L. & Dynan, W. S. (1993) J. Biol. Chem. 268, 10440-10447.
49. Mimori, T., Ohosone, Y., Hama, N., Suwa, A., Akizuki, M., Homma, M., Griffith, A. J. & Hardin, J. A. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 1777-1781.
50. Griffith, J. D. (1973) Methods Cell Biol. 7, 129-145.
51. Griffith, J. D. & Christiansen, G. (1978) Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 7, 19-35.
52. Arias, J., Peterson, S. R. & Dynan, W. S. (1991) J. Biol. Chem. 266, 8055-8061.
53. de Vries, E., van Driel, W., Bergsma, W. G., Arnberg, A. C. & van der Vliet, P. C. (1989) J. Mol. Biol. 208, 65-78.
54. Chan, D. W. & Lees-Miller, S. P. (1996) J. Biol. Chem. 271, 8936-8941.
55. Anderson, C. W. (1993) Trends Biochem. Sci. 18, 433-437.
56. Su, W., Jackson, S., Tjian, R. & Echols, H. (1991) Genes Dev. 5, 820-826.
57. Stenger, J. E., Tegtmeyer, P., Mayr, G. A., Reed, M., Wang, Y., Wang, P., Hough, P. V. & Mastrangelo, I. A. (1994) EMBO J. 13, 6011-6020.
58. Mastrangelo, I. A., Courey, A. J., Wall, J. S., Jackson, S. P. & Hough, P. V. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 5670-5674.
59. Tuteja, N., Tuteja, R., Ochem, A., Taneja, P., Huang, N. W., Simoncsits, A., Susic, S., Rahman, K., Marusic, L., Chen, J., Zhang, J., Wang, S., Ponger, S. & Falaschi, A. (1994) EMBO J. 13, 4991-5001.
60. Genersch, E., Eckerskorn, C., Lottspeich, F., Herzog, C., Kuhn, K. & Poschl, E. (1995) EMBO J. 14, 791-800.
61. Paillard, S. & Strauss, F. (1991) Nucleic Acids Res. 19, 5619-5624.
62. Rippe, K., von Hippel, P. H. & Langowski, J. (1995) Trends Biochem. Sci. 20, 500-506.
63. Schleif, R. (1992) Annu. Rev. Biochem. 61, 199-223.