A chemical method for site-specific modification of RNA: The convertible nucleoside approach

Journal of the American Chemical Society

Volumn 119, Issue 32, 1997, Pages 7423-7433

  Allerson, Charles R ^a   Chen, Swaine L ^a   Verdine, Gregory L ^a  

^a HARVARD UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; IN VITRO STUDY; MOLECULAR MODEL; NUCLEOTIDE SEQUENCE; RNA STRUCTURE; RNA SYNTHESIS;

EID: 0030749164     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja962858n     Document Type: Article

References (56)

1. Pley, H. W.; Flaherty, K. M.; McKay, D. B. Nature 1994, 372, 68-74.
2. Scott, W. G.; Finch, J. T.; Klug, A. Cell 1995, 81, 991-1002.
3. Scott, W. G.; Murray, J. B.; Arnold, J. R. P.; Stoddard, B. L.; Klug, A. Science 1997, 274, 2065-2069.
4. Cate, J. H.; Gooding, A. R.; Podell, E.; Zhou, K. H.; Golden, B. L.; Kundrot, C. E.; Cech, T. R.; Doudna, J. A. Science 1996, 273, 1678-1685.
5. Puglisi, J. D.; Chen, L.; Blanchard, S.; Frankel, A. D. Science 1995, 270, 1200-1203.
6. Fourmy, D.; Recht, M. I.; Blanchard, S. C.; Puglisi, J. D. Science 1996, 274, 1367-1371.
7. Jiang, F.; Kumar, R. A.; Jones, R. A.; Patel, D. J. Nature 1996, 382, 183-186.
8. Ye, X.; Kumar, R. A.; Patel, D. J. Chem. Biol. 1995, 2, 827-840.
9. Ye, X.; Gorin, A.; Ellington, A. D.; Patel, D. J. Nat. Struct. Biol. 1996, 3, 1026-1033.
10. Shen, L. X.; Tinoco, I., Jr. J. Mol. Biol. 1995, 247, 963-978.
11. Battiste, J. L.; Mao, H.; Rao, N. S.; Tan, R.; Muhandiram, D. R.; Kay, L. E.; Frankel, A. D.; Williamson, J. R. Science 1996, 273, 1547.
12. Uhlenbeck, O. C. RNA 1995, 1, 4-6.
13. Herschlag, D. J. Biol. Chem. 1995, 270, 20871-20874.
14. Zuker, M.; Jaeger, J. A.; Turner, D. H. Nucleic Acids Res. 1991, 19, 2704-2714.
15. Lingner, J.; Hendrick, L. L.; Cech, T. R. Genes Dev. 1994, 8, 1984-1998.
16. Michel, F.; Westhof, E. J. Mol. Biol. 1990, 216, 585-610.
17. Sproat, B. S. J. Biotechnol. 1995, 41, 221-238.
18. Heidenreich, O.; Pieken, W.; Eckstein, F. FASEB J. 1993, 7, 90-96.
19. Ferentz, A. E.; Verdine, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4000-4002.
20. Goodwin, J. T.; Glick, G. D. Tetrahedron Lett. 1994, 35, 1647-1650.
21. Sigurdsson, S. T.; Tuschl, T.; Eckstein, F. RNA 1995, 1, 575-583.
22. Allerson, C. R.; Verdine, G. L. Chem. Biol. 1995, 2, 667-682.
23. Goodwin, J. T.; Osborne, S. E.; Scholle, E. J.; Glick, G. D. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 207-5215.
24. Tor, Y.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4461-4467.
25. Beaucage, S. L.; Iyer, R. P. Tetrahedron 1992, 48, 2223-2311.
26. Milligan, J. F.; Groebe, D. R.; Witherell, G. W.; Uhlenbeck, O. C. Nucleic Acids Res. 1987, 15, 8783-8798.
27. Naumann, M.; Nieters, A.; Hatada, E. N.; Scheidereit, C. Oncogene 1993, 8, 2275-2281.
28. MacMillan, A. M.; Query, C. C.; Allerson, C. R.; Chen, S.; Verdine, G. L.; Sharp, P. A. Genes Dev. 1994, 8, 3008-3020.
29. Kleina, L. G.; Miller, J. H. J. Mol. Biol. 1990, 212, 295-318.
30. MacMillan, A. M.; Verdine, G. L. Tetrahedron 1991, 47, 2603-2616.
31. MacMillan, A. M.; Chen, L.; Verdine, G. L. J. Org. Chem. 1992, 57, 2989-2991.
32. MacMillan, A. M.; Lee, R. J.; Verdine, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4921-4922.
33. Erlanson, D. A.; Chen, L.; Verdine, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12583-12584.
34. Ferentz, A. E.; Verdine, G. L. Nucleosides Nucleotides 1992, 11, 1749-1763.
35. Xu, Y.-Z.; Zheng, Q.; Swann, P. F. J. Org. Chem. 1992, 57, 3839-3845.
36. Xu, Y.-Z.; Zheng, Q.; Swann, P. F. Tetrahedron Lett. 1992, 33, 5837-5840.
37. Xu, Y.-Z. Tetrahedron 1996, 52, 10737-10750.
38. Xu, Y.-Z.; Zheng, Q.; Swann, P. F. Tetrahedron 1992, 48, 1729-1740.
39. Harris, C. M.; Zhou, L.; Strand, E. A.; Harris, T. M. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4328-4329.
40. Wolfe, S. A.; Verdine, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12585-12586.
41. Wolfe, S. A.; Ferentz, A. E.; Grantcharova, V.; Churchill, M. E. A.; Verdine, G. L. Chem. Biol. 1995, 2, 213-221.
42. Reinisch, K. M.; Chen, L.; Verdine, G. L.; Lipscomb, W. N. Cell 1995, 82, 143-153.
43. Larson, C. J.; Verdine, G. L. Nucleic Acids Res. 1992, 20, 3525-3520.
44. Jain, J.; McCaffrey, P. G.; Miner, Z.; Kerppola, T. M.; Lambert, J. N.; Verdine, G. L.; Curran, T.; Rao, A. Nature 1993, 365, 352-353.
45. Dyer, M. A.; Naidoo, R.; Hayes, P. J.; Larson, C. J.; Verdine, G. L.; Baron, M. H. Mol. Cell. Biol. 1997, 16, 829-838.
46. Wu, T.; Ogilvie, K. K.; Pon, R. T. Nucleic Acids Res. 1989, 17, 3501-3517.
47. Lyttle, M. H. Nucleosides Nucleotides 1993, 12, 95-106.
48. MacMillan, A. M.; Verdine, G. L. J. Org. Chem. 1990, 55, 5931-5933.
49. Allerson, C. R. Ph.D. Thesis, Harvard University, 1996.
50. Trichtinger, T.; Charubala, R.; Pfleiderer, W. Tetrahedron Lett. 1983, 24, 711-714.
51. Lee, H.; Hinz, M.; Stezowski, J. J.; Harvey, R. G. Tetrahedron Lett. 1990, 31, 6773-6776.
52. Usman, N.; Ogilvie, K. K.; Jiang, M.-Y.; Cedergren, R. J. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 7845-7854.
53. Hakimelahi, G. H.; Proba, Z. A.; Ogilvie, K. K. Can. J. Chem. 1982, 60, 1106-1113.
54. Westman, E.; Strömberg, R. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 2430-2431.
55. Ferentz, A. E.; Verdine, G. L. In Nucleic Acids and Molecular Biology; Eckstein, F., Lilley, D. M. J., Eds.; Springer-Verlag: New York, 1994; pp 14-40.
56. Moore, M. J.; Sharp, P. A. Science 1992, 256, 992-997.