Catalytic domains of matrix metalloproteinases: A molecular biology approach to drug discovery

Current Medicinal Chemistry

Volumn 3, Issue 6, 1996, Pages 407-418

  Ye, Qi Zhuang ^a   Hupe, Donald ^a   Johnson, Linda ^a  

^a PFIZER INC   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MATRIX METALLOPROTEINASE; MATRIX METALLOPROTEINASE INHIBITOR;

AMINO ACID SEQUENCE; DRUG DESIGN; DRUG RESEARCH; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME BINDING; ENZYME STRUCTURE; HUMAN; MOLECULAR CLONING; NONHUMAN; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN EXPRESSION; REVIEW;

EID: 0030444920     PISSN: 09298673     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Review

References (67)

1. Woessner, J. F. FASEBJ, 1991, 5, 2145.
2. Basset, P.; Bellocq, J. P.; Wolf, C.; Stoll, I.; Hutin, P.; Limacher, J. M.; Podhajcer, O. L ; Chenard, M. P.; Rio, M. C.; Chambon, P. Nature (London), 1990, 348, 699.
3. Shapiro, S. D.; Kobayashi, D. L.; Ley, T. J. J. Biol. Chem., 1993, 268, 23824.
4. Freije, J. M ; Diez-ltza, I.; Balbin, M.; Sanchez, L. M.; Blasco, R.; Tolivia, J.; Lopez-Otin, C. J. Biol. Chem., 1994, 269, 16766
5. Sato, H.; Takino, T., Okada, Y.; Cao, J.; Shinagawa, A.; Yamamoto, E.; Selki, M. Nature, 1994, 370(6484), 61.
6. Will, H.; Hinzmann, B. Eur. J. Biochem., 1995, 231, 602.
7. Takino, T.; Sato, H.; Shinagawa, A., Seiki, M. J. Biol. Chem., 1995, 270, 23013
8. Puente, X. S.; Pendas, A M.; Llano, E.; Velasco, G ; Lopez-Otin, C. Cancer Res., 1996, 56, 944.
9. Van Wart, H. E.; Birkedal-Hansen, H. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1990, 87, 5578.
10. Vallee, B. L.; Auld, D. S. Biochemistry, 1990, 29, 5647.
11. Murphy, G.; Willenbrock, F.; Ward, R. V.; Cockett, M. I.; Eaton, D.; Docherty, A. J. P. Biochem. J., 1992, 283, 637.
12. O'Connell, J. P.; Willenbrock, F.; Docherty, A. J. P.; Eaton, D.; Murphy, G. J. Biol. Chem., 1994, 269, 14967.
13. Schnierer, S.; Kleine, T.; Gote, T.; Hillemann, A.; Knauper, V.; Tschesche, H. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1993, 191, 319.
14. Baragi, V.; Fliszar, C. J.; Conroy, M. C.; Ye, Q.-Z.; Shipley, J. M.; Welgus, H. G. J. Biol. Chem., 1994, 269, 12692.
15. Crabbe, T.; O'Connell, J. P.; Smith, B. J.; Docherty, A. J. P. Biochemistry, 1994, 33, 14419.
16. Cao, J.; Sato, H.; Takino, T.; Seiki, M. J. Biol. Chem., 1995, 270, 801.
17. Bergmann, U.; Tuuttila, A.; Stetler-Stevenson, W. G.; Tryggvason, K. Biochemistry, 1995, 34, 2819.
18. Koklitis, P. A.; Murphy, G.; Sutton, C.; Angal, S. Biochem. J., 1991, 276, 217.
19. Housley, T. J.; Baumann, A. P.; Braun, I. D.; Davis, G.; Seperack, P. K.; Wilhelm, S. M. J. Biol. Chem., 1993, 268, 4481.
20. Dioszegi, M.; Cannon, P.; Wart, H. E. V. Methods Enzymol., 1995, 248, 413.
21. Nagase, H. Methods Enzymol., 1995, 248, 449.
22. Murphy, G.; Crabbe, T. Methods Enzymol., 1995, 248, 470.
23. Woessner, J. F. Methods Enzymol., 1995, 248, 485.
24. Winther, J. R.; Sorensen, P. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1991, 88, 9330.
25. Shinde, U.; Li, Y.; Chatterjee, S.; Inouye, M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1993, 90, 6924.
26. Marcy, A. I.; Eiberger, L. L.; Harrison, R.; Chan, H. K.; Hutchinson, N. I.; Hagmann, W. K.; Cameron, P. M.; Boulton, D. A.; Hermes, J. D. Biochemistry, 1991, 30, 6476.
27. Chowdhury, S. K.; Vavra, K. J.; Brake, P. G.; Banks, T.; Falvo, J.; Wahl, R.; Eshraghi, J.; Gonyea, G.; Chait, B. T., Vestal, C H. Rapid Commun. Mass Spectrom., 1995, Volume Date 1995, 9, 563.
28. Gehring, M. R.; Condon, B.; Margosiak, S. A.; Kan, C.-C. J. Biol. Chem., 1995, 270, 22507.
29. Ye, Q.-Z.; Johnson, L. L.; Hupe, D J.; Baragi, V. Biochemistry, 1992a, 37, 11231.
30. Ye, Q.-Z.; Johnson, L. L.; Yu, A. E.; Hupe, D. Biochemistry, 1995, 34, 4702.
31. Lowry, C. L.; McGeehan, G.; LeVine, H. I. Proteins: Struct., Funct., Genet., 1992, 12, 42.
32. Ye, Q.-Z ; Johnson, L. L.; Baragi, V. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1992, 186, 143.
33. Banyai, L.; Tordai, H.; Patthy, L. Biochem. J., 1994, 298, 403.
34. Murphy, G.; Nguyen, Q.; Cookett, M. I.; Atkinson, S. J.; Allan, J. A.; Knight, C. G.; Willenbrock, F.; Docherty, A. J. P. J. Biol. Chem., 1994, 269, 6632.
35. Murphy, G. J. P.; Murphy, G.; Reynolds, J. J. FEBS Lett., 1991, 285, 4.
36. Shipley, J. M.; Doyle, G. A. R.; Fliszar, C. J.; Ye, Q.-Z.; Johnson, L. L.; Shapiro, S. D.; Welgus, H. G,; Senior, R. M. J. Biol. Chem., 1996, 271, 4335.
37. Xia, Y.; Garcia, G.; Chen, S.; Wilson, C. B.; Feng, L. FEBS Lett., 1996, 332, 285.
38. Knight, C. G.; Willenbrock, F.; Murphy, G. FEBS Lett., 1992, 296, 263.
39. Stack, M. S.; Gray, R. D. J. Biol. Chem., 1989, 264, 4277.
40. Weingarten, H.; Feder, J. Anal. Biochem., 1985, 147, 437.
41. Ye, Q.-Z.; Johnson, L. L.; Nordan, I.; Hupe, D.; Hupe, L. J. Med. Chem., 1994, 37, 206.
42. Brownell, J.; Earley, W.; Kunec, E.; Morgan, B. A.; Olyslager, B.; Wahl, R. C.; Houck, D. R. Arch. Biochem. Biophys., 1994, 314, 120.
43. Lovejoy, B.; Cleasby, A.; Hassell, A. M.; Longley, K.; Luuicr, M. A.; Weigl, D.; McGeehan, G.; McElroy, A. B.; Drewry, D.; Lambert, M. H.; Jordan, S. R. Science, 1994, 263, 375.
44. Lovejoy, B.; Hassell, A. M.; Luther, M. A.; Weigl, D.; Jordan, S. R. Biochemistry, 1994, 33, 8207.
45. Borkakoti, N.; Winkler, F. K.; Williams, D. H.; D'Arcy, A.; Broadhurst, M. J.; Brown, P. A.; Johnson, W. H.; Murray, E. J. Nature Structural Biology, 1994, 1, 106.
46. Spurlino, J. C.; Smallwood, A. M.; Carlton, D. D.; Banks, T. M.; Vavra, K. J.; Johnson, J. S.; Cook, E. R.; Falvo, J.; Walh, R. C.; Pulvino, T. A., Wendoloski, J. J ; Smith, D. L. Protein: Structure, Function, and Genetics, 1994, 19, 98.
47. Stams, T.; Spurlino, J. C.; Smith, D. L.; Wahl, R. C.; Ho, T. F.; Qoronfleh, W.; Banks, T M.; Rubin, B. Nature Structural Biology, 1994, 1, 119.
48. Bode, W.; Reinemer, P.; Huber, R.; Kleine, T.; Schnierer, S.; Tschesche, H. The EMBO J., 1994, 13, 1263.
49. Reinemer, P ; Grams, F.; Huber, R.; Kleine, T.; Schnierer, S.; Piper, M.; Tschesche, H.; Bode, W. FEBS Lett., 1994, 338, 227.
50. Becker, J. W.; Marcy, A. I.; Rokosz, L. L.; Axel, M. G.; Burbaum, J. J.; Fitzgerald, P. M. D.; Cameron, P. M.; Esser, C. K.; Hagmann, W. K.; et al. Protein Sci., 1995, 4, 1966.
51. Dhanaraj, V.; Ye, Q.-Z.; Johnson, L. L.; Hupe, D. J.; Ortwine, D. F.; Dunbar, J. B.; Rubin, J. R.; Pavlovsky, A.; Humblet, C.; Blundell, T. L. Structure, 1996, 4, 375.
52. Browner, M. F ; Smith, W. W.; Castelhano, A. L. Biochemistry, 1995, 34, 6602.
53. Gooley, P. R.; O'Connell, J. F.; Marcy, A I.; Cuca, G. C.; Salowe, S. P.; Bush, B. L.; Hermes, J. D.; Esser, C. K.; Hagmann, W. K.; Springer, J. P.; Johnson, B. A. Nature Structural Biology, 1994, 1, 111.
54. Van Doren, S. R., Kurochkin, A. V.; Hu, W.; Ye, Q.-Z.; Johnson, L. L.; Hupe, D. J.; Zuiderweg, E. R. P. Protein Sci., 1995, 4, 2487.
55. Bode, W.; Gomis-Rueth, F.-X.; Stoeckler, W. FEBS Lett., 1993, 331, 134.
56. Stoecker, W ; Grams, F.; Baumann, U.; Reinemer, P.; Gomis-Ruth, F.-X.; McKay, D. B., Bode, W. Protein Sci., 1995, 4, 823.
57. Grams, F.; Reinemer, P.; Powers, J. C.; Kleine, T.; Pieper, M.; Tschesche, H.; Huber, R.; Bode, W. Eur. J. Biochem., 1995a, 228, 830.
58. Grams, F.; Crimmin, M.; Hinnes, L.; Huxley, P ; Pieper, M.; Tschesche, H.; Bode, W. Biochemistry, 1995b, 34, 14012.
59. Botos, I.; Scapozza, L.; Zhang, D.; Liotta, L. A.; Meyer, E. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1996, 93, 2749.
60. Li, J.; Brick, P.; O'Hare, M. C.; Skarzynski, T.; Lloyd, L. F.; Curry, V. A.; Clark, I. M.; Bigg, H. F.; Hazleman, B. L.; et al. Structure, 1995, 3(6), 541.
61. Libson, A. M.; Gittis, A. G.; Collier, I. E.; Marmer, B. L.; Goldberg, G. I.; Lattman, E. E. Nat. Struct. Biol., 1995, 2, 938.
62. Gohlke, U.; Gomis-Rueth, F.-X.; Crabbe, T.; Murphy, G.; Docherty, A. J. P.; Bode, W. FEBS Lett., 1996, 378, 126.
63. Constantine, K. L.; Madrid, M.; Banyai, L.; Trexler, M.; Patthy, L.; Llinas, M. J. Mol. Biol. 1992, 223, 281.
64. Banyai, L.; Tordai, H.; Patthy, L. J. Biol. Chem., 1996, 271, 12003.
65. Beckett, R. P.; Davidson, A. H.; Drummond, A. H.; Huxley, P.; Whittaker, M. Drug Discovery Today, 1996, 1, 16.
66. Morphy, J. R.; Millican, T. A.; Porter, J. R. Curr. Med. Chem., 1995, 2, 743.
67. Porter, J. R.; Beeley, N. R. A.; Boyce, B.; Mason, B.; Millican, A.; Millar, K.; Leonard, J.; Morphy, J. R.; O'Connell, J. P. Bioorg. Med. Chem. Lett., 1994, 4, 2741.