Two-dimensional crystallization of streptavidin mutants

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 103, Issue 37, 1999, Pages 7751-7761

  Wang, Szu Wen ^a   Robertson, Channing R ^a   Gast, Alice P ^a  

^a Stanford University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001465690     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp990715s     Document Type: Article

References (90)

1. Gast, A. P.; Russel, W. B. Phys. Today 1998, 51, 24-30.
2. Russel, W. B.; Saville, D. A.; Schowalter, W. R. Colloidal Dispersions; Cambridge University Press: Cambridge, 1989.
3. Möhwald, H. Annu. Rev. Phys. Chem. 1990, 41, 441-476.
4. McConnell, H. M. Annu. Rev. Phys. Chem. 1991, 42, 171-195.
5. Jap, B. K.; Zulauf, M.; Scheybani, T.; Hefti, A.; Baumeister, W.; Aebi, U.; Engel, A. Ultramicroscopy 1992, 46, 45-84.
6. Kornberg, R. D.; Darst, S. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 1991, 1, 642-646.
7. Olson, G. B.; Hartman, H. J. Phys. 1982, 43, 855-865.
8. Lipp, M. M.; Lee, K. Y. C.; Zasadzinski, J. A.; Waring, A. J. Science 1996, 273, 1196-1199.
9. Longo, M. L.; Bisagno, A. M.; Zasadzinski, J. A. N.; Bruni, R.; Waring, A. J. Science 1993, 261, 453-456.
10. Sleytr, U. B.; Sara, M.; Messner, P.; Pum, D. J. Cell. Biochem. 1994, 33, 171-176.
11. Kupcu, S.; Sleytr, U. B.; Sara, M. J. Immunol. Methods 1996, 196, 73-84.
12. Hemming, S. A.; Bochkarev, A.; Darst, S. A.; Kornberg, R. D.; Ala, P.; Yang, D. S. C.; Edwards, A. M. J. Mol. Biol. 1995, 246, 308-316.
13. Darst, S. A.; Edwards, A. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 1995, 5, 640-644.
14. Mosbach, K. Immobilized Enzymes; Academic Press: New York, 1976; Vol. 54.
15. Blankenburg, R.; Meller, P.; Ringsdorf, H.; Salesse, C. Biochemistry 1989, 28, 8214-8221.
16. Darst, S. A.; Ahlers, M.; Meller, P. H.; Kubalek, E. W.; Blankenburg, R.; Ribi, H. O.; Ringsdorf, H.; Kornberg, R. D. Biophys. J. 1991, 59, 387-396.
17. Ku, A. C.; Darst, S. A.; Kornberg, R. D.; Robertson, C. R.; Gast, A. P. Langmuir 1992, 8, 2357-2360.
18. Nelson, D. R.; Halperin, B. I. Phys. Rev. B 1979, 19, 2457-2484.
19. Kosterlitz, J. M.; Thouless, D. J. J. Phys. C.: Solid State Phys. 1973, 6, 1181-1209.
20. Strandburg, K. J. Rev. Mod. Phys. 1988, 60, 161-207.
21. Young, A. P. Phys. Rev. B 1979, 19, 1855-1866.
22. Bowden, N.; Terfort, A.; Carbeck, J.; Whitesides, G. M. Science 1997, 276, 233-235.
23. Murray, C. A.; Sprenger, W. O.; Wenk, R. A. Phys. Rev. B 1990, 42, 688-703.
24. Murray, C. A.; Vanwinkle, D. H.; Wenk, R. A. Phase Transitions 1990, 21, 93-126.
25. Marcus, A. H.; Rice, S. A. Phys. Rev. E 1997, 55, 637-656.
26. Knobler, C. M. Science 1990, 249, 870-874.
27. Uzgiris, E. E.; Kornberg, R. D. Nature 1983, 301, 125-129.
28. Ribi, H. O.; Ludwig, D. S.; Mercer, K. L.; Schoolnik, G. K.; Kornberg, R. D. Science 1988, 239, 1272-1276.
29. Polyakov, A.; Severinova, E.; Darst, S. A. Cell 1995, 83, 365-373.
30. Darst, S. A.; Ribi, H. O.; Pierce, D. W.; Kornberg, R. D. J. Mol. Biol. 1988, 203, 269-273.
31. Frey, W.; Schief, W. R.; Pack, D. W.; Chen, C.-T.; Chilkoti, A.; Stayton, P.; Vogel, V.; Arnold, F. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 4937-4941.
32. Leuther, K. K.; Bushnell, D. A.; Kornberg, R. D. Cell 1996, 85, 773-779.
33. Asturias, F. J.; Meredith, G. D.; Poglitsch, C. L.; Kornberg, R. D. J. Mol. Biol. 1997, 272, 536-540.
34. Amos, L. A.; Henderson, R.; Unwin, P. N. T. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1982, 39, 183-231.
35. Chaiet, L.; Wolf, F. J. Arch. Biochem. Biophys. 1964, 106, 1-5.
36. Bayer, E. A.; Wilcheck, M. Avidin-Biotin Technology; Academic Press: San Diego, 1990; Vol. 184.
37. Green, N. M. Biochem. J. 1966, 101, 774-780.
38. Green, N. M. Adv. Protein Chem. 1975, 29, 85-133.
39. Green, N. M. Methods Enzymol. 1990, 184, 51-67.
40. Bayer, E. A.; Ben-Hur, H.; Wilcheck, M. Methods Enzymol. 1990, 184, 80-89.
41. Weber, P. C.; Ohlendorf, D. H.; Wendoloski, J. J.; Salemme, F. R. Science 1989, 243, 85-88.
42. Kraulis, P. J. J. Appl. Crystallogr. 1991, 24, 946-950.
43. Hofmann, K.; Wood, S. W.; Brinton, C. C.; Montibeller, J. A.; Finn, F. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1980, 77, 4666-4668.
44. Snejdárková, M.; Rehák, M.; Otto, M. Anal. Chem. 1993, 65, 665-668.
45. Ebersole, R. C.; Miller, J. A.; Moran, J. R.; Ward, M. D. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 2, 3239-3241.
46. Müller, W.; Ringsdorf, H.; Rump, E.; Wildburg, G.; Zhang, X.; Angermaier, L.; Knoll, W.; Liley, M.; Spinke, J. Science 1993, 262, 1706-1708.
47. Koppenol, S.; Stayton, P. S. J. Pharm. Sci. 1997, 86, 1204-1209.
48. Freitag, S.; Trong, I. L.; Klumb, L.; Stayton, P.; Stenkamp, R. Protein Sci. 1997, 6, 1157-1166.
49. Calvert, T. L.; Leckband, D. Langmuir 1997, 13, 6737-6745.
50. Ku, A. C.-T. The Growth of Two-Dimensional Streptavidin Crystals; Stanford University: Stanford, 1996; p 98.
51. Mullins, W. W.; Sekerka, R. F. J. Appl. Phys. 1963, 34, 323-329.
52. Yatcilla, M. T.; Robertson, C. R.; Gast, A. P. Langmuir 1998, 14, 497-503.
53. Ku, A. C.; Darst, S. A.; Kornberg, R. D.; Robertson, C. R.; Gast, A. P. J. Phys. Chem. 1993, 97, 3013-3016.
54. Yatcilla, M. T. Influence of pH on Two-Dimensional Crystals of Streptavidin; Stanford University: Stanford, 1998; p 147.
55. Vogel, V.; William R. Schief, J.; Frey, W. Supramol. Sci. 1997, 4, 163-171.
56. Gallagher, W. H.; Croker, K. M. Protein Sci. 1994, 3, 1602-1604.
57. Ataka, M.; Tanaka, S. J. Phys. Soc. Jpn. 1978, 45, 1779-1780.
58. Wang, S.-W.; Poglitsch, C. L.; Yatcilla, M. T.; Robertson, C. R.; Gast, A. P. Langmuir 1997, 13, 5794-5798.
59. Misell, D. L.; Brown, E. B. Electron Diffraction: An Introduction for Biologists; Elsevier. Amsterdam, 1987; Vol. 12.
60. Wang, S.-W.; Robertson, C. R.; Gast, A. P. Langmuir 1999, 15, 1541-1548.
61. Boodhoo, A.; Duke, N. E. C.; Kong, D.; Ritzel, M. W. L.; Kunimoto, D. Y.; Read, R. J. J. Mol. Biol. 1994, 241, 269-272.
62. Lawson, D. M.; Artymiuk, P. J.; Yewdall, S. J.; Smith, J. M. A.; Livingstone, J. C.; Treffry, A.; Luzzago, A.; Levi, S.; Arosio, P.; Cesareni, G.; Thomas, C. D.; Shaw, W. V.; Harrison, P. M. Nature 1991, 349, 541-544.
63. Braig, K.; Otwinowski, Z.; Hegde, R.; Boisvert, D. C.; Joachimiak, A.; Horwich, A. L.; Sigler, P. B. Nature 1994, 371, 578-586.
64. Vijay-Kumar, S.; Senadhi, S. E.; Ealick, S. E.; Nagabhushan, T. L.; Trotta, P. P.; Kosecki, R.; Reichert, P.; Bugg, C. E. J. Biol. Chem. 1987, 262, 4804-4805.
65. Takeda, S.; Yoshimura, H.; Endo, S.; Takahashi, T.; Nagayama, K. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1995, 23, 548-556.
66. Edwards, T. C.; Koppenol, S.; Frey, W.; Schief, W. R.; Vogel, V.; Stenkamp, R. E.; Stayton, P. S. Langmuir 1998, 14, 4683-4687.
67. Wang, S.-W.; Robertson, C.; Gast, A.; Koppenol, S.; Edwards, T.; Vogel, V.; Stayton, P. 1999. In preparation.
68. Chilkoti, A.; Tan, P. H.; Stayton, P. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 1754-1758.
69. Argarana, C. E.; Kuntz, I. D.; Birken, S.; Axel, R.; Cantor, C. R. Nucleic Acid Res. 1986, 14, 1871-1882.
70. Pahler, A.; Hendrickson, W. A.; Kolks, M. A.; Argarana, C. E.; Cantor, C. R. J. Biol. Chem. 1987, 262, 13933-13937.
71. Wang, S.-W. Effects of Interaction Modifications in Two-Dimensional Streptavidin Crystallization; Stanford University: Stanford, 1999; p 114.
72. Wilbur, D. S.; Stayton, P. S.; To, R.; Buhler, K. R.; Klumb, L. A.; Hamlin, D. K.; Stray, J. E.; Vessella, R. L. Bioconjugate Chem. 1998, 9, 100-107.
73. Nargessi, R. D.; Smith, D. S. Methods Enzymol. 1986, 122, 67-72.
74. Bruch, R. C.; Harold B. White, I. Biochemistry 1982, 21, 5334-5341.
75. Bozzola, J. J.; Russell, L. D. Electron Microscopy; Jones and Bartlett Publishers: Boston, MA, 1992.
76. Stewart, M. J. Electron Microsc. Technol. 1988, 9, 301-324.
77. Creighton, T. E. Proteins; W. H. Freeman and Company: New York, 1993.
78. Hindeleh, A. M.; Hosemann, R. J. Mater. Sci. 1991, 26, 5127-5133.
79. Hosemann, R.; Hindeleh, A. M. J. Macromol. Sci. Phys. 1995, B34, 327-356.
80. Gabriel, B. L.; Taylor, K.; Creutz, C. E.; Kretsinger, R. H. J. Struct. Biol. 1991, 107, 29-37.
81. Ewing, F. L.; Forsythe, E. L.; Woerd, M. v. d.; Pusey, M. L. J. Cryst. Growth 1996, 160, 389-397.
82. Beckmann, W.; Otto, W. H. Chem. Eng. Res. Des. 1996, 74, 750-758.
83. Tanaka, S.; Yamamoto, M.; Kawashima, K.; Ito, K.; Hayakawa, R.; Ataka, M. J. Cryst. Growth 1996, 168, 44-49.
84. Tanaka, S.; Yamamoto, M.; Kawashima, K.; Ito, K.; Hayakawa, R.; Ataka, M. Phys. Rev. E 1997, 56, 67-69.
85. Avrami, M. J. Chem. Phys. 1939, 7, 1103-1112.
86. Bamford, C. H.; Tipper, C. F. H. Reactions in the Solid State; Elsevier Scientific Publishing Company: Amsterdam, 1980; Vol. 22.
87. Cardew, P. T.; Davey, R. J. Proc. R. Soc. London A 1985, 398, 415-428.
88. Völkel, A.; Noolandi, J. J. Comput.-Aided Mater. Des. 1996, 3, 289-295.
89. Völkel, A.; Noolandi, J. J. Comput.-Aided Mater. Des. 1997, 4, 1-9.
90. Skolnick, J.; Kolinski, A. Science 1990, 250, 1121-1124.